Дэвид Кленерман | |
---|---|
Родившийся | Сентябрь 1959 г. (61 год) [1] |
Национальность | Британский |
Альма-матер | Кембриджский университет (магистр, доктор философии) |
Известен | Секвенирование красителей Illumina Сканирующая микроскопия ионной проводимости Микроскопия сверхвысокого разрешения Solexa |
Награды |
|
Научная карьера | |
Поля | Биофизическая химия |
Учреждения | Кембриджский университет Стэнфордского университета |
Тезис | Инфракрасная хемилюминесценция на спектрометре SISAM (1985 г.) |
Докторант | Ян Уильям Мерисон Смит |
Другие научные консультанты | Ричард Заре |
Интернет сайт | klenermangroup |
Сэр Дэвид Klenerman FRS FMedSci [3] [4] (1959 года рождения) является британский биофизических химик и профессор биофизической химии в кафедре химии в Кембриджском университете [5] и сотрудник в колледже Христа в Кембридже . [6] Он наиболее известен своим вкладом в области секвенирования ДНК следующего поколения (что впоследствии привело к Solexa , компании по высокоскоростному секвенированию ДНК, которую он соучредителем), [1] [7] [8] [9] [10] на основе нанопипетоксканирования ионно-проводимости микроскопии , [11] [12] и супер-разрешением микроскопии . [13]
Образование [ править ]
Klenerman получил образование в Кембриджском университете , где он был студентом из Черчилль - колледжа в Кембридже и получил его BA степень в 1982 г. [14] Он получил докторскую степень по химии в 1986 году в качестве аспиранта Черчилль - колледжа в Кембридже и был под руководством Яна Уильяма Мерисона Смита . [15] [2] [14]
Карьера и исследования [ править ]
После получения докторской степени Кленерман поступил в Стэнфордский университет в качестве стипендиата программы Фулбрайта, чтобы работать с Ричардом Заре над химией высоких обертонов . После докторантуры в Стэнфорде он вернулся в Соединенное Королевство, чтобы проработать семь лет в BP Research. Затем, в 1994 году, он поступил в Кембриджский университет в качестве преподавателя кафедры химии и научного сотрудника колледжа Христа. [2] [14] [16]
Кленерман вместе с Шанкаром Баласубраманианом изобрели метод секвенирования ДНК следующего поколения, который сегодня широко известен как секвенирование Solexa или секвенирование красителя Illumina . [7] [9] Метод основан на обнаружении нуклеотидов, меченных флуорофором, по мере их включения в цепи ДНК . [17] Этот метод секвенирования путем синтеза приобрел популярность [18] [19] и в настоящее время считается наиболее широко используемой платформой для замены обычного секвенирования по Сэнгеру.Несмотря на его сравнительно низкую способность к мультиплексированию образцов, он предлагает несколько ключевых преимуществ: он автоматизирован, быстр, высокоточен, способен секвенировать несколько цепей одновременно с помощью массивного параллельного секвенирования и экономически дешевле в случае секвенирования всего генома. [20] [21] [22]
Он также известен тем, что исследует методы сканирующей ионно-проводящей микроскопии на основе нанопипеток (вместо обычных микропипеток) . [11] [23] Его исследовательская группа преуспела в получении топографических изображений живых клеток с очень высоким разрешением, в скачкообразной визуализации, в точной доставке малых молекул в клетку и в изучении детального функционирования клеток в реальном времени. [12] [24] [25]
Совсем недавно его группа сосредоточилась на трехмерной микроскопии сверхвысокого разрешения, чтобы разработать новые идеи о неправильном сворачивании белков и нейродегенеративных заболеваниях . [13]
Коммерческая деятельность [ править ]
Кленерман и Шанкар Баласубраманиан коммерциализировали свое изобретение по высокоскоростному секвенированию ДНК на основе флуоресценции одной молекулы и в 1998 году совместно основали Solexa . Позже, в 2007 году, эта компания была приобретена Illumina за 600 миллионов долларов. [7] [26] [27] [28] [29]
В 2004 году Кленерман стал соучредителем другой дочерней компании, Ionscope, для поставки собранных сканирующих микроскопов ионной проводимости исследовательскому сообществу, которое ищет 3D-изображения живых клеток с высоким разрешением. По данным Исследовательского совета биотехнологии и биологических наук , по состоянию на февраль 2014 года Ionscope продала 35 устройств SICM по всему миру. [30]
Награды и награды [ править ]
Основные награды и награды, полученные Кленерманом за свою исследовательскую работу:
- 2007 награжден междисциплинарной премией RSC от Королевского химического общества . [2]
- В 2008 году прочитал лекцию Британского биофизического общества в Университетском колледже Дублина . [31]
- 2012 избран членом Королевского общества (FRS). [3]
- 2015 избран членом Академии медицинских наук (FMedSci). [4]
- 2018 награжден Королевской медалью в Королевское общество . [32]
- 2019 рыцарское в 2019 Новый год с отличием за заслуги в области науки и развития высокой скорости технологии секвенирования ДНК [33]
Ссылки [ править ]
- ^ a b «Дэвид КЛЕНЕРМАН - личные встречи (бесплатная информация от Companies House)» . beta.companieshouse.gov.uk .
