Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Схематическое изображение сборки ядер гистонов в нуклеосому.

В биологии , гистоны являются очень основные белки , найденные в эукариотических клеточных ядер , что пакет и порядка ДНК в структурных единицах , называемых нуклеосом . [1] [2] Гистоны богаты лизином и аргинином . Гистоны - главные белковые компоненты хроматина , действующие как катушки, вокруг которых наматывается ДНК, и играющие роль в регуляции генов . Без гистонов развернутая ДНК в хромосомах была бы очень длинной (отношение длины к ширине более 10 миллионов к 1 в ДНК человека). Например, каждый человекдиплоидная клетка (содержащая 23 пары хромосом) имеет около 1,8 метра ДНК; Намотанная на гистоны, диплоидная клетка имеет около 90 микрометров (0,09 мм) хроматина. Когда диплоидные клетки дублируются и конденсируются во время митоза , получается около 120 микрометров хромосом . [3]

Классы и варианты гистонов [ править ]

Существует пять основных семейств гистонов: H1 / H5 , H2A , H2B , H3 и H4 . [2] [4] [5] [6] Гистоны H2A, H2B, H3 и H4 известны как гистоны ядра, а гистоны H1 / H5 известны как гистоны-линкеры.

Все коровые гистоны существуют в виде димеров , которые похожи в том, что все они обладают складчатым доменом гистонов: тремя альфа-спиралями, связанными двумя петлями. Именно эта спиральная структура позволяет взаимодействовать между отдельными димерами, особенно в стиле «голова-хвост» (также называемом мотивом рукопожатия). [7] Полученные четыре различных димера затем объединяются, чтобы сформировать одно октамерное ядро нуклеосомы , приблизительно 63 Angstrom в диаметре ( соленоид (ДНК) -подобная частица). Около 146 пар оснований (п.н.) ДНК оборачиваются вокруг этой ядерной частицы 1,65 раза в левом супеспиральном повороте, чтобы получить частицу размером около 100 ангстрем. [8] Линкерный гистон H1 связывает нуклеосому на участках входа и выхода ДНК, таким образом фиксируя ДНК на месте [9] и позволяя формировать структуру более высокого порядка. Самым основным из таких образований является волокно или бусинки длиной 10 нм на нити. Это включает в себя обертывание ДНК вокруг нуклеосом примерно с 50 парами оснований ДНК, разделяющими каждую пару нуклеосом (также называемую линкерной ДНК ). Структуры более высокого порядка включают 30-нм волокно (образующее неправильный зигзаг) и 100-нм волокно, это структуры, обнаруженные в нормальных клетках. Во время митоза и мейоза конденсированные хромосомы собираются посредством взаимодействий между нуклеосомами и другими регуляторными белками.

Гистоны подразделяются на канонические репликации зависят от гистонов, которые экспрессируются во время S-фазе от клеточного цикла и репликаций независимых вариантов гистонов , выраженные в течение всего клеточного цикла. У животных гены, кодирующие канонические гистоны, обычно сгруппированы вдоль хромосомы, не имеют интронов и используют структуру петли стебля на 3'-конце вместо полиА-хвоста.. Гены, кодирующие варианты гистонов, обычно не кластеризованы, имеют интроны, а их мРНК регулируются полиА-хвостами. Сложные многоклеточные организмы обычно имеют большее количество вариантов гистонов, обеспечивающих множество различных функций. В последнее время накапливаются данные о роли различных вариантов гистонов, подчеркивающие функциональные связи между вариантами и тонкую регуляцию развития организма. [10] Варианты гистонов от разных организмов, их классификацию и особенности вариантов можно найти в базе данных «HistoneDB 2.0 - Варианты» .

Ниже приводится список белков гистонов человека:

Супер семьяСемьяПодсемействоЧлены
КомпоновщикH1H1FH1F0 , H1FNT , H1FOO , H1FX
H1H1HIST1H1A , HIST1H1B , HIST1H1C , HIST1H1D , HIST1H1E , HIST1H1T
ОсновнойH2AH2AFH2AFB1 , H2AFB2 , H2AFB3 , H2AFJ , H2AFV , H2AFX , H2AFY , H2AFY2 , H2AFZ
H2A1HIST1H2AA , HIST1H2AB , HIST1H2AC , HIST1H2AD , HIST1H2AE , HIST1H2AG , HIST1H2AI , HIST1H2AJ , HIST1H2AK , HIST1H2AL , HIST1H2AM
H2A2HIST2H2AA3 , HIST2H2AC
H2BH2BFH2BFM , H2BFS , H2BFWT
H2B1HIST1H2BA , HIST1H2BB , HIST1H2BC , HIST1H2BD , HIST1H2BE , HIST1H2BF , HIST1H2BG , HIST1H2BH , HIST1H2BI , HIST1H2BJ , HIST1H2BK , HIST1H2BLH2 , HISTN2BK , HIST1H2BL , HISTN2
H2B2HIST2H2BE
H3H3A1HIST1H3A , HIST1H3B , HIST1H3C , HIST1H3D , HIST1H3E , HIST1H3F , HIST1H3G , HIST1H3H , HIST1H3I , HIST1H3J
H3A2HIST2H3C
H3A3HIST3H3
H4H41HIST1H4A , HIST1H4B , HIST1H4C , HIST1H4D , HIST1H4E , HIST1H4F , HIST1H4G , HIST1H4H , HIST1H4I , HIST1H4J , HIST1H4K , HIST1H4L
H44HIST4H4

Структура [ править ]

Этапы сборки нуклеосом

Нуклеосом сердечник образован из двух Н2А-H2B димеров и тетрамера Н3-Н4, образуя две почти симметричные половины от третичной структуры ( С2 симметрии, одна макромолекула является зеркальным отражением другого). [8] Димеры H2A-H2B и тетрамер H3-H4 также демонстрируют псевдодиадную симметрию. 4 «ядерных» гистона (H2A, H2B, H3 и H4) относительно схожи по структуре и высоко консервативны в процессе эволюции , все они имеют мотив « спираль, поворот спирали, поворот спирали» (мотив ДНК-связывающего белка, который распознает конкретную последовательность ДНК) . У них также есть характерная черта длинных «хвостов» на одном конце аминокислоты.структура - это место посттрансляционной модификации (см. ниже). [11]

Гистон архей содержит только H3-H4-подобную димерную структуру, состоящую из того же белка. Такие димерные структуры могут складываться в высокую суперспираль («гипернуклеосому»), на которую наматывается ДНК, подобно катушкам нуклеосом. [12] Только у некоторых гистонов архей есть хвосты. [13]

Было высказано предположение, что гистоновые белки эволюционно связаны со спиральной частью расширенного AAA + АТФазного домена, С-доменом и с N-концевым доменом узнавания субстрата белков Clp / Hsp100. Несмотря на различия в их топологии, эти три складки имеют гомологичный мотив спираль-цепь-спираль (HSH). [11]

Используя метод спин-мечения с помощью электронного парамагнитного резонанса , британские исследователи измерили расстояния между катушками, вокруг которых эукариотические клетки наматывают свою ДНК. Они определили диапазон расстояний от 59 до 70 Å. [14]

В целом гистоны взаимодействуют с ДНК пяти типов:

  • Спиральные диполи образуют альфа-спирали в H2B, H3 и H4, вызывая накопление чистого положительного заряда в точке взаимодействия с отрицательно заряженными фосфатными группами на ДНК.
  • Водородные связи между основной цепью ДНК и амидной группой в основной цепи гистоновых белков
  • Неполярные взаимодействия гистоновых и дезоксирибозных сахаров на ДНК
  • Солевые мостики и водородные связи между боковыми цепями основных аминокислот (особенно лизина и аргинина ) и фосфатными атомами кислорода на ДНК
  • Неспецифические вставки малых бороздок N-концевых хвостов H3 и H2B в две малые бороздки на молекуле ДНК каждая

Очень основная природа гистонов, помимо облегчения взаимодействия ДНК-гистонов, способствует их растворимости в воде.

Гистоны подвергаются посттрансляционной модификации ферментами в первую очередь на их N-концевых хвостах, но также и в их глобулярных доменах. [15] [16] Такие модификации включают метилирование , цитруллинирование , ацетилирование , фосфорилирование , сумоилирование , убиквитинирование и АДФ-рибозилирование . Это влияет на их функцию генной регуляции.

В общем, активные гены имеют меньше связанного гистона, в то время как неактивные гены сильно связаны с гистонами во время интерфазы . [17] Также кажется, что структура гистонов была эволюционно консервативной, так как любые вредные мутации были бы сильно дезадаптивными. Все гистоны имеют высоко положительно заряженный N-конец с множеством остатков лизина и аргинина .

История [ править ]

Гистоны были обнаружены в 1884 году Альбрехтом Косселем . [18] Слово «гистон» датируется концом 19 века и происходит от немецкого слова «Histon» , само слово неопределенного происхождения - возможно, от греческого histanai или histos .

В начале 1960-х годов, до того, как были известны типы гистонов и до того, как стало известно, что гистоны высоко консервативны в различных таксономически разнообразных организмах, Джеймс Ф. Боннер и его сотрудники начали изучение этих белков, которые, как было известно, были тесно связаны с ДНК в организме человека. ядро высших организмов. [19] Боннер и его научный сотрудник Ру Чжи К. Хуанг показали, что изолированный хроматин не поддерживает транскрипцию РНК в пробирке, но если гистоны были извлечены из хроматина, РНК могла быть транскрибирована из оставшейся ДНК. [20] Их статья стала классикой цитирования. [21] Пол Т'со и Джеймс Боннер созвали Всемирный конгресс по химии и биологии гистонов в 1964 году, на котором стало ясно, что нет единого мнения о количестве видов гистонов и что никто не знает, как они будут сравнивать, если их изолировать от разные организмы. [22] [19] Затем Боннер и его сотрудники разработали методы разделения каждого типа гистонов, очистили отдельные гистоны, сравнили аминокислотный состав в одном и том же гистоне из разных организмов и сравнили аминокислотные последовательности одного и того же гистона из разных организмов в сотрудничестве. с Эмилем Смитом из Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе. [23] Например, они обнаружили, что последовательность гистона IV является высококонсервативной между горохом и тимусом теленка. [23] Однако их работа над биохимическими характеристиками отдельных гистонов не показала, как гистоны взаимодействуют друг с другом или с ДНК, с которой они были прочно связаны. [22]

Также в 1960-х годах Винсент Олфри и Альфред Мирски предположили, основываясь на своем анализе гистонов, что ацетилирование и метилирование гистонов может обеспечить механизм контроля транскрипции, но не имели доступа к детальному анализу, который более поздние исследователи смогли провести. чтобы показать, как такое регулирование может быть специфичным для генов. [24] До начала 1990-х годов гистоны отвергались большинством как инертный упаковочный материал для ядерной ДНК эукариот, точка зрения, частично основанная на моделях Марка Пташне и других, которые считали, что транскрипция активируется белок-ДНК и белок-белок. взаимодействуют в основном с голыми матрицами ДНК, как в случае с бактериями.

