Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлен из водородно-дейтериевого обмена )
Перейти к навигации Перейти к поиску

Обмен водорода и дейтерия (также называемый обменом H – D или H / D) - это химическая реакция, в которой ковалентно связанный атом водорода заменяется атомом дейтерия или наоборот. Его легче всего применить к обмениваемым протонам и дейтронам, где такое превращение происходит в присутствии подходящего источника дейтерия без какого-либо катализатора. Использование кислотных, основных или металлических катализаторов в сочетании с условиями повышенной температуры и давления может облегчить обмен незаменяемыми атомами водорода, если субстрат устойчив к условиям и используемым реагентам. Это часто приводит к пердейтерированию: обмену между водородом и дейтерием всех необмениваемых атомов водорода в молекуле.

Примером обмениваемых протонов, которые обычно исследуют таким образом, являются протоны амидов в основной цепи белка . [1] [2] [3] Метод дает информацию о доступности растворителя для различных частей молекулы и, следовательно, о третичной структуре белка. Теоретическая основа для понимания водородного обмена в белках была впервые описана Каем Ульриком Линдерстрём-Лангом, и он был первым, кто применил обмен H / D для изучения белков. [4]

Обменная реакция [ править ]

В протонном растворе обмениваемые протоны, такие как протоны в гидроксильной или аминогруппе, обмениваются протонами с растворителем . Если D 2 O является растворителем, дейтроны будут включены в эти положения. За реакцией обмена можно следить, используя множество методов (см. Обнаружение). Поскольку этот обмен является равновесной реакцией, молярное количество дейтерия должно быть высоким по сравнению с обмениваемыми протонами субстрата. Например, дейтерий добавляют к белку в H 2 O путем разбавления раствора H 2 O D 2 O (например, в десять раз). Обычно обмен осуществляется при физиологическом pH (7,0–8,0), когда белки находятся в своем наиболее естественном ансамбле конформационных состояний. [5] [6]

Реакция обмена H / D может также катализироваться кислотными, основными или металлическими катализаторами, такими как платина. Для амидных атомов водорода основной цепи белков минимальная скорость обмена наблюдается в среднем при pH 2,6. Выполняя обмен при нейтральном pH и затем быстро меняя pH, скорости обмена амидных водородов основной цепи можно резко замедлить или погасить . PH, при котором реакция гасится, зависит от метода анализа. Для обнаружения с помощью ЯМР значение pH можно довести до 4,0–4,5. Для обнаружения с помощью масс-спектрометрии значение pH снижают до минимума кривой обмена, pH 2,6. В самом простом эксперименте реакции дают возможность протекать в течение заданного времени, прежде чем ее гасят.

Паттерн дейтерирования молекулы, подвергшейся H / D обмену, может сохраняться в апротонных средах. Однако некоторые методы анализа дейтерирования молекул, таких как белки, выполняются в водном растворе, что означает, что обмен будет продолжаться с медленной скоростью даже после того, как реакция будет прекращена. Нежелательный дейтерий-водородный обмен называется обратным обменом, и для его исправления были разработаны различные методы.

Обнаружение [ править ]

Обмен H – D был первоначально измерен отцом водородного обмена Каем Ульриком Линдерстрём-Лангом с использованием трубок для градиента плотности. В наше время обмен H – D в основном контролируется методами: спектроскопии ЯМР , масс-спектрометрии и нейтронной кристаллографии . У каждого из этих методов есть свои преимущества и недостатки.

