Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Этот список секвенированных геномов животных содержит виды животных, для которых были собраны, аннотированы и опубликованы полные последовательности генома. Включены по существу полные черновые варианты геномов, но не частичные последовательности генома или последовательности только органелл.

Этот список неполный ; вы можете помочь, добавив недостающие элементы из надежных источников .

Porifera [ править ]

Ctenophora [ править ]

Placozoa [ править ]

  • Trichoplax adhaerens , Placozoan (2008 [7] ).
  • Hoilungia hongkongensis , ноябрь. gen H13 Placozoan (2018 [8] )

Книдария [ править ]

  • Hydra vulgaris , (ранее Hydra magnipapillata ), модельный гидрозойный (2010 [9] )
  • Nematostella vectensis , модельная ветреница ( ветреница морская ) (2007 [10] )
  • Aiptasia pallida , морской анемон (2015 г.) [11]
  • Acropora digitifera , коралл (2011 г.) [12]
  • Renilla muelleri , octocoral (2017, 2019) [13] [14]
  • Stylophora pistillata , коралл (2017 г.) [15]
  • Аурелия аурита , лунная медуза (2019 [16] )
  • Clytia hemisphaerica , Гидрозойная медуза (2019 [17] )
  • Pocillopora damicornis , коралл из цветной капусты (2018 [18] )
  • Orbicella faveolata , горный звездчатый коралл (2016 [19] )
  • Nemopilema nomurai , медуза Номура (2019 [20] )
  • Rhopilema esculentum , Пламенная медуза (2020 [21] )
  • Cassiopea xamachana ( Scyphozoa ) (2019) [22]
  • Alatina alata ( Cubozoa ) (2019) [22]
  • Calvadosia cruxmelitensis ( Staurozoa ) (2019) [22]
  • Dendronephthya gigantea , октокораль (2019) [23]
  • Acropora tenuis (2020) [24]

Deuterostomia [ править ]

Полухордовые [ править ]

  • Saccoglossus kowalevskii , Enteropneusta (2015 [25] ).
  • Ptychodera flava , Enteropneusta (2015 [25] ).

Иглокожие [ править ]

  • Acanthaster planci , морская звезда (2014 [26] )
  • Apostichopus japonicus , морской огурец (2017 [27] )
  • Strongylocentrotus purpuratus , морской еж и модельный дейтеростом (2006 г. [28] ).

Оболочки [ править ]

  • Ciona Кишечник , оболочка (2002 [29] ).
  • Чиона савиньи , оболочка (2007 [30] )
  • Oikopleura dioica , личинка (2001 [31] ).

Цефалохордовые [ править ]

  • Branchiostoma floridae , ланцетник (2008 [32] )

Циклостомы [ править ]

  • Petromyzon marinus , минога (2009, [33] 2013 [34] )

Хрящевые рыбы [ править ]

  • Callorhinchus milii , слоновая акула (2007 [35] )
  • Rhincodon typus , Китовая акула (2017 г.) [36]
  • Carcharodon carcharias , Большая белая акула ( 2018 [37] )
  • Chiloscyllium plagiosum , бамбуковая акула с белыми пятнами (2020 [38] )
  • Chiloscyllium punctatum , бамбуковая акула с коричневой полосой (2018 [39] )
  • Scyliorhinus torazame , облачность кошачьи акулы (2018 [39] )

Lungfish [ править ]

  • Заказать Dipnoi
    • Protopterus annectens , двоякодышащие рыбы Западной Африки (2021 [40] )

Костяная рыба [ править ]

  • Заказать Anabantiformes
    • Betta splendens , сиамские бойцовые рыбы (2018 [41] )
    • Helostoma temminkii , Целующиеся гурами (2020 [42] [43] )
  • Отряд Beloniformes
    • Oryzias latipes , medaka (2007) [44]
  • Отряд Callionymiformes
    • Callionymus lyra , обыкновенный дракончик (2020 [45] )
  • Отряд Centrarchiformes
    • Oplegnathus fasciatus , остроконечная челюсть (2019 [46] )
  • Порядок Characiformes
    • Astyanax mexicanus , мексиканская тетра (2014 [47] )
  • Отряд цихлиформ
    • Oreochromis niloticus , Нильская тилапия (2019 [48] )
    • Metriaclima zeb , цихлиды из озера Малави ( 2019 [48] )
  • Отряд Clupeiformes
    • Clupea harengus , атлантическая сельдь (2020 [49] )
    • Coilia nasus , японский гренадерский анчоус (2020 [50] )
    • Sardina pilchardus , европейская сардина ( 2019 [51] )
  • Отряд Coelacanthiformes
    • Latimeria chalumnae , латимерия Западной Индийского океана и старейшая из известных живых линий Sarcopterygii (2013 [52] [53] )
  • Отряд карповых
    • Anabarilius grahami Regan , рыба кангланг (2018 [54] )
    • Данио рерио , рыба данио (2007 [55] )
    • Heterandria formosa , Least Killifish (2019 [56] ).
    • Oxygymnocypris stewartii , ( 2019 [57] ).
    • Megalobrama amblycephala , лещ тупорылый (2017 [58] )
    • Rhodeus ocellatus , Розовый горчак (2020 [59] [42] )
    • Triplophysa bleekeri , тибетский каменный вьюн (2020 [60] )
    • Псевдобрама Симони (2020 [61] [42] )
  • Заказать Cyprinodontiformes
    • Fundulus catenatus , северный кобель (2020 [62] )
    • Fundulus olivaceus , гольян с черными пятнами (2020 [62] )
    • Fundulus nottii , Bayou topminnow (2020 [62] )
    • Fundulus xenicus, Алмазный киллфиш (2020 [62] )
    • Gambusia affinis , западная рыба-москит (2020 [63] )
    • Heterandria formosa , наименее гибельная (2019 [56] )
    • Xiphophorus maculatus , плоская рыба (2013 [64] )
    • Nothobranchius furzeri , бирюзовый киллиф (2015 [65] [66] [67] )
  • Отряд Esociformes
    • Esox lucius , северная щука (2014 [68] )
  • Отряд Gadiformes
    • Gadus morhua , атлантическая треска (2011 [69] )
  • Отряд Gasterosteiformes
    • Gasterosteus aculeatus , трехиглая колюшка (2006, 2012 [70] )
  • Отряд бычкообразных
    • Oxyeleotris marmorata , мраморный бычок (2020 [71] [42] )
  • Заказать Gymnotiformes
    • Electrophorus electricus , электрический угорь (2014) [72]
  • Отряд Lepisosteiformes
    • Lepisosteus oculatus , пятнистый щенок [73]
  • Заказать Osmeriformes
    • Protosalanx hyalocranius , ясноголовая ледяная рыба (2017 [74] )
  • Заказать Osteoglossiformes
    • Heterotis niloticus , африканская арована (2020 [75] [42] )
    • Scleropages formosus , азиатская арована (2016 [76] )
  • Отряд окуньообразных
    • Chaetodon trifasciatus , дынная рыба- бабочка (2020 [77] [42] )
    • Чанна аргус , северный змееголов (2017 [78] )
    • Chelmon rostratus , медно-полосатая рыба-бабочка (2020 [79] [42] )
    • Dissostichus mawsoni , антарктический клыкач (2019 [80] )
    • Eleginops maclovinus , патагонский робало (2019 [80] )
    • Larimichthys crocea, большой желтый горбыль (2014 [81] )
    • Lutjanus campechanus , северный красный луциан (2020 [82] )
    • Naso vlamingii , крупная рыба-единорог (2020 [83] [42] )
    • Parachaenichthys charcoti , антарктическая рыба-дракон (2017 [84] )
    • Seriola dumerili , Большой Amberjack (2017 [85] )
    • Силлаго синица , китайский силлаго (2018 [86] )
    • Siniperca knerii, Большеглазая мандаринка (2020 [87] )
    • Sparus aurata , позолоченный лещ (2018 [88] )
  • Заказать Salmoniformes
    • Salmo salar , атлантический лосось (2016 [89] )
    • Oncorhynchus mykiss , радужная форель (2014 [90] )
    • Oncorhynchus tshawytscha , Чавыча (2018 [91] [92] )
  • Отряд Scorpaeniformes
    • Sebastes schlegelii , Черный морской окунь (2018 [93] )
  • Заказать Siluriformes
    • Ictalurus punctatus , канальный сом (2016 [94] )
    • Silurus glanis , Вельсский сом (2020 [95] )
  • Отряд Spariformes
    • Datnioides pulcher , сиамская тигровая рыба (2020 [96] [42] )
    • Datnioides undecimradiatus , Меконгский тигровый окунь (2020 [97] )
  • Заказать Tetraodontiformes
    • Diodon holocanthus , длиннохвостая рыба -дикобраз (2020 [98] [42] )
    • Мол Мол , о Cean Санфиш (2016 [99] )
    • Takifugu rubripes , рыба фугу [100] (International Fugu Genome Consortium 2002 [101] )
    • Tetraodon nigroviridis , рыба фугу (2004 [102] ).

Амфибии [ править ]

  • Ambystoma mexicanum , axolotl (2018) [103]
  • Leptobrachium leishanense , Лейшанская усатая жаба (2019) [104]
  • Limnodynastes dumerilii dumerilii , восточная лягушка банджо (2020 [105] )
  • Nanorana parkeri , высокогималайская лягушка (2015) [106]
  • Oophaga pumilio , клубничная лягушка-стрелок (2018 [107] )
  • Pyxicephalus adspersus , африканская лягушка-бык (2018 [108] )
  • Рана [Lithobates] catesbeiana , североамериканская лягушка-бык (2017) [109]
  • Ринелла марина , Тростниковая жаба (2018) [110]
  • Vibrissaphora ailaonica , Усатая жаба (2019) [111]
  • Xenopus tropicalis , западная когтистая лягушка (2010 г.) [112]

Рептилии [ править ]

  • Заказать Crocodylia
    • Alligator mississippiensis , американский аллигатор (2012) [113]
    • Alligator sinensis , китайский аллигатор (2013, 2014) [114] [115]
    • Crocodylus porosus , морской крокодил (2012 г.) [113]
    • Gavialis gangeticus , индийский гавиал (2012) [113]
  • Отряд Rhynchocephalia
    • Sphenodon punctatus , tuatara (2020) [116]
  • Заказать Squamata
    • Anolis carolinensis JBL SC # 1 , Carolina anole (2011 [117] ).
    • Dopasia gracilis , бирманская стеклянная ящерица, (2015) [118]
    • Emydocephalus ijimae , морская змея Идзимы с головой черепахи, (2019) [119]
    • Eublepharis macularius , Леопардовый геккон (2016) [120]
    • Hydrophis melanocephalus , морская змея с тонкой шеей, (2019) [119]
    • Laticauda colubrina , желтогубый морской крайт, (2019) [119]
    • Laticauda laticaudata , морской крайт с синими краями, (2019) [119]
    • Ophiophagus hannah , королевская кобра (2013) [121]
    • Pantherophis guttatus , кукурузная змея (2014) [122]
    • Pogona vitticeps , Центральный бородатый дракон (2015) [123]
    • Python bivittatus , бирманский питон (2013 г.) [124]
    • Salvator merinae , аргентинский черно-белый тегу (2018 [125] )
    • Shinisaurus crocodilurus , китайская крокодиловая ящерица, (2017) [126]
  • Заказать Testudines (Chelonii)
    • Chelonia mydas , зеленая морская черепаха (2013 [127] )
    • Chrysemys picta bellii , окрашенная в западном стиле черепаха (2013 г.) [128]
    • Pelodiscus sinensis , черепаха с мягким панцирем (2013 [127] )
    • Platysternon megacephalum , Головастая черепаха (2019 [129] )

Птицы [ править ]