В течение 1980-х Яхли Лорч и Роджер Корнберг [25] показали, что нуклеосома на кор- промоторе предотвращает инициацию транскрипции in vitro, а Майкл Грюнштейн [26] продемонстрировал, что гистоны репрессируют транскрипцию in vivo, что привело к идее нуклеосомы как генеральный репрессор генов. Считается, что облегчение репрессии связано как с модификацией гистонов, так и с действием комплексов ремоделирования хроматина. Винсент Олфри и Альфред Мирски ранее предложили роль модификации гистонов в активации транскрипции [27], рассматриваемую как молекулярное проявление эпигенетики. Майкл Грюнштейн [28] и Дэвид Аллис [29] нашли поддержку этого предложения в важности ацетилирования гистонов для транскрипции в дрожжах и активности активатора транскрипции Gcn5 в качестве гистонацетилтрансферазы.

Открытие гистона H5 , как представляется , восходит к 1970 - е годы, [30] , и это теперь считается изоформы из гистона H1 . [2] [4] [5] [6]

Сохранение различных видов [ править ]

Основные гистоны находятся в ядрах в эукариотических клетках и в большинстве архейных фил, но не в бактериях . [13] Одноклеточные водоросли, известные как динофлагелляты, ранее считались единственными эукариотами, у которых полностью отсутствуют гистоны [31], однако более поздние исследования показали, что их ДНК по-прежнему кодирует гистоновые гены. [32] В отличие от основных гистонов, в бактериях обнаружены богатые лизином линкерные гистоны (H1), также известные как нуклеопротеины HC1 / HC2. [33]

Гистоны архей могут напоминать эволюционных предшественников гистонов эукариот. [13] Гистоновые белки являются одними из наиболее консервативных белков эукариот, что подчеркивает их важную роль в биологии ядра. [2] : 939 Напротив, зрелые сперматозоиды в основном используют протамины для упаковки своей геномной ДНК, скорее всего потому, что это позволяет им достичь еще более высокого коэффициента упаковки. [34]

В некоторых основных классах есть несколько вариантов форм. Они имеют гомологию аминокислотных последовательностей и структурное сходство ядра с определенным классом основных гистонов, но также имеют свои собственные особенности, которые отличаются от основных гистонов. Эти минорные гистоны обычно выполняют определенные функции метаболизма хроматина. Например, гистон H3-подобный CENPA связан только с центромерной областью хромосомы. Вариант гистона H2A H2A.Z связан с промоторами активно транскрибируемых генов, а также участвует в предотвращении распространения молчащего гетерохроматина . [35] Кроме того, H2A.Z играет роль в хроматине для стабильности генома. [36]Другой вариант H2A, H2A.X, фосфорилируется по S139 в областях вокруг двухцепочечных разрывов и маркирует область, подвергающуюся репарации ДНК . [37] Гистон H3.3 связан с телом активно транскрибируемых генов. [38]

Эволюционное происхождение [ править ]

Нуклеосомные (стержневые) гистоны, возможно, произошли от рибосомных белков ( RPS6 / RPS15 ), с которыми они имеют много общего, будучи короткими и основными белками. [39]

Гистоны линкера имеют гомологи у бактерий. [33]

Функция [ редактировать ]

Основные единицы структуры хроматина

Уплотнение цепей ДНК [ править ]

Гистоны действуют как катушки, вокруг которых наматывается ДНК. Это делает возможным уплотнение, необходимое для размещения больших геномов эукариот внутри ядер клеток: уплотненная молекула в 40 000 раз короче, чем распакованная молекула.

Регулирование хроматина [ править ]

Хвосты гистонов и их функция в образовании хроматина

Гистоны претерпевают посттрансляционные модификации, которые изменяют их взаимодействие с ДНК и ядерными белками. Гистоны H3 и H4 имеют длинные хвосты, выступающие из нуклеосомы , которые могут быть ковалентно модифицированы в нескольких местах. Модификации хвоста включают метилирование , ацетилирование , фосфорилирование , убиквитинирование , SUMOylation , цитруллинирование и ADP-рибозилирование. Ядро гистонов H2A и H2B также может быть изменено. Считается, что комбинации модификаций составляют код, так называемый « гистоновый код ». [40][41] Модификации гистонов действуют в различных биологических процессах, таких как регуляция генов , репарация ДНК , конденсация хромосом ( митоз ) и сперматогенез ( мейоз ). [42]

Общая номенклатура модификаций гистонов:

  • Название гистона (например, H3)
  • Однобуквенные аминокислоты аббревиатуры (например, К для лизин ) и аминокислота в положение белки
  • Тип модификации (Me: метил , P: фосфат , Ac: ацетил , Ub: убиквитин )
  • Количество модификаций (известно, что только Me встречается более чем в одной копии на остаток. 1, 2 или 3 - это моно-, ди- или три-метилирование)

Итак, H3K4me1 обозначает монометилирование 4-го остатка (лизина) от начала (то есть с N-конца ) белка H3.

Примеры модификаций гистонов в регуляции транскрипции
Тип
модификации		Гистон
H3K4H3K9H3K14H3K27H3K79H3K36H4K20H2BK5H2BK20
моно- метилированиеактивация [43]активация [44]активация [44]активация [44] [45]активация [44]активация [44]
диметилированиерепрессии [46]репрессии [46]активация [45]
триметилированиеактивация [47]репрессии [44]репрессии [44]активация, [45]
репрессия [44]		активациярепрессии [46]
ацетилированиеактивация [48]активация [47]активация [47]активация [49]активация


Функции модификаций гистонов [ редактировать ]

Схематическое изображение модификаций гистонов. По материалам Rodriguez-Paredes and Esteller, Nature, 2011.

Был описан огромный каталог модификаций гистонов, но функциональное понимание большинства из них все еще отсутствует. В совокупности считается, что модификации гистонов могут лежать в основе гистонового кода , посредством чего комбинации модификаций гистонов имеют определенные значения. Однако большинство функциональных данных касается отдельных заметных модификаций гистонов, которые биохимически поддаются детальному изучению.

Химия модификаций гистонов [ править ]

Метилирование лизина [ править ]

Добавление одной, двух или многих метильных групп к лизину мало влияет на химию гистона; Метилирование оставляет заряд лизина нетронутым и добавляет минимальное количество атомов, поэтому стерические взаимодействия в основном не затрагиваются. Однако белки, содержащие Tudor, хромо или PHD домены, среди прочего, могут распознавать метилирование лизина с исключительной чувствительностью и дифференцировать моно, ди и триметиллизин до такой степени, что для некоторых лизинов (например, H4K20) моно, ди и три -метилирование, по-видимому, имеет разные значения. Из-за этого метилирование лизина имеет тенденцию быть очень информативной меткой и доминирует над известными функциями модификации гистонов.

Серотонилирование глутамина [ править ]

Недавно было показано, что добавление серотониновой группы к глутамину в положении 5 H3 происходит в серотонинергических клетках, таких как нейроны. Это часть дифференцировки серотонинергических клеток. Эта посттрансляционная модификация происходит вместе с модификацией H3K4me3. Серотонилирование усиливает связывание общего фактора транскрипции TFIID с ТАТА-боксом . [50]

Метилирование аргинина [ править ]

То, что было сказано выше о химии метилирования лизина, также применимо к метилированию аргинина, и некоторые белковые домены - например, тюдоровские домены - могут быть специфичными для метиларгинина вместо метиллизина. Известно, что аргинин моно- или диметилирован, и метилирование может быть симметричным или асимметричным, потенциально с разными значениями.

Цитруллинирование аргинина [ править ]

Ферменты, называемые пептидиларгининдезиминазами (PAD), гидролизуют иминную группу аргининов и присоединяют кетогруппу, так что на аминокислотном остатке на один положительный заряд меньше. Этот процесс участвует в активации экспрессии генов, делая модифицированные гистоны менее прочно связанными с ДНК и, таким образом, делая хроматин более доступным. [51] PAD также могут оказывать противоположный эффект, удаляя или ингибируя монометилирование остатков аргинина на гистонах и, таким образом, противодействуя положительному эффекту метилирования аргинина на транскрипционную активность. [52]

Ацетилирование лизина [ править ]

Добавление ацетильной группы оказывает сильное химическое воздействие на лизин, поскольку нейтрализует положительный заряд. Это снижает электростатическое притяжение между гистоном и отрицательно заряженным остовом ДНК, ослабляя структуру хроматина; высокоацетилированные гистоны образуют более доступный хроматин и, как правило, связаны с активной транскрипцией. Ацетилирование лизина имеет менее точное значение, чем метилирование, поскольку гистоновые ацетилтрансферазы имеют тенденцию действовать более чем на один лизин; по-видимому, это отражает необходимость изменения множества лизинов, чтобы иметь значительный эффект на структуру хроматина. В модификацию входит H3K27ac .