ЯМР-спектроскопия [ править ]

Ядра водорода и дейтерия сильно различаются по своим магнитным свойствам. Таким образом, их можно различить с помощью ЯМР-спектроскопии . Дейтроны не будут наблюдаться в спектре 1 H ЯМР, и, наоборот, протоны не будут наблюдаться в спектре 2 H ЯМР. Если в 1 H ЯМР-спектре сильно дейтерированного образца наблюдаются небольшие сигналы , они называются остаточными сигналами. Их можно использовать для расчета уровня дейтерирования в молекуле. Аналогичные сигналы не наблюдаются в спектрах 2 H ЯМР из-за низкой чувствительности этого метода по сравнению с 1H анализ. Дейтроны обычно демонстрируют очень похожие химические сдвиги с аналогичными протонами. Анализ с помощью 13 С - ЯМР - спектроскопии также возможно: различные значения спинов водорода ( 1 / 2 ) и дейтерия (1) приводит к различным расщепляющих кратностей. ЯМР-спектроскопия может использоваться для определения сайт-специфичного дейтерирования молекул.

Другой метод использует спектры HSQC. Обычно спектры HSQC записываются в серию моментов времени, когда водород обменивается с дейтерием. Поскольку эксперимент HSQC специфичен для водорода, сигнал будет экспоненциально затухать по мере обмена водорода. Затем можно подобрать экспоненциальную функцию к данным и получить константу обмена. Этот метод дает остаточную -специфические информацию для всех остатков в белке одновременно [7] [8] Основной недостаток заключается в том, что он требует предварительного назначения спектра для рассматриваемого белка. Это может быть очень трудоемким и обычно ограничивает метод белками менее 25 кДа.. Поскольку для записи спектра HSQC требуются от нескольких минут до часов, амиды с быстрым обменом должны быть измерены с использованием других последовательностей импульсов.

Масс-спектрометрия [ править ]

Иллюстрация экспериментального рабочего процесса по обмену водород / дейтерий, измеренному с помощью масс-спектрометрии (HDX-MS). Черная волнистая линия представляет собой основу белка. Синяя буква « H » обозначает атомы водорода, связанные в амидах основной цепи, красная буква « D » обозначает дейтерий, связанный в амидах основной цепи. Сверху насыщенный водородом белковый раствор разбавляется концентрированным оксидом дейтерия, после чего водород, содержащийся в амидах основной цепи, будет обмениваться на дейтерий из раствора. В обычные моменты времени (t 1 -t 4) реакцию обмена гасят подкислением и охлаждением. Затем полученный образец белка можно подвергнуть перевариванию и обессоливанию, а иногда и газофазной фрагментации. Если белок был переварен, полученные пептиды разделяют с помощью жидкостной хроматографии (ЖХ) в сочетании с масс-спектрометрией (МС). Для каждой временной точки, включая недейтерированный контроль (t 0 ), измеряют среднюю массу каждого пептида. Затем, хотя это и не является общепринятой практикой, можно подвергнуть каждый аналит фрагментации, чтобы сублокализовать содержащийся водород и дейтерий. Чтобы упростить интерпретацию, здесь в спектре МС / МС показаны только ионы c-типа. Однако можно наблюдать и другие типы фрагментных ионов.

Масс-спектрометрия с водородно-дейтериевым обменом может определить общее содержание дейтерия в молекулах, которые подверглись обмену H / D. Из-за того, что требуется подготовка образца, обычно считается, что он обеспечивает точное измерение только незаменяемых атомов водорода. Он также может включать обмен H / D в газовой фазе [9] или фазовый обмен раствора перед ионизацией. [3] Он имеет несколько преимуществ в ЯМР-спектроскопии по сравнению с анализом реакций обмена H – D: требуется гораздо меньше материала, концентрация образца может быть очень низкой (всего 0,1 мкМ), предел размера намного больше, и данные обычно можно собирать и интерпретировать гораздо быстрее. [10]

Ядро дейтерия вдвое тяжелее ядра водорода, потому что оно содержит нейтрон, а также протон. Таким образом, молекула, содержащая некоторое количество дейтерия, будет тяжелее, чем молекула, содержащая весь водород. По мере того, как белок становится все более дейтерированным, молекулярная масса соответственно увеличивается. Обнаружение изменения массы белка при дейтерировании стало возможным благодаря современной масс-спектрометрии белков, о которой впервые сообщили в 1991 г. Катта и Чайт. [11]

