База данных гистонов представляет собой всеобъемлющую базу данных последовательностей гистоновых белков , включая варианты гистонов , классифицированных по типам и вариантам гистонов, поддерживаемую Национальным центром биотехнологической информации . Создание базы данных гистонов было стимулировано рентгеноструктурным анализом структуры нуклеосомного корового гистонового октамера [2] с последующим применением нового метода поиска мотива к группе белков, содержащих мотив гистоновой складки на ранних стадиях. середина 1990-х. [3] Первая версия базы данных гистонов была выпущена в 1995 году [4] , и с тех пор было выпущено несколько обновлений. [5] [6] [7][8] [9] [10] [11]
Текущая версия базы данных гистонов — HistoneDB 2.0 — с вариантами — включает последовательности и структурные аннотации для всех пяти типов гистонов (H3, H4, H2A, H2B, H1) и основных вариантов гистонов.внутри каждого типа гистонов. Он имеет множество интерактивных инструментов для изучения и сравнения последовательностей различных вариантов гистонов из разных организмов. Ядро базы данных представляет собой подобранный вручную набор последовательностей гистонов, сгруппированных в 30 различных подмножеств вариантов с аннотациями, специфичными для вариантов. Кураторский набор дополняется автоматически извлеченным набором последовательностей гистонов из базы данных неизбыточных белков с использованием алгоритмов, обученных на курируемом наборе. Интерактивный веб-сайт поддерживает различные стратегии поиска в обоих наборах данных: просмотр филогенетических деревьев; генерация по запросу нескольких выравниваний последовательностей с аннотациями признаков; классификация гистоноподобных последовательностей и просмотр таксономического разнообразия для каждого варианта гистона.