Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
HDAC8
Белок HDAC8 PDB 1t64.png
Доступные конструкции
PDBОртолог поиск: PDBe RCSB
Список идентификационных кодов PDB

1T64 , 1T67 , 1T69 , 1VKG , 1W22 , 2V5W , 2V5X , 3EW8 , 3EWF , 3EZP , 3EZT , 3F06 , 3F07 , 3F0R , 3MZ3 , 3MZ4 , 3MZ6 , 3MZ7 , 3RQD , 3SFF , 3SFH , 4QA0 , 4QA1 , 4QA2 , 4QA3 , 4QA4 , 4QA5, 4QA6 , 4QA7 , 4RN0 , 4RN1 , 4RN2 , 5DC7 , 5D1D , 5D1C , 5DC8 , 5D1B , 5DC5 , 5DC6 , 5BWZ

Идентификаторы
ПсевдонимыHDAC8 , CDLS5, HD8, HDACL1, MRXS6, RPD3, WTS, CDA07, гистондеацетилаза 8, KDAC8
Внешние идентификаторыOMIM: 300269 MGI: 1917565 HomoloGene: 41274 GeneCard: HDAC8
Расположение гена (человек)
Chr.Х-хромосома (человека) [1]
ГруппаXq13.1Начинать72 329 516 п.н. [1]
Конец72 573 101 п.н. [1]
Расположение гена (Мышь)
Chr.Х-хромосома (мышь) [2]
ГруппаX | XDНачинать102 284 639 п.н. [2]
Конец102 505 359 п.н. [2]
Генная онтология
Молекулярная функция• Hsp90 связывание с белками
• НАД-зависимую гистоновой дезацетилазу активности (H3-K14 специфический)
• гистондеацетилаза активность
• ион металла связывание
• Hsp70 связывание с белками
• GO: связывание белка 0001948
• гидролазы активности
• хроматина связывание
• связываниями фактора транскрипции
• деацетилаза активность
Сотовый компонент• цитоплазма
• комплекс гистондеацетилазы
• цитозоль
• клеточная мембрана
• нуклеоплазма
• ядерная хромосома
• ядро клетки
Биологический процесс• деацетилирование гистона H3
• регуляция транскрипции по ДНК-шаблону
• регуляция стабильности белка
• регуляция поддержания теломер
• негативная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• сборка или разборка хроматина
• транскрипция, шаблонная ДНК
• слияние сестринских хроматид
• регуляция загрузка когезина
• негативная регуляция убиквитинирования белка
• деацетилирование гистонов
• негативная регуляция экспрессии гена
• клеточный ответ на трихостатин A
• негативная регуляция дифференцировки остеобластов
• клеточный ответ на форсколин
• негативная регуляция ацетилирования гистона H3-K9
• организация хроматина
• позитивная регуляция транскрипции с промотора РНК-полимеразы II
• деацетилирование гистона H4
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
РазновидностьЧеловекМышь
Entrez

55869

70315

Ансамбль

ENSG00000147099

ENSMUSG00000067567

UniProt

Q9BY41

Q8VH37

RefSeq (мРНК)
NM_001166418
NM_001166419
NM_001166420
NM_001166422
NM_001166448

NM_018486

NM_027382
NM_001313742

RefSeq (белок)
NP_001159890
NP_001159891
NP_001159892
NP_001159894
NP_001159920

NP_060956

NP_001300671
NP_081658

Расположение (UCSC)Chr X: 72,33 - 72,57 МбChr X: 102,28 - 102,51 Мб
PubMed поиск[3][4]
Викиданные
Просмотр / редактирование человекаПросмотр / редактирование мыши

Гистондеацетилазу 8 представляет собой фермент , который у человека кодируется гистондеацетилаза 8 гена . [5] [6] [7]

Функция [ править ]

Гистоны играют решающую роль в регуляции транскрипции , прогрессии клеточного цикла и событиях развития. Гистонов ацетилирования / деацетилирования изменяет хромосома структура и влияет фактор транскрипции доступ к ДНК. Белок, кодируемый этим геном, принадлежит к классу I семейства гистондеацетилазы / acuc / apha. Он обладает гистоновой деацетилазной активностью и подавляет транскрипцию, когда привязан к промотору . [7]

