Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено с Solexa )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Illumina, Inc.
Illumina logo.svg
ТипОбщественные
Торгуется какNasdaq :  Компонент ILMN
NASDAQ-100 Компонент
S&P 500
ПромышленностьБиотехнологии
Основан1998 г.
Основатель
Штаб-квартира
Сан-Диего, Калифорния
,
нас
Ключевые люди
  • Фрэнсис де Соуза (президент и генеральный директор)
  • Джей Флэтли (исполнительный председатель)
  • Сэм Самад (финансовый директор)
ПродуктыNovaSeq 6000, HiSeq X, HiSeq 4000, MiSeq, MiSeqDx, MiniSeq, iSeq 100, NextSeq 550, NextSeq 550Dx, iScan
ДоходУвеличивать3,33 миллиарда долларов США (2018)
Операционная прибыльУвеличивать883 миллиона долларов США (2018)
Чистый доходУвеличивать826 миллионов долларов США (2018)
Количество работников~ 7,300
Веб-сайтwww .illumina .com
Сноски / ссылки
[1]

Illumina, Inc. - американская компания. Компания Illumina, основанная в апреле 1998 года, разрабатывает, производит и продает интегрированные системы для анализа генетических вариаций и биологических функций. Компания предоставляет линейку продуктов и услуг, которые обслуживают рынки секвенирования , генотипирования и экспрессии генов , а также протеомики . Штаб-квартира находится в Сан-Диего , Калифорния .

Технология Illumina имела предположительно к 2014 году снизить стоимость секвенирования в геном человека в США $ 1000 , по сравнению с цены в $ 1 млн в 2007 году [2] Клиенты включают геномные исследовательские центры, фармацевтические компании, научные учреждения, клинические исследовательские организации и биотехнологические компании .

История [ править ]

Чарник, Стуэльпнагель и Чи в офисе Illumina летом 1998 года.

Illumina была основана в апреле 1998 года Дэвидом Уолтом, Ларри Боком , Джоном Стуэльпнагелем, Энтони Чарником и Марком Чи. Работая с венчурной компанией CW Group, Бок и Стуэльпнагель раскрыли то, что станет технологией BeadArray [3] компании Illumina в Университете Тафтса, и договорились об эксклюзивной лицензии на эту технологию. В 1999 году Illumina приобрела Spyder Instruments (основанную Михалом Леблом, Ричардом Хаутеном и Юттой Эйхлер) за их технологию высокопроизводительного синтеза. Illumina завершила первичное публичное размещение акций в июле 2000 г. [4]

Компания Illumina начала предлагать услуги генотипирования по однонуклеотидному полиморфизму (SNP) в 2001 году и запустила свою первую систему Illumina BeadLab в 2002 году с использованием технологии GoldenGate Genotyping. В настоящее время Illumina предлагает продукты и услуги на основе микрочипов для расширяющегося диапазона секвенирования генетического анализа, включая генотипирование SNP, экспрессию генов и анализ белков . Технологии Illumina используются широким кругом академических, государственных, фармацевтических, биотехнологических и других ведущих учреждений по всему миру.

26 января 2007 года компания завершила сделку по приобретению британской компании Solexa, Inc. за ~ 650 миллионов долларов. [5] Solexa была основана в июне 1998 года Шанкаром Баласубраманианом и Дэвидом Кленерманом для разработки и коммерциализации технологии секвенирования генома, изобретенной основателями Кембриджского университета. Solexa INC была образована в 2005 году, когда Solexa Ltd превратилась в Lynx Therapeutics of Hayward . [6] Illumina также использует технологию секвенирования колоний ДНК, изобретенную в 1997 году Паскалем Майером и Лораном Фаринелли [7] и приобретенную Solexa в 2004 году у компании Manteia Predictive Medicine.. Он используется для выполнения ряда анализов, включая пересеквенирование всего генома, анализ экспрессии генов и анализ малой рибонуклеиновой кислоты (мРНК).