Фосфорилирование серина / треонина / тирозина [ править ]

Добавление отрицательно заряженной фосфатной группы может привести к серьезным изменениям в структуре белка, что приведет к хорошо известной роли фосфорилирования в контроле функции белка. Неясно, какие структурные последствия имеет фосфорилирование гистонов, но фосфорилирование гистонов имеет четкие функции как посттрансляционная модификация, и были охарактеризованы связывающие домены, такие как BRCT.

Функции в транскрипции [ править ]

Наиболее хорошо изученные модификации гистонов участвуют в контроле транскрипции.

Активно транскрибируемые гены [ править ]

Две модификации гистонов особенно связаны с активной транскрипцией:

Триметилирование H3 лизина 4 (H3K4me3)
Это триметилирование происходит на промоторе активных генов [53] [54] [55] и осуществляется комплексом COMPASS . [56] [57] [58] Несмотря на сохранение этого комплекса и модификации гистонов от дрожжей до млекопитающих, не совсем ясно, какую роль играет эта модификация. Однако это отличный признак активных промоторов, и уровень этой модификации гистона на промоторе гена в значительной степени коррелирует с транскрипционной активностью гена. Формирование этой метки связано с транскрипцией довольно запутанным образом: на ранней стадии транскрипции гена РНК-полимераза II переключается с инициирующей на«удлинение» , отмеченное изменением состояний фосфорилирования С-концевого домена РНК-полимеразы II (CTD) . Тот же самый фермент, который фосфорилирует CTD, также фосфорилирует комплекс Rad6 [59] [60], который, в свою очередь, добавляет метку убиквитина к H2B K123 (K120 у млекопитающих). [61] H2BK123Ub встречается во всех транскрибируемых областях, но эта метка необходима для COMPASS для триметилирования H3K4 на промоторах. [62] [63]
Триметилирование H3 лизина 36 ( H3K36me3 )
Это триметилирование происходит в теле активных генов и откладывается метилтрансферазой Set2. [64] Этот белок ассоциируется с удлиняющейся РНК-полимеразой II , а H3K36Me3 указывает на активно транскрибируемые гены. [65] H3K36Me3 распознается гистон-деацетилазным комплексом Rpd3, который удаляет ацетильные модификации из окружающих гистонов, увеличивая уплотнение хроматина и подавляя ложную транскрипцию. [66] [67] [68] Повышенное уплотнение хроматина предотвращает доступ факторов транскрипции к ДНК и снижает вероятность инициации новых событий транскрипции в теле гена. Таким образом, этот процесс помогает гарантировать, что транскрипция не прерывается.

Репрессированные гены [ править ]

Три модификации гистонов особенно связаны с репрессированными генами:

Триметилирование H3 лизина 27 (H3K27me3)
Эта гистоновая модификация депонируется поликомбическим комплексом PRC2. [69] Это явный маркер репрессии генов, [70], и, вероятно, он связан с другими белками, чтобы выполнять репрессивную функцию. Другой комплекс polycomb , PRC1, может связывать H3K27me3 [70] и добавляет модификацию гистона H2AK119Ub, которая способствует уплотнению хроматина. [71] [72] На основании этих данных оказывается, что PRC1 рекрутируется посредством действия PRC2, однако недавние исследования показывают, что PRC1 рекрутируется в те же сайты в отсутствие PRC2. [73] [74]
Ди- и три-метилирование H3 лизина 9 (H3K9me2 / 3)
H3K9me2 / 3 является хорошо охарактеризованным маркером гетерохроматина и, следовательно, сильно связан с репрессией генов. Формирование гетерохроматина лучше всего изучено у дрожжей Schizosaccharomyces pombe , где оно инициируется рекрутированием РНК-индуцированного комплекса подавления транскрипции (RITS) на двухцепочечные РНК, полученные из центромерных повторов. [75] RITS привлекает гистон-метилтрансферазу Clr4, которая откладывает H3K9me2 / 3. [76] Этот процесс называется метилированием гистонов . H3K9Me2 / 3 служит сайтом связывания для рекрутирования Swi6 ( гетерохроматиновый белок 1или HP1, другой классический маркер гетерохроматина) [77] [78], который, в свою очередь, задействует дополнительные репрессивные активности, включая модификаторы гистонов, такие как гистоновые деацетилазы и гистоновые метилтрансферазы . [79]
Триметилирование лизина 20 H4 ( H4K20me 3)
Эта модификация тесно связана с гетерохроматином [80] [81], хотя ее функциональное значение остается неясным. Эта метка ставится с помощью метилтрансферазы Suv4-20h, которая, по крайней мере, частично рекрутируется белком гетерохроматина 1 . [80]

Бивалентные промоутеры [ править ]

Анализ модификаций гистонов в эмбриональных стволовых клетках (и других стволовых клетках) выявил множество промоторов генов, несущих как H3K4Me3, так и H3K27Me3 , другими словами, эти промоторы отображают как активирующие, так и репрессирующие метки одновременно. Эта своеобразная комбинация модификаций маркирует гены, готовые к транскрипции; они не требуются в стволовых клетках, но быстро требуются после дифференцировки в некоторые клоны. Как только клетка начинает дифференцироваться, эти двухвалентные промоторы переходят либо в активное, либо в репрессивное состояние, в зависимости от выбранного клона. [82]

Другие функции [ править ]

Повреждение ДНК [ править ]

Маркировка участков повреждения ДНК является важной функцией модификаций гистонов. Он также защищает ДНК от разрушения ультрафиолетовым излучением солнца.

Фосфорилирование H2AX по серину 139 (γH2AX)
Фосфорилированные Н2 (также известные как гамма - H2AX) является маркером ДНК дважды разрывы ДНК , [83] , и образует часть ответа на повреждение ДНК . [37] [84] H2AX фосфорилируется на ранней стадии после обнаружения двухцепочечного разрыва ДНК и образует домен, простирающийся на много тысяч оснований по обе стороны от повреждения. [83] [85] [86] Гамма H2AX действует как сайт связывания для белка MDC1, который, в свою очередь, привлекает ключевые белки репарации ДНК [87] (эта сложная тема хорошо рассмотрена в [88] ) и, как таковая, гамма H2AX образует жизненно важную часть механизма, обеспечивающего стабильность генома.
Ацетилирование лизина 56 H3 (H3K56Ac)
H3K56Acx требуется для стабильности генома. [89] [90] H3K56 ацетилируется комплексом p300 / Rtt109, [91] [92] [93], но быстро деацетилируется вокруг участков повреждения ДНК. Ацетилирование H3K56 также необходимо для стабилизации застопорившихся вилок репликации, предотвращая опасные коллапсы вилок репликации. [94] [95] Хотя в целом млекопитающие гораздо чаще используют модификации гистонов, чем микроорганизмы, основная роль H3K56Ac в репликации ДНК существует только в грибах, и это стало мишенью для разработки антибиотиков. [96]

Ремонт ДНК [ править ]

Триметилирование H3 лизина 36 (H3K36me3)

H3K36me3 обладает способностью рекрутировать комплекс MSH2-MSH6 (hMutSα) пути репарации ошибочного спаривания ДНК . [97] Соответственно, участки генома человека с высокими уровнями H3K36me3 накапливают меньше соматических мутаций из-за активности репарации ошибочного спаривания . [98]

Конденсация хромосом [ править ]

Фосфорилирование H3 по серину 10 (фосфо-H3S10)
Митотическая киназа aurora B фосфорилирует гистон H3 по серину 10, вызывая каскад изменений, которые опосредуют конденсацию митотических хромосом. [99] [100] Конденсированные хромосомы поэтому очень сильно окрашивают эту метку, но фосфорилирование H3S10 также присутствует в определенных хромосомных участках вне митоза, например, в перицентрическом гетерохроматине клеток во время G2. Фосфорилирование H3S10 также было связано с повреждением ДНК, вызванным образованием R-петли в высокотранскрибируемых сайтах. [101]
Фосфорилирование H2B по серину 10/14 (фосфо-H2BS10 / 14)
Фосфорилирование H2B по серину 10 (дрожжи) или серину 14 (млекопитающие) также связано с конденсацией хроматина, но с совершенно другой целью - опосредовать конденсацию хромосом во время апоптоза. [102] [103] Этот знак - не просто поздний наблюдатель апоптоза, поскольку дрожжи, несущие мутации этого остатка, устойчивы к индуцированной перекисью водорода апоптотической гибели клеток.

Зависимость [ править ]

Эпигенетические модификации гистоновых хвостов в определенных областях мозга имеют центральное значение при зависимости. [104] [105] [106] Как только происходят определенные эпигенетические изменения, они, по-видимому, представляют собой длительные «молекулярные шрамы», которые могут объяснить стойкость зависимости. [104]

Курильщики сигарет (около 15% населения США) обычно зависимы от никотина . [107] После 7 дней никотиновой обработки мышей ацетилирование гистона H3 и гистона H4 увеличивалось на промоторе FosB в прилежащем ядре мозга, что приводило к увеличению экспрессии FosB на 61%. [108] Это также увеличило бы экспрессию варианта сплайсинга Delta FosB . В прилежащем ядре мозга Delta FosB действует как «устойчивый молекулярный переключатель» и «главный управляющий белок» в развитии зависимости . [109] [110]

Около 7% населения США страдает алкогольной зависимостью . У крыс, подвергшихся воздействию алкоголя в течение 5 дней, наблюдалось усиление ацетилирования гистона 3, лизина 9 в промоторе пронцицептина в комплексе миндалины мозга . Это ацетилирование является активирующей меткой для пронцицептина. Система опиоидных рецепторов ноцицептина / ноцицептина участвует в усиливающих или кондиционирующих эффектах алкоголя. [111]

Зависимость от метамфетамина встречается примерно у 0,2% населения США. [112] Хроническое употребление метамфетамина вызывает метилирование лизина в положении 4 гистона 3 , расположенном на промоторы этого с-FOS и 2 рецепторов хемокин CC (CCR2) генов, активация этих генов в прилежащем ядре (NAC). [113] c-fos, как известно, важен при зависимости . [114] Ген ccr2 также важен при зависимости, поскольку мутационная инактивация этого гена ослабляет зависимость. [113]

Синтез гистонов [ править ]

Первым этапом дупликации структуры хроматина является синтез гистоновых белков: H1, H2A, H2B, H3, H4. Эти белки синтезируются во время S-фазы клеточного цикла. Существуют различные механизмы, которые способствуют увеличению синтеза гистонов.