Гистондеацетилаза 8 участвует в морфогенезе черепа [8] и метаболическом контроле транскрипционного комплекса ERR-альфа / PGC1-альфа . [9]

Клиническое значение [ править ]

HDAC8 был связан с рядом болезненных состояний, особенно с острым миелоидным лейкозом, и связан с актиновым цитоскелетом в гладкомышечных клетках. siRNA, нацеленная на HDAC8, показала противоопухолевые эффекты. [10] Ингибирование апоптоза, индуцированного HDAC8, наблюдалось в Т-клеточных лимфомах . [11] Кроме того, фермент HDAC8 участвует в патогенезе нейробластомы . [12] Таким образом, существует интерес к разработке селективных ингибиторов HDAC8. [13] [14]

Взаимодействия [ править ]

  • ERR-альфа . [9]

См. Также [ править ]

  • Гистоновая деацетилаза

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl, выпуск 89: ENSG00000147099 - Ensembl , май 2017 г.
  2. ^ a b c GRCm38: выпуск Ensembl 89: ENSMUSG00000067567 - Ensembl , май 2017 г.
  3. ^ "Human PubMed Reference:" . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  4. ^ «Ссылка на Mouse PubMed:» . Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США .
  5. ^ McDonell N, Ramser J, Фрэнсис F, Vinet MC, Rider S, Sudbrak R, Riesselman л, Yaspo М.Л., Реинхардт R, Монако А.П., Росс Ж, Кан А, Kearney л, Пряжка В, Chelly J (май 2000 г.). «Характеристика очень сложной области в Xq13 и картирование трех изодицентрических точек разрыва, связанных с прелейкемией». Геномика . 64 (3): 221–9. DOI : 10.1006 / geno.2000.6128 . PMID 10756090 . 
  6. ↑ Van den Wyngaert I, de Vries W, Kremer A, Neefs J, Verhasselt P, Luyten WH, Kass SU (август 2000). «Клонирование и характеристика гистоновой деацетилазы 8 человека». FEBS Lett . 478 (1–2): 77–83. DOI : 10.1016 / S0014-5793 (00) 01813-5 . PMID 10922473 . 
  7. ^ а б «Энтрез Ген: гистондеацетилаза HDAC8 8» .
  8. ^ Haberland M, Mokalled MH, Montgomery RL, Olson EN (июль 2009). «Эпигенетический контроль морфогенеза черепа с помощью гистондеацетилазы 8» . Genes Dev . 23 (14): 1625–30. DOI : 10,1101 / gad.1809209 . PMC 2714711 . PMID 19605684 .  
  9. ^ a b Уилсон BJ, Tremblay AM, Deblois G, Sylvain-Drolet G, Giguère V (июль 2010 г.). «Переключатель ацетилирования модулирует транскрипционную активность связанного с эстрогеном рецептора альфа» . Мол. Эндокринол . 24 (7): 1349–58. DOI : 10.1210 / me.2009-0441 . PMC 5417470 . PMID 20484414 .  
  10. ^ Gallinari P, Di Marco S, P Jones, Pallaoro M, Steinkühler C (март 2007). «HDAC, деацетилирование гистонов и транскрипция генов: от молекулярной биологии до терапии рака». Cell Res . 17 (3): 195–211. DOI : 10.1038 / sj.cr.7310149 . PMID 17325692 . 
  11. ^ Баласубраманьян S, Рамос Дж, Ло Вт, Sirisawad М, Вернер Е, Багги JJ (май 2008 г.). «Новый специфический ингибитор гистондеацетилазы 8 (HDAC8) PCI-34051 индуцирует апоптоз в Т-клеточных лимфомах» . Лейкоз . 22 (5): 1026–34. DOI : 10.1038 / leu.2008.9 . PMID 18256683 . 
  12. ^ Oehme я, Deubzer ОН, Вегенер D, D Pickert, Линк ДП, герой В, Коппах-Шнайдер А, Вестерманн Ж, Ульрих С.М., фон Deimling А, Фишер М, Witt О (январь 2009 г.). «Гистоновая деацетилаза 8 в онкогенезе нейробластомы» . Clin. Cancer Res . 15 (1): 91–9. DOI : 10.1158 / 1078-0432.CCR-08-0684 . PMID 19118036 . 