В июне 2009 года Illumina объявила о запуске своего собственного Личная Полный секвенирования геномов службы на глубине 30X за $ 48000 за геном, [8] , а через год упала цена до $ 19500. [9] [10] По состоянию на май 2011 года Illumina снизила цену до 4000 долларов. [11] [12]

До 2010 года Illumina продавала только инструменты с пометкой «только для исследовательских целей»; В начале 2010 года Illumina получила одобрение FDA на использование своей системы BeadXpress в клинических испытаниях. [13] [14] Это было частью стратегии компании в то время, чтобы открыть собственную лабораторию CLIA и начать предлагать собственное клиническое генетическое тестирование. [15]

Illumina приобрела Epicenter Biotechnologies, базирующуюся в Мэдисоне, штат Висконсин , 11 января 2011 года. [16] 25 января 2012 года Hoffmann-La Roche сделала незапрошенное предложение о покупке Illumina по цене 44,50 доллара за акцию или около 5,7 миллиарда долларов. [17] [18] « Рош» попробовала другую тактику, в том числе подняла предложение (до 51 доллара, примерно на 6,8 миллиарда долларов). [19] Illumina отклонила предложение, [2] [20] и Рош отказалась от предложения в апреле. [21]

В 2014 году компания анонсировала многомиллионный продукт HiSeq X Ten, который, по ее прогнозам, обеспечит крупномасштабное секвенирование всего генома по цене 1000 долларов за геном. [22] [23] Компания заявила, что 40 таких машин смогут секвенировать больше геномов за один год, чем было произведено всеми другими секвенаторами на сегодняшний день. [24] В январе 2014 года Illumina уже занимала 70% рынка машин для секвенирования генома. [25] На машины Illumina приходилось более 90% всех полученных данных ДНК. [26] Фактически, объем данных, производимых машинами Illumina, таков, что компания инвестировала в приобретение докоммерческой фирмы Enancio в 2020 году, которая разработала алгоритм сжатия данных ДНК.специально нацеленные на данные Illumina, способные сократить объем хранилища на 80% (например, с 50 Гб сжатых до 10 Гб). [27]

5 июля 2016 года Джей Флэтли, занимавший пост генерального директора с 1999 года, взял на себя роль исполнительного председателя совета директоров. Фрэнсис де Соуза взял на себя роль президента и главного исполнительного директора и продолжает работать в совете директоров Illumina. [28] [29]

В конце 2015 года Illumina отделилась от компании GRAIL , специализирующейся на анализе крови на наличие раковых опухолей в кровотоке. В 2017 году компания планировала привлечь 1 миллиард долларов во втором раунде финансирования и получила финансирование от Билла Гейтса и Джеффа Безоса, инвестировавших 100 миллионов долларов в серию A , а Illumina сохранила 20% -ную долю в Grail. [30] Компания работает над испытанием крови с участием более 120 000 женщин во время плановых визитов для маммографии в штатах Миннесота и Висконсин , а также в партнерстве с клиникой Мэйо.. Компания Grail использует для испытаний технологию секвенирования Illumina. [31] Компания планирует развернуть тесты к 2019 году, их стоимость составит 500 долларов на человека. [32] В сентябре 2020 года Illumina объявила о предложенной сделке с наличными и акциями по приобретению Grail за 8 миллиардов долларов. [33] [34]

В ноябре 2018 года компания предложила приобрести Pacific Biosciences по цене 8 долларов за акцию или около 1,2 миллиарда долларов в целом. [35] [36] В декабре 2019 года Федеральная торговая комиссия подала в суд на блокирование приобретения. [37] Предложенная сделка была отменена 2 января 2020 года, когда Illumina выплатила Pacific сбор за расторжение договора в размере 98 миллионов долларов. [38]

В марте 2021 года FTC подала в суд, чтобы заблокировать вертикальное слияние Illumina с GRAIL. [39] [40]

История приобретения [ править ]

Ниже приводится иллюстрация слияний, поглощений, выделений и исторических предшественников компании:

  • Illumina, Inc.
    • Spyder Instruments (Acq 1999)
    • Solexa, Inc. (Acq 2008)
      • Solexa Ltd (слияние в 2005 г.)
      • Lynx Therapeutics Inc. (слияние 2005 г.)
    • Avantome Inc. (Acq 2008)
    • Эпицентр Биотехнологии (Acq 2011)
    • BlueGnome ( Acq 2012)
    • Verinata Health, Inc. (Acq 2013)
    • Advanced Liquid Logic (Acq 2013)
    • NextBio ( Acq 2013)
    • Myraqa ( Acq 2014)
    • GenoLogics Life Sciences Software Inc. (Acq 2015)
    • Эдико Геном (Acq 2018)
    • Энансио ( Acq 2020)
    • BlueBee ( Acq 2020)

Продукты [ править ]

Секвенирование ДНК [ править ]

Основные статьи: Секвенирование Illumina (Solexa) и секвенирование красителя Illumina
Секвенсор Illumina MiSeq

Illumina продает ряд высокопроизводительных систем секвенирования ДНК, также известных как секвенаторы ДНК, основанных на технологии, разработанной Solexa. Технология включает мостовую амплификацию для создания кластеров и обратимых терминаторов для определения последовательности. [41] [42] Технология, лежащая в основе этих систем секвенирования, включает лигирование фрагментированной ДНК с чипом с последующим добавлением праймера и последовательным включением и детекцией флуоресцентного дНТФ .