Определение сайт-специфического дейтерирования с помощью масс-спектрометрии более сложно, чем с помощью ЯМР-спектроскопии. Например, местоположение и относительное количество обмена дейтерия вдоль пептидного остова можно приблизительно определить, подвергая белок протеолизу после того, как реакция обмена была погашена. Затем отдельные пептиды анализируют на общую дейтерированность каждого пептидного фрагмента. При использовании этого метода разрешение обмена дейтерия определяется размером пептидов, образующихся в процессе пищеварения. [12] Пепсин , кислая протеаза., обычно используется для протеолиза, так как pH гашения должен поддерживаться во время протеолитической реакции. Чтобы свести к минимуму обратный обмен, протеолиз и последующий масс-спектрометрический анализ должны выполняться как можно быстрее. ВЭЖХ- разделение пептического гидролизата часто проводят при низкой температуре непосредственно перед масс-спектрометрией с электрораспылением, чтобы минимизировать обратный обмен. Совсем недавно UPLC стал использоваться из-за его превосходных возможностей разделения. [13]

В 1999 году было предложено достичь разрешения по одному остатку, используя фрагментацию дейтерированных пептидов, индуцированную столкновениями (CID), в сочетании с тандемной масс-спектрометрией . Вскоре было обнаружено, что CID вызывает «скремблирование» положения дейтерия в пептидах. [14] [15] Однако фрагментация, вызванная распадом MALDI в источнике (ISD), диссоциацией с захватом электронов (ECD) и диссоциацией с переносом электрона (ETD), протекает с небольшим скремблированием или без него в правильных экспериментальных условиях. [16] [17] [18]Скремблирование изотопного мечения вызывается столкновительным нагревом перед диссоциацией иона, и хотя CID действительно вызывает скремблирование, столкновительный нагрев также может происходить во время ионизации и переноса ионов. [19] Однако путем тщательной оптимизации параметров прибора, которые вызывают нагрев ионов, водородное скремблирование может быть минимизировано до степени, которая сохраняет изотопное мечение фазы раствора до тех пор, пока фрагментация не может быть выполнена с использованием техники, в которой скремблирование не происходит. [17] [18] [20] [21] Совсем недавно ультрафиолетовая фотодиссоциация (УФФД) также была исследована как возможный метод фрагментации для локализации дейтерия внутри пептидов и белков. [22] [23]В этом отношении выводы были неоднозначными, хотя можно получить фрагменты UVPD, которые не подвергались скремблированию при определенных условиях, другие показали, что скремблирование может происходить как для пептидов, так и для белков во время самой стадии фрагментации UVPD. [22] [23] Теория, объединяющая эти очевидные противоречия, имеет отношение к пути двойной фрагментации, который может возникнуть в результате УФ-облучения пептидов и белков, то есть прямой и статистической диссоциации. [24] То есть, если экспериментальные условия благоприятствуют прямой диссоциации и ион-предшественник сохраняется при низких внутренних энергиях до и во время фрагментации, уровень дейтерия в полученных фрагментах будет соответствовать незашифрованному предшественнику. [22]Однако экспериментальные условия могут способствовать статистической диссоциации во время УФ-облучения, особенно при длительном времени облучения и низком давлении газа, что приводит к внутреннему преобразованию энергии электронного возбуждения, вносимой УФ-фотонами. [23] Результатом является колебательное возбуждение облучаемой молекулы, которая, в свою очередь, претерпевает скремблирование.

Нейтронная кристаллография [ править ]

Водород-дейтериевый обмен быстро обменивающихся частиц (например, гидроксильных групп) можно измерить с атомным разрешением количественно с помощью нейтронной кристаллографии и в реальном времени, если обмен проводится во время дифракционного эксперимента.

Пучки нейтронов высокой интенсивности обычно генерируются отколом на линейных ускорителях частиц, таких как источник нейтронов отщепления . Нейтроны дифрагируют кристаллы подобно рентгеновским лучам и могут использоваться для определения структуры. Атомы водорода с числом электронов от одного до нуля в биологических условиях плохо дифрагируют рентгеновские лучи и практически невидимы в нормальных экспериментальных условиях. Нейтроны рассеиваются от атомных ядер и, следовательно, способны обнаруживать атомы водорода и дейтерия.