  13. ^ Патил V, Sodji QH, Kornacki JR, Mrksich M, Oyelere AK (май 2013). «3-гидроксипиридин-2-тион в качестве новой группы связывания цинка для селективного ингибирования гистондеацетилазы» . Журнал медицинской химии . 56 (9): 3492–506. DOI : 10.1021 / jm301769u . PMC 3657749 . PMID 23547652 .  
  14. ↑ Suzuki T, Ota Y, Ri M, Bando M, Gotoh A, Itoh Y, Tsumoto H, Tatum PR, Mizukami T, Nakagawa H, Iida S, Ueda R, Shirahige K, Miyata N (ноябрь 2012 г.). «Быстрое открытие сильнодействующих и селективных ингибиторов гистондеацетилазы 8 с использованием химии щелчков для создания библиотек кандидатов». Журнал медицинской химии . 55 (22): 9562–75. DOI : 10.1021 / jm300837y . PMID 23116147 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Валтрегни Д., Де Леваль Л., Глениссон В., Ли Тран С., Норт Б.Дж., Беллахсен А., Вейдл Ю., Вердин Е., Кастроново В. (2004). «Экспрессия гистондеацетилазы 8, гистондеацетилазы класса I, ограничена клетками, демонстрирующими дифференцировку гладких мышц в нормальных тканях человека» . Am J Pathol . 165 (2): 553–64. DOI : 10.1016 / S0002-9440 (10) 63320-2 . PMC  1618574 . PMID  15277229 .
  • Глениссон В., Уолтрени Д., Тран С.Л., Норт Б.Дж., Вердин Э., Колидж А., Кастроново В. (июнь 2005 г.). «Гистоновая деацетилаза HDAC8 связывается с альфа-актином гладких мышц и необходима для сократимости гладкомышечных клеток». FASEB J . 19 (8): 966–8. DOI : 10.1096 / fj.04-2303fje . PMID  15772115 .
  • Ведель Т., Ван Эйс Г.Дж., Уолтрегни Д., Глениссон В., Кастроново В., Вандервинден Дж. М. (2006). «Новые маркеры гладких мышц выявляют аномалии мускулатуры кишечника при тяжелых нарушениях колоректальной моторики». Нейрогастроэнтерол. Мотил . 18 (7): 526–38. DOI : 10.1111 / j.1365-2982.2006.00781.x . PMID  16771768 .
  • Вердин E, Dequiedt F, Kasler HG (2003). «Гистоновые деацетилазы класса II: универсальные регуляторы». Тенденции Genet . 19 (5): 286–93. CiteSeerX  10.1.1.464.415 . DOI : 10.1016 / S0168-9525 (03) 00073-8 . PMID  12711221 .
  • Ху Э, Чен З., Фредриксон Т. и др. (2000). «Клонирование и характеристика новой гистон-деацетилазы класса I человека, которая функционирует как репрессор транскрипции» . J. Biol. Chem . 275 (20): 15254–64. DOI : 10.1074 / jbc.M908988199 . PMID  10748112 .
  • Багги Дж.Дж., Сидерис М.Л., Мак П. и др. (2001). «Клонирование и характеристика новой деацетилазы гистонов человека, HDAC8» . Biochem. Дж . 350 (1): 199–205. DOI : 10.1042 / 0264-6021: 3500199 . PMC  1221242 . PMID  10926844 .
  • Аманн Дж. М., Нип Дж., Стром Д. К. и др. (2001). «ETO, мишень t (8; 21) при остром лейкозе, устанавливает четкие контакты с множественными гистоновыми деацетилазами и связывает mSin3A через свой домен олигомеризации» . Мол. Клетка. Биол . 21 (19): 6470–83. DOI : 10.1128 / MCB.21.19.6470-6483.2001 . PMC  99794 . PMID  11533236 .
  • Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). «Создание и первоначальный анализ более 15 000 полноразмерных последовательностей кДНК человека и мыши» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 99 (26): 16899–903. DOI : 10.1073 / pnas.242603899 . PMC  139241 . PMID  12477932 .
