Химическая база данных — это база данных , специально предназначенная для хранения химической информации . Эта информация касается химических и кристаллических структур , спектров, реакций и синтезов, а также теплофизических данных.
Базы данных биологической активности сопоставляют структуры или другую химическую информацию с результатами биологической активности, полученными в результате биоанализов в литературе, патентах и программах скрининга.
Химические структуры традиционно представляются с помощью линий, обозначающих химические связи между атомами , и рисуются на бумаге (двумерные структурные формулы ). Хотя это идеальные визуальные представления для химика , они не подходят для вычислительного использования и особенно для поиска и хранения . Небольшие молекулы (также называемые лигандамив приложениях по разработке лекарств) обычно представляются с помощью списков атомов и их соединений. Однако большие молекулы, такие как белки, более компактно представлены с использованием последовательностей их аминокислотных строительных блоков. Ожидается, что большие химические базы данных для структур будут обрабатывать хранение и поиск информации о миллионах молекул, занимающих терабайты физической памяти.
Базы данных химической литературы сопоставляют структуры или другую химическую информацию с соответствующими ссылками, такими как научные статьи или патенты. Этот тип базы данных включает STN , Scifinder и Reaxys . Ссылки на литературу также включены во многие базы данных, посвященные химической характеристике.
Кристаллографические базы данных хранят данные рентгеновской кристаллической структуры. Общие примеры включают Банк данных о белках и Кембриджскую структурную базу данных .
Базы данных спектров ЯМР коррелируют химическую структуру с данными ЯМР. Эти базы данных часто включают другие данные о характеристиках, такие как FTIR и масс-спектрометрия .