Три самых популярных секвенсора Illumina - это MiSeq, HiSeq и NovaSeq. За один прогон MiSeq генерирует 30 миллионов чтений, HiSeq генерирует 3 миллиарда чтений, а NovaSeq генерирует 13 миллиардов чтений. Между тем, традиционное секвенирование по Сэнгеру дает около 400 считываний. Для сравнения, NovaSeq может генерировать 4 триллиона оснований в день, тогда как секвенирование Сэнгера может генерировать только один миллион оснований в день. Новые машины способны секвенировать весь геном человека за 48 часов по цене 1000 долларов. Секвенсоры Illumina очень точны и имеют ошибку только один раз на тысячу оснований. [43]

Проточные кюветы (MiSeq, HiSeq и NovaSeq) [ править ]

Проточная кювета MiSeq (вверху)
Проточная кювета NovaSeq

Секвенирование Illumina происходит в проточных ячейках. Эти проточные кюветы имеют небольшие размеры и размещаются в отсеке проточной кюветы. В секвенсорах MiSeq проточная кювета может генерировать от 1 до 30 миллионов считываний за цикл. Проточная кювета HiSeq больше, чем у MiSeq, и может производить 3 миллиарда считываний за цикл. Наконец, проточная кювета NovaSeq является самой большой из трех и может производить 13 миллиардов считываний за цикл. Кластеризация проточной кюветы происходит, когда образец денатурированной ДНК помещается в проточную кювету. Праймеры, уже находящиеся в канале проточной кюветы, захватывают и связываются с концами короткого образца денатурированной ДНК. Затем ДНК-полимеразадобавляется и вводятся строительные блоки ДНК. Это приводит к тому, что вновь синтезированная нить ограничивается дном проточной ячейки. Затем исходная цепь матрицы вымывается, связывая вновь синтезированную цепь с другой последовательностью ДНК, присутствующей на поверхности. ДНК-полимераза и строительные блоки вводятся снова, образуя новую цепь. Эти шаги повторяются до тех пор, пока в кластере не будет сделано около 1000 копий. [43]

Судебный процесс [ править ]

В 2005 году соучредитель и бывший главный научный сотрудник Энтони Чарник подал в суд на Illumina; см. Czarnik v. Illumina Inc.

В 2010 году Корнельский университет и Life Technologies подали иск против Illumina, утверждая, что ее продукты на основе микрочипов нарушают восемь патентов, принадлежащих университету и лицензированных исключительно для стартапа. Дело было урегулировано в апреле 2017 года без признания вины. В сентябре 2017 года обе стороны попросили пересмотреть мировое соглашение, при этом Корнелл обвинил Illumina и Life Technologies в искажении фактов и мошенничестве. [44]

В феврале 2016 года Illumina подала иск против Oxford Nanopore Technologies , которая была первой компанией, которая начала коммерциализировать секвенирование нанопор . Illumina заявила, что Oxford Nanopore нарушила свои патенты на использование биологической нанопоры Mycobacterium smegmatis porinA (MspA) для систем секвенирования. [45] [46] В августе 2016 года обе стороны в конечном итоге урегулировали свой патентный иск, и Oxford Nanopore Technologies перешла на использование нанопоры CsgG, полученной из Escherichia coli , лицензию на которую компания VIB в Бельгии получила . [47]

В феврале 2020 года Illumina подала иск о нарушении патентных прав против BGI в отношении своих продуктов для секвенирования CoolMPS. [48] В свою очередь, BGI подала иски о нарушении патентных прав за нарушение федерального антимонопольного законодательства и законов Калифорнии о недобросовестной конкуренции , утверждая, что использование «мошенничества» для получения или обеспечения соблюдения патентов на секвенирование, заявленных против BGI, препятствует выходу фирмы на рынок США . [49]

Ссылки [ править ]

