Загадочное родство

В популяционной генетике , зашифрованное связанность происходит , когда люди в генетической ассоциации исследования более тесно связаны с другим населением , чем предполагалось исследователями. Это может действовать как смешивающий фактор как в исследованиях « случай-контроль», так и в исследованиях ассоциаций на уровне всего генома ^[1]^[2], а также в исследованиях генетического разнообразия . Наряду с стратификацией населения , это один из наиболее заметных сбивающих с толку факторов, которые могут привести к завышению количества ложноположительных результатов в исследованиях ассоциации генов. ^[3]^[4]Это часто корректируется путем включения полигенного компонента в статистическую модель , используемую для обнаружения генетических ассоциаций. ^[5] Другие подходы, которые были разработаны, чтобы попытаться контролировать загадочное родство, - это метод геномного контроля и использование тестов расширенного отношения правдоподобия . ^[6]

использованная литература

^ Войт BF, Притчард JK (сентябрь 2005). «Заблуждение из-за загадочного родства в исследованиях ассоциации случай-контроль» . PLOS Genetics . 1 (3): e32. DOI : 10.1371 / journal.pgen.0010032 . PMC 1200427 . PMID 16151517 .
^ Bulik-Sullivan BK, Лох PR, Финукейн HK, Ripke S, Yang J, Patterson N, Daly MJ, Цена AL, Neale BM (март 2015). «Регрессия LD Score отличает смешение от полигенности в полногеномных ассоциативных исследованиях» . Природа Генетика . 47 (3): 291–5. DOI : 10.1038 / ng.3211 . PMC 4495769 . PMID 25642630 .
^ Astle W, Balding DJ (ноябрь 2009). «Структура популяции и тайное родство в исследованиях генетической ассоциации». Статистическая наука . 24 (4): 451–471. arXiv : 1010.4681 . DOI : 10.1214 / 09-STS307 . ISSN 2168-8745 . S2CID 2553594 .
↑ Zhang F, Deng HW (октябрь 2010 г.). «Смешение из-за загадочного родства в исследованиях ассоциаций на основе гаплотипов». Genetica . 138 (9–10): 945–50. DOI : 10.1007 / s10709-010-9476-6 . PMID 20680405 . S2CID 24583500 .
^ Sillanpää MJ (апрель 2011). «Обзор методов учета искажений из-за стратификации населения и загадочного родства в анализе ассоциации геномных данных» . Наследственность . 106 (4): 511–9. DOI : 10.1038 / hdy.2010.91 . PMC 3183892 . PMID 20628415 .
Перейти ↑ Zhang F, Deng HW (2010). «Исправление загадочного родства в популяционных ассоциативных исследованиях непрерывных черт» . Человеческая наследственность . 69 (1): 28–33. DOI : 10,1159 / 000243151 . PMC 2880733 . PMID 19797906 .

Эта статья о генетике - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[1] Войт BF, Притчард JK (сентябрь 2005). «Заблуждение из-за загадочного родства в исследованиях ассоциации случай-контроль» . PLOS Genetics . 1 (3): e32. DOI : 10.1371 / journal.pgen.0010032 . PMC 1200427 . PMID 16151517 .

[2] Bulik-Sullivan BK, Лох PR, Финукейн HK, Ripke S, Yang J, Patterson N, Daly MJ, Цена AL, Neale BM (март 2015). «Регрессия LD Score отличает смешение от полигенности в полногеномных ассоциативных исследованиях» . Природа Генетика . 47 (3): 291–5. DOI : 10.1038 / ng.3211 . PMC 4495769 . PMID 25642630 .

[3] Astle W, Balding DJ (ноябрь 2009). «Структура популяции и тайное родство в исследованиях генетической ассоциации». Статистическая наука . 24 (4): 451–471. arXiv : 1010.4681 . DOI : 10.1214 / 09-STS307 . ISSN 2168-8745 . S2CID 2553594 .

[4] Zhang F, Deng HW (октябрь 2010 г.). «Смешение из-за загадочного родства в исследованиях ассоциаций на основе гаплотипов». Genetica . 138 (9–10): 945–50. DOI : 10.1007 / s10709-010-9476-6 . PMID 20680405 . S2CID 24583500 .

[5] Sillanpää MJ (апрель 2011). «Обзор методов учета искажений из-за стратификации населения и загадочного родства в анализе ассоциации геномных данных» . Наследственность . 106 (4): 511–9. DOI : 10.1038 / hdy.2010.91 . PMC 3183892 . PMID 20628415 .

[6] Перейти ↑ Zhang F, Deng HW (2010). «Исправление загадочного родства в популяционных ассоциативных исследованиях непрерывных черт» . Человеческая наследственность . 69 (1): 28–33. DOI : 10,1159 / 000243151 . PMC 2880733 . PMID 19797906 .

[1]