  • Заказать Accipitriformes
    • Haliaeetus albicilla , орлан-белохвост (2014 г.) [130]
    • Haliaeetus leucocephalus , белоголовый орлан (2014 г.) [130]
    • Эгипий монах , чёрный гриф (2015)
    • Aquila chrysaetos , беркут (2018) [131]
  • Заказать Anseriformes
    • Anas platyrhynchos , утка (или дикая утка) (2013) [132]
  • Отряд Apodiformes
    • Chaetura pelagica , дымоходный стриж (2014) [130]
  • Заказать Apterygiformes
    • Apteryx mantelli , коричневый киви Северного острова (2015 г.) [133]
  • Отряд Bucerotiformes
    • Buceros rhinoceros silvestris , носорог-носорог (2014) [130]
  • Заказать Caprimulgiformes
    • Antrostomus carolinensis , цыпленок-вдова (2014) [130]
  • Отряд Cariamiformes
    • Cariama cristata , серия с красными ногами (2014) [130]
  • Заказать Cathartiformes
    • Cathartes aura , индюк (2014) [130]
  • Отряд Charadriiformes
    • Charadrius voiceiferus , олень-убийца (2014) [130] [134]
    • Himantopus novaezelandiae , kakī / черная ходуля (2019) [134]
    • Himantopus himantopus , ходуля- пестрый (2019) [134]
    • Recurvirostra шоукетта , шилоклювка пестрая (2019) [134]
  • Отряд Ciconiiformes
    • Nipponia nippon , хохлатый ибис (2014) [135]
  • Отряд Coliiformes
    • Colius striatus , крапчатая мышь-птица (2014) [130]
  • Отряд Columbiformes
    • Columba livia , голубь (2014 [130] )
  • Отряд Coraciiformes
    • Merops nubicus , карминный пчелоед (2014 [130] )
  • Отряд Cuculiformes
    • Cuculus canorus , кукушка обыкновенная (2014 [130] )
    • Tauraco erythrolophus , краснохохлый турако (2014 [130] ).
  • Отряд Eurypygiformes
    • Eurypyga helias , окунь (2014 [130] ).
  • Отряд соколообразных
    • Falco cherrug , балобан (2013 [136] )
    • Falco peregrinus , сокол-сапсан (2013 [136] )
  • Отряд Galliformes
    • Arborophila rufipectus , Сычуаньская куропатка (2019 [137] )
    • Gallus gallus , курица (2004 [138] )
    • Meleagris gallopavo , домашняя индейка (2011 [139] )
    • Numida meleagris , цесарка в шлеме (2019 [140] )
    • Pavo cristatus , индийский павлин (2018 [141] )
    • Phasianus colchicus , Обыкновенный фазан (2019 [142] )
    • Syrmaticus mikado , фазан-микадо (2018 [143] )
    • Тетрао тетрикс , тетерев (2014 [144] )
  • Отряд Gaviiformes
    • Gavia stellata , краснозобая гагара (2014 [130] )
  • Заказать Gruiformes
    • Balearica Regulorum gibbericeps , журавль венценосный серый (2014 [130] )
    • Chlamydotis macqueenii , дрофа Маккуина (2014 [130] )
  • Отряд Leptosomiformes
    • Обесцвечивание лептосомуса , кукушка-валик (2014 [130] )
  • Отряд Mesitornithiformes
    • Mesitornis unicolor , коричневый мезит (2014 [130] )
  • Отряд Opisthocomiformes
    • Opisthocomus hoazin , hoatzin (2014 [130] ).
  • Заказать Passeriformes
    • Acanthisitta chloris , стрелок (2014) [130]
    • Corvus brachyrhynchos , американская ворона (2014 [130] )
    • Corvus hawaiiensis , гавайская ворона (2018 [145] )
    • Eopsaltria australis , Восточная желтая малиновка (2019) [146]
    • Ficedula albicollis , ошейниковая мухоловка (2012 [147] )
    • Ficedula hypoleuca , мухоловка-пеструшка (2012 [147] )
    • Geospiza fortis , средний зяблик (2014 [130] )
    • Хирундо Рустика , ласточка сарай (2018 [148] )
    • Lonchura striata domestica , Общественный зяблик (2018 [149] )
    • Manacus vitellinus , манакин с золотым воротником (2014 [130] )
    • Lycocorax pyrrhopterus , Райская ворона (2019 [150] [151] )
    • Manacus vitellinus , манакин с золотым воротником (2014 [130] )
    • Notiomystis cincta , stichbird или hihi (2019 [152] )
    • Paradisaea rubra , красная райская птица (2019 [151] )
    • Pteridophora albert i , король саксонской райской птицы (2019 [151] )
    • Ptiloris paradiseus , райская винтовочная птица (2019 [153] [151] )
    • Taeniopygia guttata , зебровый зяблик (2010 [154] )
  • Заказать Pelecaniformes
    • Egretta garzetta , маленькая цапля (2014 [130] )
    • Pelecanus crispus , далматинский пеликан (2014 [130] )
  • Отряд Phaethontiformes
    • Phaethon lepturus , белохвостая тропическая птица (2014 [130] )
  • Отряд Phoenicopteriformes
    • Phoenicopterus ruber ruber , американский фламинго (2014 [130] )
  • Заказать Piciformes
    • Picoides pubescens , дятел пушистый (2014 [130] )
  • Отряд Podicipediformes
    • Podiceps cristatus , большая гребенчатая поганка (2014 [130] )
  • Отряд Procellariiformes
    • Fulmarus glacialis , северный глупыш (2014 [130] )
  • Отряд Pterocliformes
    • Pterocles gutturalis , рябчик желтохвостый (2014 [130] )
  • Отряд Psittaciformes
    • Amazona leucocephala , кубинская амазонка (2019 [155] )
    • Amazona ventralis , Hispaniolan amanzon (2019 [155] ).
    • Amazona vittata , пуэрториканский попугай (2012 [156] )
    • Ара макао , Алая ара (2013 [157] )
    • Cyanoramphus malherbi , kākāriki karaka (2020 [158] )
    • Melopsittacus undulatus , волнистый попугайчик (2014 [130] )
    • Nestor notabilis , kea (2014 [130] ).
  • Отряд Struthioniformes
    • Struthio camelus australis , обыкновенный страус (2014 [130] )
  • Отряд Sphenisciformes
    • Aptenodytes forsteri , императорский пингвин (2014 [130] )
    • Aptenodytes patagonicus , королевский пингвин (2019 [159] [160] )
    • Eudyptes chrysocome , западный пингвин рокхоппер (2019 [159] [161] )
    • Eudyptes chrysolophus chrysolophus , пингвин Macaroni (2019 [159] [162] )
    • Eudyptes chrysolophus schlegeli , Королевский пингвин (2019 [159] [163] )
    • Eudyptes filholi , восточный пингвин рокхоппер (2019 [159] [164] )
    • Eudyptes moseleyi , северный пингвин рокхоппер (2019 [159] [165] )
    • Eudyptes pachyrhynchus , фьордлендский хохлатый пингвин (2019 [159] [166] )
    • Eudyptes robustus , пингвин с ловчей хохолкой (2019 [159] [167] )
    • Eudyptes sclateri , прямохохлый пингвин (2019 [159] [168] )
    • Eudyptula minor albosignata , пингвин с белыми шипами (2019 [159] [169] )
    • Eudyptula minor minor , маленький синий пингвин (2019 [159] [170] )
    • Eudyptula novaehollandiae , сказочный пингвин (2019 [159] [171] )
    • Megadyptes antipodes antipodes , желтоглазый пингвин или хойхо (2019 [159] [172] )
    • Pygoscelis adeliae , пингвин Адели (2014 [130] )
    • Pygoscelis antarctica , антарктический пингвин (2019 [159] [173] )
    • Pygoscelis papua , папуасский пингвин (2019 [159] [174] )
    • Spheniscus demersus , африканский пингвин (2019 [159] )
    • Spheniscus humboldti , пингвин Гумбольдта (2019 [159] [175] )
    • Spheniscus magellanicus , Магелланов пингвин (2019 [159] [176] )
    • Spheniscus mendiculus , пингвин Галапагосских островов (2019 [159] [177] )
  • Отряд Strigiformes
    • Tyto alba , сипуха (2014 [130] )
    • Strix occidentalis caurina , северная пятнистая сова (2017 [178] )
    • Strix varia , Пёстрая неясыть (2017 [178] )
  • Отряд Сулиформные
    • Phalacrocorax auritus , двуногий баклан (2017 [179] ).
    • Phalacrocorax brasilianus , неотропный баклан (2017 [179] )
    • Phalacrocorax carb , большой баклан (2014 [130] )
    • Phalacrocorax harrisi , Галапагосский баклан (2017 [179] )
    • Phalacrocorax pelagicus , пелагический баклан (2017 [179] )
  • Заказать Tinamiformes
    • Tinamus guttatus , тинамо с белым горлом (2014 [130] )
  • Отряд Trochiliformes
    • Калипта анна , колибри Анны (2014 [130] )
  • Отряд Trogoniformes
    • Apaloderma vittatum , полосатый трогон (2014 [130] )

Млекопитающие [ править ]

  • Подкласс Prototheria , отряд Monotremata , семейство Ornithorhynchidae
    • Ornithorhynchus anatinus , platypus (2007 г., [180] завершены в 2021 г. [181] )
    • Tachyglossus aculeatus , ехидна (2021 [181] )
  • Подкласс Theria (сумчатые и плацентарные млекопитающие)
    • Инфракласс Metatheria (сумчатые)
      • Отряд Didelphimorphia , семейство Didelphidae (опоссумы)
        • Monodelphis domestica , серый короткохвостый опоссум (2007 [182] )
      • Заказать Дасьюроморфия
        • Семья Dasyuridae
          • Antechinus stuartii , Коричневый антехинус (2020 [183] )
          • Sarcophilus harrisii , тасманский дьявол ( [184] )
        • Семья Thylacinidae
          • Thylacinus cynocephalus , тилацин ( [185] )
      • Заказать Diprotodontia
        • Семья Macropodidae
          • Macropus eugenii , таммар валлаби (2011 [186] )
        • Семья Phascolarctidae
          • Phascolarctos cinereus , коала (проект 2013 г. [187] )
    • Инфракласс Eutheria (плацентарные млекопитающие)
      1. Отряд Erinaceomorpha , семейство Erinaceidae
        • Erinaceus europaeus , западноевропейский еж ( [188] )
      2. Отряд Eulipotyphla , семейство Solenodontidae
        1. Solenodon Parodoxus , Hispaniolan solenodon (2018 [189] ).
      3. Отряд рукокрылых
        • Семья Megadermatidae
          • Megaderma lyra , большая ложная летучая мышь-вампир (2013 [190] )
        • Семья Mormoopidae
          • Pteronotus parnellii , усатая летучая мышь Парнелла (2013 [190] )
        • Семья Pteropodidae
          • Pteropus vampyrus , летучая мышь (2012 [191] )
          • Eidolon helvum , летучая мышь Старого Света (2013 [190] )
        • Семья Rhinolophidae
          • Rhinolophus ferrumequinum , большая подковообразная летучая мышь (2013 [190] )
        • Семья Vespertilionidae
          • Myotis lucifugus , маленькая коричневая летучая мышь (2010 [192] )
        • Семейство Phyllostomidae
          • Leptonycteris yerbabuenae , длинноносая летучая мышь (2020 [193] )
          • Leptonycteris nivalis , большая длинноносая летучая мышь (2020 [193] )
          • Musonycteris harrisoni , банановая летучая мышь (2020 [193] )
          • Artibeus jamaicensis , ямайская летучая мышь (2020 [193] )
          • Macrotus waterhousii , листоносая летучая мышь Уотерхауса (2020 [193] )
      4. Заказать Приматы
        • Семья Galagidae
          • Otolemur garnettii , ушастый галаго или кустарник ( [194] )
        • Семья Cercopithecidae
          • Macaca mulatta , макака-резус (2007 [195] и китайская макака-резус Macaca mulatta lasiota в 2011 году [196] )
          • Macaca fascicularis , Cynomolgus или макака-крабоядная (2011 [196] )
          • Папио анубис , оливковый бабуин (2020 [197] )
          • Papio cynocephalus , желтый бабуин (2016 [198] )
          • Rhinopithecus roxellana , золотистая курносая обезьяна (2019 [199] )
        • Семья Hominidae
          • Подсемейство Ponginae
            • Pongo pygmaeus / Pongo abelii , орангутанг (Борнео / Суматра) (2011 [200] )
          • Подсемейство Homininae
            • Горилла горилла , западная горилла (2012 [201] )
            • Homo sapiens , современный человек (проект 2001 г. [202] [203], завершен на 91–96% [204] )
            • Homo neanderthalensis , неандерталец (проект 2010 [205] )
            • Пан троглодиты , шимпанзе (2005 [206] )
            • Пан панискус , бонобо (2012 [207] )
        • Семья Callitrichidae
          • Callithrix jacchus , мартышка (2010, [208], весь геном, 2014 [209] )
      5. Заказать Carnivora
        • Семья Felidae
          • Acinonyx jubatus , африканский гепард (2015 [210] )
          • Felis silvestris catus , кошка (2007 [211] )
          • Panthera leo , лев (2013 [212] )
          • Panthera pardus , Амурский леопард (2016 [213] )
          • Panthera Tigris Altaica , Амурский тигр (также называемый Сибирский тигр ) (2013 [212] )
          • Panthera tigris tigris , бенгальский тигр (2013 [212])
          • Panthera uncia , снежный барс (2013 [212] )
          • Prionailurus bengalensis , леопардовый кот (2016 [213] )
        • Семья Canidae
          • Canis lupus familyis , собака (2005 [214] )
          • Canis lupus lupus , волк (2017 [215] ).
          • Lycaon pictus , африканская дикая собака (2018 [216] )
        • Семья Ursidae
          • Ailuropoda melanoleuca , гигантская панда (2010 [217] )
          • Ursus arctos ssp. horribilis , медведь гризли (2018 [218] )
          • Ursus americanus , американский черный медведь (2019 [219] )
          • Ursus maritimus , Белый медведь (2014 [220] [221] )
        • Семья Odobenidae
          • Odobenus rosmarus , морж (2015 [222] )
        • Семья Mustelidae
          • Enhydra lutris kenyoni , калан (2017 [223] )
          • Mustela erminea , горностай (2018 [224] )
          • Mustela putorius furo , хорек (2014 [225] )
          • Pteronura brasiliensis , гигантская выдра (2019 [226] )
      6. Отряд Proboscidea , Family Elephantidae
        • Elephas maximus , азиатский слон (2015 [227] )
        • Loxodonta africana , африканский слон (2009 [228] )
      7. Заказать Sirenia (морские коровы)
        • Семья Trichechidae
          • Trichechus manatus , вест-индийский ламантин (2015 [222] )
      8. Отряд Perissodactyla (однопалые копытные), семейство Equidae
        • Equus ferus caballus , лошадь (2009 [229] 2018 [230] )
      9. Отряд Cetartiodactyla (копытные и китообразные)
        • Семья Antilocapridae
          • Antilocapra americana , вилорог (2019 [231] )
        • Семья Balaenidae
          • Balaena mysticetus , гренландский кит (2015 [232] )
          • Eubalaena glacialis , североатлантический кит (2018 [233] )
        • Семья Balaenopteridae
          • Balaenoptera acutorostrata , малый полосатик (2014 [234] )
          • Balaenoptera borealis , сейсмический кит (2018 [233] )
          • Balaenoptera musculus , синий кит (2018 [233] )
          • Balaenoptera Physalus , финвит (2014 [234] )
          • Megaptera novaeangliae , горбатый кит (2018 [233] )
        • Семья Bovidae
          • Ammotragus lervia , берберская овца (2019 [231] )
          • Antidorcas marsupialis , Springbox (2019 [231] )
          • Bison bonasus , европейский зубр (2017 [235] )
          • Bos grunniens , як 2012 ( [236] )
          • Bos primigenius indicus , зебу или брахманский скот (2012 [237] )
          • Bos primigenius taurus , корова 2009 ( [238] )
          • Bubalus bubalis , речной буйвол (2017 [239] )
          • Capra ibex , Козы (2019 [231] )
          • Cephalophus harveyi , дукер Харви (2019 [231] )
          • Connochaetes taurinus , голубой гну (2019 [231] )
          • Damaliscus lunatus , цессебе обыкновенный (2019 [231] )
          • Газелла Томсони , газель Томсона (2019 [231] )
          • Hippotragus niger , Собольная антилопа ( 2019 [240] )
          • Kobus ellipsiprymnus , Водяной козел (2019 [231] )
          • Litocranius walleri , Геренук (2019 [231] )
          • Oreotragus oreotragus , Клипспрингер (2019 [231] )
          • Орикс газелла , Гемсбок (2019 [241] )
          • Оурбиа ореби , Ориби (2019 [231] )
          • Овис аммон , Аргали (2019 [231] )
          • Овис аммон поли i , овца марко поло (2017 [242] )
          • Нангер Гранти , газель Гранта (2019 [231] )
          • Neotragus moschatus , Suni (2019 [231] )
          • Neotragus pygmaeus , Королевская антилопа (2019 [231] )
          • Philantomba maxwellii , дукер Максвелла (2019 [231] )
          • Procapra przewalskii , газель Пржевальского (2019 [231] )
          • Голубые бараны nayaur , нахуры (2019 [231] )
          • Raphicerus campestris , Steenbox (2019 [231] )
          • Redunca redunca , Бохор Ридбак (2019 [231] )
          • Syncerus caffer , африканский буйвол (2019 [231] )
          • Sylvicapra grimmia , дукер обыкновенный (2019 [231] )
          • Tragelaphus , Спиральнорогий бык (2019 [231] )
          • Tragelaphus buxtoni , Горная ньяла (2019 [231] )
          • Tragelaphus strepsiceros , Большой куду (2019 [231] )
          • Tragelaphus imberbis , Малый куду (2019 [231] )
          • Tragelaphus spekii , Ситатунга (2019 [231] )
          • Tragelaphus scriptus , Бушбак (2019 [231] )
          • Taurotragus oryx , Канна обыкновенная (2019 [231] )
        • Семья Cervidae
          • Cervus albirostris , олень Тарольда (2019 [231] )
          • Elaphurus davidianus , олень отца Давида (2018 [243] )
          • Muntiacus crinifrons , мунтжак с волосатым передом (2019 [231] )
          • Muntiacus muntjak , индийский мунтжак (2019 [231] )
          • Muntiacus reevesi , мунтжак Ривза (2019 [231] )
          • Рэнгифер Тарандус , Северный олень (2017 [244] )
        • Семья Delphinidae
          • Tursiops truncatus , афалин (2012 [191] )
          • Neophocaena phocaenoides , беспоперная морская свинья (2014 [234] )
          • Orcinus orca , касатка (2015 [222] )
          • Sousa Chinensis , индо-тихоокеанский горбатый дельфин (2019 [245] )
        • Семья Eschrichtiidae
          • Eschrichtius robustus , серый кит (2018 [233] )
        • Семья Жирафовые
          • Giraffa camelopardalis , Жираф (2019 [231] )
          • Giraffa camelopardalis tippelskirchi , жираф масаи (2019 [246] )
          • Окапия Джонстони , Окапи (2019 [231] )
        • Семья Monodontidae
          • Delphinapterus , белуха (2017 [247] )
        • Семья Moschidae
          • Moschus berezovskii , кабарга лесная (2018 [248] )
          • Moschus chrysogaster , альпийская кабарга (2019 [231] )
        • Семья Physeteridae
          • Physeter macrocephalus , кашалот (2019 [249] )
        • Семья Suidae
          • Sus scrofa , свинья (2012 [250] )
        • Семья Tragulidae
          • Tragulus javanicus , Яванская мышь-олень (2019 [231] )
      10. Заказать Rodentia
        • Семья Caviidae
          • Hydrochoerus hydrochaeris , капибара (2018 [251] )
        • Семья Cricetidae
          • Peromyscus leucopus , белоногая мышь (2019 [252] )
        • Семья Мюриды
          • Mastomys coucha , южная мультимамматная мышь (2019 [253] )
          • Штамм Mus musculus : C57BL / 6 J , мышь (2002 [254] )
          • Rattus norvegicus , крыса (2004 [255] )
      11. Заказать зайцеобразные
        • Семья Leporidae
          • Oryctolagus cuniculus , европейский кролик (2010 [188] [256] )