  1. ^ US SEC: Форма 10-K Illumina, Inc. , Комиссия по ценным бумагам и биржам США, 12 февраля 2019 г. , получено 20 июня 2019 г.
  2. ^ a b «Генеральный директор Illumina об обещании генома за 1000 долларов - и оставшейся работе» . Перекодировать . 25 марта 2014 г.
  3. ^ «Иллюмина - история происхождения» . www.linkedin.com . Проверено 5 октября 2020 .
  4. ^ Stipp, Дэвид (3 апреля 2000). «13 биотехнологических IPO, за которыми стоит следить» . Удача . Дата обращения 4 ноября 2019 .
  5. ↑ Девлин, Ханна (3 апреля 2020 г.). « Почему Великобритания отстала в тестировании на коронавирус? » . Хранитель . Проверено 21 апреля 2020 года .
  6. ^ "История секвенирования Illumina" . illumina.com . Проверено 25 января 2017 .
  7. ^ Кавасима, Эрик Х .; Лоран Фаринелли; Паскаль Майер (12 мая 2005 г.). «Патент: Метод амплификации нуклеиновых кислот» . Архивировано из оригинала на 2013-02-22 . Проверено 22 декабря 2012 г. {{несогласованные цитаты}}CS1 maint: postscript ( ссылка )
  8. ^ Everygenome.com: Индивидуальное секвенирование генома - Illumina, Inc. Архивировано 19 октября 2011 г. на Wayback Machine
  9. ↑ Керри Долан (16 сентября 2010 г.). «Генеральный директор Illumina на обеде, который его представил» . Forbes .
  10. ^ Кевин Дэвис (2009-06-11). «Illumina предложит услугу персонального секвенирования генома за 48 000 долларов» . Мир био-информационных технологий.
  11. ^ «Illumina снижает стоимость секвенирования до 4000 долларов - UTSanDiego.com» .
  12. ^ Everygenome.com: Индивидуальное секвенирование генома - Illumina, Inc. Архивировано 19 октября 2011 г. на Wayback Machine
  13. ^ Petrone, Джастин (4 мая 2010). «FDA разрешает использовать систему Illumina BeadXpress в клинических условиях» . GenomeWeb .
  14. ^ "510 (k) Premarket Notification K093128" . FDA . Проверено 7 апреля 2017 года .
  15. ^ «Крупные поставщики массивов обещают новые микросхемы, приобретения и диагностику в 2009 году» . GenomeWeb . 6 января 2009 г.
  16. ^ "Illumina. ::. Пресс-релиз по связям с инвесторами" . Investor.illumina.com. 2011-01-11. Архивировано из оригинала на 2013-11-21 . Проверено 18 января 2014 .
  17. ^ «Рош - Рош предлагает приобрести все находящиеся в обращении акции Illumina, Inc., чтобы еще больше укрепить свою ведущую роль в диагностике» . Архивировано из оригинала на 2012-02-28 . Проверено 7 марта 2012 .
  18. ^ "Xconomy: Пять причин, по которым Illumina должна бороться с оскорбительной низкой ставкой Роше" . Xconomy . 5 марта 2012 г.
  19. ↑ Рош и Иллюмина: Принимая это на свой счет . The Economist (18 апреля 2012 г.). Проверено 5 сентября 2013.
  20. ^ "Правление Illumina отклоняет враждебный тендер Роше" . connection.ebscohost.com . Архивировано из оригинала на 2014-08-11.
  21. ^ Рош решает не продлевать свое тендерное предложение для Illumina, Inc., заархивированное 8 августа 2014 г. на Wayback Machine.
  22. Рианна Кларк, Лиат (15 января 2014 г.). «Illumina объявляет о выдающемся методе секвенирования генома человека за 1000 долларов» . Проводной . Дата обращения 4 ноября 2019 .
  23. ^ Молтени, Меган (19 ноября 2018). «Теперь вы можете секвенировать весь свой геном всего за 200 долларов» . Проводной . Дата обращения 4 ноября 2019 .
  24. ^ Янг, Сьюзен (2014-01-14). «Illumina утверждает, что с новым высокопроизводительным секвенсором генома человека достигла рубежа в 1000 долларов США | MIT Technology Review» . Technologyreview.com . Проверено 18 января 2014 .
  25. ^ Циммерман, Эйлин (18 февраля 2014). «50 самых умных компаний: Illumina» . Обзор технологий Массачусетского технологического института . Массачусетский технологический институт . Проверено 25 августа 2014 года .
  26. ^ Regalado, Антонио. «EmTech: Illumina утверждает, что в этом году будет секвенировано 228 000 геномов человека» . Обзор технологий Массачусетского технологического института . Массачусетский технологический институт . Проверено 26 сентября 2014 года .
  27. ^ Персонал (15 июля 2020 г.). «Illumina приобретает французский стартап по сжатию геномных данных Enancio» . GenomeWeb . Нью-Йорк: Crain Communications . Дата обращения 16 июля 2020 .
