Перейти к навигации Перейти к поиску
| Разработчики) | Ариэль Шварц ( Калифорнийский университет в Беркли ), Лиор Пахтер ( Калифорнийский университет в Беркли ) |
|---|---|
| Стабильный выпуск | 2.0 |
| Операционная система | UNIX , Linux , Mac |
| Тип | Инструмент биоинформатики |
| Лицензия | Открытый источник |
| Веб-сайт | AMAP скачать |
AMAP - это программа множественного выравнивания последовательностей, основанная на отжиге последовательностей . [1] Этот подход состоит в построении множественного выравнивания по одному совпадению за раз, тем самым обходя многие проблемы прогрессивного выравнивания. Параметры AMAP можно использовать для настройки компромисса между чувствительностью и специфичностью.
Программу можно использовать через веб-сервер AMAP или как отдельную программу, которую можно установить с исходным кодом.
Ввод / вывод [ править ]
Эта программа принимает последовательности в формате FASTA .
Формат вывода включает: формат FASTA , Clustal .
Ссылки [ править ]
- ^ С. Шварц, А .; Пахтер, Л. (19 января 2007 г.). «Множественное выравнивание путем отжига последовательностей» . Биоинформатика . 23 (2): e24 – e29. DOI : 10.1093 / биоинформатики / btl311 .
Внешние ссылки [ править ]