Протостомия [ править ]

Насекомые [ править ]

  • Заказать Blattodea
    • Blattella germanica , немецкий таракан (2018 [257] )
    • Periplaneta americana , американский таракан (2018 [258] )
    • Zootermopsis nevadensis , термит из сырого дерева (2014 [259]
    • Cryptotermes secundus , термит из сухого дерева (2018 [257] )
    • Macrotermes natalensis , высший термит (2014 [260]
  • Отряд жесткокрылых
    • Dendroctonus ponderosae Hopkins, жук (горный сосновый жук) (2013 [261] )
    • Aquatica lateralis , японский водный светлячок "Heike-botaru" (светлячок) (2018 [262] )
    • Photinus pyralis , светлячок Большой Медведицы (2018 [262] )
    • Protaetia brevitarsis , Журавль с белыми пятнами (2019 [263] )
    • Tribolium castaneum Штамм: GA-2 , жук (красный мучной жук) (2008 [264] )
  • Отряд Diptera
    • Семья Calliphoridae
      • Aldrichina grahami , Forensic мясная муха (2020 [265] )
    • Семья Chironomidae
      • Dasypogon diadema , Охотничья муха-разбойник (2019 [266] )
      • Parochlus steinend , антарктическая крылатая мошка (2017 [267] )
      • Proctacanthus coquillett i , Assassin fly (2017 [268] ).
    • Семейство Culicidae (комары)
      • Комар жёлтолихорадочный Штамм: LVPib12 , комаров ( вектор от лихорадки денге и т.д.) (2007 [269] )
      • Aedes albopictus (2015 [270] )
      • Anopheles darlingi
      • Anopheles gambiae Штамм: PEST , комаров ( вектор от малярии ) (2002 [271] )
      • Anopheles gambiae Штамм: М , комаров ( вектор по малярии ) (2010 [272] )
      • Anopheles gambiae Штамм: S , комаров ( вектор по малярии ) (2010) [272] )
      • Anopheles sinensis , москит (переносчик малярии vivax , лимфатического филяриоза иинфекций Setaria ), (2014 г.) [273]
      • Anopheles stephensii
      • Anopheles arabiensis (2015 [274] )
      • Anopheles quadriannulatus (2015) [274].
      • Anopheles merus (2015) [274]
      • Anopheles melas (2015) [274]
      • Anopheles christyi (2015) [274]
      • Anopheles epiroticus (2015) [274]
      • Anopheles maculatus (2015) [274]
      • Anopheles culicifacies (2015) [274]
      • Anopheles minimus (2015) [274]
      • Anopheles funestus (2015) 2019 [274] [275]
      • Anopheles dirus (2015) [274]
      • Anopheles farauti (2015) [274]
      • Anopheles atroparvus (2015) [274]
      • Anopheles sinensis (2015) [274]
      • Anopheles albimanus (2015) [274]
      • Culex quinquefasciatus , комар ( вектор из вируса Западного Нила , филяриатоз и т.д.) (2010 [276] )
    • Семейство Drosophilidae (плодовые мухи)
      • Drosophila albomicans , плодовая муха (2012 [277] )
      • Drosophila ananassae , плодовая муха (2007 [278] )
      • Drosophila biarmipes , плодовая муха (2011 [279] )
      • Drosophila bipectinata , плодовая муха (2011 [279] )
      • Drosophila erecta , плодовая муха (2007 [278] )
      • Drosophila elegans , плодовая муха (2011 [279] )
      • Drosophila eugracilis , плодовая муха (2011 [279] )
      • Drosophila ficusphila , плодовая муха (2011 [279] )
      • Drosophila grimshawi , плодовая муха (2007 [278] )
      • Drosophila kikkawai , плодовая муха (2011 [279] )
      • Drosophila melanogaster , плодовая муха (модельный организм) (2000 [280] )
      • Drosophila mojavensis , плодовая муха (2007 [278] )
      • Drosophila neotestacea , плодовая мушка (транскриптом 2014 [281] )
      • Drosophila persimilis , плодовая муха (2007 [278] )
      • Drosophila pseudoobscura , плодовая муха (2005 [282] )
      • Drosophila rhopaloa , плодовая муха (2011 [279] )
      • Drosophila santomea , плодовая муха ( [283] )
      • Drosophila sechellia , плодовая муха (2007 [278] )
      • Drosophila simulans , плодовая муха (2007 [278] )
      • Drosophila takahashi , плодовая муха (2011 [279] )
      • Drosophila virilis , плодовая муха (2007 [278] )
      • Drosophila willistoni , плодовая муха (2007 [278] )
      • Drosophila yakuba , плодовая муха (2007 [278] )
    • Семья Phoridae
      • Megaselia abdita , кочанная муха (транскриптом 2013 [284] )
    • Семейство Psychodidae (сливные мухи)
      • Clogmia albipunctata , мотылек (транскриптом 2013 [284] )
    • Семейство Sarcophagidae (плотские мухи)
      • Sarcophaga Bullata , Flesh fly (2019 [285] ).
    • Семья Syrphidae (журчалки)
      • Episyrphus balteatus , журчалка (транскриптом 2011 [286] )
  • Отряд Hemiptera
    • Acyrthosiphon pisum , тля (гороховая тля) (2010 [287] )
    • Ericerus pela , китайское насекомое-восковая щитовка (2019) [288]
    • Laodelphax striatellus , малая коричневая цикадка (2017 [289] )
    • Lycorma delicatula , пятнистая муха (2019 [290] )
    • Rhodnius prolixus , жук-поцелуй (2015 [291] )
    • Rhopalosiphum maidis , Кукурузная тля (2019 [292] )
    • Sitobion miscanthi , индийская зерновая тля (2019 [293] )
    • Triatoma rubrofasciata , жук-убийца (2019 [294] )
  • Отряд перепончатокрылых
    • Acromyrmex echinatior colony Ae372 , муравей (панамский листорез) (2011 [295] )
    • Apis mellifera , пчела (медоносная пчела), (модель эусоциального поведения ) (2006 [296] )
    • Atta cephalotes , муравей ( муравей -листорез) (2011 [297] )
    • Camponotus floridanus , муравей (2010 [298] )
    • Cerapachys biroi , муравей (клональный муравей-рейдер) (2014 [299] )
    • Сальятор Harpegnathos , муравей (2010 [298] )
    • Ласиус нигер , муравей (черный садовый муравей) (2017 [300] )
    • Linepithema humile , муравей (аргентинский муравей) (2011 [301] )
    • Nasonia giraulti , оса (паразитоидная оса) (2010 [302] )
    • Nasonia longicornis , оса (паразитоидная оса) (2010 [302] )
    • Nasonia vitripennis , оса (паразитоидная оса; модельный организм) (2010 [302] )
    • Номия Меландери , Щелочная пчела (2019 [303] )
    • Pogonomyrmex barbatus , муравей (красный муравей-комбайн) (2011 [304] )
    • Solenopsis invicta , муравей (огненный муравей) (2011 [305] )
  • Отряд Lepidoptera
    • Antharaea yamamai , шелковая моль из японского дуба (2019 [306] )
    • Arctia plantaginis , Древесная тигровая моль (2020 [307] )
    • Bicyclus anynana , косящий куст коричневый (2017 [308] )
    • Bombyx mori Штамм: p50T , моль (домашний шелкопряд ) (2004 [309] )
    • Cydia pomonella , плодовая плодожорка (2019) [310]
    • Данай Плексипп , бабочка ( бабочка монарх ) (2011 [311] )
    • Heliconius melpomene , бабочка (2012 [312] )
    • Melitaea cinxia , Рябистая бабочка Glanville (2014 [313] )
    • Megathymus ursus violae , медведь, гигантская бабочка-шкипер (2018 [314] )
    • Papilio bianor , китайская бабочка-павлин (2019 [315] )
    • Pieris rapae , маленькая капустная белая бабочка (2016 [316] )
    • Plutella xylostella , моль ( пядень обыкновенная ) (2013 [317] )
    • Spodoptera frugiperda , Осенняя совка (2017 [318] [319] )
    • Eudocima phalonia , моль-прокалывание плодов (2017 [320] )
  • Отряд Orthoptera
    • Locusta migratoria , перелетная саранча (2014 [321] )
    • Schistocerca gregaria , пустынная саранча (2020 [322] )
  • Отряд Phthiraptera
    • Pediculus humanus , вошь ( сосательная вошь ; паразит) (2010 [323] )
  • Отряд Trichoptera
    • Stenopsyche tienmushanensi s, Caddisfly (2018 [324] )

Ракообразные [ править ]

  • Acartiatonsa dana , космополитическая каланоидная копепода (2019 [325] )
  • Daphnia pulex , водяная блоха (2007 [326] [327] [328] )
  • Эулимнадия Тексана , Креветки- моллюски (2018 [329] )
  • Macrobrachium nipponense , восточная речная креветка (2021 [330] )
  • Neocaridina denticulata , креветки (2014 [331] )
  • Parhyale hawaiensis , амфипода (2016 [332] )
  • Portunus trituberculatus , краб- плавун (2020 [333] )
  • Procambarus virginalis , мраморный рак (2018 [334] )
  • Tigriopus kingsejongensis , эндемичная для Антарктики веслоногая рачка (2017 [335] )

Хелицераты [ править ]

  • Limulus polyphemus , атлантический подковообразный краб (2014 г.) [336]
  • Carcinoscorpius rotundicauda , мангровый подковообразный краб (2020 г.) [337]

Из них паукообразные:

  • Acanthoscurria geniculata , бразильский белоколенный птицеед (2014 [338] )
  • Argiope bruennichi, европейский осовый паук (2021 [339] )
  • Dysdera silvatica , ночной эндемичный паук мокриц Канарских островов (2019 [340] )
  • Черноногий клещ , (олень тик ) (2016 [341] )
  • Mesobuthus martensii , китайский скорпион (2013 [342] )
  • Nephila clavipes , (золотая шелковая ткачиха) (2017 [343] )
  • Parasteatoda tepidariorum , (обыкновенный домашний паук) (2017 [344] )
  • Stegodyphus mimosarum , африканский социальный бархатный паук (2014 [338] )
  • Tetranychus urticae , паутинный клещ (2011 [345] )
  • Tropilaelaps mercedesae , (пчелиный клещ) (2017 [346] )

Myriapoda [ править ]

  • Strigamia maritima , многоножка [347]

Тихоходки [ править ]

  • Hypsibius dujardini , водяной медведь (2015 [348] [349] )

Моллюски [ править ]

  • Acanthopleura granulata , хитон (2020 [350] )
  • Achatina fulica , гигантская африканская улитка (2019 [351] )
  • Architeuthis dux , гигантский кальмар (2020 [352] )
  • Argopecten purpuratus , перуанский гребешок (2018 [353] )
  • Bathymodiolus platifrons , водоросли (2017 [354]
  • Biomphalaria glabrata , важная с медицинской точки зрения дышащая воздухом пресноводная улитка из семейства Planorbidae (2017 [355] )
  • Chlamys farreri , морской гребешок Чжиконг (2017 [356] )
  • Crassostrea gigas , Тихоокеанская устрица (2012 [357] )
  • Dreissena rostriformis , мидия Quagga (2019 [358] )
  • Euprymna scolopes , кальмар гавайский бобтейл (2019 [359] )
  • Elysia chlorotica , морской слизень, работающий на солнечной энергии (2019 [360] )
  • Haliotis Discus hannai , тихоокеанский морское ушко (2017 [361] )
  • Hapalochlaena maculosa , южный синекольчатый осьминог (2020 [362] )
  • Lottia гигантская , сова лимфы (2013 [363] )
  • Limnoperna fortunei , инвазивная золотая мидия (2017 [364] )
  • Modiolus philippinarum , мелководная мидия (2017 [354] )
  • Mytilus galloprovincialis , средиземноморские мидии (2016 [365] )
  • Octopus bimaculoides , калифорнийский осьминог с двумя пятнами (2015 [366] )
  • Осьминог малый , обыкновенный длиннорукий осьминог (2018 [367]
  • Octopus vulgaris , обыкновенный осьминог (2019 [368] )
  • Patinopecten yessoensis , гребешок Yesso (2017 [369] )
  • Pecten maximus , Большой гребешок (2020 [370] )
  • Pinctada fucata , Жемчужная устрица (2012 [371] )
  • Pomacea canaliculata , золотая яблочная улитка (2018 [372] )
  • Ruditapes philippinarum , Манильский моллюск (2017 [373] )
  • Saccostrea glomerata , Сиднейская каменная устрица (2018 [374] )
  • Scapharca broughtonii , Кровавый моллюск (2019 [375] )
  • Venustaconcha ellipsiformis , пресноводная мидия (2018 [376] )

Platyhelminthes [ править ]

  • Clonorchis sinensis , печеночная двуустка (патоген человека) (проект 2011 г. [377] )
  • Echinococcus granulosus , цепень (патоген для собак) (2013, [378] 2013 [379] )
  • Echinococcus multilocularis , ленточный червь (2013 [378] )
  • Микростома Hymenolepis , ленточный червь (2013 [378] )
  • Schistosoma haematobium , шистосома (патоген человека) (2012 [380] 2019 [381] )
  • Schistosoma japonicum , шистосома (патоген человека) (2009 [382] )
  • Schistosoma mansoni , шистосома (патоген человека) (2009, [383] 2012 [384] )
  • Schmidtea mediterranea , планария (модельный организм) (2006 [385] [386] )
  • Taenia solium , цепень (2013 [378] )

Нематоды [ править ]

  • Ancylostoma ceylanicum , зоонозный анкилостомоз, поражающий как людей, так и других млекопитающих (2015 [387] )
  • Ascaris suum , гигантский аскаридный червь, заражающий свиней, тесно связанный с заражающим человека гигантским круглым червем Ascaris lumbricoides (2011 [388] )
  • Brugia malayi (штамм: TRS) , филяриальный паразит, заражающий человека (2007 [389] )
  • Bursaphelenchus xylophilus , поражает сосны (2011 [390] ).
  • Caenorhabditis angaria (штамм: PS1010) (2010 [391] )
  • Caenorhabditis brenneri , гонохорический (облигатный) вид, более близкий к C. briggsae, чем C. elegans [392] [393]
  • Caenorhabditis briggsae (2003 [394] )
  • Caenorhabditis elegans (штамм: Bristol N2) , модельный организм (1998 [395] )
  • Caenorhabditis remanei , A gonochoristic (мужское и женское облигатным) виды более тесно связанные с C. briggsae , чем C. Элеганс [396] [397]
  • Dirofilaria immitis , филяриальный паразит, заражающий собак (2012 [398] )
  • Globodera pallida , патоген растений (2014 [399] )
  • Haemonchus contortus , кровяной паразит, заражающий овец и коз (2013 [400] )
  • Heterodera glycines , нематода соевых бобов (2019 [401] )
  • Бактериофора гетерорабдита , (2013 [402] )
  • Лоа-лоа , филяриальный паразит, заражающий человека (2013 [403] )
  • Meloidogyne hapla , северная узловатая нематода (патоген растений) (2008 [404] )
  • Meloidogyne incognita , южная узловатая нематода (патоген растений) (2008 [405] )
  • Necator americanus , анкилостомы, заражающие человека(2014 [406] )
  • Onchocerca volvulus , филяриальный паразит, поражающий человека [407]
  • Pristionchus pacificus , модельное беспозвоночное (2008 [408] )
  • Romanomermis culicivorax , энтомопатогенная нематода, поражающая личинок различных видов комаров (2013 [409] )
  • Schistosoma haematobium , мочевой кровяной сосальщик, инфицирующий людей (2019 [381] )
  • Trichuris suis , власоглав, заражающий свиней(2014 [410] )
  • Trichuris muris , власоглав, заражающий мышей(2014 [411] )
  • Trichuris trichiura , власоглав, заражающий человека(2014 [411] )
  • Wuchereria bancrofti , филяриальный паразит, заражающий человека [407]