- ^ a b c d «Победитель междисциплинарной премии 2007 года» . Королевское химическое общество . Проверено 26 января +2016 .
- ^ а б "Дэвид Кленерман: Королевское общество" . Справочник научных сотрудников . Королевское общество . Проверено 26 января +2016 .
- ^ a b "Сотрудник: Академия медицинских наук" . Академия медицинских наук, Соединенное Королевство . Проверено 26 января +2016 .
- ^ "Профессор Дэвид Кленерман FMedSci FRS" . Химический факультет Кембриджского университета . Кембриджский университет . Проверено 26 января +2016 .
- ^ "Профессор Дэвид Кленерман" . Колледж Христа, Кембридж . Проверено 26 января +2016 .
- ^ a b c "История секвенирования Illumina" . Иллюмина . Проверено 26 января +2016 .
- ↑ Дэвис, Кевин (7 сентября 2010 г.). Геном за 1000 долларов . Свободная пресса . стр. 102 -115. ISBN 978-1416569596. Проверено 26 января +2016 .
- ^ a b Бентли, ДР; Баласубраманян, S; Swerdlow, HP; и другие. (6 ноября 2008 г.). «Точное секвенирование всего человеческого генома с использованием химии обратимых терминаторов» . Природа . 456 (7218): 53–59. Bibcode : 2008Natur.456 ... 53В . DOI : 10,1038 / природа07517 . PMC 2581791 . PMID 18987734 .
- ^ "История Solexa" . Bio-IT World (сентябрь – октябрь 2010 г.). 28 сентября 2010 . Проверено 26 января +2016 .
- ^ a b «Нанесение рисунков показывает силу пипетки» . BBC News . 5 сентября 2006 . Проверено 26 января +2016 .
- ^ a b «Рисование с ДНК: Нанопипетка позволяет подавать биомолекулы на поверхность под напряжением» . Новости химии и машиностроения . 83 (44). Американское химическое общество . 31 октября 2005 . Проверено 26 января +2016 .
- ^ a b Ад, Стефан В .; Sahl, Steffen J .; Бейтс, Марк; Чжуан, Сяовэй; Хайнцманн, Райнер; Бут, Мартин Дж .; Беверсдорф, Йорг; Штенгель, Глеб; Гесс, Харальд; Тиннефельд, Филипп; Хонигманн, Альф; Якобс, Стефан; Теста, Илария; Cognet, Laurent; Лунис, Брахим; Эверс, Хельге; Дэвис, Саймон Дж .; Эггелинг, Кристиан; Кленерман, Дэвид; Виллиг, Катрин I .; Вичидомини, Джузеппе; Кастелло, Марко; Диаспро, Альберто; Кордес, Торбен; Штеффен Дж. Саль; Тиннефельд, Филипп; Кленерман, Дэвид; Катрин И. Виллиг (14 октября 2015 г.). «Дорожная карта микроскопии сверхвысокого разрешения на 2015 год». Журнал Physics D . 48 (44): 443001. arXiv : 1711.04999 . Bibcode : 2015JPhD ... 48R3001H .DOI : 10.1088 / 0022-3727 / 48/44/443001 . S2CID 4804015 .