Атомы водорода обычно заменяются дейтерием, что приводит к сильному положительному коэффициенту рассеяния. Часто достаточно заменить только растворитель и лабильные атомы водорода в кристалле белка диффузией пара. В такой структуре степень заполнения обмениваемого атома дейтерия в кристалле будет уменьшаться от 0 до 100%, что напрямую определяет количество обмена.

Приложения [ править ]

Рассеяние нейтронов [ править ]

Пердейтерирование одного компонента многокомпонентной системы может обеспечить контраст для экспериментов по рассеянию нейтронов , где контраст, полученный с использованием дейтерированных растворителей, недостаточен. [ необходима цитата ]

Структура белка [ править ]

Невозможно определить структуру белка с обменом H / D, кроме нейтронной кристаллографии, а также невозможно определить вторичные структурные элементы. Причины этого связаны с тем, как структура белка замедляет обмен. Скорость обмена зависит от двух параметров: доступности растворителя и водородных связей. Таким образом, амид, который является частью внутримолекулярной водородной связибудет обмениваться медленно, если вообще будет, в то время как амид на поверхности белка, водородно связанного с водой, будет быстро обмениваться. Амиды, захороненные в растворителе, но не связанные водородными связями, также могут иметь очень низкую скорость обмена. Поскольку и доступность растворителя, и водородная связь влияют на скорость обмена, становится трудно приписать данную скорость обмена структурному элементу без кристаллографии или структурных данных ЯМР.

Обмен H – D был использован для характеристики пути сворачивания белков путем рефолдинга белка в условиях обмена. В эксперименте прямого обмена (с H на D) импульс дейтерия добавляется после различного количества времени рефолдинга. Части структуры, которые образуются быстро, будут защищены и, следовательно, не будут заменены, тогда как области, которые складываются на поздних этапах пути, будут подвергаться обмену в течение более длительных периодов времени. Таким образом, обмен H / D может использоваться для определения последовательности различных событий сворачивания. Факторами, определяющими временное разрешение этого подхода, являются эффективность смешивания и то, как быстро можно выполнить резкое охлаждение после этикетирования.

Обмен H – D был использован для характеристики белковых структур [25] и межбелковых взаимодействий. [26] Необходимо провести обменную реакцию с изолированными белками и с комплексом. Затем сравниваются обменивающиеся регионы. Если область скрыта за счет связывания, амиды в этой области могут быть защищены в комплексе и обмениваться медленно. Однако необходимо иметь в виду, что обмен H – D не может использоваться для определения границ связывания для всех взаимодействий белок-белок. Некоторые белок-белковые взаимодействия управляются электростатическими силами боковых цепей и вряд ли изменят скорость обмена амидных водородов основной цепи, особенно если амидные водороды расположены в стабильных структурных элементах, таких как альфа-спирали .

Наконец, обмен H – D можно использовать для мониторинга конформационных изменений в белках, поскольку они связаны с функцией белка. Если конформация изменена в результате посттрансляционной модификации , активации фермента, связывания лекарственного средства или других функциональных событий, вероятно, произойдет изменение обмена H / D, которое может быть обнаружено. [27]

HDXsite (онлайн-сервер) [ править ]

HDXsite - это онлайн-веб-сервер, который включает в себя некоторые приложения, такие как HDX modeller, повышающие разрешение экспериментальных данных HDX и моделирующие факторы защиты для отдельных остатков. [28] ( https://hdxsite.nms.kcl.ac.uk/ )

Ссылки [ править ]

