Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Delftia acidovorans
Научная классификация
Королевство:
Бактерии
Тип:
Протеобактерии
Класс:
Бетапротеобактерии
Заказ:
Burkholderiales
Семья:
Comamonadaceae
Род:
Дельфтия
Биномиальное имя
Delftia acidovorans
(den Dooren de Jong 1926)
Wen et al. 1999 г.
Тип штамма
ATCC 15668T
Синонимы

Comamonas acidovorans (den Dooren de Jong 1926) Tamaoka et al. 1987
Pseudomonas indoloxidans Gray 1928
Pseudomonas desmolytica Gray and Thornton 1928
Pseudomonas acidovorans den Dooren de Jong 1926

Delftia acidovorans - грамотрицательная , подвижная, неспорообразующая палочковидная бактерия [1], известная своей способностью биоминерализовать золото [2] и характеристиками биоремедиации. [3] Впервые он был выделен из почвы в Делфте, Нидерланды. [1] Бактерия первоначально была классифицирована как Psuedamonas acidovorans и Comamonas acidovorans, а затем реклассифицирована как Delftia acidovorans . [4]

История [ править ]

Delftia acidovorans первоначально была известна как Comamonas acidovorans . [1] Он был переименован из-за родства рРНК [5] и отличий от других микробов семейства Comamonadaceae . [1] Об этих различиях свидетельствуют филогенетические и фенотипические данные. [1] Новое название, Delftia acidovorans , - это ссылка на город Делфт , где он был впервые обнаружен и зарегистрирован. [1]

Биология и биохимия [ править ]

Тип и морфология [ править ]

D. acidovorans - сапрофит , [6] грамотрицательная , не спорулирующая , неденитрифицирующая , неферментирующая палочковидная бактерия. [1] D. acidovorans существует как одна клетка, так и парами, ширина которых составляет 0,4-0,8 мкм, а длина 2,5-4,1 мкм. [1] D. acidovorans передвигается через полярные или биполярные пучки жгутиков. [1] Пучки могут иметь от одного до пяти жгутиков. [1]

Штаммы и филогения [ править ]

Delftia acidovorans существует как часть Betaproteobacteria линии в пределах Comamonadaceae семьи . Штаммы D. acidovorans SPH1, ATCC 1 15668 и Cs 1-4 тесно связаны между собой. Хотя штаммы CCUG 247B и CCUG 15835 относятся к Delftia acidovorans , они больше похожи на Delftia tsuruhatensis . CCUG 247B и CCUG 15835 часто группируются с D. tsuruhatensis, а не с D. acidovorans. [7]

Метаболизм [ править ]

D. acidovorans является мезофильным, оптимальная температура выращивания составляет 30 ° C. [7] Он не выживет в психрофильных условиях. [1] D. acidovorans не является галофилом и предпочитает среду с минимальной или нулевой концентрацией солей для роста. [1] Штаммы D. acidovorans Cs1-4 и SPH-1 являются аэробными бактериями. [7]

Штаммы D. acidovorans Cs1-4 и SPH-1 могут использовать фенантрен, пируват, ванилат, сукцинат, муравьиную кислоту , глюконовую кислоту , гидроксимасляную кислоту , молочную кислоту и пропионовую кислоту в качестве источника углерода. [7] D. acidovorans не продуцирует уреазу, является положительной по отношению к каталазе и оксидазе и окисляет фруктозу и маннитол [5]

Биоминерализация [ править ]

D. acidovorans - одна из немногих бактерий, наряду с Cupriavidus Metallidurans , которые могут метаболизировать золото. [8] [2] Au 3+ восстанавливается внеклеточно не рибосомным вторичным метаболитом дельфтибактином. Дельфтибактин - уникальный метаболит, так как он может защищать бактерии от токсичности золота, а также восстанавливать ионы золота до твердой формы. [2] Дельфтибактин может удалять золото из шламов, содержащих морскую воду и карбонат кальция , а также способен извлекать золото из электронных отходов. [9] [10] Методы биогидрометаллургии с использованием D. acidovoransповышают рентабельность переработки и являются устойчивой альтернативой цианидному выщелачиванию. [11] Свинец также можно извлечь из выброшенной электроники с помощью D. acidovorans . [3] Попытки вызвать экспрессию дельфтибактина в Escherichia coli не увенчались успехом из-за токсичности белка DelH. [10]

