Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Информационная система по биоразнообразию океана
Тип сайтаИнтернет-система данных и информации
Доступно ванглийский
URLwww.obis.org
Коммерческийнет
Постановка на учетне требуется
ЗапущенМарт 2002 г.
Текущий статусактивный
OBIS записи для океана Санфиш , Мола Мола , как в июле 2018 года, визуализируется OBIS картографа (www.obis.org)

Информационная система по биоразнообразию океанов ( OBIS ), ранее Ocean Биогеографической информационная система , представляет собой веб-точка доступа к информации о распределении и численности живых видов в океане . Он был разработан как компонент управления информацией десятилетней переписи морской флоры и фауны.(CoML) (2001-2010), но не ограничивается данными, полученными из CoML, и направлен на обеспечение комплексного обзора всех данных о морском биоразнообразии, которые могут быть предоставлены ему в открытом доступе соответствующими хранителями данных. Согласно информации на его веб-сайте по состоянию на июль 2018 года, ОБИС «является глобальным центром обмена данными и информацией с открытым доступом по морскому биоразнообразию для науки, сохранения и устойчивого развития». На сайте ОБИС перечислены 8 конкретных целей, главная из которых состоит в том, чтобы «обеспечить [] крупнейшую в мире базу научных знаний о разнообразии, распространении и численности всех морских организмов в интегрированном и стандартизированном формате». [1]

История и текущий статус [ править ]

Первоначальные идеи для ОБИС были разработаны на совещании CoML по бентической (донной) океанской жизни в октябре 1997 года. Рекомендации этого семинара привели к созданию веб-сайта ( http://marine.rutgers.edu/OBIS ) в Рутгерсе в 1998 году для продемонстрировать исходную концепцию ОБИС. [2] Первый международный семинар ОБИС был проведен 3-4 ноября 1999 г. в Вашингтоне, округ Колумбия, в результате чего был определен объем проекта и установлены контакты с потенциальными партнерами, а отдельные статьи опубликованы в специальном выпуске журнала « Океанография » [3] в рамках которой основатель ОБИС доктор Дж. Ф. Грасслсформулировал видение ОБИС как «онлайнового всемирного атласа для доступа, моделирования и картирования морских биологических данных в многомерном географическом контексте». [4] В мае 2000 года правительственные агентства США в рамках Национальной программы океанографического партнерства вместе с Фондом Альфреда П. Слоана профинансировали восемь исследовательских проектов для инициирования ОБИС. В мае 2001 года Национальный научный фонд США профинансировал Университет Рутгерса разработку глобального портала для ОБИС. Также в 2001 г. был сформирован Международный комитет ОБИС, первое заседание которого состоялось в августе 2001 г. [5]

Производственная версия портала OBIS была запущена в Университете Рутгерса в 2002 году как веб-сайт http://www.iobis.org , обслуживающий 430 000 записей данных с привязкой к видам из 8 партнерских баз данных, включая записи о рыбах из FishBase , головоногих из CephBase , кораллы из биогеоинформатики гексакоралов , моллюски из базы данных индо-тихоокеанских моллюсков и многое другое. [6] К маю 2006 года портал ОБИС смог получить доступ к 9,5 миллионам записей о 59 000 видов из 112 баз данных [7], а к декабрю 2010 года (по завершении переписи морской флоры и фауны) предоставил доступ к 27,7 миллионам записей, представляющих 167 000 названия таксонов. [8]По состоянию на июль 2018 года на веб-сайте ОБИС указано, что система обеспечивает доступ к более чем 45 миллионам наблюдений почти за 120 000 морских видов (сокращение числа названий является результатом разрешения синонимов, то есть сокращения таксонов, зарегистрированных под несколькими названиями, до одного принятое название) на основе взносов 500 организаций из 56 стран. [9]