  1. ^ Englander SW, Мейн л (1992-06-01). «Сворачивание белков изучено с использованием метки с водородным обменом и двумерного ЯМР». Ежегодный обзор биофизики и структуры биомолекул . 21 (1): 243–65. DOI : 10.1146 / annurev.bb.21.060192.001331 . PMID  1525469 .
  2. ^ Englander SW, Sosnick TR, Englander JJ, Мейн L (февраль 1996). «Механизмы и использование водородного обмена» . Текущее мнение в структурной биологии . 6 (1): 18–23. DOI : 10.1016 / s0959-440x (96) 80090-X . PMC 3412065 . PMID 8696968 .  
  3. ^ a b Конерманн Л., Пан Дж., Лю Ю. Х. (март 2011 г.). «Водородообменная масс-спектрометрия для изучения структуры и динамики белков». Обзоры химического общества . 40 (3): 1224–34. DOI : 10.1039 / C0CS00113A . PMID 21173980 . 
  4. ^ Englander SW, Мейн L, Bai Y, Sosnick TR (май 1997). «Водородный обмен: современное наследие Линдерстрём-Ланг» . Белковая наука . 6 (5): 1101–9. DOI : 10.1002 / pro.5560060517 . PMC 2143687 . PMID 9144782 .  
  5. ^ Englander SW, Kallenbach NR (ноябрь 1983). «Водородный обмен и структурная динамика белков и нуклеиновых кислот». Ежеквартальные обзоры биофизики . 16 (4): 521–655. DOI : 10.1017 / S0033583500005217 . PMID 6204354 . 
  6. Перейти ↑ Johnson RS, Walsh KA (декабрь 1994). «Масс-спектрометрическое измерение белкового амид-водородного обмена апо- и голо-миоглобина» . Белковая наука . 3 (12): 2411–2418. DOI : 10.1002 / pro.5560031224 . PMC 2142783 . PMID 7756994 .  
  7. ^ Демура M (2006). «Понимание ЯМР структурной стабильности и сворачивания кальций-связывающего лизоцима» . В Webb GA (ред.). Современный магнитный резонанс . Дордрехт: Спрингер. С. 497–501. DOI : 10.1007 / 1-4020-3910-7_62 . ISBN 978-1-4020-3894-5.
  8. ^ Чандак М.С., Накамура Т., Макабе К., Такенака Т., Мукаяма А., Чаудхури Т.К. и др. (Июль 2013). «Кинетика H / D-обмена co-chaperonin GroES Escherichia coli изучена методами 2D ЯМР и DMSO-тушенного обмена». Журнал молекулярной биологии . 425 (14): 2541–60. DOI : 10.1016 / j.jmb.2013.04.008 . PMID 23583779 . 
  9. ^ Стюарт JH, Шапиро RH, DePuy CH, Bierbaum VH (1977). «Реакции водородно-дейтериевого обмена карбанионов с водой-d2 в газовой фазе». Журнал Американского химического общества . 99 (23): 7650–3. DOI : 10.1021 / ja00465a037 .
  10. ^ Wales TE, Энген JR (2006). «Водородообменная масс-спектрометрия для анализа динамики белков». Обзоры масс-спектрометрии . 25 (1): 158–70. Bibcode : 2006MSRv ... 25..158W . DOI : 10.1002 / mas.20064 . PMID 16208684 . 
  11. ^ Катта V, Хаит BT (апрель 1991). «Конформационные изменения в белках, исследованные с помощью масс-спектрометрии с электрораспылением и ионизацией водорода». Быстрые коммуникации в масс-спектрометрии . 5 (4): 214–7. Bibcode : 1991RCMS .... 5..214K . DOI : 10.1002 / rcm.1290050415 . PMID 1666528 . 
  12. ↑ Zhang Z, Smith DL (апрель 1993 г.). «Определение амидного водородного обмена с помощью масс-спектрометрии: новый инструмент для выяснения структуры белков» . Белковая наука . 2 (4): 522–31. DOI : 10.1002 / pro.5560020404 . PMC 2142359 . PMID 8390883 .  
  13. ^ Wales TE, Fadgen KE, Герхардт GC, Энген JR (сентябрь 2008). «Высокоскоростное разделение UPLC с высоким разрешением при нулевых градусах Цельсия» . Аналитическая химия . 80 (17): 6815–20. DOI : 10.1021 / ac8008862 . PMC 2562353 . PMID 18672890 .  
  14. ^ Йоргенсен TJ, Gårdsvoll H, Ploug M, Roepstorff P (март 2005). «Внутримолекулярная миграция амидных атомов водорода в протонированных пептидах при столкновительной активации». Журнал Американского химического общества . 127 (8): 2785–93. DOI : 10.1021 / ja043789c . PMID 15725037 . 
  15. ^ Йоргенсен TJ, Баше Н, Р Roepstorff, Gårdsvoll Н, Ploug М (декабрь 2005). «Активация столкновением с помощью тандемной времяпролетной масс-спектрометрии MALDI вызывает внутримолекулярную миграцию амидных водородов в протонированных пептидах» . Молекулярная и клеточная протеомика . 4 (12): 1910–9. DOI : 10.1074 / mcp.M500163-MCP200 . PMID 16127176 . 