Биоремедиация и биопроизводство [ править ]

D. acidovorans способен превращать токсичные металлы, такие как ионы селена и хрома, в безвредные продукты. [3] Он также может разлагать фенантрен , который является источником углерода из полицилических ароматических углеводородов (ПАУ). Фенантрен - распространенный загрязнитель окружающей среды. [7]

D. acidovorans можно использовать для производства полигидроксиалканоатов (ПГА). PHA - выгодная альтернатива традиционному пластиковому оборудованию, используемому в медицинских учреждениях. Традиционное производство пластика требует ресурсов и загрязняет окружающую среду, тогда как производство PHA с помощью D. acidovorans является более устойчивым решением. [12]

Роль в болезни [ править ]

Delftia acidovorans - это эмерджентный условно-патогенный микроорганизм, демонстрирующий устойчивость к антибиотикам. [6] [13] Инфекция может привести к бактериемии , [14] кератит , [15] [16] пневмония , [17] эмпиема , [18] отит , [19] и перитонит . [20] Известные источники инфекции включают зараженную воду [19] и катетеры . [13] [14] D. acidovorans следует рассматривать как возбудитель болезни у пациентов при подозрении на загрязнение воды или почвы.[5] D. acidovorans также был изолирован в клинических условиях, таких как системы обратного осмоса, [21] хирургические пылесосы, [22] и раковины операционных. [23] Некоторые штаммы могут переносить хлоргексидин , [24] распространенное хирургическое дезинфицирующее средство.