Аннелиды [ править ]

  • Capitella teleta , полихета (2007, [412] 2013 [363] )
  • Helobdella robusta , пиявка (2007, [413] 2013 [363] )
  • Eisenia fetida , дождевой червь (2015, [414] 2016 [415] )

Bryozoa [ править ]

  • Bugula неритин , мшанки (2020, [416] )

Brachiopoda [ править ]

  • Lingula anatina , брахиопод (2015, [417] )

Коловратка [ править ]

  • Adineta vaga , коловратка (2013, [418] )

См. Также [ править ]

  • Список секвенированных бактериальных геномов
  • Список секвенированных геномов архей
  • Список секвенированных эукариотических геномов
  • Список секвенированных геномов грибов
  • Список секвенированных геномов растений
  • Список секвенированных геномов протистов
  • Список секвенированных пластомов

Ссылки [ править ]

  1. ^ Шривастава М., Симаков О., Чепмен Дж, Фэи Б., Готье М.Э., Митрос Т. и др. (Август 2010 г.). «Геном Amphimedon queenslandica и эволюция сложности животных» . Природа . 466 (7307): 720–6. Bibcode : 2010Natur.466..720S . DOI : 10,1038 / природа09201 . PMC  3130542 . PMID  20686567 .
  2. ^ a b Ryu T, Seridi L, Moitinho-Silva L, Oates M, Liew YJ, Mavromatis C, et al. (Февраль 2016). «Гологеномный анализ двух морских губок с разными микробиомами» . BMC Genomics . 17 (1): 158. DOI : 10,1186 / s12864-016-2501-0 . PMC 4772301 . PMID 26926518 .  
  3. ^ Кенни Н., Фрэнсис, В. и др. (Июль 2020 г.). «Отслеживание геномной эволюции животных с помощью сборки на хромосомном уровне пресноводной губки Ephydatia muelleri» . Nature Communications . 11 (1): 720–6. Bibcode : 2020NatCo..11.3676K . DOI : 10.1038 / s41467-020-17397-ш . PMC 7385117 . PMID 32719321 .  
  4. ^ Национальный институт исследования генома человека (2012). "Проект генома мнемиопсиса NHGRI" . Проверено 5 февраля 2013 .
  5. ^ Райан Дж. Ф., Панг К., Шницлер К. Э., Нгуен А. Д., Морленд Р. Т., Симмонс Д. К. и др. (Декабрь 2013). «Геном гребневика Mnemiopsis leidyi и его значение для эволюции типов клеток» . Наука . 342 (6164): 1242592. DOI : 10.1126 / science.1242592 . PMC 3920664 . PMID 24337300 .  
  6. ^ Мороз Л.Л., Кокот К.М., Цитарелла М.Р., Досунг С., Норекиан Т.П., Поволоцкая И.С. и др. (Июнь 2014 г.). «Геном гребневика и эволюционное происхождение нейронных систем» . Природа . 510 (7503): 109–14. Bibcode : 2014Natur.510..109M . DOI : 10,1038 / природа13400 . PMC 4337882 . PMID 24847885 .  
  7. ^ Шривастава М, Бегович Э, Чепмен Дж, Патнэм Н.Х., Хеллстен У., Кавашима Т. и др. (Август 2008 г.). «Геном Trichoplax и природа плакозоя» . Природа . 454 (7207): 955–60. Bibcode : 2008Natur.454..955S . DOI : 10,1038 / природа07191 . PMID 18719581 . S2CID 4415492 .  
  8. ^ Eitel M, Francis WR, Varoqueaux F, Daraspe J, Osigus HJ, Krebs S и др. (Июль 2018). «Сравнительная геномика и природа видов плакозоя» . PLOS Биология . 16 (7): e2005359. DOI : 10.1371 / journal.pbio.2005359 . PMC 6067683 . PMID 30063702 .  
  9. ^ Чапман Дж. А., Киркнесс Э. Ф., Симаков О., Хэмпсон С. Е., Митрос Т., Вайнмайер Т. и др. (Март 2010 г.). «Динамический геном гидры» . Природа . 464 (7288): 592–6. Bibcode : 2010Natur.464..592C . DOI : 10,1038 / природа08830 . PMC 4479502 . PMID 20228792 .  
  10. ^ Putnam NH, Srivastava M, Hellsten U, Dirks B, Chapman J, Salamov A, et al. (Июль 2007 г.). «Геном морского анемона раскрывает репертуар и геномную организацию предкового эуметазоана» . Наука . 317 (5834): 86–94. Bibcode : 2007Sci ... 317 ... 86P . DOI : 10.1126 / science.1139158 . PMID 17615350 . S2CID 9868191 .  
  11. ^ Баумгартен С., Симаков О., Эшерик Л. Я., Лью Ю. Дж., Ленерт Е. М., Мичелл СТ и др. (Сентябрь 2015 г.). «Геном Aiptasia, модель морского анемона для кораллового симбиоза» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (38): 11893–8. Bibcode : 2015PNAS..11211893B . DOI : 10.1073 / pnas.1513318112 . PMC 4586855 . PMID 26324906 .  
  12. ^ Синдзато C, Сёгучи E, Кавасима Т, Хамада М, Хисата К., Танака М и др. (Июль 2011 г.). «Использование генома Acropora digitifera для понимания реакции кораллов на изменение окружающей среды». Природа . 476 (7360): 320–3. Bibcode : 2011Natur.476..320S . DOI : 10,1038 / природа10249 . PMID 21785439 . S2CID 4364757 .  
  13. ^ Цзян Дж (2017). «Геном Renilla muelleri» . рифгеномика .
  14. ↑ Jiang JB, Quattrini AM, Francis WR, Ryan JF, Rodríguez E, McFadden CS (апрель 2019). «Гибрид de novo сборки генома морских анютиных глазок (Renilla muelleri)» . GigaScience . 8 (4). DOI : 10,1093 / gigascience / giz026 . PMC 6446218 . PMID 30942866 .  
  15. ^ Voolstra CR, Ли Y, Лью YJ, Баумгартен S, D Zoccola, Flot ДФ и др. (Декабрь 2017 г.). «Сравнительный анализ геномов Stylophora pistillata и Acropora digitifera свидетельствует о значительных различиях между видами кораллов» . Научные отчеты . 7 (1): 17583. Bibcode : 2017NatSR ... 717583V . DOI : 10.1038 / s41598-017-17484-х . PMC 5730576 . PMID 29242500 .  
  16. ↑ Gold DA, Katsuki T, Li Y, Yan X, Regulski M, Ibberson D и др. (Январь 2019). «Геном медузы Aurelia и эволюция сложности животных» (PDF) . Природа, экология и эволюция . 3 (1): 96–104. DOI : 10.1038 / s41559-018-0719-8 . PMID 30510179 . S2CID 54437176 .   
  17. ^ Леклер л, Хорин С, Шевалье S, Lapébie Р, Dru Р, Перон С, и др. (Май 2019). «Геном медузы Clytia hemisphaerica и эволюция жизненного цикла книдарий». Природа, экология и эволюция . 3 (5): 801–810. DOI : 10.1038 / s41559-019-0833-2 . PMID 30858591 . S2CID 73728941 .  
  18. Перейти ↑ Cunning R, Bay RA, Gillette P, Baker AC, Traylor-Knowles, N (2018). «Сравнительный анализ генома Pocillopora damicornis подчеркивает роль иммунной системы в эволюции кораллов» . Научные отчеты . 8 (1): 16134. Bibcode : 2018NatSR ... 816134C . DOI : 10.1038 / s41598-018-34459-8 . PMC 6208414 . PMID 30382153 .  
  19. ^ Prada C, Hanna B, Budd AF, Woodley CM, Schmutz J, Grimwood J и др. (2016). «В 2016 году пустые ниши после вымирания увеличивают численность современных кораллов». Текущая биология . 1 (26): 3190–3194. DOI : 10.1016 / j.cub.2016.09.039 . PMID 27866895 . S2CID 188206 .  
  20. ^ Kim HM, Weber JA, Lee N, Park SG, Cho YS, Bhak Y, et al. (Март 2019 г.). «Геном гигантской медузы Номуры проливает свет на раннюю эволюцию активного хищничества» . BMC Biology . 17 (1): 28. DOI : 10,1186 / s12915-019-0643-7 . PMC 6441219 . PMID 30925871 .  
  21. ^ Li Y, Gao L, Pan Y, Tian M, Li Y, He C и др. (Апрель 2020 г.). «Эталонный геном на уровне хромосом медузы Rhopilema esculentum» . GigaScience . 9 (4). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa036 . PMC 7172023 . PMID 32315029 .  
  22. ^ а б в Охдера А., Эймс С.Л., Диков Р.Б., Каял Э., Чиодин М., Басби Б. и др. (Июль 2019). «Коробка, стебелька и перевернутая? Наброски геномов из различных линий медуз (Cnidaria, Acraspeda): Alatina alata (Cubozoa), Calvadosia cruxmelitensis (Staurozoa) и Cassiopea xamachana (Scyphozoa)» . GigaScience . 8 (7). DOI : 10,1093 / gigascience / giz069 . PMC 6599738 . PMID 31257419 .  
  23. ^ Джеон Y, Парк SG, Ли N, Weber JA, Ким HS, Hwang SJ, и др. (Март 2019 г.). «Проект генома октокорала, Dendronephthya gigantea» . Геномная биология и эволюция . 11 (3): 949–953. DOI : 10.1093 / GbE / evz043 . PMC 6447388 . PMID 30825304 .  
  24. ^ Cooke I, Ying H, Forêt S, Bongaerts P, Strugnell JM, Simakov O, et al. (Ноябрь 2020 г.). «Геномные сигнатуры кораллового холобионта выявляют адаптацию хозяина, вызванную изменением климата в голоцене и симбионтами, характерными для рифов» . Успехи науки . 6 (48): eabc6318. Bibcode : 2020SciA .... 6.6318C . DOI : 10.1126 / sciadv.abc6318 . PMC 7695477 . PMID 33246955 . S2CID 227179581 .   
  25. ^ а б Симаков О., Кавашима Т., Марлетаз Ф., Дженкинс Дж., Коянаги Р., Митрос Т. и др. (Ноябрь 2015 г.). «Геномы полухордовых и происхождение дейтеростомов» . Природа . 527 (7579): 459–65. Bibcode : 2015Natur.527..459S . DOI : 10,1038 / природа16150 . PMC 4729200 . PMID 26580012 .  
  26. ^ Богмэн кВт, МакДугалл С, Cummins SF, зал М, Degnan БМ, Сато Н, Shoguchi Е (декабрь 2014). «Геномная организация кластеров Hox и ParaHox в иглокожих, Acanthaster planci». Бытие . 52 (12): 952–8. DOI : 10.1002 / dvg.22840 . PMID 25394327 . S2CID 32809575 .  
  27. ↑ Jo J, Oh J, Lee HG, Hong HH, Lee SG, Cheon S и др. (Январь 2017 г.). «Проект генома морского огурца Apostichopus japonicus и генетический полиморфизм среди вариантов окраски» . GigaScience . 6 (1): 1–6. DOI : 10,1093 / gigascience / giw006 . PMC 5437941 . PMID 28369350 .  
  28. ^ Содергрен E, Weinstock GM, Davidson EH, Cameron RA, Gibbs RA, Angerer RC и др. (Ноябрь 2006 г.). «Геном морского ежа Strongylocentrotus purpuratus» . Наука . 314 (5801): 941–52. Bibcode : 2006Sci ... 314..941S . DOI : 10.1126 / science.1133609 . PMC 3159423 . PMID 17095691 .  
  29. ^ Dehal Р, Сато У, Кэмпбелл Р. К., Чапмен Дж, Degnan В, Де Томазо А, и др. (Декабрь 2002 г.). «Проект генома Ciona Кишечник: понимание происхождения хордовых и позвоночных». Наука . 298 (5601): 2157–67. Bibcode : 2002Sci ... 298.2157D . DOI : 10.1126 / science.1080049 . PMID 12481130 . S2CID 15987281 .  
  30. ^ Малый KS, Брудно M, Hill MM, Sidow A (2007). «Выравнивание гапломов и эталонная последовательность высокополиморфного генома Ciona savignyi» . Геномная биология . 8 (3): R41. DOI : 10.1186 / GB-2007-8-3-R41 . PMC 1868934 . PMID 17374142 .  
  31. ^ Seo HC, Kube M, Edvardsen RB, Jensen MF, Beck A, Spriet E, et al. (Декабрь 2001 г.). «Миниатюрный геном морской хордовой Oikopleura dioica». Наука . 294 (5551): 2506. DOI : 10.1126 / science.294.5551.2506 . PMID 11752568 . 
  32. ^ Putnam NH, Butts T, Ferrier DE, Furlong RF, Hellsten U, Kawashima T. и др. (Июнь 2008 г.). «Геном амфиоксуса и эволюция хордового кариотипа» . Природа . 453 (7198): 1064–71. Bibcode : 2008Natur.453.1064P . DOI : 10,1038 / природа06967 . PMID 18563158 . S2CID 4418548 .  
  33. ^ Libants S, Карры К, В Н, Титер JH, Чанг-Дэвидсон YW, Чжан Z, Вилкерсон С, Ли Вт (июль 2009 г.). «Геном морской миноги Petromyzon marinus показывает раннее происхождение нескольких семейств хемосенсорных рецепторов в линии позвоночных» . BMC Evolutionary Biology . 9 : 180. DOI : 10.1186 / 1471-2148-9-180 . PMC 2728731 . PMID 19646260 .  
  34. ^ Smith JJ, Kuraku S, Holt C, Sauka-Spengler T, Jiang N, Campbell MS, et al. (Апрель 2013). «Секвенирование генома морской миноги (Petromyzon marinus) дает представление об эволюции позвоночных» . Генетика природы . 45 (4): 415–21, 421e1-2. DOI : 10.1038 / ng.2568 . PMC 3709584 . PMID 23435085 .  
  35. ^ Венкатеш Б., Киркнесс Э. Ф., Ло Ю. Х., Халперн А. Л., Ли А. П., Джонсон Дж и др. (Апрель 2007 г.). «Обзорное секвенирование и сравнительный анализ генома слоновой акулы (Callorhinchus milii)» . PLOS Биология . 5 (4): e101. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0050101 . PMC 1845163 . PMID 17407382 .  
  36. Перейти ↑ Read TD, Petit RA, Joseph SJ, Alam MT, Weil MR, Ahmad M и др. (Июль 2017 г.). «Проект секвенирования и сборки генома самой большой рыбы в мире, китовой акулы: Rhincodon typus Smith 1828» . BMC Genomics . 18 (1): 532. DOI : 10,1186 / s12864-017-3926-9 . PMC 5513125 . PMID 28709399 .  
  37. ^ Марра Нью-Джерси, Стэнхоуп MJ, Джуэ Н.К., Ван М., Сан К., Павински Битар П. и др. (Февраль 2019). «В геноме белой акулы обнаружены древние приспособления пластиножаберных, связанные с заживлением ран и поддержанием стабильности генома» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 116 (10): 4446–4455. DOI : 10.1073 / pnas.1819778116 . PMC 6410855 . PMID 30782839 .  
  38. ^ Zhang Y, Gao H, Li H, Guo J, Ouyang B, Wang M и др. (Ноябрь 2020 г.). «Геном бамбуковой акулы с белыми пятнами выявляет хромосомные перестройки и быстро развивающиеся иммунные гены хрящевой рыбы» . iScience . 23 (11): 101754. DOI : 10.1016 / j.isci.2020.101754 . PMC 7677710 . PMID 33251490 .  
  39. ^ а б Хара Й, Ямагути К., Онимару К., Кадота М., Коянаги М., Кили С.Д. и др. (Ноябрь 2018 г.). «Геномы акул дают представление об эволюции пластиножаберных и происхождении позвоночных». Природа, экология и эволюция . 2 (11): 1761–1771. DOI : 10.1038 / s41559-018-0673-5 . PMID 30297745 . S2CID 52944566 .  
  40. ^ Ван К., Ван Дж., Чжу Ц., Ян Л, Рен Й, Руань Дж и др. (Февраль 2021 г.). «Геном африканских двоякодышащих рыб проливает свет на переход позвоночных от воды к суше». Cell . DOI : 10.1016 / j.cell.2021.01.047 . PMID 33545087 . 
  41. ↑ Fan G, Chan J, Ma K, Yang B, Zhang H, Yang X и др. (Ноябрь 2018 г.). «Эталонный геном на уровне хромосом сиамской бойцовой рыбы Betta splendens, модельный вид для изучения агрессии» . GigaScience . 7 (11). DOI : 10,1093 / gigascience / giy087 . PMC 6251983 . PMID 30010754 .  