  16. ^ Баше N, Rand KD, Roepstorff P, Йоргенсен TJ (август 2008). «Газофазная фрагментация пептидов распадом MALDI в источнике с ограниченным скремблированием амидного водорода (1H / 2H)». Аналитическая химия . 80 (16): 6431–5. DOI : 10.1021 / ac800902a . PMID 18642878 . 
  17. ^ a b Rand KD, Adams CM, Zubarev RA, Jørgensen TJ (январь 2008 г.). «Диссоциация с захватом электронов протекает с низкой степенью внутримолекулярной миграции атомов водорода пептидных амидов». Журнал Американского химического общества . 130 (4): 1341–9. DOI : 10.1021 / ja076448i . PMID 18171065 . 
  18. ^ a b Zehl M, Rand KD, Jensen ON, Jørgensen TJ (декабрь 2008 г.). «Диссоциация с переносом электронов облегчает измерение включения дейтерия в селективно меченые пептиды с разрешением по одному остатку». Журнал Американского химического общества . 130 (51): 17453–9. DOI : 10.1021 / ja805573h . PMID 19035774 . 
  19. ^ Rand KD, Zehl M, Йоргенсен TJ (октябрь 2014). «Измерение водородно-дейтериевого обмена белков с высоким пространственным разрешением с помощью масс-спектрометрии: преодоление газофазного водород / дейтериевого скремблирования». Счета химических исследований . 47 (10): 3018–27. DOI : 10.1021 / ar500194w . PMID 25171396 . 
  20. ^ Wollenberg ДТ, Pengelley S, Mouritsen JC, Suckau D, Йоргенсен Cl, Йоргенсен TJ (июнь 2020). «Предотвращение H / D-скремблирования с минимальными потерями при передаче ионов для анализа HDX-MS / MS-ETD на масс-спектрометре Q-TOF с высоким разрешением». Аналитическая химия . 92 (11): 7453–7461. DOI : 10.1021 / acs.analchem.9b05208 . PMID 32427467 . 
  21. Перейти ↑ Rand KD, Pringle SD, Morris M, Engen JR, Brown JM (октябрь 2011 г.). «ETD в ионопроводе бегущей волны при настроенных условиях источника ионов Z-спрея позволяет проводить измерения обмена водород / дейтерий в зависимости от места установки» . Журнал Американского общества масс-спектрометрии . 22 (10): 1784–93. Bibcode : 2011JASMS..22.1784R . DOI : 10.1007 / s13361-011-0196-7 . PMC 3438897 . PMID 21952892 .  
  22. ^ a b c Mistarz UH, Bellina B, Jensen PF, Brown JM, Barran PE, Rand KD (январь 2018 г.). «УФ-фотодиссоциационная масс-спектрометрия точно локализует участки дейтерирования основной цепи в пептидах» . Аналитическая химия . 90 (2): 1077–1080. DOI : 10.1021 / acs.analchem.7b04683 . PMID 29266933 . 
  23. ^ a b c Modzel M, Wollenberg DT, Trelle MB, Larsen MR, Jørgensen TJ (декабрь 2020 г.). «Ультрафиолетовая фотодиссоциация протонированных пептидов и белков может происходить с H / D-скремблированием». Аналитическая химия . DOI : 10.1021 / acs.analchem.0c02957 . PMID 33295747 . 
  24. ^ R Джулиан R (сентябрь 2017 г.). «Механизм экспериментов с УВПД сверху вниз: понимание очевидных противоречий». Журнал Американского общества масс-спектрометрии . 28 (9): 1823–1826. DOI : 10.1021 / jasms.8b05650 . PMID 28702929 . 
  25. ^ Белого М. Р., Хан М., Deredge Д, Росс CR, Квинтин R, Zucconi BE, Высоцкий В.Х., Wintrode ЛП, Уилсон Г.М., Гарсен ЭД (январь 2015). «Мутация интерфейса димера в глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназе регулирует его связывание с AU-богатой РНК» . Журнал биологической химии . 290 (3): 1770–85. DOI : 10.1074 / jbc.M114.618165 . PMC 4340419 . PMID 25451934 .  
  26. ^ Манделл JG, Baerga-Ortiz A, Falick А.М., Komives Е.А. (2005). Измерение доступности растворителя на границах раздела белок-белок . Методы молекулярной биологии. 305 . С. 65–80. DOI : 10.1385 / 1-59259-912-5: 065 . ISBN 1-59259-912-5. PMID  15939994 .
  27. ^ Гутман M, Cupo A, Julien JP, Sanders RW, Wilson IA, Мур JP, Ли К. (февраль 2015). «Эффективность антител связана со способностью распознавать закрытую форму Env ВИЧ до слияния» . Nature Communications . 6 : 6144. Bibcode : 2015NatCo ... 6.6144G . DOI : 10.1038 / ncomms7144 . PMC 4338595 . PMID 25652336 .  
  28. ^ Салмас, Рамин Эхтейари; Борисик, Антони Джеймс (15.02.2021). «HDXmodeller: онлайн-сервер для HDX-MS высокого разрешения с автоматической проверкой» . Биология коммуникации . 4 (1). DOI : 10.1038 / s42003-021-01709-х . ISSN 2399-3642 . 