Инфекцию D. acidovorans можно подтвердить с помощью теста на оранжевый индол. [18] Устойчивость к антибиотикам к аминогликозидам является обычным явлением. [6] [13] [18] [17] [20]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Б с д е е г ч я J K L Вэнь, Aimin; Феган, Марк; Хейворд, Крис; Чакраборти, Сукумар; Хитрый, Линдси (1999). "Филогенетические отношения между членами Comamonadaceae и описание Delftia acidovorans (den Dooren de Jong 1926 и Tarnoaka et al. 1987) gen. Nov., Comb. Nov" . Международный журнал систематической бактериологии . 49 (2): 567–576. DOI : 10.1099 / 00207713-49-2-567 . PMID  10319477 - через PubMed.
  2. ^ a b c Джонстон, Чад W .; Wyatt, Morgan A .; Ли, Сян; Ибрагим, Ашраф; Шустер, Иеремия; Саутэм, Гордон; Магарви, Натан А. (2013). «Биоминерализация золота металлофором из ассоциированного с золотом микроба» . Природа Химическая биология . 9 (4): 241–243. DOI : 10.1038 / nchembio.1179 . ISSN 1552-4469 . PMID 23377039 .  
  3. ^ a b c Убалде, Марта С .; Брана, Виктория; Суэйро, Фабиана; Морель, Мария А .; Мартинес-Росалес, Сесилия; Маркес, Каролина; Кастро-Совински, Сусана (2012). «Универсальность изолятов Delftia sp. Как инструментов для биоремедиации и технологий биоудобрения» . Современная микробиология . 64 (6): 597–603. DOI : 10.1007 / s00284-012-0108-5 . ISSN 0343-8651 . PMID 22476956 . S2CID 1464049 .   
  4. ^ Рема, Тара; Лоуренс, Джон Р .; Дайнс, Джеймс Дж .; Хичкок, Адам П .; Корбер, Даррен Р. (2014-10-01). «Микроскопический и спектроскопический анализ толерантности к хлоргексидину в биопленках Delftia acidovorans» . Противомикробные препараты и химиотерапия . 58 (10): 5673–5686. DOI : 10,1128 / AAC.02984-14 . ISSN 0066-4804 . PMC 4187954 . PMID 25022584 .   
  5. ^ a b c Mahmood, S .; Тейлор, KE; Оверман, Т.Л .; Маккормик, Мичиган (01.11.2012). «Острый инфекционный эндокардит, вызванный Delftia acidovorans, редким патогеном, осложняющим внутривенное употребление наркотиков» . Журнал клинической микробиологии . 50 (11): 3799–3800. DOI : 10.1128 / JCM.00553-12 . ISSN 0095-1137 . PMC 3486206 . PMID 22933597 .   
  6. ^ a b c Кавамура, Ичиро; Яги, Тэцуя; Хатакеяма, Кадзухито; Хасэгава, Ёсинори; Окура, Теруко; Окусу, Киёфуми; Такахаши, Ёсиюки; Кодзима, Сейджи (2011). «Рецидивирующая бактериемия, связанная с сосудистым катетером, вызванная Delftia acidovorans с различными профилями чувствительности к противомикробным препаратам» . Журнал инфекций и химиотерапии . 17 (1): 111–113. DOI : 10.1007 / s10156-010-0089-х . PMID 20628778 . S2CID 41936424 .  
  7. ^ a b c d e Shetty, Ameesha R .; де Ганнес, Видья; Оби, Чиома К .; Лукас, Сьюзен; Лапидус, Алла; Ченг, Ян-Фанг; Goodwin, Lynne A .; Питлак, Сэмюэл; Питерс, Линда; Михайлова Наталья; Тешима, Хадзуки (2015). «Полная последовательность генома фенантрен-деградирующей почвенной бактерии Delftia acidovorans Cs1-4» . Стандарты геномных наук . 10 : 55. DOI : 10,1186 / s40793-015-0041-х . ISSN 1944-3277 . PMC 4572682 . PMID 26380642 .   
  8. ↑ Ри, Мария Анжелика; Zammit, Carla M .; Райт, Фрэнк (2016-06-01). «Бактериальные биопленки на золотых зернах - значение для геомикробных превращений золота» . FEMS Microbiology Ecology . 92 (6): fiw082. DOI : 10.1093 / femsec / fiw082 . ISSN 0168-6496 . PMID 27098381 .  
  9. ^ Юсофф, AHM; Nading, ME; Салими, MN (2017). «Извлечение частиц золота (Au) из морской воды микробами Delftia Acidovorans» . Журнал физики: Серия конференций . 908 (1): 012045. Bibcode : 2017JPhCS.908a2045Y . DOI : 10.1088 / 1742-6596 / 908/1/012045 . ISSN 1742-6588 . 
  10. ^ a b «Рециркуляция золота. Использование дельфибактина для переработки золота из электронных отходов» . iGEM .
  11. ^ Kaksonen, Анна Х .; Боксолл, Наоми Дж .; Гумуля, Йозефин; Khaleque, Himel N .; Моррис, Кристина; Боху, Цин; Ченг, Ка Ю; Usher, Kayley M .; Лаканиеми, Айно-Майя (01.09.2018). «Последние достижения в области биогидрометаллургии и микробиологической характеристики» . Гидрометаллургия . 180 : 7–25. DOI : 10.1016 / j.hydromet.2018.06.018 . ISSN 0304-386X . 