  28. ^ «Джей Флэтли, чтобы принять на себя роль исполнительного председателя совета директоров Illumina; Фрэнсис де Суза назначен президентом и главным исполнительным директором» (пресс-релиз). Иллюмина. 7 марта 2016.[ самостоятельно опубликованный источник ]
  29. ^ Персонал (июль 2016 г.). "Люди". Новости генной инженерии и биотехнологии (бумага). 36 (13). п. 37.
  30. ^ Херпер, Мэтью. «Компания привлечет 1 миллиард долларов на создание анализа крови для выявления рака» . Forbes . Проверено 30 апреля 2017 .
  31. ^ "Ученые Mayo Clinc следят за тестом на рак панциря" . Звездная трибуна . Проверено 30 апреля 2017 .
  32. ^ Свенсон, Черил (2017-04-30). «Джефф Безос и Билл Гейтс ошибаются насчет Illumina? - Пестрый дурак» . Пестрый дурак . Проверено 30 апреля 2017 .
  33. ^ https://uk.reuters.com/article/us-grail-ma-illumina/illumina-to-pay-8-billion-for-jeff-bezos-backed-cancer-testing-firm-grail-idUKKCN26C1FY
  34. ^ Farr, Кристина (2020-09-21). «Illumina покупает спонсируемую Джеффом Безосом фирму Grail, занимающуюся тестированием рака, за 8 миллиардов долларов» . CNBC . Проверено 22 сентября 2020 .
  35. ^ «Illumina приобретет тихоокеанские биологические науки примерно за 1,2 миллиарда долларов, расширяя доступ к долгосрочному секвенированию и ускоряя научные открытия» . BioSpace .
  36. ^ «Illumina приобретает Pacific Biosciences за 1,2 миллиарда долларов» . BioSpace .
  37. ^ "FTC бросает вызов предлагаемому приобретению Illumina PacBio" . Федеральная торговая комиссия . 17 декабря 2019 . Проверено 31 марта 2021 года .
  38. ^ «Illumina отказывается от сделки на 1,2 миллиарда долларов, чтобы купить конкурента Pacific Biosciences» . CNBC. 2020-01-02 . Проверено 3 января 2020 .
  39. ^ Кендалл, Брент; Рокофф, Джонатан Д. (31 марта 2021 г.). «FTC стремится заблокировать приобретение Illumina компании Grail в области биологических наук за 7,1 миллиарда долларов» . Wall Street Journal . Проверено 31 марта 2021 года .
  40. ^ "FTC бросает вызов предложенному Illumina приобретению создателя тестов для обнаружения рака Grail" . Федеральная торговая комиссия . 30 марта 2021 . Проверено 31 марта 2021 года .
  41. ^ S Balasubramanian RSC Chem. Commun., 47 (26), 7281-7286 (2011).
  42. ^ Бентли, Дэвид Р .; и другие. (6 ноября 2008 г.). «Точное секвенирование всего человеческого генома с использованием химии обратимых терминаторов» . Природа . 456 (7218): 53–59. Bibcode : 2008Natur.456 ... 53В . DOI : 10,1038 / природа07517 . PMC 2581791 . PMID 18987734 .  
  43. ^ a b «Секвенирование следующего поколения • iBiology» . iBiology . Проверено 15 мая 2020 .
  44. ^ «Корнелл возрождает ранее урегулированный иск о нарушении патентных прав против Illumina» .
  45. ^ «Борьба с пивом из-за многообещающей технологии генетического секвенирования» .
  46. ^ «Illumina подает в суд на Oxford Nanopore за нарушение патентных прав» .
  47. ^ «Illumina и Oxford Nanopore урегулировали иск о нарушении патентных прав» . GenomeWeb . Проверено 13 января 2021 .
  48. ^ "Illumina подает дополнительный иск о нарушении патентных прав против BGI в США" BioSpace . Проверено 13 января 2021 .
  49. ^ «BGI подает в суд на Illumina за нарушение антимонопольного законодательства, утверждает, что фирма получила патенты последовательного доступа посредством мошенничества» . GenomeWeb . Проверено 13 января 2021 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Веб-сайт компании Illumina
  • DNAVision - официальный поставщик услуг Illumina.
  • Gene Logic - проводит исследования на основе метода Золотых ворот Illumina.
  • Персональная служба полного секвенирования генома компании Illumina
  • Национальный центр геномных ресурсов (NCGR) Центр секвенирования - сертифицированный поставщик услуг Illumina.
  • Genotypic Technology GENOMICS SIMPLIFIED - сертифицированный поставщик услуг Illumina.
  • Карта инструментов Illumina NGS в США.
  • Бизнес-данные для Illumina:
    • Google Финансы
    • Yahoo! Финансы
    • Документы SEC

Координаты : 32.8875924 ° N 117.1730577 ° W32°53′15″N 117°10′23″W /  / 32.8875924; -117.1730577