  42. ^ a b c d e f g h i j Fan G, Song Y, Yang L, Huang X, Zhang S, Zhang M и др. (Август 2020 г.). «Публикация первых данных и объявление о проекте 10 000 геномов рыб (Fish10K)» . GigaScience . 9 (8). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa080 . PMC 7433795 . PMID 32810278 .  
  43. ^ Гуани S, Юэ S, Liandong Y, Сяоюнь Н, Сую Z, Mengqi Z, Xianwei У, Юэ С, он Z (2020), геномные данные целующейся гурами, Helostoma temminkii , GigaScience базы данных, DOI : 10,5524 / 102190 , получено 2020-08-19
  44. ↑ Kasahara M, Naruse K, Sasaki S, Nakatani Y, Qu W, Ahsan B и др. (Июнь 2007 г.). «Проект генома медаки и понимание эволюции генома позвоночных». Природа . 447 (7145): 714–9. Bibcode : 2007Natur.447..714K . DOI : 10,1038 / природа05846 . PMID 17554307 . S2CID 4419559 .  
  45. ^ Winter S, Prost S, De Raad J, Coimbra R, Wolf M, Nebenfuehr M и др. (2020). «Сборка генома на уровне хромосом бентосных видов Syngnathiformes: обыкновенного дракончика Callionymus lyra» . Гигабайт . 2020 : 1–10. doi : 10.46471 / гигабайт.6 .
  46. ^ Сяо Y, Сяо Z, Ма Д, Лю Дж, Ли Дж (март 2019). "Последовательность генома ножевой челюсти Oplegnathus fasciatus (Temminck & Schlegel, 1844): первый проект генома на уровне хромосомы в семействе Oplegnathidae" . GigaScience . 8 (3). DOI : 10,1093 / gigascience / giz013 . PMC 6423371 . PMID 30715332 .  
  47. ^ Макгоу С.Е., Гросс Дж. Б., Акен Б., Блин М., Боровски Р., Чалопин Д. и др. (Октябрь 2014 г.). «Геном пещерной рыбы обнаруживает гены-кандидаты потери зрения» . Nature Communications . 5 (1): 5307. Bibcode : 2014NatCo ... 5.5307M . DOI : 10.1038 / ncomms6307 . PMC 4218959 . PMID 25329095 .  
  48. ^ a b Конте М.А., Джоши Р., Мур Е.К., Нандамури С.П., Гаммердингер В.Дж., Робертс Р.Б. и др. (Апрель 2019 г.). «Сборки в масштабе хромосом показывают структурную эволюцию геномов африканских цихлид» . GigaScience . 8 (4). DOI : 10,1093 / gigascience / giz030 . PMC 6447674 . PMID 30942871 .  
  49. ^ Í Kongsstovu S, Dahl HA, Gislason H, Í Homrum E, Jacobsen JA, Flicek P, Mikalsen SO (апрель 2020 г.). «Идентификация мужских гетерогаметных половых регионов в геноме атлантической сельди Clupea harengus» . Журнал биологии рыб . 97 (1): 190–201. DOI : 10.1111 / jfb.14349 . PMC 7115899 . PMID 32293027 . S2CID 215774454 .   
  50. ^ Xu G, Bian C, Nie Z, Li J, Wang Y, Xu D и др. (Январь 2020 г.). «Геном и популяционное секвенирование сборки генома на уровне хромосом китайского анчоуса с хвостиком (Coilia nasus) позволяет по-новому взглянуть на миграционную адаптацию» . GigaScience . 9 (1). DOI : 10,1093 / gigascience / giz157 . PMC 6939831 . PMID 31895412 .  
  51. ^ Луро Б., Де Моро Г., Гарсия С., Кокс С.Дж., Вериссимо А., Сабатино С.Дж. и др. (Май 2019). «Проект генома европейской сардины (Sardina pilchardus) с разрешенным гаплотипом» . GigaScience . 8 (5). DOI : 10,1093 / gigascience / giz059 . PMC 6528745 . PMID 31112613 .  
  52. ^ Amemiya CT, Alföldi J, Lee AP, Fan S, Philippe H, Maccallum I и др. (Апрель 2013). «Геном африканских латимерии дает представление об эволюции четвероногих» . Природа . 496 (7445): 311–6. Bibcode : 2013Natur.496..311A . DOI : 10,1038 / природа12027 . PMC 3633110 . PMID 23598338 .  
  53. ^ Запись ансамбля
  54. ^ Jiang W, Qiu Y, Pan X, Zhang Y, Wang X, Lv Y, и др. (2018). «Anabarilius grahami (Реган) и его эволюционные и генетические приложения» . Границы генетики . 9 : 614. DOI : 10,3389 / fgene.2018.00614 . PMC 6288284 . PMID 30564274 .  
  55. ^ "Ensembl genome browser 59: Danio rerio - Description - Search Ensembl Zebrafish" . Ensembl.org . Проверено 27 августа 2010 .
  56. ^ a b van Kruistum H, van den Heuvel J, Travis J, Kraaijeveld K, Zwaan BJ, Groenen MA, et al. (Июль 2019). «Геном живородящей рыбы Heterandria formosa предполагает роль консервативных генов позвоночных в эволюции плацентарных рыб» . BMC Evolutionary Biology . 19 (1): 156. DOI : 10,1186 / s12862-019-1484-2 . PMC 6660938 . PMID 31349784 .  
  57. ^ Лю HP, Сяо SJ, Wu N, Wang D, Liu YC, Zhou CW и др. (Февраль 2019). «Последовательность и сборка de novo генома Oxygymnocypris stewartii» . Научные данные . 6 : 190009. Bibcode : 2019NatSD ... 690009L . DOI : 10.1038 / sdata.2019.9 . PMC 6362891 . PMID 30720802 .  
  58. ^ Лю Х, Чен С, Гао З, Мин Дж, Гу И, Цзянь Дж и др. (Июль 2017 г.). «Проект генома тупорылого леща (Megalobrama amblycephala) показывает развитие межмышечной кости и адаптацию к питанию травоядных» . GigaScience . 6 (7): 1–13. DOI : 10,1093 / gigascience / gix039 . PMC 5570040 . PMID 28535200 .  
  59. ↑ Fan G, Song Y, Yang L, Huang X, Zhang S, Zhang M и др. (2020). «Геномные данные розового горчака Rhodeus ocellatus». База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102192 . Cite journal requires |journal= (help)
  60. ^ Юань Д., Чен Х, Гу Х, Цзоу М, Цзоу И, Фанг Дж и др. (Ноябрь 2020 г.). «Хромосомный геном Triplophysa bleekeri дает представление о его эволюции и адаптации к окружающей среде» . GigaScience . 9 (11). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa132 . PMC 7684707 . PMID 33231676 .  
  61. ↑ Fan G, Song Y, Yang L, Huang X, Zhang S, Zhang M и др. (2020). «Геномные данные Pseudobrama simoni». База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102191 . Cite journal requires |journal= (help)
  62. ^ a b c d Джонсон Л.К., Сахасрабуде Р., Гилл Дж. А., Роуч Дж. Л., Фроенике Л., Браун К. Т., Уайтхед А. (июнь 2020 г.). «Проект геномных сборок с использованием считывания секвенирования с платформ Oxford Nanopore Technology и Illumina для четырех видов североамериканских киллифов Fundulus» . GigaScience . 9 (6). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa067 . PMC 7301629 . PMID 32556169 .  
  63. ↑ Шао Ф, Людвиг А., Мао И, Лю Н, Пэн З. (август 2020 г.). «Сборка генома на уровне хромосом самки западной москитовидной рыбы (Gambusia affinis)» . GigaScience . 9 (8). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa092 . PMC 7450667 . PMID 32852039 .  
  64. ^ Schartl М, Вальтер РБ, Shen Y, Т Гарсиа, Catchen Дж, Amores А, и др. (Май 2013). «Геном плоской рыбы, Xiphophorus maculatus, дает представление об эволюционной адаптации и нескольких сложных чертах» . Генетика природы . 45 (5): 567–72. DOI : 10.1038 / ng.2604 . PMC 3677569 . PMID 23542700 .  
  65. ^ Harel I, Benayoun BA, Machado B, Singh PP, Hu CK, Pech MF, Valenzano DR, Zhang E, Sharp SC, Artandi SE, Brunet A (февраль 2015 г.). «Платформа для быстрого изучения старения и болезней у короткоживущих позвоночных» . Cell . 160 (5): 1013–1026. DOI : 10.1016 / j.cell.2015.01.038 . PMC 4344913 . PMID 25684364 .  
  66. ^ Райхвальд К., Петцольд А., Кох П., Дауни Б. Р., Хартманн Н., Питч С. и др. (Декабрь 2015 г.). "Понимание эволюции половых хромосом и старения из генома короткоживущих рыб". Cell . 163 (6): 1527–38. DOI : 10.1016 / j.cell.2015.10.071 . PMID 26638077 . S2CID 16423362 .  
  67. ^ Валенсано Д.Р., Бенаюн Б.А., Сингх П.П., Чжан Э., Эттер П.Д., Ху СК, Клемент-Зиза М., Виллемсен Д., Цуй Р., Харель I, Мачадо БЭ, Йи М.С., Шарп СК, Бустаманте С.Д., Бейер А., Джонсон Е.А. , Брюне А (декабрь 2015 г.). «Геном африканской бирюзы киллифа обеспечивает понимание эволюции и генетической архитектуры продолжительности жизни» . Cell . 163 (6): 1539–54. DOI : 10.1016 / j.cell.2015.11.008 . PMC 4684691 . PMID 26638078 .  
  68. ^ Рондо Э. Б., Минкли Д. Р., Леонг Дж. С., Мессмер А. М., Янцен Дж. Р., фон Шальбург К. Р. и др. (2014). «Геном и карта сцепления северной щуки (Esox lucius): выявлена ​​консервативная синтения между сестринской группой лососевых и Neoteleostei» . PLOS ONE . 9 (7): e102089. Bibcode : 2014PLoSO ... 9j2089R . DOI : 10.1371 / journal.pone.0102089 . PMC 4113312 . PMID 25069045 .  
  69. ^ Ensembl Pre entry [ постоянная мертвая ссылка ]
  70. ^ Jones FC, Grabherr MG, Chan YF, Russell P, Mauceli E, Johnson J, et al. (Апрель 2012 г.). «Геномные основы адаптивной эволюции трехиглой колюшки» . Природа . 484 (7392): 55–61. Bibcode : 2012Natur.484 ... 55. . DOI : 10,1038 / природа10944 . PMC 3322419 . PMID 22481358 .  
  71. ↑ Fan G, Song Y, Yang L, Huang X, Zhang S, Zhang M и др. (2020), Геномные данные мраморного бычка, Oxyeleotris marmorata , База данных GigaScience, doi : 10.5524 / 102185 , получено 19 августа 2020 г.
  72. ^ Галлант JR, Traeger LL, Volkening JD, Moffett H, Chen PH, Novina CD и др. (Июнь 2014 г.). «Нечеловеческая генетика. Геномная основа конвергентной эволюции электрических органов» . Наука . 344 (6191): 1522–5. DOI : 10.1126 / science.1254432 . PMC 5541775 . PMID 24970089 .  
  73. ^ "Пятнистый гар" . Ensembl . Проверено 11 сентября 2014 года .
  74. ^ Лю К., Сюй Д, Ли Дж, Бянь С, Дуань Дж, Чжоу И и др. (Апрель 2017 г.). «Секвенирование всего генома китайской ясноголовой ледяной рыбы, Protosalanx hyalocranius» . GigaScience . 6 (4): 1–6. DOI : 10,1093 / gigascience / giw012 . PMC 5530312 . PMID 28327943 .  
  75. ↑ Fan G, Song Y, Yang L, Huang X, Zhang S, Zhang M и др. (2020), Геномные данные африканского костистого языка, Heterotis niloticus , База данных GigaScience, doi : 10.5524 / 102184 , получено 19 августа 2020 г.
  76. ↑ Bian C, Hu Y, Ravi V, Kuznetsova IS, Shen X, Mu X и ​​др. (Апрель 2016 г.). «Геном азиатской арованы (Scleropages formosus) дает новое понимание эволюции ранней линии костистых» . Научные отчеты . 6 (1): 24501. Bibcode : 2016NatSR ... 624501B . DOI : 10.1038 / srep24501 . PMC 4835728 . PMID 27089831 .  
  77. ↑ Fan G, Song Y, Yang L, Huang X, Zhang S, Zhang M и др. (2020). «Геномные данные дынной рыбы-бабочки, Chaetodon trifasciatus». База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102187 . Cite journal requires |journal= (help)
  78. ^ Xu J, Bian C, Chen K, Liu G, Jiang Y, Luo Q и др. (Апрель 2017 г.). «Проект генома северного змееголова Channa argus» . GigaScience . 6 (4): 1–5. DOI : 10,1093 / gigascience / gix011 . PMC 5530311 . PMID 28327946 .  
  79. ↑ Fan G, Song Y, Yang L, Huang X, Zhang S, Zhang M и др. (2020), Геномные данные медной рыбы-бабочки, Chelmon rostratus , База данных GigaScience, doi : 10.5524 / 102189 , получено 19 августа 2020 г.
  80. ^ а б Чен Л., Лу И, Ли В., Рен Й, Ю М., Цзян С. и др. (Апрель 2019 г.). «Геномная основа для колонизации замерзающего Южного океана, выявленная геномами антарктического клыкача и патагонского робало» . GigaScience . 8 (4). DOI : 10,1093 / gigascience / giz016 . PMC 6457430 . PMID 30715292 .  
  81. ^ Wu C, Zhang D, Kan M, Lv Z, Zhu A, Su Y, et al. (Ноябрь 2014 г.). «Черновой геном большого желтого горбыля свидетельствует о хорошо развитом врожденном иммунитете» . Nature Communications . 5 : 5227. Bibcode : 2014NatCo ... 5.5227W . DOI : 10.1038 / ncomms6227 . PMC 4263168 . PMID 25407894 .  
  82. ^ Норрелл AE, Джонс KL, Сайан EA (2020-04-29). «Разработка и характеристика геномных ресурсов немодельной морской костистости, красного луциана (Lutjanus campechanus, Lutjanidae): построение карты сцепления высокой плотности, закрепление контигов генома и сравнительный геномный анализ» . PLOS ONE . 15 (4): e0232402. Bibcode : 2020PLoSO..1532402N . DOI : 10.1371 / journal.pone.0232402 . PMC 7190162 . PMID 32348345 .  
  83. ↑ Fan G, Song Y, Yang L, Huang X, Zhang S, Zhang M и др. (2020). «Геномные данные гигантской рыбы-единорога, Naso vlamingii». База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102188 . Cite journal requires |journal= (help)
  84. ^ Ahn DH, Шин СК, Ким Б. М., Кан S, Ким Д.Х., Ahn I, J Парк, Парк Н (август 2017 г.). «Проект генома антарктической рыбы-дракона, Parachaenichthys charcoti» . GigaScience . 6 (8): 1–6. DOI : 10,1093 / gigascience / gix060 . PMC 5597851 . PMID 28873966 .  
  85. ^ Sarropoulou E, Sundaram AY, Kaitetzidou E, Kotoulas G, Gilfillan GD, Papandroulakis N, et al. (Декабрь 2017 г.). «Полногеномный обзор и динамика экспрессии генов амберджека Seriola dumerili» . GigaScience . 6 (12): 1–13. DOI : 10,1093 / gigascience / gix108 . PMC 5751066 . PMID 29126158 .  
  86. ^ Xu S, Xiao S, Zhu S, Zeng X, Luo J, Liu J и др. (Сентябрь 2018 г.). «Проект сборки генома китайского силлаго (Sillago sinica), первый эталонный геном рыб силлагинид» . GigaScience . 7 (9). DOI : 10,1093 / gigascience / giy108 . PMC 6143730 . PMID 30202912 .  
  87. ↑ Лу Л, Чжао Дж, Ли С (март 2020 г.). «Сборка высококачественного генома и аннотации большеглазой мандариновой рыбы ( Siniperca knerii )» . G3 . 10 (3): 877–880. DOI : 10,1534 / g3.119.400930 . PMC 7056987 . PMID 31953307 .  