В 2009 г. ОБИС был принят как проект в рамках программы Международного обмена океанографическими данными и информацией (МООД) Межправительственной океанографической комиссии (МОК) ЮНЕСКО, а в 2011 г. с прекращением финансирования секретариата и портала в Рутгерсе со стороны Фонда Слоуна. , предложение о размещении Морским институтом Фландрии (VLIZ) в Остенде , Бельгиябыл принят в качестве долгосрочного хоста для системы, а также секретариат ОБИС был переведен из Университета Рутгерса в Проектный офис МОК для МООД в Остенде, откуда в настоящее время ОБИС обслуживается и ведется дополнительная разработка без изменения веб-адреса. Таким образом, теперь ОБИС находится в Остенде, в том же здании, где находится ВЛИЗ. VLIZ поддерживает две таксономические базы данных, Всемирный регистр морских видов и IRMNG , Временный регистр морских и неморских родов.оба из них используются в таксономических решениях, используемых для управления отображением информации о видах в OBIS, а также обеспечивают таксономическую иерархию, с помощью которой можно перемещаться по содержимому OBIS. ОБИС в настоящее время находится под руководством МООД при поддержке руководящей группы, Руководящей группы МООД по ОБИС (SG-OBIS); Оперативная деятельность направляется Исполнительным комитетом ОБИС (ОБИС-ЕС) при поддержке 6 рабочих групп ОБИС. Секретариат ОБИС, расположенный в проектном офисе ЮНЕСКО / МОК для МООД в Остенде (Бельгия), включает менеджера проекта ОБИС и менеджера данных и, помимо обслуживания системы ОБИС, также обеспечивает обучение и техническую помощь поставщикам данных, направляет новые данные стандарты и технические разработки, а также поощряет международное сотрудничество для повышения групповых преимуществ сети.[10]

Данные, доступные через OBIS, охватывают все группы организмов, которые имеют какое-либо отношение к морским или устьевым местообитаниям, включая береговые линии и атмосферу над океаном, таких как морские позвоночные (рыбы, морские млекопитающие, черепахи, морские птицы и т. Д.); морские беспозвоночные (включая зоопланктон ); морские бактерии ; и морские растения (например, фитопланктон, водоросли, мангровые заросли).

Портал ОБИС [ править ]

По мере развития доступных веб-технологий портал ОБИС прошел ряд итераций с момента его создания в 2002 году. Первоначально система извлекала удаленные данные в режиме реального времени в ответ на запрос пользователя и использовала KGS Mapper для визуализации результатов. В 2004 году были введены централизованное индексирование и кеширование метаданных, что привело к более быстрым и надежным результатам, а к параметрам визуализации данных был добавлен преобразователь c-squares . [11] В 2010 году впервые была представлена ​​полноценная веб- система на основе ГИС вместе с новой версией веб-сайта, которая привела к значительно более подробному и гибкому представлению результатов поиска, а также к ряду новых параметров поиска. [12]В апреле 2018 года было объявлено о финансировании разработки новой версии OBIS «2.0» с улучшенными возможностями., [13] и выпущена 29 января 2019 года. [14] URL-адрес веб-сайта изменен с iobis.org на obis.org.

Региональные узлы ОБИС [ править ]

За период с 2004 г. по настоящее время также была создана международная сеть региональных узлов OBIS , которые облегчают подключение источников данных в их регионе к главной сети данных OBIS, а также все чаще предоставляют специализированные услуги или просмотр данных OBIS пользователям в их конкретный регион.

