| Энтеробактер cowanii | |
|---|---|
| Научная классификация | |
| Царство: | |
| Тип: | |
| Класс: | |
| Приказ: | |
| Семья: | |
| Род: | |
| Биномиальное имя | |
| Энтеробактер cowanii | |
Enterobacter cowanii является грамотрицательной , подвижно, факультативно-анаэробной , палочкообразными бактериями рода Enterobacter . Этот вид обычно ассоциируется с естественной средой и встречается в почве, воде и сточных водах. [1] E. cowanii связана с патогенами растений, которые проявляют симптомы тяжелой дефолиации и гибели растений. [2] Этот вид, первоначально называвшийся NIH Group 42, был впервые предложен в 2000 году как потенциальный член семейства Enterobacteriaceae . [3]Название этого вида дано в честь английского бактериолога С.Т. Коуэна за его значительный вклад в области бактериальной систематики. [3]
Фенотипическая характеристика [ править ]
Enterobacter cowanii фенотипически определяется как грамотрицательная, подвижная и факультативная анаэробная бактерия. Морфология этой бактерии описывается как имеющая кремовый цвет при культивировании на неселективной среде YDC (дрожжевой экстракт-декстроза-CaCO3). [2] При тестировании на продукцию ферментов E. cowanii была положительной на аспарагин и каталазу, но также была отрицательной на уреазу и оксидазу. [2] При первоначальном представлении как NIH Group 42 семьдесят традиционных фенотипических характеристик были определены и перечислены Kohaku et al. [3]
Генотипическая характеристика [ править ]
Разнообразие штаммов, присутствующих в видах Enterobacter cowanii , было подтверждено посредством анализа содержания G + C ДНК и результатов гибридизации ДНК-ДНК, которая включает гибридизацию (отжиг) предполагаемых штаммов с E. cowanii LMG 23569T. [1] Сходство ДНК 70% или больше указывает на то, что представляющие интерес штаммы принадлежат к одному виду. [4] При тестировании на сходство ДНК-ДНК, сравнивающем ген rpoB E. cowanii , штаммы BCC 009, BCC 011, BCC 078 показали сходство ДНК от 76% до 92%. [1]
NB Используя подход мультилокусного анализа последовательностей (MLSA), основанный на частичном секвенировании генов, кодирующих белок (gyrB, rpoB, infB и atpD), этот вид был переклассифицирован в род Kosakonia , так что его название более правильно было дано как Kosakonia cowanii . [5]
Микробиология [ править ]
Изоляты Enterobacter cowanii были экстрагированы из ткани листьев эвкалиптовых деревьев. [1] Для определения общего родства выделенных штаммов использовали секвенирование гена 16S рРНК. [1] Ген 16S рРНК обычно используется для секвенирования и установления родства изолятов, поскольку он высококонсервативен. Филогенетически родственные штаммы E. cowanii , определенные с помощью секвенирования гена 16S рРНК и гена rpoB, включают BCC 078, BCC 074, BCC 008, BCC 011 и BCC 009. [1]
Разнообразие [ править ]
При сравнении ДНК репрезентативного штамма группы 42 NIH и ДНК 35 других видов Enterobacteriaceae методом ДНК-ДНК-гибридизации было обнаружено, что степень реассоциации находится в диапазоне 5–38% при 70 ° C. [3] Благодаря своим уникальным фенотипическим характеристикам и отличному отделению от других видов Enterobacteriaceae путем гибридизации ДНК, существует достаточно доказательств того, что E. cowanii является отдельным видом в семействе Enterobacteriaceae. [3]
Ссылки [ править ]
- ^ Б с д е е Brady, CL; Вентер, СН; Cleenwerck, I .; Engelbeen, K .; de Vos, P .; Вингфилд, MJ; Telechea, N .; Коутиньо, TA (2009). «Выделение Enterobacter cowanii из эвкалипта с симптомами бактериального ожога и отмирания в Уругвае» . Письма по прикладной микробиологии . 49 (4): 461–465. DOI : 10.1111 / j.1472-765X.2009.02692.x . PMID 19674289 .
- ^ a b c Фуртадо, GQ; Гимарайнш, LMS; Лиссабон, DO; Кавальканте, ВП; Арриэль, DAA; Альфенас, AC; Оливейра, младший (2012). «Первый отчет о Enterobacter cowanii, вызывающей бактериальное пятно на Mabea fistulifera, родном лесном виде в Бразилии» . Болезнь растений . V (10): 96. DOI : 10,1094 / PDIS-02-12-0160-ПДН .
- ^ a b c d e Иноуэ, Кохаку; Sugiyama, K .; Kosako, Y .; Sakazaki, R .; Ямаи, С. (2000). « Enterobacter cowanii sp. Nov., Новый вид семейства Enterobacteriaceae». . 2000" Current Microbiology . 41 (6): 417-420. DOI : 10.1007 / s002840010160 . PMID 11080391 .
- ^ Горис, J .; Константинидис, КТ; Klappenbach, JA; Coenye, T .; Vandamme, P .; Тидже, JM (2007). «Значения гибридизации ДНК-ДНК и их связь с сходством последовательности всего генома. 2007» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 57 (Pt 1): 81–91. DOI : 10.1099 / ijs.0.64483-0 . PMID 17220447 .
- ^ Брэди, JC .; Cleenwerck, I .; Venter, S .; Coutinho, T .; Де Вос, П. (2013). «Таксономическая оценка рода Enterobacter на основе анализа мультилокусных последовательностей (MLSA): предложение реклассифицировать E. nimipressuralis и E. amnigenus в Lelliottia gen. Nov. Как Lelliottia nimipressuralis comb. Nov. И Lelliottia amnigena comb. Nov., Соответственно, E. . gergoviae и E. pyrinus в Pluralibacter gen. nov. как Pluralibacter gergoviae comb. nov. и Pluralibacter pyrinus comb. nov., соответственно, E. cowanii ,E. radicincitans , E. oryzae и E. arachidis в Kosakonia gen. ноя как Kosakonia cowanii греб . nov., Kosakonia radicincitans comb. nov., Kosakonia oryzae греб . ноя и Kosakonia arachidis гребешок. nov., соответственно, и E. turicensis , E. helveticus и E. pulveris в Cronobacter как Cronobacter zurichensis nom. nov., Cronobacter helveticus comb. ноя и гребешок Cronobacter pulveris . nov., соответственно, и исправленное описание родов Enterobacterи Cronobacter . 2013 ». Систематическая и прикладная микробиология . 36 (Pt 5): 309–319. Doi : 10.1016 / j.syapm.2013.03.005 . PMID 23632228 .