  88. ^ Паулетто М., Манусаки Т., Феррарессо С., Баббуччи М., Цакогианнис А., Луро Б. и др. (2018-08-17). «Sparus aurata раскрывает эволюционную динамику генов, зависимых от пола, у последовательных рыб-гермафродитов» . Биология коммуникации . 1 (1): 119. DOI : 10.1038 / s42003-018-0122-7 . PMC 6123679 . PMID 30271999 .  
  89. ^ Лиен С., Куп Б.Ф., Сандве С.Р., Миллер Дж.Р., Кент М.П., ​​Ном Т. и др. (Май 2016). «Геном атлантического лосося дает представление о редиплоидизации». Природа . 533 (7602): 200–5. Bibcode : 2016Natur.533..200L . DOI : 10.1038 / nature17164 . PMID 27088604 . S2CID 4398298 .  
  90. ^ Бертло С, Брюне Ф, Чалопин Д., Хуанчич А, Бернар М., Ноэль Б. и др. (Апрель 2014 г.). «Геном радужной форели позволяет по-новому взглянуть на эволюцию после дупликации всего генома у позвоночных» . Nature Communications . 5 : 3657. Bibcode : 2014NatCo ... 5.3657B . DOI : 10.1038 / ncomms4657 . PMC 4071752 . PMID 24755649 .  
  91. ^ Christensen KA, Leong JS, Sakhrani D, Biagi CA, Minkley DR, Withler RE и др. (2018-04-05). «Геном и транскриптом чавычи (Oncorhynchus tshawytscha)» . PLOS ONE . 13 (4): e0195461. Bibcode : 2018PLoSO..1395461C . DOI : 10.1371 / journal.pone.0195461 . PMC 5886536 . PMID 29621340 .  
  92. ^ Narum С.Р., Ди Genova А, Мичелетти SJ, Маасс А (июль 2018). «Геномные вариации, лежащие в основе сложных жизненных характеристик, выявленные секвенированием генома у чавычи» . Ход работы. Биологические науки . 285 (1883): 20180935. DOI : 10.1098 / rspb.2018.0935 . PMC 6083255 . PMID 30051839 .  
  93. ^ He Y, Chang Y, Bao L, Yu M, Li R, Niu J и др. (Май 2019). «Геном черного морского окуня Sebastes schlegelii на уровне хромосом дает представление об эволюции живорождения» (PDF) . Ресурсы молекулярной экологии . 0 (5): 1309–1321. DOI : 10.1111 / 1755-0998.13034 . PMID 31077549 . S2CID 149454779 .   
  94. ^ Лю З., Лю С., Яо Дж, Бао Л., Чжан Дж, Ли Й и др. (Июнь 2016). «Последовательность генома канального сома дает представление об эволюции образования чешуек у костистых рыб» . Nature Communications . 7 : 11757. Bibcode : 2016NatCo ... 711757L . DOI : 10.1038 / ncomms11757 . PMC 4895719 . PMID 27249958 .  
  95. ^ Озеров М.Ю., Flajšhans М, Noreikiene К, Vasemägi А, Гросс Р (ноябрь 2020). «Проект сборки генома пресноводного сома Apex Predator Wels ( Silurus glanis ) с использованием секвенирования связанного чтения» . G3 . 10 (11): 3897–3906. DOI : 10,1534 / g3.120.401711 . PMC 7642921 . PMID 32917720 . S2CID 221636677 .   
  96. ↑ Fan G, Song Y, Yang L, Huang X, Zhang S, Zhang M и др. (2020). «Геномные данные сиамской тигровой рыбы, Datnioides pulcher». База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102186 . Cite journal requires |journal= (help)
  97. ^ Sun S, Wang Y, Zeng W, Du X, Li L, Hong X и др. (Май 2020 г.). «Геном меконгского тигрового окуня (Datnioides undecimradiatus) дает представление о филогенетическом положении Lobotiformes и биологической сохранности» . Научные отчеты . 10 (1): 8164. Bibcode : 2020NatSR..10.8164S . DOI : 10.1038 / s41598-020-64398-2 . PMC 7235238 . PMID 32424221 . S2CID 218670972 .   
  98. ↑ Fan G, Song Y, Yang L, Huang X, Zhang S, Zhang M и др. (2020). «Данные генома длиннохвостой рыбы-дикобраза, Diodon holocanthus». База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102183 . Cite journal requires |journal= (help)
  99. ↑ Pan H, Yu H, Ravi V, Li C, Lee AP, Lian MM и др. (Сентябрь 2016 г.). «Геном самой большой костистой рыбы, морской солнечной рыбы (Mola mola), позволяет понять, насколько быстро она растет» . GigaScience . 5 (1): 36. DOI : 10,1186 / s13742-016-0144-3 . PMC 5016917 . PMID 27609345 .  
  100. ^ «Четвертая ассамблея генома» . Проект генома фугу . Международный консорциум генома фугу. Архивировано из оригинала на 2010-01-31.
  101. ^ Aparicio S, Chapman J, Stupka E, Putnam N, Chia JM, Dehal P и др. (Август 2002 г.). «Сборка полногеномного ружья и анализ генома Fugu rubripes» . Наука . 297 (5585): 1301–10. Bibcode : 2002Sci ... 297.1301A . DOI : 10.1126 / science.1072104 . PMID 12142439 . S2CID 10310355 .  
  102. ^ Jaillon O, Aury JM, Brunet F, Petit JL, Stange-Thomann N, Mauceli E, et al. (Октябрь 2004 г.). «Дупликация генома костистых рыб Tetraodon nigroviridis выявляет ранний протокариотип позвоночных». Природа . 431 (7011): 946–57. Bibcode : 2004Natur.431..946J . DOI : 10,1038 / природа03025 . PMID 15496914 . S2CID 4414316 .  
  103. ^ Nowoshilow S, Schloissnig S, Fei JF, Dahl A, Pang AW, Pippel M и др. (Февраль 2018). «Геном аксолотля и эволюция ключевых регуляторов тканевого образования». Природа . 554 (7690): 50–55. Bibcode : 2018Natur.554 ... 50N . DOI : 10.1038 / nature25458 . PMID 29364872 . 
  104. ^ Li J, Yu H, Wang W, Fu C, Zhang W, Han F, Wu H (декабрь 2019). «Геномные и транскриптомные взгляды на молекулярные основы сексуально диморфных брачных шипов у Leptobrachium leishanense » . Nature Communications . 10 (1): 5551. Bibcode : 2019NatCo..10.5551L . DOI : 10.1038 / s41467-019-13531-5 . PMC 6895153 . PMID 31804492 .  
  105. ^ Li Q, Guo Q, Zhou Y, Tan H, Bertozzi T, Zhu Y и др. «Проект сборки генома восточной лягушки банджо Limnodynastes dumerilii dumerilii (Anura: Limnodynastidae)». gigabytejournal.com . doi : 10.46471 / гигабайт 2 .
  106. ^ Sun YB, Xiong ZJ, Xiang XY, Liu SP, Zhou WW, Tu XL и др. (Март 2015 г.). «Полногеномная последовательность тибетской лягушки Nanorana parkeri и сравнительная эволюция геномов четвероногих» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (11): E1257-62. Bibcode : 2015PNAS..112E1257S . DOI : 10.1073 / pnas.1501764112 . PMC 4371989 . PMID 25733869 .  
  107. ^ Роджерс Р.Л., Чжоу Л., Чу К., Маркес Р., Корл А., Линдерот Т. и др. (Декабрь 2018 г.). «Геномный захват транспонируемыми элементами в ядовитой лягушке клубники» . Молекулярная биология и эволюция . 35 (12): 2913–2927. DOI : 10.1093 / molbev / msy185 . PMC 6278860 . PMID 30517748 .  
  108. ^ Дентон Р.Д., Кудра Р.С., Малком Дж. В., Дю През Л., Мэлоун Дж. Х. (20 ноября 2018 г.). «Геном африканской лягушки-быка (Pyxicephalus adspersus) объединяет два наследственных ингредиента для создания половых хромосом позвоночных». bioRxiv : 329847. дои : 10,1101 / 329847 . S2CID 90800869 . 
  109. ^ Хаммонд С.А., Уоррен Р.Л., Вандервальк Б.П., Кучук Е., Хан Х., Гибб Е.А., Пандох П., Кирк Х., Чжао Y, Джонс М., Мунгалл А.Дж., Купе Р., Плезанс С, Мур Р.А., Холт Р.А., Раунд JM, Охора С, Валле Б.В., Велдхоен Н., Хелбинг С.К., Бирол I (ноябрь 2017 г.). «Проект генома североамериканской лягушки-быка дает представление о гормональной регуляции длинной некодирующей РНК» . Nature Communications . 8 (1): 1433. Bibcode : 2017NatCo ... 8.1433H . DOI : 10.1038 / s41467-017-01316-7 . PMC 5681567 . PMID 29127278 .  
  110. ^ Эдвардс RJ, Tuipulotu DE, Amos TG, O'Meally D, Richardson MF, Russell TL, et al. (Август 2018 г.). «Проект сборки генома инвазивной тростниковой жабы, Rhinella marina» . GigaScience . 7 (9). DOI : 10,1093 / gigascience / giy095 . PMC 6145236 . PMID 30101298 .  
  111. ↑ Li Y, Ren Y, Zhang D, Jiang H, Wang Z, Li X, Rao D (сентябрь 2019 г.). «Сборка на уровне хромосом генома усатой жабы с использованием секвенирования ДНК третьего поколения и анализа Hi-C» . GigaScience . 8 (9). DOI : 10,1093 / gigascience / giz114 . PMC 6755253 . PMID 31544214 .  
  112. ^ Hellsten U, Harland RM, Gilchrist MJ, Hendrix D, Jurka J, Kapitonov V, et al. (Апрель 2010 г.). «Геном западной когтистой лягушки Xenopus tropicalis» . Наука . 328 (5978): 633–6. Bibcode : 2010Sci ... 328..633H . DOI : 10.1126 / science.1183670 . PMC 2994648 . PMID 20431018 .  
  113. ^ a b c Сент-Джон Дж. А., Браун Э. Л., Исберг С. Р., Майлз Л. Г., Чонг А. Ю., Гонгора Дж. и др. (Январь 2012 г.). «Секвенирование трех геномов крокодилов для освещения эволюции архозавров и амниот» . Геномная биология . 13 (1): 415. DOI : 10,1186 / GB-2012-13-1-415 . PMC 3334581 . PMID 22293439 .  
  114. ^ Ван QH, Пан SK, Ху L, Чжу Y, Xu PW, Xia JQ, и др. (Сентябрь 2013). «Геномный анализ и открытие сигнатур ныряющих и сенсорных свойств исчезающего китайского аллигатора» . Клеточные исследования . 23 (9): 1091–105. DOI : 10.1038 / cr.2013.104 . PMC 3760627 . PMID 23917531 .  
  115. ^ Ван QH, Пан SK, Ху L, Чжу Y, Xu PW, Xia JQ, и др. (28 марта 2014 г.). «Геномные данные китайского аллигатора ( Alligator sinensis )». База данных GigaScience . DOI : 10.5524 / 100077 .
  116. ^ Gemmell NJ, Rutherford K, Prost S, Tollis M, Winter D, Macey JR и др. (Август 2020 г.). «Геном туатары раскрывает древние особенности эволюции амниот» . Природа . 584 (7821): 403–409. DOI : 10.1038 / s41586-020-2561-9 . PMC 7116210 . PMID 32760000 .  
  117. ^ Alföldi J, Di Palma F, Grabherr M, Williams C, Kong L, Mauceli E, et al. (Август 2011 г.). «Геном зеленой ящерицы анола и сравнительный анализ с птицами и млекопитающими» . Природа . 477 (7366): 587–91. Bibcode : 2011Natur.477..587A . DOI : 10,1038 / природа10390 . PMC 3184186 . PMID 21881562 .  
  118. ^ Сонг Б, Ченг S, Сунь Y, Чжун X, Цзинь J, Гуань R, Мерфи RW, Че J, Чжан Y, Лю X (2015). «Черновик генома безногой ящерицы-ангидницы, Ophisaurus gracilis» . GigaScience . 4 : 17. DOI : 10,1186 / s13742-015-0056-7 . PMC 4391233 . PMID 25859342 .  
  119. ^ а б в г Кишида Т., Гоу Й, Тацумото С., Тацуми К., Кураку С., Тода М. (2019). «Потеря обоняния у морских змей открывает новые перспективы для адаптации амниот к водной среде» . Труды Королевского общества B: биологические науки . 286 (1910): 20191828. DOI : 10.1098 / rspb.2019.1828 . PMC 6742997 . PMID 31506057 .  
  120. ^ Xiong Z, Li F, Li Q, Zhou L, Gamble T, Zheng J и др. (Октябрь 2016 г.). «Проект генома леопардового геккона Eublepharis macularius » . GigaScience . 5 (1): 47. DOI : 10,1186 / s13742-016-0151-4 . PMC 5080775 . PMID 27784328 .  
  121. ^ Вонк FJ, Casewell NR, Henkel CV, Heimberg А.М., Jansen HJ, McCleary RJ, и др. (Декабрь 2013). «Геном королевской кобры показывает динамическую эволюцию генов и адаптацию в системе змеиного яда» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (51): 20651–6. Bibcode : 2013PNAS..11020651V . DOI : 10.1073 / pnas.1314702110 . PMC 3870661 . PMID 24297900 .  
  122. ^ Ullate-Аготе A, Milinkovitch MC, Tzika AC (2015-07-02). «Последовательность генома кукурузной змеи (Pantherophis guttatus), ценный ресурс для исследований EvoDevo на чешуях». Международный журнал биологии развития . 58 (10–12): 881–8. DOI : 10,1387 / ijdb.150060at . PMID 26154328 . 
  123. ^ Джордж А, Ли Q, Lian Дж, O'Meally D, J Дикин, Ван Z, и др. (2015-12-01). «Секвенирование с высоким охватом и аннотированная сборка генома австралийской ящерицы-дракона Pogona vitticeps» . GigaScience . 4 (1): 45. DOI : 10,1186 / s13742-015-0085-2 . PMC 4585809 . PMID 26421146 .  
  124. ^ Castoe Т.А., де Конинг AP, зал KT, карта DC, DR, Шилд Фуджит М.К. и др. (Декабрь 2013). «Геном бирманского питона раскрывает молекулярную основу экстремальной адаптации змей» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (51): 20645–50. Bibcode : 2013PNAS..11020645C . DOI : 10.1073 / pnas.1314475110 . PMC 3870669 . PMID 24297902 .  
  125. ^ Roscito JG, Sameith K, Pippel M, Francoijs KJ, Winkler S, Dahl A и др. (Декабрь 2018 г.). «Геном ящерицы тегу Salvator merianae: объединение данных Illumina, PacBio и данных оптического картирования для создания очень непрерывной сборки» . GigaScience . 7 (12). DOI : 10,1093 / gigascience / giy141 . PMC 6304105 . PMID 30481296 .  
  126. ^ Гао Дж, Ли Кью, Ван З., Чжоу И, Мартелли П., Ли Ф и др. (Июль 2017 г.). «Секвенирование, сборка de novo и аннотирование генома находящейся под угрозой исчезновения китайской крокодиловой ящерицы Shinisaurus crocodilurus» . GigaScience . 6 (7): 1–6. DOI : 10,1093 / gigascience / gix041 . PMC 5569961 . PMID 28595343 .  
  127. ^ а б Ван З., Паскуаль-Анайя Дж., Задисса А., Ли В., Ниимура Ю., Хуанг З. и др. (Июнь 2013). «Проект геномов мягкой черепахи и зеленой морской черепахи дает представление о развитии и эволюции специфического для черепах строения тела» . Генетика природы . 45 (6): 701–706. DOI : 10.1038 / ng.2615 . PMC 4000948 . PMID 23624526 .  
  128. ^ Shaffer HB , Minx P, Warren DE, Shedlock AM, Thomson RC, Valenzuela N и др. (Март 2013 г.). «Геном западной нарисованной черепахи, модель эволюции экстремальных физиологических адаптаций в медленно развивающейся ветви» . Геномная биология . 14 (3): R28. DOI : 10.1186 / GB-2013-14-3-r28 . PMC 4054807 . PMID 23537068 .  
