Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Джумён Ким - семейный профессор биологии в Университете штата Луизиана, профессор Рассела Томпсона-младшего . Его исследовательские интересы включают геномный импринтинг и эпигенетику . Лаборатория доктора Кима в основном занимается изучением функций и регуляторных механизмов, управляющих генами, подверженными геномному импринтингу . [1] Ранее описав импринтированный домен, расположенный на проксимальной хромосоме 7 мыши / хромосоме человека 19q13.4, его лаборатория в настоящее время сосредоточена на понимании регуляторных механизмов, управляющих моноаллельной экспрессией семи импринтированных генов в кластере: Peg3, Usp29, Zfp264 , APeg3 (экспрессируется отцовски) и Zim1, Zim2, Zim3 (экспрессируется от матери). [2][3] [4] [5] [6] [7] [8] В качестве второго направления проекта его лаборатория изучает функцию доминантного гена в кластере, Peg3, как регулятора транскрипции. [9] [10] [11] [12] Прошлые проекты в лаборатории Кима включали изучение эпигенетической нестабильности импринтированных генов во время туморогенеза , [13] [14] [15] потенциальную роль AEBP2 какнацеливающего белка PRC2 и в развитие клеток нервного гребня [16] [17] [18], а также метилирование ДНК ретротранспозонов мыши и человека. [19][20]


Образование [ править ]

Избранные публикации [ править ]

  • Ким Дж., Экрам МБ, Ким Х., Фейсал М., Фрей В.Д., Хуанг Дж.М., Тран К., Ким М.М., Ю С. (2012). «Импринтинг контрольной области (ICR) домена Peg3» . Hum Mol Genet . 21 (12): 2677–87. DOI : 10,1093 / HMG / dds092 . PMC  3363340 . PMID  22394678 .
  • Тиавилль М.М., Ким Х., Фрей В.Д., Ким Дж. (2013). «Идентификация эволюционно консервативного цис-регуляторного элемента, контролирующего импринтированный домен Peg3» . PLOS ONE . 8 (9): e75417. DOI : 10.1371 / journal.pone.0075417 . PMC  3769284 . PMID  24040411 .
  • Ким Дж., Фрей В. Д., Хе Х, Ким Х, Экрам МБ, Бакши А., Фейсал М., Перера Б. П., Йе А., Теруяма Р. (2013). «Мутационные эффекты Peg3 на репродукцию и семейства генов, специфичных для плаценты» . PLOS ONE . 8 (12): e83359. DOI : 10.1371 / journal.pone.0083359 . PMC  3877027 . PMID  24391757 .
  • Тиавилль М.М., Хуанг Дж.М., Ким Х., Экрам МБ, Ро Т.Й., Ким Дж. (Январь 2013 г.). «ДНК-связывающий мотив и гены-мишени импринтированного фактора транскрипции PEG3» . Джин . 512 (2): 314–20. DOI : 10.1016 / j.gene.2012.10.005 . PMC  3513644 . PMID  23078764 .