  12. ^ Романелли, Мария Джованна; Поволо, Сильвана; Фаваро, Лоренцо; Фонтана, Федерико; Басалья, Марина; Казелла, Серджио (2014). «Разработка Delftia acidovorans DSM39 для производства полигидроксиалканоатов из отходов скотобойни» . Международный журнал биологических макромолекул . 71 : 21–27. DOI : 10.1016 / j.ijbiomac.2014.03.049 . PMID 24704165 . 
  13. ^ a b c Чотиканатис, Кобкул; Беккер, Мартин; Росас-Гарсия, Габриэла; Хаммершлаг, Маргарет Р. (2011). «Рецидивирующая внутрисосудистая катетер-связанная бактериемия, вызванная Delftia acidovorans у пациента, находящегося на гемодиализе» . Журнал клинической микробиологии . 49 (9): 3418–3421. DOI : 10.1128 / JCM.00625-11 . ISSN 0095-1137 . PMC 3165601 . PMID 21775546 .   
  14. ^ а б Ланг, КДж; Chinzowu, T .; Канн, KJ (2012). "Delftia acidovorans как необычный возбудитель литого сепсиса" . Индийский журнал микробиологии . 52 (1): 102–103. DOI : 10.1007 / s12088-011-0221-3 . ISSN 0046-8991 . PMC 3298582 . PMID 23450157 .   
  15. ^ Ли, Санг Мок; Ким, Ми Кум; Ли, Джэ Лим; Ви, Вон Рян; Ли, Джин Хак (2008). «Опыт кератита Comamonas Acidovorans с отсроченным началом и ответом на лечение в роговице с ослабленным иммунитетом» . Корейский офтальмологический журнал . 22 (1): 49–52. DOI : 10.3341 / kjo.2008.22.1.49 . ISSN 1011-8942 . PMC 2629953 . PMID 18323706 .   
  16. ^ Лангман, Мэн; Dighiero, PL; Гикель, Дж. Дж. (02 октября 2007 г.). «Комамонас: не очень распространенное средство для людей, носящих гидрогелевые контактные линзы» . Acta Ophthalmologica Scandinavica . 85 : 0. DOI : 10.1111 / j.1600-0420.2007.01062_3296.x .
  17. ^ a b Йылдыз, Ханифи; Сюннетчиоглу, Айсель; Экин, Селами; Баран, Ирфан; Озгёкче, Месут; Аскер, Сельви; Юней, Ибрагим; Акьюз, Сумейе (10.02.2020). Тургут, Энгин (ред.). «Пневмония Delftia Acidovorans с образованием полостей в легких» . Колумбия Медика . 50 (3): 215–221. DOI : 10,25100 / cm.v50i3.4025 . PMC 7141147 . PMID 32284666 .  
  18. ^ a b c Хан, Садия; Систла, Суджата; Дходапкар, Рахул; Париджа, Субхаш Чандра (2012). «Смертельная инфекция Delftia acidovorans у иммунокомпетентного пациента с эмпиемой» . Азиатско-Тихоокеанский журнал тропической биомедицины . 2 (11): 923–924. DOI : 10.1016 / S2221-1691 (12) 60254-8 . PMC 3609244 . PMID 23569872 .  
  19. ^ а б Рейна, Хорди; Лломпарт, Изабель; Аломар, Педро (март 1991 г.). «Острый гнойный отит, вызванный Comamonas acidovorans» . Бюллетень клинической микробиологии . 13 (5): 38–39. DOI : 10.1016 / 0196-4399 (91) 90006-H .
  20. ^ a b Артан, Айше Серра; Гурсу, Мельтем; Эльчиоглу, Омер Джелал; Казанчоглу, Румейза (2020). «Перитонит Delftia Acidovorans у пациента, проходящего перитонеальный диализ» . Турецкий журнал нефрологии . 29 (4): 326–328. DOI : 10,5152 / turkjnephrol.2020.4204 .
  21. ^ Ясин, Мохамед Х .; Абрамовиц, Блез; Харири, Рахман; Маккиббен, Лианна; Пиневич, AJ (2020). «Псевдо-вспышка Delftia acidovorans в портативных установках обратного осмоса: меры по обеспечению безопасного и экономичного гемодиализа» . Американский журнал инфекционного контроля . 48 (3): 304–308. DOI : 10.1016 / j.ajic.2019.11.027 . ISSN 0196-6553 . PMID 31952870 .  
  22. ^ Миньо де Каспар, Herminia; Грасбон, Томас; Кампик, Ансельм (2000). «Автоматизированное хирургическое оборудование требует регулярной дезинфекции коллектора контроля вакуума для предотвращения послеоперационного эндофтальмита11. Авторы не имеют права собственности на какой-либо из продуктов» . Офтальмология . 107 (4): 685–690. DOI : 10.1016 / s0161-6420 (99) 00178-5 . ISSN 0161-6420 . PMID 10768329 .  
  23. ^ Ta, C .; Wong, G .; Cole, W .; Медведев, Г. (2020-09-01). «Загрязнение раковины и передача операционному персоналу» . Новые микробы и новые инфекции . 37 : 100754. дои : 10.1016 / j.nmni.2020.100754 . ISSN 2052-2975 . PMC 7502367 . PMID 32995014 .   
  24. ^ Рема, Тара; Лоуренс, Джон Р .; Дайнс, Джеймс Дж .; Хичкок, Адам П .; Корбер, Даррен Р. (2014). «Микроскопический и спектроскопический анализ толерантности к хлоргексидину в биопленках Delftia acidovorans» . Противомикробные препараты и химиотерапия . 58 (10): 5673–5686. DOI : 10,1128 / AAC.02984-14 . ISSN 0066-4804 . PMC 4187954 . PMID 25022584 .   

Внешние ссылки [ править ]

  • Типовой штамм Delftia acidovorans в Bac Dive - база метаданных по бактериальному разнообразию