Дальнейшее чтение [ править ]

  • Дэвид Вайс, Эд. (2016). Водородообменная масс-спектрометрия белков: основы, методы и приложения . Нью-Йорк: Вили. ISBN 9781118616499.
  • Masson, Glenn R .; Берк, Джон Э .; Ан, Натали Дж .; Ананд, Ганеш С .; Борхерс, Кристоф; Бриер, Себастьян; Бу-Ассаф, Джордж М .; Engen, John R .; Englander, S. Walter; Фабер, Йохан; Гарлиш, Рэйчел; Гриффин, Патрик Р .; Гросс, Майкл Л .; Гуттман, Миклош; Хамуро, Ёситомо; Хек, Альберт-младший; Худе, Дамиан; Iacob, Roxana E .; Йоргенсен, Томас Дж. Д.; Калташов, Игорь А .; Klinman, Judith P .; Конерманн, Ларс; Мужчина, Петр; Мэйн, Лиланд; Паскаль, Брюс Д.; Райхманн, Дана; Скехел, Марк; Снайдер, Йост; Струценберг, Тимоти С .; Underbakke, Eric S .; Вагнер, Корнелия; Уэльс, Томас Э .; Уолтерс, Бенджамин Т .; Weis, David D .; Уилсон, Дерек Дж .; Винтроде, Патрик Л .; Чжан, Чжунци; Чжэн, Цзе; Шример, Дэвид С .; Рэнд, Каспер Д. (27 июня 2019 г.).«Рекомендации по проведению, интерпретации и отчетности масс-спектрометрии водородно-дейтериевого обмена (HDX-MS)» . Методы природы . 16 (7): 595–602. DOI : 10.1038 / s41592-019-0459-у . PMID  31249422 .