Озеро находится на Центральном плато, к юго-востоку от Кигали . [1] Озеро является частью комплекса озер и водно-болотных угодий в плоской долине, идущей в направлении ЮЮВ, шириной 35 километров (22 мили). Река Ньяварунгу извивается на юг через долину, затопляя ее, создавая зону постоянных болот и озер. Озеро Мугесера находится на восточном берегу реки и является самым большим озером в комплексе. [2]
Несмотря на близость к экватору, климат сравнительно умеренный из-за высоты. Сезон дождей с марта по май и снова с сентября по декабрь. [1] Озеро питается рядом рек и второстепенных ручьев, берущих начало на хребтах на севере, востоке и юге, которые доставляют большую часть воды в сезон дождей. [3] Вода обычно имеет температуру около 25 °C (77 °F). [3] Рыба в изобилии, и есть много видов водоплавающих птиц. Другие животные включают водяных черепах, крокодилов, варанов, змей и выдр. [4]
В 15 веке район вокруг озера был заселен племенем хондого народа тутси , скотоводов, сформировавших независимое государство. [5] Тутси мигрировали в регион Вирунга в Руанде в течение 15 и 16 веков, поселившись между озерами Мугесера и Мухази . Постепенно они приобрели власть на большей части территории современной Руанды, породнившись с хуту и культурно ассимилировавшись с ними. [6]