Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Конвергенция гаплотипов - это несвязанное появление идентичных  гаплотипов  в разных популяциях в результате либо  конвергентной эволюции,  либо случайного совпадения .

Описание [ править ]

Пример сети гаплотипов, используемой для демонстрации родства между популяциями на основе общих гаплотипов. В случае конвергенции гаплотипов между популяциями можно сделать вывод из сети гаплотипов, что эти популяции более тесно связаны, чем они есть на самом деле. 

Конвергенция гаплотипов встречается редко из-за большой вероятности того, что два неродственных человека независимо развивают точно такую ​​же генетическую последовательность в интересующем участке. Таким образом, гаплотипы являются общими в основном между очень близкими людьми, поскольку генетическая информация у двух родственных особей будет намного более похожей, чем у несвязанных людей. [1] Смещение замещения дополнительно увеличивает вероятность конвергенции гаплотипов, так как это увеличивает вероятность мутаций, происходящих в одном и том же сайте. [2] Последовательности также могут отличаться от той же исходной последовательности, а затем возвращаться обратно, сходясь таким образом. [3]Конвергенция через конвергентную эволюцию в двух не связанных между собой группах встречается гораздо реже, поскольку производные черты могут возникать совершенно разными путями. [4] [5]

Ошибочное определение того, что два человека действительно идентичны из-за конвергенции гаплотипов, становится гораздо менее вероятным при тестировании большего количества генетических маркеров, поскольку для этого потребуется большее количество чрезвычайно редких совпадений. [6] Благодаря современным подходам к высокопроизводительному секвенированию, секвенирование большого набора маркеров или даже всего генома становится гораздо более осуществимым и значительно сводит к минимуму эти проблемы. [7]

Примеры [ править ]

В некоторых регионах из-за низкого разнообразия гена Y-STR (часто используемого для изучения происхождения фамилии) конвергенция гаплотипов может сбивать с толку анализ, делая вывод, что неродственные люди очень тесно связаны. [8]

Точно так же исследование гаплогрупп митохондриальной ДНК Нового Света показало, что сходство гаплотипов у коренных американцев и азиатов было результатом гипервариабельности области HVSI в митохондриальной ДНК, а не общего происхождения. [2]

В качестве примера конвергенции гаплотипов из-за конвергентной эволюции в более отдаленных родственных группах, трехногая колюшка  в условиях черной воды, аналогичная таковой у древнего  синеголового киллифа  и  черного леща, независимо развила один и тот же гаплотип в гене SWS2, что способствует лучшему зрению в этих условиях. [9]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Бреннер, Чарльз Х. (2014-01-01). «Понимание вероятности совпадения гаплотипа Y». Международная судебная медицина: генетика . 8 (1): 233–243. DOI : 10.1016 / j.fsigen.2013.10.007 . PMID  24315614 .
  2. ^ a b Malhi, Ripan S .; Эшлеман, Джейсон А .; Гринберг, Джонатан А .; Weiss, Deborah A .; Шук, Бет А. Шульц; Kaestle, Frederika A .; Лоренц, Джозеф Дж .; Кемп, Брайан М .; Джонсон, Джон Р. (2002-04-01). «Структура разнообразия в гаплогруппах митохондриальной ДНК Нового Света: последствия для предыстории Северной Америки» . Американский журнал генетики человека . 70 (4): 905–919. DOI : 10.1086 / 339690 . PMC 379119 . PMID 11845406 .  
  3. ^ Кэрнс, Дж .; Фостер, Польша (август 1991 г.). «Адаптивная реверсия мутации сдвига рамки в Escherichia Coli» . Генетика . 128 (4): 695–701. ISSN 0016-6731 . PMC 1204544 . PMID 1916241 .   
  4. ^ Бреннер, Чарльз Х. (2014). «Понимание вероятности совпадения гаплотипа Y». Международная судебная медицина: генетика . 8 (1): 233–243. DOI : 10.1016 / j.fsigen.2013.10.007 . PMID 24315614 . 
  5. ^ Стерн, Дэвид Л. (2013). «Генетические причины конвергентной эволюции». Природа Обзоры Генетики . 14 (11): 751–764. DOI : 10.1038 / nrg3483 . ISSN 1471-0064 . PMID 24105273 . S2CID 15282549 .   
  6. ^ «Общие гаплотипы» . ancestry.com. 14 декабря 2006 . Проверено 28 марта 2012 года . CS1 maint: discouraged parameter (link)[ нужен лучший источник ]
  7. ^ Blair, C .; Мерфи, RW (01.01.2011). «Последние тенденции в молекулярном филогенетическом анализе: что делать дальше?» . Журнал наследственности . 102 (1): 130–138. DOI : 10.1093 / jhered / esq092 . ISSN 0022-1503 . PMID 20696667 .  
  8. ^ Соле-Мората, Неус; Вильяэскуса, Патрисия; Гарсиа-Фернандес, Карла; Font-Porterias, Neus; Ильескас, Мария Хосе; Вальверде, Лаура; Тасси, Франческа; Гиротто, Сильвия; Ферек, Клод (2017-08-04). «Анализ гаплогруппы R1b-DF27 показывает, что большая часть иберийских линий Y-хромосомы возникла недавно in situ» . Научные отчеты . 7 (1): 7341. Bibcode : 2017NatSR ... 7.7341S . DOI : 10.1038 / s41598-017-07710-х . ISSN 2045-2322 . PMC 5544771 . PMID 28779148 .   
  9. ^ Marques, Дэвид A .; Тейлор, Джон С .; Джонс, Фелисити С .; Пальма, Федерика Ди; Кингсли, Дэвид М .; Реймхен, Томас Э. (11 апреля 2017 г.). «Конвергентная эволюция опсина SWS2 способствует адаптивному излучению трехиглой колюшки в различные световые среды» . PLOS Биология . 15 (4): e2001627. DOI : 10.1371 / journal.pbio.2001627 . ISSN 1545-7885 . PMC 5388470 . PMID 28399148 .