- ^ а б в Анон (2017). «Кленерман, профессор Давид» . Кто есть кто . ukwhoswho.com (онлайн- издательство Oxford University Press ). A&C Black, отпечаток Bloomsbury Publishing plc. DOI : 10.1093 / WW / 9780199540884.013.266724 . ( требуется подписка или членство в публичной библиотеке Великобритании ) (требуется подписка)
- ^ Кленерман, Дэвид (1985). Инфракрасная хемилюминесценция на спектрометре SISAM . lib.cam.ac.uk (кандидатская диссертация). Кембриджский университет. OCLC 499899771 . EThOS uk.bl.ethos.355881 .
- ^ "Дэвид Кленерман избран ФРС" . Колледж Христа, Кембридж . Проверено 27 января +2016 .
- ^ Balasubramanian, Шанкар (4 мая 2011). «Секвенирование нуклеиновых кислот: от химии к медицине» . Химические коммуникации . 47 (26): 7281–7286. DOI : 10.1039 / c1cc11078k . PMC 3428630 . PMID 21544287 .
- Перейти ↑ Quail, Michael A (25 ноября 2008 г.). «Улучшения большого центра генома в системе секвенирования Illumina» . Методы природы . 5 (12): 1005–1010. DOI : 10.1038 / nmeth.1270 . PMC 2610436 . PMID 19034268 .
- ^ Cronn, Ричард (27 августа 2008). «Мультиплексное секвенирование геномов хлоропластов растений с использованием технологии Solexa« секвенирование путем синтеза »» . Исследования нуклеиновых кислот . 36 (19): e122. DOI : 10.1093 / NAR / gkn502 . PMC 2577356 . PMID 18753151 . Проверено 29 января +2016 .
- ^ Metzker, Michael L. (8 декабря 2009). «Технологии секвенирования - новое поколение». Природа Обзоры Генетики . 11 (1): 31–46. CiteSeerX 10.1.1.719.3885 . DOI : 10.1038 / nrg2626 . PMID 19997069 . S2CID 205484500 .
- ^ Петтерссон, Эрик; Лундеберг, Иоаким; Ахмадиан, Афшин (2009). «Поколения технологий секвенирования». Геномика . 93 (2): 105–111. DOI : 10.1016 / j.ygeno.2008.10.003 . PMID 18992322 .
- Перейти ↑ Quail, Michael A (24 июля 2012 г.). «Рассказ о трех платформах секвенирования следующего поколения: сравнение секвенсоров Ion Torrent, Pacific Biosciences и Illumina MiSeq» . BMC Genomics . 13 (341): 341. DOI : 10.1186 / 1471-2164-13-341 . PMC 3431227 . PMID 22827831 .
- ↑ Шевчук, Андрей I (2011). «Реализация биологического и биомедицинского потенциала наноразмерной визуализации с помощью пипеточного зонда». Наномедицина . 6 (3): 565–575. DOI : 10.2217 / nnm.10.154 . PMID 21542692 .
- ^ Чен, Цзяо-Чен; Чжоу, Йи; Бейкер, Лейн А. (2012). «Сканирующая микроскопия ионной проводимости». Ежегодный обзор аналитической химии . 5 (207): 207–228. Bibcode : 2012ARAC .... 5..207C . DOI : 10,1146 / annurev-anchem-062011-143203 . PMID 22524219 .
- ^ Бергнер, Стефан; Вацяян, Прити; Матысик, Франк-Майкл (2 мая 2013 г.). «Последние достижения в сканирующей электрохимической микроскопии с высоким разрешением живых клеток - обзор». Analytica Chimica Acta . 775 : 1–13. DOI : 10.1016 / j.aca.2012.12.042 . PMID 23601970 .
- ^ «Сокращение научного бюджета Великобритании было бы ложной экономией» . Financial Times . Nikkei . 18 июня 2013 . Проверено 27 января +2016 .
- ^ "600 миллионов долларов для фирмы ДНК" . Университетская . Проверено 27 января +2016 .
- ^ "Illumina покупает Solexa" . Forbes . 13 ноября 2006 . Проверено 27 января +2016 .
- ^ «Illumina купит Solexa за 600 миллионов долларов на складе» . The Wall Street Journal . 13 ноября 2006 . Проверено 27 января +2016 .
- ^ «Новая технология микроскопа позволяет получать изображения живых клеток» . BBSRC . Проверено 30 января 2016 года .
- ^ "Экскурсия по лекциям Британского биофизического общества" . Университетский колледж Дублина . Проверено 27 января +2016 .
- ^ Королевская медаль 2018
- ^ [1]