Белок deglycase DJ-1 , также известный как белок болезни Паркинсона 7 , представляет собой белок , который у человека кодируется PARK7 гена . [5]
PARK7 |
---|
|
Доступные конструкции |
---|
PDB | Ортолог поиск: PDBe RCSB |
---|
Список идентификационных кодов PDB |
---|
1J42 , 1P5F , 1PDV , 1PDW , 1PE0 , 1Q2U , 1SOA , 1UCF , 2OR3 , 2R1T , 2R1U , 2R1V , 2RK3 , 2RK4 , 2RK6 , 3B36 , 3B38 , 3B3A , 3BWE , 3CY6 , 3CYF , 3CZ9 , 3CZA , 3EZG , 3F71 , 3SF8 , 4BTE, 4MNT , 4MTC , 4N0M , 4N12 , 4OGF , 4OQ4 , 4P2G , 4P34 , 4P35 , 4P36 , 4ZGG , 4RKW , 4RKY , 4S0Z |
|
|
Идентификаторы |
---|
Псевдонимы | PARK7 , DJ-1, DJ1, HEL-S-67p, дегликаз, связанный с паркинсонизмом, GATD2 |
---|
Внешние идентификаторы | OMIM : 602533 MGI : 2135637 HomoloGene : 38295 GeneCards : PARK7 |
---|
Расположение гена ( человек ) |
---|
| Chr. | Хромосома 1 (человека) [1] |
---|
| Группа | 1п36.23 | Начинать | 7 954 291 п.н. [1] |
---|
Конец | 7 985 505 п.н. [1] |
---|
|
Расположение гена ( Мышь ) |
---|
| Chr. | Хромосома 4 (мышь) [2] |
---|
| Группа | 4 | 4 E2 | Начинать | 150 897 133 п.н. [2] |
---|
Конец | 150 914 437 п.н. [2] |
---|
|
Паттерн экспрессии РНК |
---|
| Дополнительные данные эталонного выражения |
|
Онтология генов |
---|
Молекулярная функция | • связывание сигнализации рецептора • связывание цитокин • двухвалентные ионов связывание • транскрипционный фактор связывания • L-доп декарбоксилаза активатора активность • пептидазу активности • киназа связывание • тирозин 3-монооксигеназный активатор активность • фермента связывания • связывание мРНКа • белка гомодимеризация активности • связывание каркасного белка • связывание малых белков с активирующими ферментами • связывание с одноцепочечной ДНК • связывание с убиквитин-подобным белком, связывающее ферменты • связывание с белками GO: 0001948 • активность пероксиредоксина • связывание двухцепочечной ДНК • связывание с ионами меди • связывание с ионами ртути • активность коактиватора транскрипции GO: 0001105 • оксидоредуктазы активность, действуя на перекиси в качестве акцептора • андрогенов связывания рецептора • супероксид шаперона активности дисмутазы меди • РНК - связывающий • идентичные связывания с белками • убиквитин конкретных протеазы связывания • гидролазы активность • одновалентной ион связывания • кадгерин связывания • белок deglycase активности • GO: 0032403 белок -содержащий сложный переплет
|
---|
Сотовый компонент | • цитоплазма • цитозоль • мембрана • митохондриальное межмембранное пространство • митохондрия • проекция нейрона • ядро • комплекс I дыхательной цепи митохондрий • эндоплазматический ретикулум • мембранный рафт • хроматин • внеклеточная экзосома • плазматическая мембрана • митохондриальный матрикс • тело клетки • тело PML • пресинапс • перинуклеарное область цитоплазмы • аксон • нуклеоплазма
|
---|
Биологический процесс | • негативная регуляция процесса апоптоза нейронов • позитивная регуляция связывания ДНК регуляторной области транскрипции • негативная регуляция сумоилирования белка • негативная регуляция активности эндопептидазы цистеинового типа, участвующей в апоптотическом сигнальном пути • негативная регуляция связывания белков • синаптическая передача, дофаминергическая • позитивная регуляция выработки интерлейкина-8 • негативная регуляция протеасомного убиквитин-зависимого катаболического процесса протеина • передача сигнала Ras протеина • клеточный ответ на глиоксаль • негативная регуляция ацетилирования протеина • позитивная регуляция процесса биосинтеза активных форм кислорода • позитивная регуляция разобщающей активности окислительного фосфорилирования • положительная регуляция передачи сигналов протеинкиназы B • негативная регуляция катаболического процесса белка • двигательное поведение взрослых • регуляция процесса апоптоза нейронов • негативная регуляция внешнего апоптотического сигнального пути • негативная регуляция гибели клеток • процесс биосинтеза гликолата • позитивная регуляция активности гомодимеризации белков • негативная регуляция экспрессии генов • однократное оплодотворение • позитивная регуляция фосфорилирования пептидил-серина • позитивная регуляция митохондриального транспорта электронов, НАДН в убихинон • негативная регуляция индуцированной перекисью водорода внутренней апоптотической сигнализации нейронов пути • негативная регуляция окислительного стресс-индуцированной гибели клеток • воспалительная реакция • отрицательное регулирование оксидативный стресс-индуцированной нейрон внутренней апоптическая сигнального пути • регулирование надмолекулярной организации волокон • негативной регуляции смерти нейронов • негативной регуляции фосфорилирования белка • негативной регуляции эндоплазматический Внутренний апоптотический сигнальный путь, вызванный стрессом ретикулума • негативная регуляция активности протеинкиназы • негативная регуляция гибели нейронов, вызванной окислительным стрессом • деполяризация мембраны • стабилизация протеина • организация митохондрий • положение TIVE регуляция ДНК-связывающий фактор транскрипции активности • отрицательное регулирование смерти