Гаплогруппа L5 (мтДНК)

Гаплогруппа L5
Возможное время происхождения	114,200-126,200 YBP ^[1]
Возможное место происхождения	Восточная Африка , Долина Верхнего Нила
Предок	L2-6
Потомки	L5a , L5c
Определение мутаций	3423, 7972, 12432, 12950 ^[2]

Гаплогруппа L5 представляет собой кладу митохондриальной ДНК человека (мтДНК). Ранее он был известен как L1e .

Происхождение [ править ]

Этот раздел пуст. Вы можете помочь, добавив к нему . ( Декабрь 2009 г. )

Распространение [ править ]

L5 - небольшая гаплогруппа с центром в Восточной Африке . Самая высокая частота у пигмеев мбути из восточной части Центральной Африки - 15%. ^[3] Он присутствует с относительно небольшими частотами в Танзании ( Сандаве и другие), Кении, Эфиопии, Судане, Нубии, Египте ^[4]^{[Примечание 1]} и Саудовской Аравии. ^[5]

Гаплогруппа L5 была обнаружена среди образцов на островном кладбище в Кулубнарти , Судан , которые датируются раннехристианским периодом (550–800 гг. Нашей эры). ^[6]

Субклады [ править ]

Дерево [ править ]

Это филогенетическое дерево субкладов гаплогруппы L5 основано на статье Манниса ван Овена и Манфреда Кайзера. Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека ^[2] и последующих опубликованных исследований.

Самый недавний общий предок (MRCA)
- L1-6
  - L2-6
    - L5
      - L5a
        L5a1
        L5a1a
        L5a1b
        L5a1c
        L5a2
      - L5c
        L5c1
        L5c2

Ссылки [ править ]

^ Соарес, P; Эрмини, L; Томсон, Н. Мормина, М; Рито, Т; Рель, А; Салас, А; Оппенгеймер, S; Маколей, V (2009). «Поправка на очищающий отбор: улучшенные митохондриальные молекулярные часы человека» . Американский журнал генетики человека . 84 (6): 740–59. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2009.05.001 . PMC 2694979 . PMID 19500773 .
^ а б ван Овен, Маннис; Манфред Кайзер (13 октября 2008 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Мутация человека . 30 (2): E386 – E394. DOI : 10.1002 / humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .
^ Сара А. Тишкофф и др. 2007, История говорящих по клику популяций Африки, полученная на основе генетической изменчивости мтДНК и Y-хромосомы. Молекулярная биология и эволюция 2007 24 (10): 2180-2195.
^ Стеванович, А; А. Жиль; Э. Бузаид; Р. Кефи; Ф. Пэрис; Р.П. Гейро; JL Spadoni; Ф. Эль-Ченауи; Э. Беро-Коломб (29 января 2004 г.). «Разнообразие последовательностей митохондриальной ДНК у оседлого населения из Египта». Анналы генетики человека . 68 (1): 23–39. DOI : 10.1046 / j.1529-8817.2003.00057.x . PMID 14748828 . S2CID 44901197 .
^ Абу-Амеро и др. 2008 Февраль. «Структура митохондриальной ДНК на Аравийском полуострове» , BMC Evolutionary Biology. 8 (45): 52.
^ Сирак, Кендра; Френандес, Даниэль; Новак, Марио; Ван Гервен, Деннис; Пинхаси, Рон (2016). Тезисы докладов Межконгресса IUAES 2016 - Сообщество разделилось? Выявление генома (ов) сообщества средневековой Кулубнарти с использованием секвенирования следующего поколения . IUAES.CS1 maint: uses authors parameter (link)

Заметки [ править ]

^ Образец UPE52 является подкладом L5a.

Внешние ссылки [ править ]

Викискладе есть медиафайлы, связанные с гаплогруппой L5 (мтДНК) .

Общий
- Гаплогруппы Яна Логана L5.
- Филотрия Манниса ван Овена

Филогенетическое дерево гаплогрупп митохондриальной ДНК человека (мтДНК)

Митохондриальная Ева ( L )

L0

L1–6

L1

L2

L3

L4

L5

L6

M

N

CZ

D

E

грамм

Q

О

А

S

р

я

W

Икс

Y

C

Z

B

F

R0

pre-JT

п

U

HV

JT

K

ЧАС

V

J

Т

Эта статья о генетике - незавершенная . Вы можете помочь Википедии, расширив ее .

[soares-1] Соарес, P; Эрмини, L; Томсон, Н. Мормина, М; Рито, Т; Рель, А; Салас, А; Оппенгеймер, S; Маколей, V (2009). «Поправка на очищающий отбор: улучшенные митохондриальные молекулярные часы человека» . Американский журнал генетики человека . 84 (6): 740–59. DOI : 10.1016 / j.ajhg.2009.05.001 . PMC 2694979 . PMID 19500773 .

[vanOven-2] а б ван Овен, Маннис; Манфред Кайзер (13 октября 2008 г.). «Обновленное комплексное филогенетическое дерево глобальных вариаций митохондриальной ДНК человека» . Мутация человека . 30 (2): E386 – E394. DOI : 10.1002 / humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .

[3] Сара А. Тишкофф и др. 2007, История говорящих по клику популяций Африки, полученная на основе генетической изменчивости мтДНК и Y-хромосомы. Молекулярная биология и эволюция 2007 24 (10): 2180-2195.

[Stevanovitch-4] Стеванович, А; А. Жиль; Э. Бузаид; Р. Кефи; Ф. Пэрис; Р.П. Гейро; JL Spadoni; Ф. Эль-Ченауи; Э. Беро-Коломб (29 января 2004 г.). «Разнообразие последовательностей митохондриальной ДНК у оседлого населения из Египта». Анналы генетики человека . 68 (1): 23–39. DOI : 10.1046 / j.1529-8817.2003.00057.x . PMID 14748828 . S2CID 44901197 .

[6] Абу-Амеро и др. 2008 Февраль. «Структура митохондриальной ДНК на Аравийском полуострове» , BMC Evolutionary Biology. 8 (45): 52.

[7] Сирак, Кендра; Френандес, Даниэль; Новак, Марио; Ван Гервен, Деннис; Пинхаси, Рон (2016). Тезисы докладов Межконгресса IUAES 2016 - Сообщество разделилось? Выявление генома (ов) сообщества средневековой Кулубнарти с использованием секвенирования следующего поколения . IUAES.CS1 maint: uses authors parameter (link)

[5] Образец UPE52 является подкладом L5a.

[1]