Дрожжи [ править ]

Дрожжи несут одну или две копии каждого гистонового гена, которые не сгруппированы, а разбросаны по хромосомам. Транскрипция гена гистона контролируется множеством регуляторных белков гена, таких как факторы транскрипции, которые связываются с участками промотора гистонов. В почкующихся дрожжах ген-кандидат для активации экспрессии гистонового гена - SBF. SBF представляет собой фактор транскрипции, который активируется в поздней фазе G1, когда он диссоциирует от своего репрессора Whi5 . Это происходит, когда Whi5 фосфорилируется Cdc8, который является G1 / S Cdk. [115] Подавление экспрессии гистоновых генов вне S-фаз зависит от белков Hir, которые образуют неактивную структуру хроматина в локусе гистоновых генов, вызывая блокировку активаторов транскрипции. [116][117]

Metazoans [ править ]

У многоклеточных животных увеличение скорости синтеза гистонов обусловлено увеличением процессинга пре-мРНК до ее зрелой формы, а также уменьшением деградации мРНК; это приводит к увеличению активной мРНК для трансляции гистоновых белков. Было обнаружено, что механизм активации мРНК заключается в удалении сегмента на 3'-конце цепи мРНК и зависит от ассоциации с белком, связывающим стержень-петлю ( SLBP ). [118] SLBP также стабилизирует мРНК гистонов во время фазы S, блокируя деградацию нуклеазой 3'hExo. [119]Уровни SLBP контролируются белками клеточного цикла, заставляя SLBP накапливаться, когда клетки входят в S-фазу, и деградировать, когда клетки покидают S-фазу. SLBP маркируются для деградации путем фосфорилирования по двум остаткам треонина циклин-зависимыми киназами, возможно, циклином A / cdk2, в конце S-фазы. [120] Metazoans также имеют несколько копий гистоновых генов, сгруппированных на хромосомах, которые локализованы в структурах, называемых тельцами Кахаля, как определено с помощью анализа захвата конформации хромосомы по всему геному (4C-Seq). [121]

Связь между механизмами контроля клеточного цикла и синтезом гистонов [ править ]

Ядерный белок атаксии-телеангиэктазии (NPAT), также известный как ядерный белок-коактиватор транскрипции гистонов, представляет собой фактор транскрипции, который активирует транскрипцию гена гистона на хромосомах 1 и 6 клеток человека. NPAT также является субстратом циклина E-Cdk2, который необходим для перехода между фазой G1 и фазой S. NPAT активирует экспрессию гена гистона только после того, как он был фосфорилирован G1 / S-Cdk циклином E-Cdk2 в ранней S-фазе. [122] Это показывает важную регуляторную связь между контролем клеточного цикла и синтезом гистонов.

См. Также [ править ]

  • Варианты гистонов
  • Хроматин
  • Подавление гена
  • Генетика
  • Гистонацетилтрансфераза
  • Гистоновые деацетилазы
  • Гистоновая метилтрансфераза
  • Ферменты, модифицирующие гистоны
  • Нуклеосома
  • Путь PRMT4
  • Гистон H1

Ссылки [ править ]