  • Антарктический ОБИС
Организаторы Бельгийской платформы биоразнообразия, Брюссель, и Морского института Фландрии , Остенде. Под управлением Бруно Даниса
  • Аргентина
Организатор: Centro Nacional Patagonico - (CENPAT) - CONICET. Под управлением Мирты Льюис
  • Австралия
Организатор - Организация научных и промышленных исследований Содружества - океаны и атмосфера. Под управлением Дэйва Уоттса
  • Канада
Организаторы - Центр морского биоразнообразия и Бедфордский институт океанографии. Под управлением Боба Брантона
  • Китай
Организатор - Институт океанологии. Управляется Сунь Сяося
  • Европа
Организатор Vlaams Instituut voor de Zee . Управляется Уордом Аппельтансом
  • Индийский океан
Организаторы - Национальная химическая лаборатория и Национальный институт океанографии. Под управлением Бабы Инголе
  • Япония
Организатор - Национальный институт экологических исследований. Под управлением Джунко Шимура
  • Новая Зеландия / юго-западная часть Тихого океана
Организатор - Национальный институт водных и атмосферных исследований. Под управлением Дона Робертсона
  • К югу от Сахары
Размещено Южноафриканским центром данных по океанографии. Управляется Мартеном Грундлингом
  • Филиппины
Организатор - Центр биоразнообразия АСЕАН. Под управлением Кристиана Эллорана
  • Тропический и субтропический восток южной части Тихого океана
Организатор - Университет Консепсьона. Под управлением Рубена Эскрибандо
  • Тропический и субтропический Западная Южная Атлантика
Организаторы: Университет Сан-Паулу (USP) и Справочный центр экологической информации (CRIA. Управляется Фабио Ланг Да Силвера)
  • Соединенные Штаты Америки
Размещено Геологической службой США (USGS). Под управлением Марка Форнуолла

См. Также [ править ]

  • Перепись морской жизни
  • Всемирный регистр морских видов (WoRMS)

Избранные публикации об ОБИС [ править ]

  • Грассл, Дж. Ф. и Стокс, К. И., 1999. Глобальная океаническая биогеографическая информационная система (ОБИС) для переписи морской жизни. Океанография 12 (3), стр. 12-14.
  • Грассл, Дж. Ф. 2000. Биогеографическая информационная система океана (ОБИС): он-лайн всемирный атлас для доступа, моделирования и картирования морских биологических данных в многомерном географическом контексте. Океанография 13 (3), стр. 5-7.
  • Чжан Ю. и Грассл Дж. Ф. 2003. Портал океанской биогеографической информационной системы. Oceanologica Acta 25 (5), стр. 193–197.
  • Марк Дж. Костелло, Дж. Фредерик Грассл, Юньцин Чжан, Карен Стокс и Эдвард Ванден Берг, 2005. Где есть что и что где? Онлайн-картография морских видов. Информационный бюллетень MarBEF . Весна 2005 г., стр. 20–22.
  • Вуд Дж. Б., Чжан, П. Я., Костелло, М. Дж. И Грассл, Дж. Ф. 2006. Введение в ОБИС, www.iobis.org. В: Милославич П. и Кляйн Э. (ред.), Карибское морское биоразнообразие: известное и неизвестное. DEStech Publications Inc., Ланкастер, Пенсильвания, США, стр. 253–254.
  • Костелло MJ, Stocks K., Zhang Y., Grassle JF, Fautin DG 2007. О системе океанской биогеографической информации. Получено с http://hdl.handle.net/2292/5236
  • Эдвард Ванден Берге, Карен И. Стокс и Дж. Фредерик Грассл. 2010. Интеграция данных: Биогеографическая информационная система океана. Глава 17 (стр. 333-353) в Аласдер Д. Макинтайр (ред.): Жизнь в Мировом океане. Глава Blackwell Publishing Ltd. также доступна по адресу http://www.comlmaps.org/mcintyre/ch17/data-integration-the-ocean-biogeographic-information-system .
  • Ванден Берге Э., Халпин П., Ланг да Силвейра Ф., Стокс К. и Грассл Ф. 2010. Интеграция биологических данных в системы наблюдения за океаном: будущая роль ОБИС. В Hall J, Harrison DE, and Stammer D. (eds) Proceedings of OceanObs'09: Устойчивые наблюдения за океаном и информация для общества (том 2). Париж, Публикация Европейского космического агентства № WPP-306.
  • Костелло MJ, Vanhoorne B., Appeltans W. 2015. Продвижение сохранения биоразнообразия с помощью таксономии, публикации данных и совместной инфраструктуры. Биология сохранения 29 (4), 1094–1099.

