IQ кальмодулин-связывающий мотив представляет собой аминокислотную последовательность мотива , содержащей следующую последовательность:
- [FILV] Qxxx [RK] Gxxx [RK] xx [FILVWY]
IQ кальмодулин-связывающий мотив | ||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Идентификаторы | ||||||||||
Символ | IQ | |||||||||
Pfam | PF00612 | |||||||||
ИнтерПро | IPR000048 | |||||||||
УМНАЯ | SM00015 | |||||||||
ПРОФИЛЬ | PS50096 | |||||||||
SCOP2 | 1wdc / SCOPe / SUPFAM | |||||||||
|
Термин «IQ» относится к первым двум аминокислотам мотива: изолейцину (обычно) и глутамину (неизменно).
Функция
Кальмодулин (CaM) признан основным сенсором кальция (Ca 2+ ) и организатором регуляторных событий благодаря его взаимодействию с разнообразной группой клеточных белков. Для многих известных СаМ-связывающих белков существуют три класса мотивов узнавания; мотив IQ как консенсус для Ca 2+ -независимого связывания и два родственных мотива для Ca 2+ -зависимого связывания, обозначенные 1-14 и 1-5-10 в зависимости от положения консервативных гидрофобных остатков. [2]
Пример
Регуляторный домен миозина гребешка представляет собой трехцепочечный белковый комплекс, который включает этот мотор в ответ на связывание Ca 2+ . Взаимодействия боковых цепей связывают две легкие цепи в тандеме с соседними сегментами тяжелой цепи, несущими мотив IQ-последовательности. Сайт связывания Ca 2+ представляет собой новый ручной мотив EF на основной легкой цепи и стабилизируется за счет связей, включающих тяжелую цепь и обе легкие цепи, с учетом потребности всех трех цепей в связывании и регуляции Ca 2+ в интактной молекула миозина. [3]
Рекомендации
- ^ Houdusse A, Cohen C (январь 1996). «Структура регуляторного домена миозина гребешка при разрешении 2 A: значение для регуляции» . Структура . 4 (1): 21–32. DOI : 10.1016 / S0969-2126 (96) 00006-8 . PMID 8805510 .
- ^ Rhoads AR, Friedberg F (апрель 1997 г.). «Мотивы последовательности для распознавания кальмодулина». FASEB J . 11 (5): 331–40. DOI : 10.1096 / fasebj.11.5.9141499 . PMID 9141499 .
- ^ Xie X, Harrison DH, Schlichting I, Sweet RM, Kalabokis VN, Szent-Gyögeryi AG, Cohen C (март 1994). «Структура регуляторного домена миозина гребешка при разрешении 2,8 А». Природа . 368 (6469): 306–12. DOI : 10.1038 / 368306a0 . PMID 8127365 . S2CID 4279198 .