  1. ^ Youngson RM (2006). Словарь Коллинза по биологии человека . Глазго: HarperCollins. ISBN 978-0-00-722134-9.
  2. ^ a b c d Кокс М., Нельсон Д. Р., Ленингер А. Л. (2005). Принципы биохимии Ленингера . Сан-Франциско: WH Freeman. ISBN 978-0-7167-4339-2.
  3. ^ Рэдон С, D Пилч, Rogakou Е, Седельникова О, Newrock К, Боннер Вт (апрель 2002 г.). «Варианты гистона H2A H2AX и H2AZ». Текущее мнение в области генетики и развития . 12 (2): 162–9. DOI : 10.1016 / S0959-437X (02) 00282-4 . PMID 11893489 . 
  4. ^ a b "База данных вариантов гистонов 2.0" . Национальный центр биотехнологической информации . Проверено 13 января 2017 года .
  5. ^ a b Bhasin M, Reinherz EL, Reche PA (2006). «Распознавание и классификация гистонов с использованием машины опорных векторов» (PDF) . Журнал вычислительной биологии . 13 (1): 102–12. DOI : 10,1089 / cmb.2006.13.102 . PMID 16472024 .  
  6. ^ а б Хартл Д.Л., Фрайфельдер Д., Снайдер Л.А. (1988). Основы генетики . Бостон: Джонс и Бартлетт Издательство. ISBN 978-0-86720-090-4.
  7. ^ Mariño-Рамирес L, Kann М.Г., Сапожник Б.А., Ландсман D (октябрь 2005). «Структура гистонов и стабильность нуклеосом» . Экспертный обзор протеомики . 2 (5): 719–29. DOI : 10.1586 / 14789450.2.5.719 . PMC 1831843 . PMID 16209651 .  
  8. ^ a b Luger K, Mäder AW, Richmond RK, Sargent DF, Richmond TJ (сентябрь 1997 г.). «Кристаллическая структура ядерной частицы нуклеосомы при разрешении 2,8 A». Природа . 389 (6648): 251–60. Bibcode : 1997Natur.389..251L . DOI : 10.1038 / 38444 . PMID 9305837 . S2CID 4328827 .   PDB : 1AOI
  9. Перейти ↑ Farkas D (1996). Упрощенная ДНК: автостопом по ДНК . Вашингтон, округ Колумбия: AACC Press. ISBN 978-0-915274-84-0.
  10. ^ Янг, CW; Шибата, Й; Стармер, Дж; Да, D; Магнусон, Т. (1 июля 2015 г.). «Гистон H3.3 поддерживает целостность генома во время развития млекопитающих» . Гены и развитие . 29 (13): 1377–92. DOI : 10,1101 / gad.264150.115 . PMC 4511213 . PMID 26159997 .  
  11. ^ а б Альва В., Аммельбург М., Сёдинг Дж., Лупас А.Н. (март 2007 г.). «О происхождении гистоновой складки» . BMC Структурная биология . 7 : 17. DOI : 10,1186 / 1472-6807-7-17 . PMC 1847821 . PMID 17391511 .  
  12. ^ Mattiroli F, Бхаттачариа S, Дайер П. Н., Белый А. Е., Песочный К, Беркхарт BW, Бирн КР, Ли Т, Ahn Н.Г., Сантанжело TJ, Рив Ю.Н., Люгер К (август 2017 г.). «Структура хроматина на основе гистонов в архее» . Наука . 357 (6351): 609–612. Bibcode : 2017Sci ... 357..609M . DOI : 10.1126 / science.aaj1849 . PMC 5747315 . PMID 28798133 .  
  13. ^ a b c Хеннеман Б., ван Эммерик К., ван Инген Х., Dame RT (сентябрь 2018 г.). «Структура и функции гистонов архей» . PLOS Genetics . 14 (9): e1007582. Bibcode : 2018BpJ ... 114..446H . DOI : 10.1371 / journal.pgen.1007582 . PMC 6136690 . PMID 30212449 .  
  14. ^ Уорд Р, Bowman А, Эль-Mkami Н, Оуэн-Хьюз Т, Норман Д. (февраль 2009 г.). «Измерения PELDOR на большом расстоянии на частице гистонового ядра» . Журнал Американского химического общества . 131 (4): 1348–9. DOI : 10.1021 / ja807918f . PMC 3501648 . PMID 19138067 .  
  15. ^ Mersfelder Е.Л., Parthun MR (19 мая 2006). «Сказка за хвостом: модификации основного домена гистонов и регуляция структуры хроматина» . Исследования нуклеиновых кислот . 34 (9): 2653–62. DOI : 10.1093 / NAR / gkl338 . PMC 1464108 . PMID 16714444 .  
  16. ^ Tropberger P, Schneider R (июнь 2013). «Почесывание (боковой) поверхности регуляции хроматина модификациями гистонов». Структурная и молекулярная биология природы . 20 (6): 657–61. DOI : 10.1038 / nsmb.2581 . PMID 23739170 . S2CID 2956823 .  
  17. ^ Allison, Lizabeth A. (2012). Фундаментальная молекулярная биология, второе издание . Соединенные Штаты Америки: John Wiley & Sons. п. 102. ISBN 9781118059814.
  18. ^ Удача JM (1965). «Химия гистонов: пионеры». В Bonner J, Ts'o P (ред.). Нуклеогистоны . Сан-Франциско, Лондон и Амстердам: Holden-Day, Inc.
  19. ^ a b Боннер, Джеймс (1994). «Главы из моей жизни» . Ежегодный обзор физиологии растений и молекулярной биологии растений . 45 : 1–23. DOI : 10.1146 / annurev.pp.45.060194.000245 .
  20. ^ Huang RC, Боннер J (июль 1962). «Гистон, супрессор синтеза хромосомной РНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 48 (7): 1216–22. Bibcode : 1962PNAS ... 48.1216H . DOI : 10.1073 / pnas.48.7.1216 . PMC 220935 . PMID 14036409 .  
  21. ^ "Huang RC & Bonner J. Histone, супрессор синтеза хромосомной РНК. Proc. Nat. Acad. Sci. США 48: 1216-22, 1962" (PDF) . Citation Classics (12): 79, 20 марта 1978 г.
  22. ^ a b Джеймс Боннер и Пол Т'со (1965) Нуклеогистоны . Holden-Day Inc, Сан-Франциско, Лондон, Амстердам.
  23. ^ а б ДеЛанж Р.Дж., Фамбро Д.М., Смит Э.Л., Боннер Дж. (октябрь 1969 г.). «Гистон IV теленка и гороха. 3. Полная аминокислотная последовательность гистона IV проростков гороха; сравнение с гомологичным гистоном тимуса теленка». Журнал биологической химии . 244 (20): 5669–79. PMID 5388597 . 
  24. ^ Оллфри В.Г., Фолкнер R, Мирский AE (май 1964). «Ацетилирование и метилирование гистонов и их возможная роль в регуляции синтеза РНК» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 51 (5): 786–94. Bibcode : 1964PNAS ... 51..786A . DOI : 10.1073 / pnas.51.5.786 . PMC 300163 . PMID 14172992 .  
  25. ^ Лорч Y, LaPointe JW, Корнберг RD (апрель 1987). «Нуклеосомы подавляют инициацию транскрипции, но допускают удлинение цепи со смещением гистонов». Cell . 49 (2): 203–10. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (87) 90561-7 . PMID 3568125 . S2CID 21270171 .  
  26. ^ Kayne PS, Ким UJ, Хан M, Маллен JR, Yoshizaki F, Grunstein M (октябрь 1988). «Чрезвычайно консервативный N-конец гистона H4 необязателен для роста, но необходим для репрессии молчаливых локусов спаривания у дрожжей». Cell . 55 (1): 27–39. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (88) 90006-2 . PMID 3048701 . S2CID 7994350 .  
  27. ^ Pogo BG, Оллфри В.Г., Мирский А.Е. (апрель 1966). «Синтез РНК и ацетилирование гистонов в процессе активации генов в лимфоцитах» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 55 (4): 805–12. Bibcode : 1966PNAS ... 55..805P . DOI : 10.1073 / pnas.55.4.805 . PMC 224233 . PMID 5219687 .  
  28. ^ Durrin LK, Манн Р., Kayne PS, Grunstein M (июнь 1991). «Для активации промотора in vivo требуется N-концевая последовательность дрожжевого гистона H4». Cell . 65 (6): 1023–31. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (91) 90554-c . PMID 2044150 . S2CID 28169631 .  
  29. ^ Броунелл JE, Чжоу Дж, Ranalli Т, Р Кобаяши, Эдмондсоном Д.Г., Рот С.Ю., Эллиса компакт - диск (март 1996 года). «Гистонацетилтрансфераза A Tetrahymena: гомолог дрожжевого Gcn5p, связывающий ацетилирование гистона с активацией гена» . Cell . 84 (6): 843–51. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (00) 81063-6 . PMID 8601308 . 
  30. ^ Авилес FJ, Chapman GE, Kneale Г.Г., Кран-Robinson C, Брэдбери EM (август 1978). «Конформация гистона H5. Выделение и характеристика глобулярного сегмента» . Европейский журнал биохимии . 88 (2): 363–71. DOI : 10.1111 / j.1432-1033.1978.tb12457.x . PMID 689022 . 
  31. ↑ Rizzo PJ (август 2003 г.). «Эти удивительные хромосомы динофлагеллят» . Клеточные исследования . 13 (4): 215–7. DOI : 10.1038 / sj.cr.7290166 . PMID 12974611 . 
  32. ^ Талберт PB, Henikoff S (2012). «Хроматин: упаковка без нуклеосом» . Текущая биология . 22 (24): R1040 – R1043. DOI : 10.1016 / j.cub.2012.10.052 . PMID 23257187 . 
  33. ^ a b Kasinsky HE, Lewis JD, Dacks JB, Ausió J (январь 2001 г.). «Происхождение гистонов линкера H1». Журнал FASEB . 15 (1): 34–42. DOI : 10,1096 / fj.00-0237rev . PMID 11149891 . 
  34. ^ Кларк HJ (1992). «Ядерный и хроматиновый состав гамет и ранних эмбрионов млекопитающих». Биохимия и клеточная биология . 70 (10–11): 856–66. DOI : 10.1139 / o92-134 . PMID 1297351 . 
  35. ^ Guillemette В, Батай А.Р., Gévry Н, Адам М, М Бланшетт, Роберт Ж, Гудро л (декабрь 2005 г.). «Вариант гистона H2A.Z глобально локализован на промоторах неактивных генов дрожжей и регулирует расположение нуклеосом» . PLOS Биология . 3 (12): e384. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0030384 . PMC 1275524 . PMID 16248679 .  
  36. ^ Биллон P, J Кота (октябрь 2011). «Точное отложение гистона H2A.Z в хроматине для экспрессии и поддержания генома». Biochim Biophys Acta . 1819 (3–4): 290–302. DOI : 10.1016 / j.bbagrm.2011.10.004 . PMID 22027408 . 
  37. ^ a b Паулл Т.Т., Рогаку Е.П., Ямазаки В., Кирхгесснер К.У., Геллерт М., Боннер В.М. (2000). «Критическая роль гистона H2AX в рекрутировании факторов репарации в ядерные фокусы после повреждения ДНК» . Текущая биология . 10 (15): 886–95. DOI : 10.1016 / S0960-9822 (00) 00610-2 . PMID 10959836 . 
  38. ↑ Ahmad K, Henikoff S (июнь 2002 г.). «Вариант гистона H3.3 маркирует активный хроматин за счет независимой от репликации сборки нуклеосом» . Молекулярная клетка . 9 (6): 1191–200. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (02) 00542-7 . PMID 12086617 . 
  39. ^ Ханнон Бозоргмехр J (октябрь 2019). «Происхождение хромосомных гистонов в рибосомном белке 30S». Джин . 726 : 144155. дои : 10.1016 / j.gene.2019.144155 . PMID 31629821 . 
  40. ^ Стрэхл BD, CD Allis (январь 2000). «Язык ковалентных модификаций гистонов». Природа . 403 (6765): 41–5. Bibcode : 2000Natur.403 ... 41S . DOI : 10.1038 / 47412 . PMID 10638745 . S2CID 4418993 .  
  41. ^ Jenuwein T, Allis CD (август 2001). «Перевод гистонового кода» (PDF) . Наука . 293 (5532): 1074–80. CiteSeerX 10.1.1.453.900 . DOI : 10.1126 / science.1063127 . PMID 11498575 . S2CID 1883924 .    
  42. ↑ Song N, Liu J, An S, Nishino T, Hishikawa Y, Koji T (август 2011). «Иммуногистохимический анализ модификаций гистона H3 в зародышевых клетках во время сперматогенеза мышей» . Acta Histochemica et Cytochemica . 44 (4): 183–90. DOI : 10,1267 / ahc.11027 . PMC 3168764 . PMID 21927517 .  
  43. ↑ Беневоленская Е.В. (август 2007 г.). «Деметилазы гистона H3K4 необходимы для развития и дифференцировки». Биохимия и клеточная биология . 85 (4): 435–43. DOI : 10.1139 / o07-057 . PMID 17713579 . 
  44. ^ a b c d e f g h Барски А., Куддапах С., Цуй К., Ро Т.Ю., Шонес Д.Э., Ван З., Вэй Г., Чепелев И., Чжао К. (май 2007 г.). «Профилирование с высоким разрешением метилирования гистонов в геноме человека» . Cell . 129 (4): 823–37. DOI : 10.1016 / j.cell.2007.05.009 . PMID 17512414 . 
  45. ^ a b c Steger DJ, Lefterova MI, Ying L, Stonestrom AJ, Schupp M, Zhuo D, Vakoc AL, Kim JE, Chen J, Lazar MA, Blobel GA, Vakoc CR (апрель 2008 г.). «Рекрутирование DOT1L / KMT4 и метилирование H3K79 повсеместно связаны с транскрипцией генов в клетках млекопитающих» . Молекулярная и клеточная биология . 28 (8): 2825–39. DOI : 10.1128 / MCB.02076-07 . PMC 2293113 . PMID 18285465 .  
  46. ^ a b c Розенфельд Дж. А., Ван З., Шонес Д. Е., Чжао К., ДеСалле Р., Чжан М.К. (2009). «Определение модификаций обогащенных гистонов в негенных частях генома человека» . BMC Genomics . 10 : 143. DOI : 10.1186 / 1471-2164-10-143 . PMC 2667539 . PMID 19335899 .  
  47. ^ a b c Кох СМ, Эндрюс Р.М., Фличек П., Диллон С.К., Караоз У., Клелланд Г.К., Уилкокс С., Беар Д.М., Фаулер Дж. К., Куттет П., Джеймс К. Д., Лефевр Г. К., Брюс А. В., Дови О. М., Эллис П. Д., Дами. П., Лэнгфорд К.Ф., Вен З., Бирни Е., Картер Н. П., Ветри Д., Данхэм И. (июнь 2007 г.). «Пейзаж модификаций гистонов в 1% генома человека в пяти линиях клеток человека» . Геномные исследования . 17 (6): 691–707. DOI : 10.1101 / gr.5704207 . PMC 1891331 . PMID 17567990 .  
  48. ^ Guillemette В, Р Drogaris, Лин НН, Армстронг Н, Hiragami-Хамада К, Имхоф А, Bonneil Е, Р Тибо, Verreault А, Festenstein RJ (31 марта 2011). «Лизин 4 H3 ацетилируется по активным промоторам гена и регулируется метилированием лизина 4 H3» . PLOS Genetics . 7 (3): e1001354. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1001354 . PMC 3069113 . PMID 21483810 .  
  49. ^ Creyghton MP, Cheng AW, Welstead GG, Kooistra T, Carey BW, Steine EJ, Hanna J, Lodato MA, Фрамптон GM, Sharp PA Бойер LA, Young RA, Йениш R (декабрь 2010). «Гистон H3K27ac отделяет активные усилители от предполагаемых и предсказывает состояние развития» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (50): 21931–6. DOI : 10.1073 / pnas.1016071107 . PMC 3003124 . PMID 21106759 .  
  50. ^ Фаррелли Л.А., Томпсон Р.Э., Чжао С., Лепак А.Е., Лю Y, Бхану Н.В. и др. (Март 2019 г.). «Серотонилирование гистонов - это разрешающая модификация, которая усиливает связывание TFIID с H3K4me3» . Природа . 567 (7749): 535–539. Bibcode : 2019Natur.567..535F . DOI : 10.1038 / s41586-019-1024-7 . PMC 6557285 . PMID 30867594 .  
  51. ^ Christophorou М.А., Каштелу-Бранку G, Галлей-Стотт Р.П., Оливейра CS, Лоос R, Radzisheuskaya А, Моуэн К.А., Бертоне Р, Сильва JC, Zernicka-Гетц М, Нильсен М.Л., Гэрдон JB, Kouzarides Т (март 2014). «Цитруллинирование регулирует плюрипотентность и связывание гистона H1 с хроматином» . Природа . 507 (7490): 104–8. Bibcode : 2014Natur.507..104C . DOI : 10,1038 / природа12942 . PMC 4843970 . PMID 24463520 .  
  52. ^ Кутберт GL, Daujat S, Сноуден AW, Erdjument-Бромейдж Н, Хагивара Т, Ямада М, R Шнайдер, Грегори П.Д., Tempst Р, Бэннистер AJ, Kouzarides Т (сентября 2004 года). «Удаление гистона препятствует метилированию аргинина» . Cell . 118 (5): 545–53. DOI : 10.1016 / j.cell.2004.08.020 . PMID 15339660 . 
  53. ^ Krogan NJ, Dover J, Wood A, Schneider J, Heidt J, Боатенг MA, Дин K, Райан OW, Golshani A, Джонстон M, Гринблатт JF, Shilatifard A (март 2003). «Комплекс Paf1 необходим для метилирования гистона H3 с помощью COMPASS и Dot1p: связывание удлинения транскрипции с метилированием гистона» . Молекулярная клетка . 11 (3): 721–9. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (03) 00091-1 . PMID 12667454 . 
  54. ^ Ng HH, Роберт F, Young RA, Struhl K (март 2003). «Целенаправленное рекрутирование Set1 гистоновой метилазы путем удлинения Pol II обеспечивает локализованную метку и память о недавней транскрипционной активности» . Молекулярная клетка . 11 (3): 709–19. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (03) 00092-3 . PMID 12667453 . 
  55. ↑ Bernstein BE, Kamal M, Lindblad-Toh K, Bekiranov S, Bailey DK, Huebert DJ, McMahon S, Karlsson EK, Kulbokas EJ, Gingeras TR, Schreiber SL, Lander ES (январь 2005). «Геномные карты и сравнительный анализ модификаций гистонов у человека и мыши» . Cell . 120 (2): 169–81. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.01.001 . PMID 15680324 . 
  56. ^ Krogan NJ, Dover J, Khorrami S, Гринблатт JF, Schneider J Джонстон M, Shilatifard A (март 2002). «COMPASS, гистон H3 (лизин 4) метилтрансфераза, необходимая для теломерного подавления экспрессии генов» . Журнал биологической химии . 277 (13): 10753–5. DOI : 10.1074 / jbc.C200023200 . PMID 11805083 . 
  57. ^ Roguev А, Schaft Д, Шевченко А, Pijnappel WW, Вильма М, Осланд R, Стюарт Ф. (декабрь 2001). «Комплекс Saccharomyces cerevisiae Set1 включает гомолог Ash2 и метилирует гистон 3 лизин 4» . Журнал EMBO . 20 (24): 7137–48. DOI : 10.1093 / emboj / 20.24.7137 . PMC 125774 . PMID 11742990 .  
  58. ^ Nagy PL, Griesenbeck J, Корнберг RD, Клири ML (январь 2002). «Комплекс триторакс-группы, очищенный от Saccharomyces cerevisiae, необходим для метилирования гистона H3» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 99 (1): 90–4. Bibcode : 2002PNAS ... 99 ... 90N . DOI : 10.1073 / pnas.221596698 . PMC 117519 . PMID 11752412 .  
  59. ↑ Wood A, Schneider J, Dover J, Johnston M, Shilatifard A (ноябрь 2005 г.). «Комплекс Bur1 / Bur2 необходим для моноубиквитинирования гистона H2B с помощью Rad6 / Bre1 и метилирования гистона с помощью COMPASS» . Молекулярная клетка . 20 (4): 589–99. DOI : 10.1016 / j.molcel.2005.09.010 . PMID 16307922 . 
  60. ^ Sarcevic В, Моусон А, Бейкер РТ, Sutherland RL (апрель 2002 г.). «Регулирование убиквитин-конъюгированного фермента hHR6A посредством CDK-опосредованного фосфорилирования» . Журнал EMBO . 21 (8): 2009–18. DOI : 10.1093 / emboj / 21.8.2009 . PMC 125963 . PMID 11953320 .  
  61. ^ Robzyk K, Рехт J, Osley MA (январь 2000). «Rad6-зависимое убиквитинирование гистона H2B в дрожжах». Наука . 287 (5452): 501–4. Bibcode : 2000Sci ... 287..501R . DOI : 10.1126 / science.287.5452.501 . PMID 10642555 . 
  62. ↑ Sun ZW, Allis CD (июль 2002 г.). «Убиквитинирование гистона H2B регулирует метилирование H3 и молчание генов у дрожжей». Природа . 418 (6893): 104–8. Bibcode : 2002Natur.418..104S . DOI : 10,1038 / природа00883 . PMID 12077605 . S2CID 4338471 .  
  63. ^ Dover J, J Schneider, Tawiah-Боатенг М.А., Вуд А, Dean K, M Johnston, Shilatifard A (август 2002). «Метилирование гистона H3 с помощью COMPASS требует убиквитинирования гистона H2B с помощью Rad6» . Журнал биологической химии . 277 (32): 28368–71. DOI : 10.1074 / jbc.C200348200 . PMID 12070136 . 
  64. ^ Стрэхл BD, Грант PA, Бриггс SD, вс ZW, Bone JR, Caldwell JA, Молла S, Кук Р., Shabanowitz J, Hunt DF, Allis CD (март 2002). «Set2 представляет собой нуклеосомную гистон-H3-селективную метилтрансферазу, которая опосредует репрессию транскрипции» . Молекулярная и клеточная биология . 22 (5): 1298–306. DOI : 10.1128 / MCB.22.5.1298-1306.2002 . PMC 134702 . PMID 11839797 .  
  65. ^ Li J, Moazed D, Gygi SP (декабрь 2002). «Ассоциация гистон-метилтрансферазы Set2 с РНК-полимеразой II играет роль в удлинении транскрипции» . Журнал биологической химии . 277 (51): 49383–8. DOI : 10.1074 / jbc.M209294200 . PMID 12381723 . 
  66. ^ Carrozza МДж, Ли В, Florens л, Суганума Т, Свенсон С. К., Ли К. К., Шайа WJ, Андерсон S, Йейтс Дж, Вашбурн М.П., Уоркмэн ДЛ (ноябрь 2005 г.). «Метилирование гистона H3 с помощью Set2 направляет деацетилирование кодирующих областей с помощью Rpd3S для подавления ложной внутригенной транскрипции» . Cell . 123 (4): 581–92. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.10.023 . PMID 16286007 . 
  67. ^ Keogh MC, Kurdistani SK, Morris SA, Ahn SH, Podolny V, Collins SR, Schuldiner M, Chin K, Punna T, Thompson NJ, Boone C, Emili A, Weissman JS, Hughes TR, Strahl BD, Grunstein M, Greenblatt JF, Buratowski S, Krogan NJ (ноябрь 2005 г.). «Котранскрипционное метилирование set2 гистона H3 лизина 36 рекрутирует репрессивный комплекс Rpd3» . Cell . 123 (4): 593–605. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.10.025 . PMID 16286008 . 
  68. ^ Joshi AA, Struhl K (декабрь 2005). «Взаимодействие хромодомена Eaf3 с метилированным H3-K36 связывает деацетилирование гистонов с элонгацией Pol II» . Молекулярная клетка . 20 (6): 971–8. DOI : 10.1016 / j.molcel.2005.11.021 . PMID 16364921 . 
  69. Перейти ↑ Kuzmichev A, Nishioka K, Erdjument-Bromage H, Tempst P, Reinberg D (ноябрь 2002 г.). «Активность гистон-метилтрансферазы, связанная с человеческим мультибелковым комплексом, содержащим энхансер белка Zeste» . Гены и развитие . 16 (22): 2893–905. DOI : 10.1101 / gad.1035902 . PMC 187479 . PMID 12435631 .  
  70. ^ a b Цао Р., Ван Л., Ван Х, Ся Л., Эрдджумент-Бромаж Х, Темпст П., Джонс Р. С., Чжан Ю. (ноябрь 2002 г.). «Роль метилирования гистона H3 лизина 27 в сайленсинге Polycomb-группы». Наука . 298 (5595): 1039–43. Bibcode : 2002Sci ... 298.1039C . DOI : 10.1126 / science.1076997 . PMID 12351676 . S2CID 6265267 .  
  71. ^ Де Napoles М, Mermoud JE, Wakao R, Tang Ю.А., ЭндоН M, R, Appanah Нестеровой TB, Silva J, Otte А.П., Vidal М, Н, косэки Брокдорф N (ноябрь 2004 г.). «Белки группы поликомб Ring1A / B связывают убиквитилирование гистона H2A с наследственным молчанием генов и инактивацией X» . Клетка развития . 7 (5): 663–76. DOI : 10.1016 / j.devcel.2004.10.005 . PMID 15525528 . 
  72. ↑ Wang H, Wang L, Erdjument-Bromage H, Vidal M, Tempst P, Jones RS, Zhang Y (октябрь 2004 г.). «Роль убиквитинирования гистона H2A в сайленсинге Polycomb». Природа . 431 (7010): 873–8. Bibcode : 2004Natur.431..873W . DOI : 10,1038 / природа02985 . hdl : 10261/73732 . PMID 15386022 . S2CID 4344378 .  
  73. ^ Таварес Л., Димитрова Е., Оксли Д., Вебстер Дж., Пут Р., Деммерс Дж., Безстарости К., Тейлор С., Ура Х, Койде Х, Вутц А., Видаль М., Элдеркин С., Брокдорф Н. (февраль 2012 г.). «Комплексы RYBP-PRC1 опосредуют убиквитилирование H2A в сайтах-мишенях поликомбов независимо от PRC2 и H3K27me3» . Cell . 148 (4): 664–78. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.12.029 . PMC 3281992 . PMID 22325148 .  
  74. ^ Гао Z, Чжан J, Bonasio R, Strino F, Савай А, Пэризи Ж, Kluger Y, Reinberg D (февраль 2012). «Гомологи PCGF, белки CBX и RYBP определяют функционально разные комплексы семейства PRC1» . Молекулярная клетка . 45 (3): 344–56. DOI : 10.1016 / j.molcel.2012.01.002 . PMC 3293217 . PMID 22325352 .  
  75. ^ Verdel А, Цзя S, S Гербера, Сугияма Т, Gygi S, Греуол С.И., Moazed Д (январь 2004). «РНКи-опосредованное нацеливание на гетерохроматин комплексом RITS» . Наука . 303 (5658): 672–6. Bibcode : 2004Sci ... 303..672V . DOI : 10.1126 / science.1093686 . PMC 3244756 . PMID 14704433 .  
  76. ↑ Rea S, Eisenhaber F, O'Carroll D, Strahl BD, Sun ZW, Schmid M, Opravil S, Mechtler K, Ponting CP, Allis CD, Jenuwein T (август 2000). «Регулирование структуры хроматина с помощью сайт-специфических гистоновых H3-метилтрансфераз». Природа . 406 (6796): 593–9. Bibcode : 2000Natur.406..593R . DOI : 10.1038 / 35020506 . PMID 10949293 . S2CID 205008015 .  
  77. ^ Баннистер AJ, Zegerman P, Партридж JF, Miska Е.А., Томас JO, Allshire RC, Kouzarides T (март 2001). «Селективное распознавание метилированного лизина 9 на гистоне H3 хромо-доменом HP1». Природа . 410 (6824): 120–4. Bibcode : 2001Natur.410..120B . DOI : 10.1038 / 35065138 . PMID 11242054 . S2CID 4334447 .  
  78. ^ Лахнер М, О'Кэррола D, Rea S, Mechtler К, Jenuwein Т (март 2001). «Метилирование гистона H3 лизином 9 создает сайт связывания для белков HP1». Природа . 410 (6824): 116–20. Bibcode : 2001Natur.410..116L . DOI : 10.1038 / 35065132 . PMID 11242053 . S2CID 4331863 .  
  79. ^ Баджпаи G джайнская I, Inamdar М.М., Das D, Padinhateeri R (январь 2017). «Связывание ДНК-изгибающих негистоновых белков дестабилизирует регулярную 30-нм структуру хроматина» . PLOS Вычислительная биология . 13 (1): e1005365. Bibcode : 2017PLSCB..13E5365B . DOI : 10.1371 / journal.pcbi.1005365 . PMC 5305278 . PMID 28135276 .  
  80. ^ a b Schotta G, Lachner M, Sarma K, Ebert A, Sengupta R, Reuter G, Reinberg D, Jenuwein T (июнь 2004 г.). «Путь сайленсинга для индукции триметилирования H3-K9 и H4-K20 конститутивного гетерохроматина» . Гены и развитие . 18 (11): 1251–62. DOI : 10,1101 / gad.300704 . PMC 420351 . PMID 15145825 .  
  81. ^ Kourmouli Н, Р Джеппесен, Mahadevhaiah S, Бургойн Р, У Р, Гилберта ДМ, Bongiorni S, Prantera G, Фанти л, Pimpinelli S, Ши Вт, Fundele Р, Синг ПБ (май 2004 г.). «Гетерохроматин и триметилированный лизин 20 гистона H4 у животных» . Журнал клеточной науки . 117 (Pt 12): 2491–501. DOI : 10,1242 / jcs.01238 . PMID 15128874 . 
  82. ^ Bernstein BE, Mikkelsen TS, Xie X, Kamal M, Huebert DJ, Cuff J, Fry B, Meissner A, Wernig M, Plath K, Jaenisch R, Wagschal A, Feil R, Schreiber SL, Lander ES (апрель 2006 г.). «Двухвалентная структура хроматина отмечает ключевые гены развития в эмбриональных стволовых клетках» . Cell . 125 (2): 315–26. DOI : 10.1016 / j.cell.2006.02.041 . PMID 16630819 . 
  83. ^ a b Rogakou EP, Pilch DR, Orr AH, Иванова VS, Боннер WM (март 1998 г.). «Двухцепочечные разрывы ДНК вызывают фосфорилирование гистона H2AX на серине 139» . Журнал биологической химии . 273 (10): 5858–68. DOI : 10.1074 / jbc.273.10.5858 . PMID 9488723 . 
  84. ^ Селеста A, Петерсен S, Романиенко PJ, Фернандес-Капетильо O, Чен HT, Седельникова OA, Рейна-Сан-Мартин B, Коппола V, Меффре E, Дифилиппантонио MJ, Редон C, Pilch DR, Olaru A, Eckhaus M, Camerini -Отеро Р.Д., Тессаролло Л., Ливак Ф., Манова К., Боннер В.М., Нуссенцвейг М.С., Нуссенцвейг А. (май 2002 г.). «Геномная нестабильность у мышей, лишенных гистона H2AX» . Наука . 296 (5569): 922–7. Bibcode : 2002Sci ... 296..922C . DOI : 10.1126 / science.1069398 . PMC 4721576 . PMID 11934988 .  
  85. ^ Шрофф R, Арбель-Иден А, Пилч D, G Ира, Боннер WM, Петрини JH, Хабер JE, Лихтен М (октябрь 2004 г.). «Распределение и динамика модификации хроматина, вызванной определенным двухцепочечным разрывом ДНК» . Текущая биология . 14 (19): 1703–11. DOI : 10.1016 / j.cub.2004.09.047 . PMC 4493763 . PMID 15458641 .  
  86. ^ Rogakou Е.П., Буна С, Рэдон С, Боннер WM (сентябрь 1999). «Мегабазные домены хроматина, участвующие в двухцепочечных разрывах ДНК in vivo» . Журнал клеточной биологии . 146 (5): 905–16. DOI : 10.1083 / jcb.146.5.905 . PMC 2169482 . PMID 10477747 .  
  87. ^ Стюарт GS, Ван B, Bignell CR, Тейлор М., Elledge SJ (февраль 2003). «MDC1 является медиатором контрольной точки повреждения ДНК млекопитающих». Природа . 421 (6926): 961–6. Bibcode : 2003Natur.421..961S . DOI : 10,1038 / природа01446 . PMID 12607005 . S2CID 4410773 .  
  88. ↑ Bekker-Jensen S, Mailand N (декабрь 2010 г.). «Сборка и функция ДНК двухцепочечных очагов репарации разрывов в клетках млекопитающих». Ремонт ДНК . 9 (12): 1219–28. DOI : 10.1016 / j.dnarep.2010.09.010 . PMID 21035408 . 
  89. ^ Оздемир А, Spicuglia S, Lasonder Е, Вермеулен М, Campsteijn С, Stunnenberg HG, Лоджи С (июль 2005). «Характеристика лизина 56 гистона H3 как сайта ацетилирования в Saccharomyces cerevisiae» . Журнал биологической химии . 280 (28): 25949–52. DOI : 10.1074 / jbc.C500181200 . PMID 15888442 . 
  90. ^ Масумото Н, Хок D, R Кобаяши, Verreault А (июль 2005). «Роль регулируемого клеточного цикла ацетилирования лизина 56 гистона H3 в ответе на повреждение ДНК». Природа . 436 (7048): 294–8. Bibcode : 2005Natur.436..294M . DOI : 10,1038 / природа03714 . PMID 16015338 . S2CID 4414433 .  
  91. Перейти ↑ Driscoll R, Hudson A, Jackson SP (февраль 2007 г.). «Дрожжи Rtt109 способствуют стабильности генома за счет ацетилирования гистона H3 по лизину 56» . Наука . 315 (5812): 649–52. Bibcode : 2007Sci ... 315..649D . DOI : 10.1126 / science.1135862 . PMC 3334813 . PMID 17272722 .  
  92. ^ Хан Дж, Чжоу Н, Horazdovsky В, Чжан К, Сюй Р.М., Чжан Z (февраль 2007 г.). «Rtt109 ацетилирует гистон H3, лизин 56 и функционирует в репликации ДНК». Наука . 315 (5812): 653–5. Bibcode : 2007Sci ... 315..653H . DOI : 10.1126 / science.1133234 . PMID 17272723 . S2CID 19056605 .  
  93. ↑ Das C, Lucia MS, Hansen KC, Tyler JK (май 2009 г.). «CBP / p300-опосредованное ацетилирование гистона H3 по лизину 56» . Природа . 459 (7243): 113–7. Bibcode : 2009Natur.459..113D . DOI : 10,1038 / природа07861 . PMC 2756583 . PMID 19270680 .  
  94. Перейти ↑ Han J, Zhou H, Li Z, Xu RM, Zhang Z (сентябрь 2007 г.). «Ацетилирование лизина 56 гистона H3, катализируемое RTT109 и регулируемое ASF1, необходимо для целостности реплисомы» . Журнал биологической химии . 282 (39): 28587–96. DOI : 10.1074 / jbc.M702496200 . PMID 17690098 . 
  95. ^ Wurtele Н, Кайзер Г.С., Бакал Дж, Сент-Илер Е, Ли EH, Тсао S, Дорн Дж, Мэддокс Р, Lisby М, Pasero Р, Verreault А (январь 2012). «Ацетилирование лизина 56 гистона H3 и ответ на повреждение вилки репликации ДНК» . Молекулярная и клеточная биология . 32 (1): 154–72. DOI : 10.1128 / MCB.05415-11 . PMC 3255698 . PMID 22025679 .  
  96. ^ Wurtele Н, Тсао S, G Лепин, Mullick А, Тремблэй Дж, Drogaris Р, Ли ЕН, Тибо Р, Verreault А, М Раймонда (июль 2010). «Модуляция ацетилирования гистона H3 лизина 56 в качестве противогрибковой терапевтической стратегии» . Природная медицина . 16 (7): 774–80. DOI : 10.1038 / nm.2175 . PMC 4108442 . PMID 20601951 .  
  97. Перейти ↑ Li F, Mao G, Tong D, Huang J, Gu L, Yang W, Li GM (апрель 2013 г.). «Гистоновая метка H3K36me3 регулирует репарацию ошибочного спаривания ДНК человека посредством взаимодействия с MutSα» . Cell . 153 (3): 590–600. DOI : 10.1016 / j.cell.2013.03.025 . PMC 3641580 . PMID 23622243 .  
  98. ^ Supek F, Ленер B (июль 2017). «Кластерные сигнатуры мутаций показывают, что подверженная ошибкам репарация ДНК нацелена на мутации активных генов» . Cell . 170 (3): 534–547.e23. DOI : 10.1016 / j.cell.2017.07.003 . ЛВП : 10230/35343 . PMID 28753428 . 
  99. ^ Уилкинс BJ, Ралль Н.А., Ostwal Y, Kruitwagen Т, Hiragami-Хамада К, Винклер М, Barral Y, Fischle Вт, Нейман Н (январь 2014). «Каскад модификаций гистонов вызывает конденсацию хроматина в митозе». Наука . 343 (6166): 77–80. Bibcode : 2014Sci ... 343 ... 77W . DOI : 10.1126 / science.1244508 . hdl : 11858 / 00-001M-0000-0015-11C0-5 . PMID 24385627 . S2CID 7698266 .  
  100. Перейти ↑ Johansen KM, Johansen J (2006). «Регуляция структуры хроматина путем фосфорилирования гистона H3S10». Хромосомные исследования . 14 (4): 393–404. DOI : 10.1007 / s10577-006-1063-4 . PMID 16821135 . S2CID 8556959 .  
  101. ↑ Castellano-Pozo M, Santos-Pereira JM, Rondón AG, Barroso S, Andújar E, Pérez-Alegre M, García-Muse T, Aguilera A (ноябрь 2013 г.). «Петли R связаны с фосфорилированием гистона H3 S10 и конденсацией хроматина» . Молекулярная клетка . 52 (4): 583–90. DOI : 10.1016 / j.molcel.2013.10.006 . PMID 24211264 . 
  102. ^ Ченг WL, Ajiro К, Самедзима К, Kloc М, Р Ченг, Бизань СА, Beeser А, Etkin Л. Д., Чернова Дж, Ирншоу туалет, CD - Эллиса (май 2003 г.). «Апоптотическое фосфорилирование гистона H2B опосредуется стерильной двадцать киназой млекопитающих» . Cell . 113 (4): 507–17. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (03) 00355-6 . PMID 12757711 . 
  103. ^ Ahn SH, Cheung WL, Hsu JY, Diaz RL, Smith MM, Allis CD (январь 2005). «Стерильная 20 киназа фосфорилирует гистон H2B по серину 10 во время апоптоза, вызванного перекисью водорода у S. cerevisiae» . Cell . 120 (1): 25–36. DOI : 10.1016 / j.cell.2004.11.016 . PMID 15652479 . 
  104. ^ a b Робисон AJ, Nestler EJ (октябрь 2011 г.). «Транскрипционные и эпигенетические механизмы зависимости» . Nat. Rev. Neurosci . 12 (11): 623–37. DOI : 10.1038 / nrn3111 . PMC 3272277 . PMID 21989194 .  
  105. ^ Хичкок LN, Lattal км (2014). «Гистон-опосредованная эпигенетика в зависимости». Эпигенетика и нейропластичность - доказательства и дебаты . Prog Mol Biol Transl Sci . Прогресс в молекулярной биологии и трансляционной науке. 128 . С. 51–87. DOI : 10.1016 / B978-0-12-800977-2.00003-6 . ISBN 9780128009772. PMC  5914502 . PMID  25410541 .
  106. ^ Маккуон SC, Wood MA (апрель 2010). «Эпигенетическая регуляция при расстройствах, связанных с употреблением психоактивных веществ» . Curr Psychiatry Rep . 12 (2): 145–53. DOI : 10.1007 / s11920-010-0099-5 . PMC 2847696 . PMID 20425300 .  
  107. ^ "Является ли никотиновая зависимость?" .
  108. ^ Левин А, Хуан Y, Drisaldi В, Гриффин Е.А., Поллэк ДД, Сюй S, D Инь, Schaffran С, Кандел БД, Кандел ER (ноябрь 2011 года). «Молекулярный механизм шлюзового наркотика: эпигенетические изменения, инициированные кокаином экспрессией основного гена никотина» . Sci Transl Med . 3 (107): 107ra109. DOI : 10.1126 / scitranslmed.3003062 . PMC 4042673 . PMID 22049069 .  
  109. ^ Сборки JK (ноябрь 2014). «Молекулярная нейробиология зависимости: что такое (Δ) FosB?». Am J Злоупотребление алкоголем . 40 (6): 428–37. DOI : 10.3109 / 00952990.2014.933840 . PMID 25083822 . S2CID 19157711 .  
  110. ^ Нестлер EJ, Барро M, Self DW (сентябрь 2001). «DeltaFosB: устойчивый молекулярный переключатель от зависимости» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 98 (20): 11042–6. Bibcode : 2001PNAS ... 9811042N . DOI : 10.1073 / pnas.191352698 . PMC 58680 . PMID 11572966 .  
  111. ^ Д'Аддарио С, Caputi FF, Экстрем TJ, Ди Бенедетто М, Maccarrone М, Romualdi Р, Candeletti S (февраль 2013 г. ). «Этанол вызывает эпигенетическую модуляцию экспрессии генов продинорфина и проноцицептина в комплексе миндалины крысы». J. Mol. Neurosci . 49 (2): 312–9. DOI : 10.1007 / s12031-012-9829-у . PMID 22684622 . S2CID 14013417 .  
  112. ^ "Каковы масштабы злоупотребления метамфетамином в Соединенных Штатах?" .
  113. ^ a b Годино A, Jayanthi S, Cadet JL (2015). «Эпигенетический ландшафт амфетаминовой и метамфетаминовой зависимости у грызунов» . Эпигенетика . 10 (7): 574–80. DOI : 10.1080 / 15592294.2015.1055441 . PMC 4622560 . PMID 26023847 .  
  114. Перейти ↑ Cruz FC, Javier Rubio F, Hope BT (декабрь 2015 г.). «Использование c-fos для изучения нейронных ансамблей в кортикостриатной схеме зависимости» . Brain Res . 1628 (Pt A): 157–73. DOI : 10.1016 / j.brainres.2014.11.005 . PMC 4427550 . PMID 25446457 .  
  115. ↑ de Bruin RA, McDonald WH, Kalashnikova TI, Yates J, Wittenberg C (июнь 2004 г.). «Cln3 активирует G1-специфическую транскрипцию посредством фосфорилирования SBF-связанного репрессора Whi5» . Cell . 117 (7): 887–98. DOI : 10.1016 / j.cell.2004.05.025 . PMID 15210110 . 
  116. ^ Сей Н, Ким UJ, Шустер Т, М Grunstein (ноябрь 1992 г.). «Идентификация нового набора регуляторных генов клеточного цикла, которые регулируют S-фазу транскрипции гистоновых генов в Saccharomyces cerevisiae» . Молекулярная и клеточная биология . 12 (11): 5249–59. DOI : 10.1128 / mcb.12.11.5249 . PMC 360458 . PMID 1406694 .  
  117. ^ Дымова D, Nackerdien Z, Furgeson S, S Эгучи, Osley М.А. (1999). «Роль транскрипционных репрессоров в нацеливании на дрожжевой Swi / Snf комплекс» . Молекулярная клетка . 4 (1): 75–83. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (00) 80189-6 . PMID 10445029 . 
  118. ^ Dominski Z, Erkmann JA, Ян X, SaNchez R, Marzluff WF (январь 2002). «Новый белок цинкового пальца связан с мяРНП U7 и взаимодействует с белком, связывающим стержень-петлю в пре-мРНП гистона, чтобы стимулировать процессинг 3'-конца» . Гены и развитие . 16 (1): 58–71. DOI : 10,1101 / gad.932302 . PMC 155312 . PMID 11782445 .  
  119. ^ Dominski Z, Ян XC, Kaygun H, M Dadlez, Marzluff WF (август 2003). «3'-экзонуклеаза, которая специфически взаимодействует с 3'-концом мРНК гистона» . Молекулярная клетка . 12 (2): 295–305. DOI : 10.1016 / S1097-2765 (03) 00278-8 . PMID 14536070 . 
  120. ^ Чжэн L, Dominski Z, Ян XC, вязами P, Рашка CS, Borchers CH, Marzluff WF (март 2003). «Фосфорилирование белка, связывающего ствол и петлю (SLBP) по двум треонинам, запускает деградацию SLBP, единственного регулируемого клеточного цикла фактора, необходимого для регуляции процессинга мРНК гистонов, в конце S фазы» . Молекулярная и клеточная биология . 23 (5): 1590–601. DOI : 10.1128 / MCB.23.5.1590-1601.2003 . PMC 151715 . PMID 12588979 .  
  121. ↑ Wang Q, Sawyer IA, Sung MH, Sturgill D, Shevtsov SP, Pegoraro G, Hakim O, Baek S, Hager GL, Dundr M (март 2016 г.). «Тельца Кахаля связаны с конформацией генома» . Nature Communications . 7 : 10966. Bibcode : 2016NatCo ... 710966W . DOI : 10.1038 / ncomms10966 . PMC 4802181 . PMID 26997247 .  
  122. Перейти ↑ Zhao J, Kennedy BK, Lawrence BD, Barbie DA, Matera AG, Fletcher JA, Harlow E (сентябрь 2000 г.). «NPAT связывает циклин E-Cdk2 с регуляцией зависимой от репликации транскрипции гистонового гена» . Гены и развитие . 14 (18): 2283–97. DOI : 10.1101 / GAD.827700 . PMC 316937 . PMID 10995386 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • HistoneDB 2.0 - База данных гистонов и вариантов в NCBI
  • Хроматин, гистоны и катепсин ; PMAP Карта протеолиза - анимация