  • Дерст К.Л., Люттербах Б., Куммалуэ Т. и др. (2003). «Слитый белок inv (16) связывается с корепрессорами через домен тяжелой цепи миозина гладких мышц» . Мол. Клетка. Биол . 23 (2): 607–19. DOI : 10.1128 / MCB.23.2.607-619.2003 . PMC  151524 . PMID  12509458 .
  • Родригес М., Ю Икс, Чен Дж, Сунъян Зи (2004). «Специфичность связывания фосфопептида COOH-концевых (BRCT) доменов BRCA1» . J. Biol. Chem . 278 (52): 52914–8. DOI : 10.1074 / jbc.C300407200 . PMID  14578343 .
  • Джонсон Дж. М., Касл Дж., Гаррет-Энгель П. и др. (2004). «Полногеномный обзор альтернативного сплайсинга пре-мРНК человека с помощью микрочипов соединения экзонов». Наука . 302 (5653): 2141–4. CiteSeerX  10.1.1.1017.9438 . DOI : 10.1126 / science.1090100 . PMID  14684825 .
  • Ли Х, Резай-Заде Н., Сето Э (2004). «Отрицательная регуляция активности гистондеацетилазы 8 циклической АМФ-зависимой протеинкиназой А» . Мол. Клетка. Биол . 24 (2): 765–73. DOI : 10.1128 / MCB.24.2.765-773.2004 . PMC  343812 . PMID  14701748 .
  • Ваннини А., Вольпари С., Филокамо Г. и др. (2004). «Кристаллическая структура эукариотической цинк-зависимой гистондеацетилазы, человеческого HDAC8, в комплексе с ингибитором гидроксамовой кислоты» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 101 (42): 15064–9. DOI : 10.1073 / pnas.0404603101 . PMC  524051 . PMID  15477595 .
  • Валтрегни Д., Норт Б., Ван Меллерт Ф. и др. (2005). «Скрининг экспрессии гистондеацетилаз (HDAC) при раке простаты человека выявляет различные профили HDAC класса I между эпителиальными и стромальными клетками». Европейский журнал гистохимии . 48 (3): 273–90. PMID  15590418 .
  • Валтрегни Д., Глениссон В., Тран С.Л. и др. (2006). «Гистоновая деацетилаза HDAC8 связывается с альфа-актином гладких мышц и необходима для сократимости гладкомышечных клеток». FASEB J . 19 (8): 966–8. DOI : 10.1096 / fj.04-2303fje . PMID  15772115 .
  • Gantt SL, Gattis SG, Fierke CA (2006). «Каталитическая активность и ингибирование гистондеацетилазы 8 человека зависит от идентичности иона металла в активном центре». Биохимия . 45 (19): 6170–8. DOI : 10.1021 / bi060212u . PMID  16681389 .
  • Ли Х., Сенгупта Н., Виллагра А. и др. (2006). «Гистоновая деацетилаза 8 предохраняет человеческий белок все более коротких теломер 1B (hEST1B) от разрушения, опосредованного убиквитином» . Мол. Клетка. Биол . 26 (14): 5259–69. DOI : 10.1128 / MCB.01971-05 . PMC  1592721 . PMID  16809764 .
  • Ваннини А., Вольпари С., Галлинари П. и др. (2007). «Связывание субстрата с гистоновыми деацетилазами, как показано кристаллической структурой комплекса HDAC8-субстрат» . EMBO Reports . 8 (9): 879–84. DOI : 10.1038 / sj.embor.7401047 . PMC  1973954 . PMID  17721440 .
  • Накагава М., Ода Ю., Эгути Т. и др. (2007). «Профиль экспрессии гистоновых деацетилаз класса I в раковых тканях человека» . Онкол. Rep . 18 (4): 769–74. DOI : 10.3892 / or.18.4.769 . PMID  17786334 .

Внешние ссылки [ править ]

  • HDAC8 + белок, + человеческий по медицинским предметным рубрикам Национальной медицинской библиотеки США (MeSH)

Эта статья включает текст из Национальной медицинской библиотеки США , которая находится в свободном доступе .