индуцирующей сигнализации сложной сборки • негативной регуляции апоптоз процесс • протеолиз • отрицательное регулирование белка K48-сшитый deubiquitination • допамин поглощение участвует в синаптической передаче • положительной регуляции тирозина 3- активность монооксигеназы • позитивная регуляция активности L-допа декарбоксилазы • негативная регуляция гибели нейронов, вызванная перекисью водорода • регуляция воспалительного ответа • регуляция сигнального пути рецептора андрогена • негативная регуляция гибели клеток, вызванная пероксидом водорода • позитивная регуляция аутофагии митохондрий • реакция на перекись водорода • детоксикация иона меди • позитивная регуляция активности супероксиддисмутазы • позитивная регуляция процесса биосинтеза дофамина • позитивная регуляция локализации белка в ядре • позитивная регуляция процесса биосинтеза L-допа • активация протеинкиназы B acti жизнеспособность • гиперполяризация мембраны • детоксикация иона ртути • негативная регуляция TRAIL-активируемого апоптотического сигнального пути • клеточная детоксикация окислителей • негативная регуляция активности убиквитин-специфической протеазы • аутофагия • клеточный ответ на реактивные формы кислорода • регуляция мембранного потенциала митохондрий • негативная регуляция убиквитинирования белков • метаболический процесс перекиси водорода • положительная регуляция экспрессии генов • отрицательная регуляция экспорта белка из ядра • негативная регуляция активности убиквитин-протеинтрансферазы • позитивная регуляция индуцированного окислительным стрессом внутреннего апоптотического сигнального пути • клеточный ответ на окислительный стресс • позитивная регуляция активности рецепторов андрогенов • позитивная регуляция пирролин-5-карбоксилата редуктазы • положительного регулирование транскрипции РНК - полимераза II • клеточного ответ на перекиси водород • метилглиоксаля процесс обмена веществ • лактат биосинтетического процесса • пептидил-цистеин deglycation • пептидил-аргинин deglycation • пептидил-лизин deglycation • deglycation белка, глиоксальте удаление • белка deglycation, Удаление метилглиоксаля • дегликация глутатиона • метаболический процесс глиоксала • негативная регуляция внутреннего апоптотического сигнального пути, вызванного нитрозативным стрессом • позитивная регуляция острого воспалительного ответа на антигенный стимул • дегликозилирование белка • позитивная регуляция активности NAD (P) H оксидазы у • репарации ДНК • клеточный ответ на повреждение ДНК стимул • инсулина секреции • гомеостаза глюкозы • гуанин deglycation • гуанин deglycation, метилглиоксаля удаление • гуанин deglycation, глиоксаль удаление • отрицательное регулирование активных форм кислорода биосинтетических процессов
|
---|
Источники: Amigo / QuickGO |
|
Ортологи |
---|
Разновидность | Человек | Мышь |
---|
Entrez | | |
---|
Ансамбль | | |
---|
UniProt | | |
---|
RefSeq (мРНК) | | |
---|
RefSeq (белок) | | |
---|
Расположение (UCSC) | Chr 1: 7.95 - 7.99 Мб | Chr 4: 150.9 - 150.91 Мб |
---|
PubMed поиск | [3] | [4] |
---|
Викиданные |
Просмотр / редактирование человека | Просмотр / редактирование мыши |
|
Ген
Ген PARK7 , также известный как DJ-1 , кодирует белок семейства пептидаз C56. Ген человека PARK7 имеет 8 экзонов и расположен в полосе хромосомы 1p36.23. [5]
Протеин
Человеческий белок дегликаза DJ-1 имеет размер 20 кДа и состоит из 189 аминокислот с семью β-цепями и девятью α-спиралями в целом и присутствует в виде димера . [6] [7] [8] Он принадлежит к семейству белков пептидазы C56.
Белковые структуры человеческого белка DJ-1, шаперона Escherichia coli Hsp31, YhbO и YajL и протеазы архей эволюционно консервативны. [9]
В окислительных условиях белок дегликаза DJ-1 ингибирует агрегацию α-синуклеина за счет своей шаперонной активности [10] [11], таким образом, функционируя как окислительно-восстановительный шаперон и как датчик окислительного стресса . Соответственно, DJ-1, по-видимому, защищает нейроны от окислительного стресса и гибели клеток. [5] Параллельно, белок DJ-1 действует как положительный регулятор транскрипции, зависимой от андрогенных рецепторов . DJ-1 экспрессируется как в нервной сетчатке, так и в пигментном эпителии сетчатки у млекопитающих, где он играет нейропротекторную роль против окислительного стресса как в физиологических, так и в патологических условиях. [12] [13]
Было показано, что пирролохинолинхинон (PQQ) снижает самоокисление белка DJ-1, что является ранней стадией начала некоторых форм болезни Паркинсона . [14]
Было показано, что функциональный белок DJ-1 связывает металлы и защищает от металлической цитотоксичности со стороны меди и ртути . [15]
Дефекты этого гена являются причиной аутосомно-рецессивной болезни Паркинсона с ранним началом 7. [5] [16]
Было показано, что PARK7 взаимодействует с:
- КАСКА , [17]
- EFCAB6 , [18] и
- PIAS2 . [19]
- Обзор всей структурной информации, доступной в PDB для UniProt : Q99497 (белок / нуклеиновая кислота дегликаза DJ-1) в PDBe-KB .
Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , который находится в общественном достоянии .