  129. ↑ Цао Д., Ван М, Гэ И, Гонг С. (май 2019 г.). «Проект генома головастой черепахи Platysternon megacephalum» . Научные данные . 6 (1): 60. Bibcode : 2019NatSD ... 6 ... 60C . DOI : 10.1038 / s41597-019-0067-9 . PMC 6522511 . PMID 31097710 .  
  130. ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al am an ao ap aq Джарвис Э. Д., Мирараб С., Аберер А.Дж., Ли Б., Хоуд П., Ли С. и др. (Декабрь 2014 г.). «Полногеномный анализ позволяет выявить ранние ветви на древе жизни современных птиц» . Наука. 346 (6215): 1320–31. Bibcode : 2014Sci ... 346.1320J . DOI : 10.1126 / science.1253451 . PMC  4405904 . PMID  25504713 .
  131. ^ "Геном Золотого Орла секвенирован" .
  132. ^ Хуанг И, Ли И, Берт Д.В., Чен Х, Чжан И, Цянь В. и др. (Июль 2013). «Геном и транскриптом утки дают представление о видах-резервуарах вируса птичьего гриппа» . Генетика природы . 45 (7): 776–783. DOI : 10.1038 / ng.2657 . PMC 4003391 . PMID 23749191 .  
  133. ^ Le Duc D, Renaud G, Krishnan A, Almén MS, Huynen L, Prohaska SJ и др. (Июль 2015 г.). «Геном киви дает представление об эволюции ночного образа жизни» . Геномная биология . 16 (1): 147. DOI : 10.1186 / s13059-015-0711-4 . PMC 4511969 . PMID 26201466 .  
  134. ^ а б в г Галла С.Дж., Форсдик Н.Дж., Браун Л., Хоппнер М.П., ​​Кнапп М., Мэлони РФ и др. (Декабрь 2018 г.). «Контрольные геномы от отдаленно родственных видов могут быть использованы для обнаружения полиморфизмов единичных нуклеотидов для информирования управления сохранением» . Гены . 10 (1): 9. DOI : 10,3390 / genes10010009 . PMC 6356778 . PMID 30583569 .  
  135. ^ Li S, Li B, Cheng C, Xiong Z, Liu Q, Lai J и др. (2014-12-11). «Геномные признаки исчезновения и возрождения хохлатого ибиса и других исчезающих видов птиц» . Геномная биология . 15 (12): 557. DOI : 10.1186 / s13059-014-0557-1 . PMC 4290368 . PMID 25496777 .  
  136. ^ а б Чжан X, Пан С., Ван Дж, Диксон А., Хе Дж, Мюллер М.Г. и др. (Май 2013). «Последовательности генома сапсана и балобана дают представление об эволюции хищного образа жизни». Генетика природы . 45 (5): 563–6. DOI : 10.1038 / ng.2588 . PMID 23525076 . S2CID 10858993 .  
  137. ^ Чжоу Ц., Ту Х, Ю Х, Чжэн С., Дай Б., Прайс М. и др. (Сентябрь 2019 г.). «Проект генома сычуаньской куропатки, находящейся под угрозой исчезновения ( Arborophila rufipectus ) с эволюционными последствиями» . Гены . 10 (9): 677. DOI : 10,3390 / genes10090677 . PMC 6770966 . PMID 31491910 .  
  138. ^ Международный консорциум по секвенированию куриного генома. (Декабрь 2004 г.). «Последовательность и сравнительный анализ генома курицы обеспечивают уникальные перспективы эволюции позвоночных» . Природа . 432 (7018): 695–716. Bibcode : 2004Natur.432..695C . DOI : 10,1038 / природа03154 . PMID 15592404 . S2CID 4405203 .  
  139. ^ Dalloul RA, Long JA, Zimin AV, Aslam L, Beal K, Blomberg L и др. (Сентябрь 2010 г.). «Мультиплатформенное секвенирование нового поколения домашней индейки (Meleagris gallopavo): сборка и анализ генома» . PLOS Биология . 8 (9): e10000475. DOI : 10.1371 / journal.pbio.1000475 . PMC 2935454 . PMID 20838655 .  
  140. ^ Виньяль А, Буатар S, Thebault N, Dayo ГК, Япы-Gnaore В, Youssao Абду Карим I и др. (Июль 2019). «Сборка генома цесарки предоставляет новые доказательства эволюции после одомашнивания и отбора у галлиформ» . Ресурсы молекулярной экологии . 19 (4): 997–1014. DOI : 10.1111 / 1755-0998.13017 . PMC 6579635 . PMID 30945415 .  
  141. ^ Джайсвал SK Гупт А, Саксен R (5 мая 2018). «Последовательность генома индийского павлина раскрывает особый случай сверкающей птицы». bioRxiv . DOI : 10.1101 / 315457 . S2CID 196632443 . 
  142. ^ Лю Ю., Лю С., Чжан Н., Цюэ П, Лю Н., Хёглунд Дж и др. (Декабрь 2019 г.). "Сборка генома общего фазана Phasianus colchicus: модель видообразования и экологической геномики" . Геномная биология и эволюция . 11 (12): 3326–3331. DOI : 10.1093 / GbE / evz249 . PMC 7145668 . PMID 31713630 .  
  143. ^ Ли CY, Hsieh PH, Chiang LM, Chattopadhyay A, Li KY, Lee YF и др. (Май 2018). «Секвенирование всего генома de novo выявило уникальные гены, которые внесли свой вклад в адаптивную эволюцию фазана Микадо» . GigaScience . 7 (5). DOI : 10,1093 / gigascience / giy044 . PMC 5941149 . PMID 29722814 .  
  144. ^ Ван В, Экблом R, Bunikis я, Siitari Н, Хёглунд J (март 2014). «Секвенирование полного генома тетерева (Tetrao tetrix): сборка под руководством предполагает более быструю эволюцию Z и MHC» . BMC Genomics . 15 : 180. DOI : 10.1186 / 1471-2164-15-180 . PMC 4022176 . PMID 24602261 .  
  145. ^ Sutton JT, Helmkampf M, Steiner CC, Bellinger MR, Korlach J, Hall R и др. (Август 2018 г.). «Высококачественная, долго читаемая сборка генома De Novo для помощи сохранению последних оставшихся на Гавайях видов ворон» . Гены . 9 (8): 393. DOI : 10.3390 / genes9080393 . PMC 6115840 . PMID 30071683 .  
  146. ↑ Gan HM, Falk S, Morales HE, Austin CM, Sunnucks P, Pavlova A (сентябрь 2019 г.). «Геномные доказательства новых половых хромосом у восточной желтой малиновки» . GigaScience . 8 (9). DOI : 10,1093 / gigascience / giz111 . PMC 6736294 . PMID 31494668 .  
  147. ^ а б Эллегрен Х., Смедс Л., Бурри Р., Оласон П.И., Бакстрём Н., Каваками Т. и др. (Ноябрь 2012 г.). «Геномный ландшафт расхождения видов у мухоловок Ficedula». Природа . 491 (7426): 756–60. Bibcode : 2012Natur.491..756E . DOI : 10.1038 / nature11584 . PMID 23103876 . S2CID 4414084 .  
  148. ^ Форменти Г., Кьяра М., Поведа Л., Франкойс К.Дж., Бонисоли-Алквати А., Канова Л. и др. (Январь 2019). «Длинные считывания SMRT и оптические карты Direct Label и Stain позволяют создать высококачественную сборку генома европейской ласточки (Hirundo rustica rustica)» . GigaScience . 8 (1). DOI : 10,1093 / gigascience / giy142 . PMC 6324554 . PMID 30496513 .  
  149. ^ Colquitt Б.М., Mets DG, Brainard MS (март 2018). «Проект сборки генома бенгальского зяблика, Lonchura striata domestica, модель вариабельности двигательных навыков и обучения» . GigaScience . 7 (3): 1–6. DOI : 10,1093 / gigascience / giy008 . PMC 5861438 . PMID 29618046 .  
  150. ^ Prost S, Armstrong EE, Nylander J, Thomas GW, Suh A, Petersen B и др. (2019). «Геномный» . Набор данных GigaDB - данные генома райской птицы Lycocorax pyrrhopterus . gigadb.org . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102158 . Проверено 14 июня 2019 .
  151. ^ a b c d Прост С., Армстронг Э., Ниландер Дж., Томас Г. В., Сух А., Петерсен Б. и др. (Май 2019). «Сравнительный анализ выявляет геномные особенности, потенциально участвующие в эволюции райских птиц» . GigaScience . 8 (5). DOI : 10,1093 / gigascience / giz003 . PMC 6497032 . PMID 30689847 .  
  152. ^ Де Вильмерёй Р Рутшманн А, Ли К.Д., Ивен JG, Брекке P, сантуре AW (март 2019). «Небольшой адаптивный потенциал у птиц, находящихся под угрозой исчезновения». Текущая биология . 29 (5): 889–894.e3. DOI : 10.1016 / j.cub.2019.01.072 . PMID 30799244 . S2CID 72334429 .  
  153. ^ Prost S, Armstrong EE, Nylander J, Thomas GW, Suh A, Petersen B и др. (2019). «Геномный». Данные генома райской птицы Ptiloris paradiseus . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102159 .
  154. ^ Уоррен WC, Clayton DF, Ellegren H, Arnold AP, Hillier LW, Künstner A и др. (Апрель 2010 г.). «Геном певчей птицы» . Природа . 464 (7289): 757–62. Bibcode : 2010Natur.464..757W . DOI : 10,1038 / природа08819 . PMC 3187626 . PMID 20360741 .  
  155. ^ а б Колчанова С., Кливер С., Комиссаров А., Добринин П., Тамазян Г., Григорьев К. и др. (Январь 2019). «Геномы трех близкородственных карибских амазонок дают представление об истории и сохранении видов» . Гены . 10 (1): 54. DOI : 10,3390 / genes10010054 . PMC 6356210 . PMID 30654561 .  
  156. ^ Oleksyk ТЗ, Pombert ДФ, Сия D, Мазо-Варгас А, Б Рамос, Guiblet Вт, и др. (Сентябрь 2012 г.). «Проект по секвенированию генома пуэрториканского попугая (Amazona vittata), финансируемый из местных источников, увеличивает данные о птицах и способствует образованию молодых исследователей» . GigaScience . 1 (1): 14. doi : 10.1186 / 2047-217X-1-14 . PMC 3626513 . PMID 23587420 .  
  157. ^ Сибери К.М., Дауд С.Е., Сибери П.М., Раудсепп Т., Брайтсмит Д.Д., Либориуссен П. и др. (2013-05-08). «Мультиплатформенный проект сборки генома de novo и сравнительный анализ для Scarlet Macaw (Ara macao)» . PLOS ONE . 8 (5): e62415. Bibcode : 2013PLoSO ... 862415S . DOI : 10.1371 / journal.pone.0062415 . PMC 3648530 . PMID 23667475 .  
  158. ↑ Galla SJ, Moraga R, Brown L, Cleland S, Hoeppner MP, Maloney RF и др. (Май 2020 г.). «Сравнение родословных, генетических и геномных оценок родства для обоснования решений о спаривании у двух критически угрожаемых птиц: значение для программ природоохранного разведения во всем мире» . Эволюционные приложения . 13 (5): 991–1008. DOI : 10.1111 / eva.12916 . PMC 7232769 . PMID 32431748 .  
  159. ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s Pan H, Cole TL, Bi X, Fang M, Zhou C, Yang Z и др. (Сентябрь 2019 г.). «Геномы с большим охватом для выяснения эволюции пингвинов» . GigaScience . 8 (9). DOI : 10,1093 / gigascience / giz117 . PMC 6904868 . PMID 31531675 .  
  160. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Чарльз-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные королевского пингвина (Aptenodytes patagonicus) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102182 .
  161. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные западного пингвина рокхоппер (Eudyptes chrysocome) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102170 .
  162. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные пингвина Macaroni (Eudyptes chrysolophus chrysolophus) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102165 .
  163. ^ Алан Д.Т., Эндрю Р.Х., Маккинлей Б., Чарльз-Андре Б., Ченгран З., Дэниел К.Т. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные королевского пингвина (Eudyptes chrysolophus schlegeli) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102164 .
  164. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные восточного пингвина рокхоппер (Eudyptes filholi) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102169 .
  165. ^ Пан Х, Коул Т., Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные северного пингвина рокхоппер (Eudyptes moseleyi) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102171 .
  166. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные хохлатого пингвина Фьордленда (Eudyptes pachyrhynchus) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102166 .
  167. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные пингвина с ловчей хохлатой (Eudyptes robustus) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102167 .
  168. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные пингвина с прямым гребнем (Eudyptes sclateri) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102168 .
  169. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные белохвостого пингвина (Eudyptula minor albosignata) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102177 .
  170. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные синего пингвина (Eudyptula minor minor) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102178 .
  171. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные сказочного пингвина (Eudyptula novaehollandiae) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102179 .
  172. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные Желтоглазого пингвина (Megadyptes antipodes antipodes) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102172 .
  173. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные антарктического пингвина (Pygoscelis antarctica) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102181 .
  174. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные пингвина Gentoo (Pygoscelis papua) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102180 .
  175. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные пингвина Гумбольдта (Spheniscus humboldti) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102176 .
  176. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные магелланова пингвина (Spheniscus magellanicus) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102173 .
  177. ^ Пан Х, Коул Т, Коуто А, Би Х, Мачадо А.М., Брежова Б. и др. (2019). «Геномный». Геномные данные галапагосского пингвина (Spheniscus mendiculus) . База данных GigaScience. DOI : 10.5524 / 102175 .
