Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Вспомогательная деятельность Семья 9
Идентификаторы
Условное обозначениеAux_Act_9
PfamPF03443
ИнтерПроIPR005103
CAZyAA9
Доступные белковые структуры:
Pfam  структуры / ECOD  
PDBRCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDBsumкраткое изложение структуры

Семейство 9 вспомогательной активности (ранее GH61) представляет собой семейство литических полисахаридных монооксигеназ . Семейство ранее было неправильно классифицировано как семейство 61 гликозилгидролаз, однако в марте 2013 года оно было переклассифицировано. [1] [2]

Известно, что AA9 является медьзависимым окислительным ферментом, способным расщеплять кристаллическую целлюлозу. [3] Активность в значительной степени зависит от присутствия иона двухвалентной меди и восстановителя, такого как галлат или аскорбат. Окислительное действие AA9 может воздействовать как на восстанавливающий, так и на невосстанавливающий конец фрагментов глюкозы. [ необходима цитата ] Хотя ферменты AA9 можно найти в большом спектре грибов, разлагающих биомассу, исследования этого семейства являются относительно новыми. [4] Эта классификация доступна на веб-сайте CAZy [5] [6], а также обсуждается в CAZypedia, онлайн-энциклопедии углеводно-активных ферментов. [7] [8] [9]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Левассер, Энтони; Друла, Элоди; Ломбард, Винсент; Coutinho, Pedro M .; Генриссат, Бернар (21 марта 2013 г.). «Расширение ферментативного репертуара базы данных CAZy для интеграции вспомогательных окислительно-восстановительных ферментов» . Биотехнология для биотоплива . 6 (1): 41. DOI : 10,1186 / 1754-6834-6-41 . ISSN  1754-6834 . PMC  3620520 . PMID  23514094 .
  2. ^ Хемсворт, Глин R; Дэвис, Гидеон Дж; Уолтон, Пол Х (2013). «Недавние исследования медьсодержащих литических полисахаридных монооксигеназ». Текущее мнение в структурной биологии . 23 (5): 660–668. DOI : 10.1016 / j.sbi.2013.05.006 . PMID 23769965 . 
  3. ^ Vaaje-Колстад, Густав; Вестеренг, Бьёрге; Хорн, Свейн Дж .; Лю, Чжаньлянь; Чжай, Хун; Сорли, Мортен; Эйсинк, Винсент Г. Х. (08.10.2010). «Окислительный фермент, усиливающий ферментативное превращение упорных полисахаридов». Наука . 330 (6001): 219–222. Bibcode : 2010Sci ... 330..219V . DOI : 10.1126 / science.1192231 . ISSN 0036-8075 . PMID 20929773 . S2CID 206527624 .   
  4. ^ Бей, Матье; Чжоу, Симэн; Пойдевин, Летиция; Хенриссат, Бернар; Coutinho, Pedro M .; Беррен, Жан-Ги; Сигойо, Жан-Клод (15.01.2013). «Окисление целло-олигосахаридов выявляет различия между двумя литическими полисахаридными монооксигеназами (семейство GH61) из Podospora anserina» . Прикладная и экологическая микробиология . 79 (2): 488–496. DOI : 10,1128 / aem.02942-12 . ISSN 0099-2240 . PMC 3553762 . PMID 23124232 .   
  5. ^ "Дом" . CAZy.org . Проверено 6 марта 2018 .
  6. ^ Ломбард В, Golaconda Ramulu Н, Drula Е, Кутинью ЛС, Henrissat Б (январь 2014). «База данных по углеводно-активным ферментам (CAZy) за 2013 год» . Исследования нуклеиновых кислот . 42 (выпуск базы данных): D490–5. DOI : 10.1093 / NAR / gkt1178 . PMC 3965031 . PMID 24270786 .  
  7. ^ "Вспомогательная деятельность Семья 9" . CAZypedia.org . Проверено 8 марта 2018 .
  8. ^ "Семейство гликозид гидролаз 61" . CAZypedia.org . Проверено 6 марта 2018 .
  9. ^ CAZypedia Consortium (декабрь 2018). «Десять лет CAZypedia: живая энциклопедия углеводно-активных ферментов» (PDF) . Гликобиология . 28 (1): 3–8. DOI : 10.1093 / glycob / cwx089 . PMID 29040563 .  
Эта статья включает текст из общественного достояния Pfam и InterPro : IPR005103