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Джумён Ким" . Проверено 15 ноября, 2017 .
  2. ^ Ким Дж, Ekram МБ, Ким Н, Фэйсэл М, Фрея WD, Хуанг JM, Чан К, Ким М.М., Ю. С. (2012). «Импринтинг контрольной области (ICR) домена Peg3» . Hum Mol Genet . 21 (12): 2677–87. DOI : 10,1093 / HMG / dds092 . PMC 3363340 . PMID 22394678 .  
  3. ^ Thiaville М. М., Ким Н, Фрея WD, Ким J (2013). «Идентификация эволюционно консервативного цис-регуляторного элемента, контролирующего импринтированный домен Peg3» . PLOS ONE . 8 (9): e75417. DOI : 10.1371 / journal.pone.0075417 . PMC 3769284 . PMID 24040411 .  
  4. Перейти ↑ Kim J, Ye A (2016). «Филогенетический и эпигенетический след предполагаемых усилителей домена Peg3» . PLOS ONE . 11 (4): e0154216. DOI : 10.1371 / journal.pone.0154216 . PMC 4841594 . PMID 27104590 .  
  5. Перейти ↑ Perera BP, Kim J (2016). «Альтернативные промоторы Peg3 с материнской специфичностью» . Sci Rep . 6 : 24438. DOI : 10.1038 / srep24438 . PMC 4830991 . PMID 27075691 .  
  6. He H, Perera BP, Ye A, Kim J (2016). «Родительские и сексуальные конфликты из-за импринтированного домена Peg3» . Sci Rep . 6 : 38136. DOI : 10.1038 / srep38136 . PMC 128876 . PMID 27901122 .  
  7. He H, Ye A, Perera BP, Kim J (2017). «Роль YY1 в импринтированной области Peg3» . Sci Rep . 7 : 6427. DOI : 10.1038 / s41598-017-06817-5 . PMC 5526879 . PMID 28743993 .  
  8. ^ Бретц CL, Ким J (2017). «Установление метилирования ДНК на основе транскрипции в локусе Peg3 мыши» . Эпигенетика . 19 сентября [Epub перед печатью] (11): 945–952. DOI : 10.1080 / 15592294.2017.1377869 . PMC 5788428 . PMID 28925797 .  
  9. Перейти ↑ Ye A, He H, Kim J (2014). «Отцовски экспрессируемые контроли Peg3, материнские экспрессирующие Zim1 как транс-фактор» . PLOS ONE . 9 (9): e108596. DOI : 10.1371 / journal.pone.0108596 . PMC 4180786 . PMID 25265264 .  
  10. Перейти ↑ Lee S, Ye A, Kim J (2015). «ДНК-связывающий мотив импринтированного фактора транскрипции PEG3» . PLOS ONE . 10 (12): e0145531. DOI : 10.1371 / journal.pone.0145531 . PMC 4686966 . PMID 26692216 .  
  11. Перейти ↑ Ye A, He H, Kim J (2016). «PEG3 связывается с H19-ICR как репрессор транскрипции» . Эпигенетика . 11 (12): 889–900. DOI : 10.1080 / 15592294.2016.1255385 . PMC 5193492 . PMID 27824289 .  
  12. Перейти ↑ Ye A, He H, Kim J (2017). «Контроль PEG3 на комплексе MSL млекопитающих» . PLOS ONE . 12 (6): e0178363. DOI : 10.1371 / journal.pone.0178363 . PMC 5469463 . PMID 28609438 .  
  13. ^ Ким J, Бретц CL, Ли S (2015). «Эпигенетическая нестабильность импринтированных генов при раке человека» . Nucleic Acids Res . 43 (22): 10689–99. DOI : 10.1093 / NAR / gkv867 . PMC 4678850 . PMID 26338779 .  
  14. ^ Бретц CL, Langohr IM, Ли S, Ким J (2015). «Эпигенетическая нестабильность при импринтинге контрольных регионов в Т-клеточном новообразовании, индуцированном Kras (G12D)» . Эпигенетика . 10 (12): 1111–201. DOI : 10.1080 / 15592294.2015.1110672 . PMC 4844204 . PMID 26507119 .  
  15. ^ Бретц CL, Langohr IM, Ким J (2017). «Эпигенетический ответ импринтированных доменов во время канцерогенеза» . Clin Epigenetics . 9 : 90. DOI : 10,1186 / s13148-017-0393-8 . PMC 5572065 . PMID 28855972 .  
  16. Перейти ↑ Kim H, Kang K, Kim J (2009). «AEBP2 как потенциальный целевой белок для Polycomb Repression Complex PRC2» . Nucleic Acids Res . 37 (9): 2940–50. DOI : 10.1093 / NAR / gkp149 . PMC 2685092 . PMID 19293275 .  
  17. ^ Kim H, K Kang, Ekram MB, Рох TY, Ким J (2011). «Aebp2 как эпигенетический регулятор клеток нервного гребня» . PLOS ONE . 6 (9): e25174. DOI : 10.1371 / journal.pone.0025174 . PMC 3176318 . PMID 21949878 .  
  18. ^ Ким Н, Ekram МБ, Бакши А, Ким J (2015). «AEBP2 как активатор транскрипции и его роль в миграции клеток» . Геномика . 105 (2): 108–15. DOI : 10.1016 / j.ygeno.2014.11.007 . PMC 4314425 . PMID 25451679 .  
  19. Перейти ↑ Bakshi A, Kim J (2014). «Профилирование эпигеномов млекопитающих на основе ретротранспозонов: метилирование ДНК LTR IAP в эмбриональных стволовых, соматических и раковых клетках» . Геномика . 104 (6): 538–44. DOI : 10.1016 / j.ygeno.2014.09.009 . PMC 4262695 . PMID 25277721 .  
  20. ^ Бакши А, Herke СВ, Батцер М.А., Ким J (2016). «Вариации метилирования АДНК человеческих повторов Alu» . Эпигенетика . 11 (2): 163–73. DOI : 10.1080 / 15592294.2015.1130518 . PMC 4846114 . PMID 26890526 .  

Внешние ссылки [ править ]

  • Джумён Ким Лаб