Ссылки [ править ]

  1. ^ Веб-сайт ОБИС (посещение 18 июля 2018 г.)
  2. ^ Грассл, Дж. Ф. и Стокс, К. И., 1999. «Глобальная океаническая биогеографическая информационная система (ОБИС) для переписи морской жизни». Океанография 12 (3): 12-14.
  3. ^ Океанография Том 13, вып. 3 ноября 2000 г. Специальный выпуск: Океанская биогеографическая информационная система.
  4. ^ Грассл, Дж. Ф. 2000. «Биогеографическая информационная система океана (ОБИС): он-лайн всемирный атлас для доступа, моделирования и картирования морских биологических данных в многомерном географическом контексте». Океанография 13 (3): 5-7.
  5. ↑ Zhang, Y. and Grassle, JF 2003. «Портал океанской биогеографической информационной системы». Oceanologica Acta 25 (5): 193-197.
  6. ^ "www.iobis.org: архивная версия, 20 марта 2002 г." . Архивировано 20 марта 2002 года . Проверено 20 марта 2002 года .
  7. ^ "www.iobis.org: архивная версия, 2 мая 2006 г." . Архивировано 2 мая 2006 года . Проверено 2 мая 2006 года .
  8. ^ www.obis.org: архивная версия, 13 декабря 2010 г.
  9. ^ Об ОБИС: архивная версия, 5 июля 2018 г.
  10. ^ Об ОБИС: Управление
  11. ^ Тони Рис и Фиби Чжан, 2007. «Развитие концепций в архитектуре и функциональности OBIS, океанской биогеографической информационной системы». в Vanden Berghe, E. et al. (ред.) Proceedings of Ocean Biodiversity Informatics: международная конференция по управлению данными морского биоразнообразия, Гамбург, Германия, 29 ноября - 1 декабря 2004 г. Отчет семинара МОК, 202, Специальная публикация 37 VLIZ: стр. 167-176.
  12. ^ Эй Фудзиока и др. , 2012. «Развитие глобальных исследований морской биогеографии с помощью программного обеспечения ГИС с открытым исходным кодом и облачных вычислений». Транзакции в ГИС 16 (2): 143–160.
  13. ^ «МОК инвестирует в OBIS2.0, крупную модернизацию платформы OBIS» ,
  14. ^ "Выпущен ОБИС 2.0" ,

Внешние ссылки [ править ]

Международный портал ОБИС [ править ]

  • Международный портал ОБИС

Региональные узлы ОБИС [ править ]

  • AfrOBIS: африканский узел OBIS к югу от Сахары
  • EurOBIS: европейский узел OBIS
  • Индобис: узел OBIS в Индийском океане
  • ОБИС Австралия: австралийский региональный узел ОБИС
  • ОБИС Китай: китайский региональный узел ОБИС
  • OBIS Юго-западная часть Тихого океана: региональный узел Юго-западной части Тихого океана OBIS
  • СКАР-МарБИН: Информационная сеть по морскому биоразнообразию Антарктики
  • SEAOBIS: узел OBIS в Юго-Восточной Азии
  • ОБИС в США: региональный узел ОБИС в США
  • ОБИС Канада: канадский региональный узел ОБИС

Тематические узлы [ править ]

  • OBIS-SEAMAP (Информационная система по биоразнообразию океана - пространственный экологический анализ популяций мегапозвоночных)

Родительский проект [ править ]

  • Домашняя страница Census of Marine Life

История [ править ]

  • Оригинальный прототип портала ОБИС (около 2000 г.)
  • Из архивов: Эволюция портала ОБИС с 2002 г. по настоящее время.