  178. ^ а б Ханна З.Р., Хендерсон Дж. Б., Уолл Дж. Д., Эмерлинг Калифорния, Фукс Дж., Рункель С. и др. (Октябрь 2017 г.). «Геном северной пятнистой совы (Strix occidentalis caurina): расхождение с неясытью (Strix varia) и характеристика связанных со светом генов» . Геномная биология и эволюция . 9 (10): 2522–2545. DOI : 10.1093 / GbE / evx158 . PMC 5629816 . PMID 28992302 .  
  179. ^ a b c d Бурга А., Ван В., Бен-Дэвид Е., Вольф ПК, Рэйми А. М., Вердуго С., Лион К., Паркер П. Г., Кругляк Л. (июнь 2017 г.). «Генетическая подпись эволюции потери полета у галапагосских бакланов» . Наука . 356 (6341): eaal3345. DOI : 10.1126 / science.aal3345 . PMC 5567675 . PMID 28572335 .  
  180. ^ Уоррен WC, Хиллиер LW, Маршалл Грейвс JA, Birney E, Ponting CP, Grützner F, et al. (Май 2008 г.). «Анализ генома утконоса показывает уникальные признаки эволюции» . Природа . 453 (7192): 175–83. Bibcode : 2008Natur.453..175W . DOI : 10,1038 / природа06936 . PMC 2803040 . PMID 18464734 .  
  181. ^ а б Ю. Чжоу и др. Геномы утконоса и ехидны раскрывают биологию и эволюцию млекопитающих. Nature, опубликовано в сети 6 января 2021 г .; DOI: 10.1038 / s41586-020-03039-0
  182. ↑ Mikkelsen TS, Wakefield MJ, Aken B, Amemiya CT, Chang JL, Duke S и др. (Май 2007 г.). «Геном сумчатого Monodelphis domestica обнаруживает нововведение в некодирующих последовательностях». Природа . 447 (7141): 167–77. Bibcode : 2007Natur.447..167M . DOI : 10,1038 / природа05805 . PMID 17495919 . S2CID 4337232 .  
  183. ^ Бренди, Parice A .; Тан, Саймон; Джонсон, Роберт SP; Хогг, Кэролайн Дж .; Белов, Катерина (2020). «Первый эталонный геном Antechinus предоставляет ресурс для исследования генетической основы семелпаритности и возрастных невропатологий» . Гигабайт . 2020 : 1-22. doi : 10.46471 / гигабайт 7 . Проверено 17 ноября 2020 .
  184. ^ Запись ансамбля
  185. ^ Фейгин CY, Ньютон AH, Доронина L, Шмитц J, Хипсли CA, Митчелл KJ и др. (Январь 2018). «Геном тасманского тигра дает представление об эволюции и демографии вымершего сумчатого плотоядного животного». Природа, экология и эволюция . 2 (1): 182–192. DOI : 10.1038 / s41559-017-0417-у . PMID 29230027 . S2CID 4630578 .  
  186. ^ Renfree МБ, Papenfuss АТ, Дикин JE, Линдсей Дж, Хайдер Т, Белов К, и др. (Август 2011 г.). «Последовательность генома австралийского кенгуру Macropus eugenii дает представление об эволюции размножения и развития млекопитающих» . Геномная биология . 12 (8): R81. DOI : 10.1186 / ГБ-2011-12-8-r81 . PMC 3277949 . PMID 21854559 .  
  187. Перейти ↑ Davey, M. (10 апреля 2013 г.). «Австралийцы расшифровывают генетический код коалы» . Возраст . Проверено 25 июня 2013 года .
  188. ^ a b «Проект генома млекопитающих» . Массачусетский технологический институт . Архивировано из оригинала на 2009-01-06 . Проверено 23 мая 2012 .
  189. ^ Григорьев К., Кливер С., Добрынин П., Комиссаров А., Вольфсбергер В., Крашенинникова К. и др. (Июнь 2018). «Инновационная стратегия сборки способствует пониманию эволюции и генетики сохранения исчезающего вида Solenodon paradoxus с острова Эспаньола» . GigaScience . 7 (6). DOI : 10,1093 / gigascience / giy025 . PMC 6009670 . PMID 29718205 .  
  190. ^ a b c d Паркер Дж, Цагкогеорга Дж., Коттон Дж. А., Лю Й., Проверо П., Ступка Е., Росситер С. Дж. (октябрь 2013 г.). «Полногеномные признаки конвергентной эволюции у эхолокационных млекопитающих» . Природа . 502 (7470): 228–31. Bibcode : 2013Natur.502..228P . DOI : 10,1038 / природа12511 . PMC 3836225 . PMID 24005325 .  
  191. ^ a b Линдблад-Тох К., Гарбер М., Зук О, Лин М.Ф., Паркер Б.Дж., Уошитл С. и др. (Октябрь 2011 г.). «Карта высокого разрешения эволюционных ограничений человека с использованием 29 млекопитающих» . Природа . 478 (7370): 476–82. Bibcode : 2011Natur.478..476. . DOI : 10,1038 / природа10530 . PMC 3207357 . PMID 21993624 .  
  192. ^ Запись ансамбля
  193. ^ a b c d e Gutiérrez-Guerrero YT, Ibarra-Laclette E, Martínez Del Río C, Barrera-Redondo J, Rebollar EA, Ortega J, et al. (Июнь 2020 г.). «Геномные последствия диетического разнообразия и параллельной эволюции из-за нектароядности у летучих мышей с носом» . GigaScience . 9 (6). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa059 . PMC 7276932 . PMID 32510151 .  
  194. ^ Запись ансамбля
  195. ^ Гиббс Р.А., Роджерс Дж., Катце М.Г., Бумгарнер Р., Вайншток Г.М., Мардис Э.Р. и др. (Апрель 2007 г.). «Эволюционные и биомедицинские идеи из генома макаки резус». Наука . 316 (5822): 222–34. Bibcode : 2007Sci ... 316..222. . DOI : 10.1126 / science.1139247 . PMID 17431167 . S2CID 10535839 .  
  196. ^ а б Янь Г, Чжан Г, Фанг Х, Чжан И, Ли Ц, Лин Ф и др. (Октябрь 2011 г.). «Секвенирование генома и сравнение двух моделей животных-приматов, кроме яванского макак и китайских макак-резусов». Природа Биотехнологии . 29 (11): 1019–23. DOI : 10.1038 / nbt.1992 . PMID 22002653 . S2CID 9218360 .  
  197. ^ Батра СС, Леви-Сакин М, Робинсон Дж, Гиллори Дж, Дуринк С, Вилгалис Т.П. и др. (Декабрь 2020 г.). «Точная сборка генома оливкового павиана (Papio anubis) с использованием данных длительного считывания и данных Hi-C» . GigaScience . 9 (12). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa134 . PMC 7719865 . PMID 33283855 .  
  198. ^ Wall JD, Schlebusch SA, Alberts SC, Cox LA, Snyder-Mackler N, Nevonen KA и др. (Июль 2016 г.). «Геномное происхождение и модели расхождения на основе данных секвенирования с низким охватом показывают сложную историю примесей у диких бабуинов» . Молекулярная экология . 25 (14): 3469–83. DOI : 10.1111 / mec.13684 . PMC 5306399 . PMID 27145036 .  
  199. ^ Ван Л, Ву Дж, Лю X, Ди Д, Лян И, Фэн И и др. (Август 2019 г.). «Высококачественная сборка генома находящейся под угрозой исчезновения золотистой курносой обезьяны (Rhinopithecus roxellana)» . GigaScience . 8 (8). DOI : 10,1093 / gigascience / giz098 . PMC 6705546 . PMID 31437279 .  
  200. ^ Локк Д.П., Хиллиер Л.В., Уоррен В.К., Уорли К.С., Назарет Л.В., Музны Д.М. и др. (Январь 2011 г.). «Сравнительно-демографический анализ геномов орангутангов» . Природа . 469 (7331): 529–33. Bibcode : 2011Natur.469..529L . DOI : 10,1038 / природа09687 . PMC 3060778 . PMID 21270892 .  
  201. ^ Scally А, Dutheil JY, Хиллир LW, Джордан GE, Goodhead я, Эрреро Дж, и др. (Март 2012 г.). «Понимание эволюции гоминидов из последовательности генома гориллы» . Природа . 483 (7388): 169–75. Bibcode : 2012Natur.483..169S . DOI : 10,1038 / природа10842 . PMC 3303130 . PMID 22398555 .  
  202. ^ McPherson JD, Marra M, Hillier L, Waterston RH, Chinwalla A, Wallis J и др. (Февраль 2001 г.). «Физическая карта генома человека». Природа . 409 (6822): 934–41. Bibcode : 2001Natur.409..934M . DOI : 10.1038 / 35057157 . PMID 11237014 . S2CID 186244510 .  
  203. ^ Вентер JC, Адамс MD, Майерс EW, Ли PW, Mural RJ, Sutton GG и др. (Февраль 2001 г.). «Последовательность генома человека». Наука . 291 (5507): 1304–51. Bibcode : 2001Sci ... 291.1304V . DOI : 10.1126 / science.1058040 . PMID 11181995 . S2CID 85981305 .  
  204. ^ «Psst, геном человека никогда не был полностью секвенирован» . СТАТ . 2017-06-20 . Проверено 23 октября 2017 .
  205. ^ Green RE, Krause J, Briggs AW, Maricic T, Stenzel U, Kircher M и др. (Май 2010 г.). «Проект последовательности генома неандертальца» . Наука . 328 (5979): 710–722. Bibcode : 2010Sci ... 328..710G . DOI : 10.1126 / science.1188021 . PMC 5100745 . PMID 20448178 .  
  206. ^ Консорциум секвенирования и анализа шимпанзе. (Сентябрь 2005 г.). «Исходная последовательность генома шимпанзе и сравнение с геномом человека». Природа . 437 (7055): 69–87. Bibcode : 2005Natur.437 ... 69. . DOI : 10,1038 / природа04072 . PMID 16136131 . S2CID 2638825 .  
  207. ^ Prüfer K, Munch K, Hellmann I, Akagi K, Miller JR, Walenz B и др. (Июнь 2012 г.). «Геном бонобо по сравнению с геномами шимпанзе и человека» . Природа . 486 (7404): 527–31. Bibcode : 2012Natur.486..527P . DOI : 10.1038 / nature11128 . PMC 3498939 . PMID 22722832 .  
  208. ^ Запись ансамбля
  209. ^ Worley KC, Warren WC, Rogers J, Locke D, Muzny DM, Mardis ER и др. (Консорциум по секвенированию и анализу генома мартышек) (август 2014 г.). «Геном обыкновенной мартышки дает представление о биологии и эволюции приматов» . Генетика природы . 46 (8): 850–7. DOI : 10.1038 / ng.3042 . PMC 4138798 . PMID 25038751 .  
  210. ^ Добрынин П., Лю С., Тамазян Г., Сюн З., Юрченко А.А., Крашенинникова К. и др. (Декабрь 2015 г.). «Геномное наследие африканского гепарда Acinonyx jubatus» . Геномная биология . 16 (1): 277. DOI : 10.1186 / s13059-015-0837-4 . PMC 4676127 . PMID 26653294 .  
  211. ^ Понтиус Ю, Малликин Дж. С., Смит Д. Р., Линдблад-То К., Гнерре С., Зажим М. и др. (Ноябрь 2007 г.). «Исходная последовательность и сравнительный анализ генома кошки» . Геномные исследования . 17 (11): 1675–89. DOI : 10.1101 / gr.6380007 . PMC 2045150 . PMID 17975172 .  
  212. ^ а б в г Чо Й.С., Ху Л, Хоу Х, Ли Х, Сюй Дж., Квон С. и др. (2013). «Геном тигра и сравнительный анализ с геномами льва и снежного барса» . Nature Communications . 4 : 2433. Bibcode : 2013NatCo ... 4.2433C . DOI : 10.1038 / ncomms3433 . PMC 3778509 . PMID 24045858 .  
  213. ^ а б Ким С., Чо Й.С., Ким Х.М., Чунг О, Ким Х., Джо С. и др. (Октябрь 2016 г.). «Сравнение геномов млекопитающих плотоядных, всеядных и травоядных животных с новой сборкой леопарда» . Геномная биология . 17 (1): 211. DOI : 10.1186 / s13059-016-1071-4 . PMC 5090899 . PMID 27802837 .  
  214. ^ Lindblad-Toh K, Wade CM, Mikkelsen TS, Karlsson EK, Jaffe DB, Kamal M и др. (Декабрь 2005 г.). «Последовательность генома, сравнительный анализ и структура гаплотипов домашней собаки». Природа . 438 (7069): 803–19. Bibcode : 2005Natur.438..803L . DOI : 10,1038 / природа04338 . PMID 16341006 . S2CID 4338513 .  
  215. ^ Гопалакришнан S, Саманиий Castruita JA, Синдинг МС, Kuderna НЧ, Райкконена Дж, Петерсно В, и др. (Июнь 2017 г.). «Контрольная последовательность генома волка (Canis lupus lupus) и ее значение для геномики популяций Canis spp.» . BMC Genomics . 18 (1): 495. DOI : 10,1186 / s12864-017-3883-3 . PMC 5492679 . PMID 28662691 .  
  216. ^ Армстронг EE, Тейлор RW, Prost S, Blinston P, van der Meer E, Madzikanda H и др. (Февраль 2019). «Экономически эффективная сборка генома африканской дикой собаки (Lycaon pictus) с использованием связанных считываний» . GigaScience . 8 (2). DOI : 10,1093 / gigascience / giy124 . PMC 6350039 . PMID 30346553 .  
  217. ^ Ли Р., Фан В, Тянь Г, Чжу Х, Хе Л, Цай Дж и др. (Январь 2010 г.). «Последовательность и сборка de novo генома гигантской панды» . Природа . 463 (7279): 311–7. Bibcode : 2010Natur.463..311L . DOI : 10,1038 / природа08696 . PMC 3951497 . PMID 20010809 .  
  218. ^ Тейлор Г.А., Кирк Х., Кумб Л., Джекман С.Д., Чу Дж., Цзе К. и др. (Ноябрь 2018 г.). «Геном североамериканского бурого медведя или гризли: Ursus arctos ssp. Horribilis» . Гены . 9 (12): 598. DOI : 10,3390 / genes9120598 . PMC 6315469 . PMID 30513700 .  
  219. ^ Шривастава А., Кумар Сарсани V, Фиддес I, Шихан С.М., Сегер Р.Л., Бартер М.Э. и др. (Февраль 2019). «Сборка генома и экспрессия генов у американского черного медведя позволяют по-новому взглянуть на реакцию почек на гибернацию» . Исследования ДНК . 26 (1): 37–44. DOI : 10,1093 / dnares / dsy036 . PMC 6379037 . PMID 30395234 .  
  220. ^ Лю С., Лоренцен Э.Д., Фумагалли М., Ли Б., Харрис К., Сюн З. и др. (Май 2014 г.). «Популяционная геномика обнаруживает недавнее видообразование и быструю эволюционную адаптацию белых медведей» . Cell . 157 (4): 785–94. DOI : 10.1016 / j.cell.2014.03.054 . PMC 4089990 . PMID 24813606 .  
  221. ^ Ли В, Чжан G, Willersleve Е, Ван - J, Ван J (2011). «Геномные данные белого медведя ( Ursus maritimus )» . GigaScience . DOI : 10.5524 / 100008 . Проверено 21 июня 2019 .
  222. ^ а б в Фут А.Д., Лю Й., Томас Г.В., Винерж Т., Альфельди Дж., Дэн Дж. и др. (Март 2015 г.). «Конвергентная эволюция геномов морских млекопитающих» . Генетика природы . 47 (3): 272–5. DOI : 10.1038 / ng.3198 . PMC 4644735 . PMID 25621460 .  
  223. ^ Jones SJ, Haulena M, Taylor GA, Chan S, Bilobram S, Warren RL и др. (Декабрь 2017 г.). «Геном северной каланы (Enhydra lutris kenyoni)» . Гены . 8 (12): 379. DOI : 10,3390 / genes8120379 . PMC 5748697 . PMID 29232880 .  
  224. ^ Колелла ДП, Lan Т, Шустер SC, Talbot SL, Кук JA, Линдквист С (2018-05-31). «Mustela erminea обнаружила, что импульсная гибридизация влияет на эволюцию высокогорных районов» . