Мартин родился в Лондоне , в семье купца. Он посещал школу неподалеку от своего дома, а когда ему исполнилось 16 лет, работал на отца, намереваясь сделать карьеру в бизнесе. Он женился на Мари Анне Фоннеро, дочери Клода Фоннеро , беженца -гугенота , который поселился в Англии и стал успешным торговцем. [2] Он отказался от этой идеи в пользу медицинских и ботанических исследований. Его интерес к ботанике возник из-за знакомства с аптекарем Джоном Уилмером и доктором Патриком Блэром , хирургом-аптекарем из Данди , который практиковал в Лондоне. Мартин прочитал несколько лекций по ботанике в Лондоне в 1721 и 1726 годах, а в 1727 году был избран членом Лондонского королевского общества .
Мартин был одним из основателей (вместе с Иоганном Якобом Диллениусом и другими) и секретарем ботанического общества, которое в течение нескольких лет собиралось в кофейне «Радуга» на Уотлинг-стрит.
В 1732 году он был назначен профессором ботаники в Кембриджском университете , но, не найдя особой поддержки и затруднений из-за нехватки оборудования, вскоре прекратил читать лекции. Однако он сохранял свою профессорскую должность до 1768 года, когда ушел в отставку в пользу своего сына Томаса. Покинув кафедру ботаники в Кембридже, он подарил университету ряд своих ботанических образцов и книг. [3]
Джон Мартин женился на Евлалии Кинг, дочери Джона Кинга (1652–1732), ректора Пертенхолла в Бедфордшире и Челси в Лондоне. Их сын Томас Мартин (1735–1825) также был выдающимся ботаником, автором книги «Деревенская флора» (1792–1794). После смерти своей первой жены Джон Мартин женился на Мэри Энн Фоннеро, дочери Клода Фоннеро, торговца из Лондона и особняка Крайстчерч , Ипсвич, и брата Томаса Фоннеро .
Хотя у него не было медицинского образования, он долгое время практиковал врачом в Челси , где и умер в 1768 году.
Его сын Томас написал мемуары о своем отце в 1770 году. [4] Расширенная версия этих мемуаров была подготовлена и опубликована Джорджем Горэмом в 1830 году. [5]