Джошуа Шаевиц (1977 г.р.) — американский биофизик и профессор физики Института Льюиса-Сиглера Принстонского университета в Принстоне, штат Нью-Джерси . [1] Он известен своими работами в области биофизики одиночных молекул, роста и подвижности бактерий, а также поведения животных. [2]
Шаевиц получил степень бакалавра физики в Колумбийском университете в Нью-Йорке в 1999 году, где он был стипендиатом II Раби . Он получил докторскую степень в 2004 году в Стэнфордском университете , где изучал молекулярные моторы кинезина [3] и РНК-полимеразы [4] [5] с помощью оптического пинцета в группе Стивена Блока . Затем Шаевиц перешел в Калифорнийский университет в Беркли в качестве научного сотрудника Миллера . Там он сосредоточился на подвижности бактерий, в том числе активируемых актином Rickettsia rickettsii , [6] Myxococcus xanthus , [7] и бесстеночной Spiroplasma . [8] С 2007 года Шаевиц работал на факультете Принстонского университета , занимая должности на кафедре физики и в Институте интегративной геномики Льюиса-Сиглера, где он имеет звание профессора.
Работа Шаевица сосредоточена на прецизионных измерениях в различных биологических системах, уделяя особое внимание темам, связанным с формой клеток бактерий, формированием активного вещества и структур в группах движущихся клеток, а также количественной оценкой поведения животных.
Его группа впервые применила трехмерную визуализацию живых клеток для изучения формы бактерий во время роста. В серии статей Шаевитц и его коллеги раскрыли, как механизм внедрения клеточной стенки со спиральной координацией может производить клетки правильной формы как в виде палочек, так и в виде спиральных клеток. [9] [10] [11] [12] Его группа также изучает механику бактериальных клеток, включая жесткость при изгибе, [13] тургорное давление и жесткость клеточной стенки, [14] и регуляцию давления. [15] [16]
Шаевиц также работал над механизмами скользящей подвижности и коллективного поведения социальной бактерии Myxococcus xanthus . Эта работа включает в себя измерение механохимии отдельных скользящих двигателей внутри живых бактерий [17] [18] и связь между фазовыми переходами активного вещества и формированием эволюционно выгодных плодовых тел. [19] [20]
Третье направление исследований Шаевица связано с количественной оценкой поведения животных с использованием контролируемых и неконтролируемых алгоритмов машинного обучения. Шаевитц и профессор нейробиологии Принстона Мала Мурти опубликовали автоматизированную систему (LEAP) для измерения поз животных на основе больших наборов данных из фильмов. [21] Недавно это было распространено на данные о нескольких животных в пакете под названием SLEAP . [22] Его работа расширилась до понимания динамики поведения животных с помощью методов неконтролируемой кластеризации в сотрудничестве с коллегой из Принстона по физике Уильямом Биалеком и другими. [23] [24] [25] [26]