Darwin Core (часто сокращенно DwC ) - это расширение Dublin Core для информатики биоразнообразия . Он предназначен для обеспечения стабильного стандартного справочника для обмена информацией о биологическом разнообразии. [1] Термины, описанные в этом стандарте, являются частью более широкого набора словарей и технических спецификаций, разрабатываемых и поддерживаемых Стандартами информации о биоразнообразии (TDWG) (ранее известными как Рабочая группа по таксономическим базам данных (TDWG)).
Описание [ править ]
Ядро Дарвина - это совокупность стандартов, предназначенных для облегчения обмена информацией о биологическом разнообразии . DwC включает глоссарий терминов и документацию, содержащую справочные определения, примеры и комментарии. Обзор принятых в настоящее время терминов и концепций можно найти в кратком справочном руководстве Darwin Core, поддерживаемом TDWG .
Оперативное подразделение DwC в первую очередь основано на таксонах , их встречаемости в природе, задокументированной наблюдениями, образцами и образцами, а также связанной с ними информацией. В стандарт включены документы, описывающие, как эти термины управляются, как набор терминов может быть расширен для новых целей и как эти термины могут использоваться.
Каждый термин DwC включает определение и обсуждения, предназначенные для содействия последовательному использованию этих терминов в разных приложениях и дисциплинах. В других контекстах такие термины могут называться свойствами, элементами, полями, столбцами, атрибутами или концепциями. Хотя типы данных и ограничения не указаны в определениях терминов, даны рекомендации о том, как ограничить значения там, где это необходимо, например, предлагая использовать контролируемые словари .
Стандарты DwC имеют версии и постоянно развиваются, и рабочие группы часто добавляют в документацию практические примеры, в которых обсуждаются, уточняются и расширяются нормативные определения каждого термина. Такой подход к документации позволяет стандарту адаптироваться к новым целям, не нарушая работу существующих приложений.
На практике Darwin Core отделяет определение и семантику отдельных терминов от применения этих терминов в различных технологиях. Darwin Core предоставляет отдельные инструкции о том, как кодировать термины как RDF, [2] XML [3] или текстовые файлы. [4]
Простой Дарвин Ядро [5] является спецификацией для одного конкретного способа использования терминов и для данных акций о таксонов и их вхождения в строго структурированным способом. Вероятно, это имелось в виду, если бы кто-то предложил «форматировать ваши данные в соответствии с Ядром Дарвина».
История [ править ]
Darwin Core был первоначально создан как профиль Z39.50 Группой разработчиков биологии Z39.50 (ZBIG) при поддержке гранта Национального научного фонда США. [6] Название «Дарвинское ядро» было впервые придумано Алленом Эллисоном на первом заседании ZBIG, проведенном в Канзасском университете в 1998 году, когда он комментировал концептуальное сходство профиля с Dublin Core. Профиль Darwin Core был позже выражен как документ схемы XML для использования протоколом распределенного поиска общей информации (DiGIR). Для пересмотра Darwin Core была создана рабочая группа TDWG , а 9 октября 2009 года был официально выпущен ратифицированный стандарт метаданных.
Хотя с тех пор Darwin Core ратифицирован в качестве стандарта TDWG / Biodiversity Information Standards , у него было множество предыдущих версий, используемых в производстве. Опубликованный стандарт содержит нормативный список терминов [7] с полной историей версий терминов, ведущих к текущему стандарту.
Имя | Пространство имен | Количество терминов | Схема XML | Дата выпуска |
---|---|---|---|---|
Ядро Дарвина 1.0 | Непригодный | 24 | (Z39.50 GRS-1) | 1998 г. |
Darwin Core 1.2 (классический) | http://digir.net/schema/conceptual/darwin/2003/1.0/ [8] | 46 | [6] | 2001-09-11 |
Darwin Core 1.21 (MaNIS / HerpNet / ORNIS / FishNet2) | http://digir.net/schema/conceptual/darwin/2003/1.0/ [9] | 63 | [7] | 2003-03-15 |
Darwin Core OBIS | http://www.iobis.org/obis/ [10] | 27 | [8] | 2005-07-10 |
Darwin Core 1.4 (проект стандарта) | http://rs.tdwg.org/dwc/dwcore/ [11] | 46 | [9] | 2007-04-23 |
Базовый стандарт Дарвина | http://rs.tdwg.org/dwc/terms/ | 169 | [10] | 2009-10-09 |
Ключевые проекты с использованием Darwin Core [ править ]
- Глобальный информационный фонд по биоразнообразию (GBIF) [12]
- Система Ocean Биогеографической Информация (ОБИС) [13]
- Атлас живой Австралии (ALA)
- Интернет-зоологические коллекции австралийских музеев (OZCAM) [ мертвая ссылка ]
- Сетевая информационная система по млекопитающим (MaNIS)
- Орнитологическая информационная система (ORNIS)
- FishNet 2
- VertNet
- Canadensys
- Sistema Nature 3.0
- Энциклопедия жизни
- Интегрированные оцифрованные биоколлекции (iDigBio) [14] [15]
См. Также [ править ]
- Архив Дарвина
- Стандартные спецификации Darwin Core - репозиторий GitHub, где активно поддерживается DwC [16]
- Стандарты информации о биоразнообразии (TDWG)
- Биоразнообразие
- Информатика биоразнообразия
- Стандарты метаданных
Ссылки [ править ]
- ^ Wieczorek, Джон; Д. Блум; Р. Гуралник; С. Блюм; М. Деринг; Р. Де Джованни; Т. Робертсон; Д. Вьегле (2012). «Ядро Дарвина: развивающийся стандарт данных о биоразнообразии, разработанный сообществом» . PLoS ONE . 7 (1): e29715. Bibcode : 2012PLoSO ... 729715W . DOI : 10.1371 / journal.pone.0029715 . PMC 3253084 . PMID 22238640 .
- ^ Руководство Darwin Core XML
- ^ Руководство Darwin Core XML
- ^ Руководство по основному тексту Дарвина
- ^ Простое ядро Дарвина
- ^ Экспериментальный стенд протокола поиска информации Z39.50 для сбора биологических и таксономических данных, № 9811443 [1]
- ^ Список нормативных терминов Darwin Core
- ^ Дарвин Ядро 1.2 [2]
- ^ Дарвин Ядро 1,21 [3]
- ^ Дарвин Core OBIS [4]
- ^ Ядро Дарвина 1.4 [5]
- ^ "Ядро Дарвина" . Глобальный информационный фонд по биоразнообразию . Архивировано из оригинального 12 апреля 2011 года . Проверено 12 апреля 2011 года . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
- ^ «Схема данных и метаданные» . Биогеографическая информационная система океана . Архивировано из оригинала 8 октября 2010 года . Проверено 12 апреля 2011 года . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
- ^ «Руководство по загрузке данных» . iDigBio . Проверено 26 сентября 2016 года . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
- ^ «Распространение ваших данных: публикация данных и стандарты данных с iDigBio» . iDigBio . Проверено 26 сентября 2016 года . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
- ^ Целевая группа Darwin Core, Стандарты информации о биоразнообразии (TDWG) (2014-11-08), Darwin Core: 2014-11-08 , doi : 10.5281 / zenodo.592792 , получено 22.10.2020
Внешние ссылки [ править ]
- Краткое справочное руководство Darwin Core
- Сайт разработки ядра Дарвина
- Официальный веб-сайт Darwin Core
- Краткое изложение Darwin Core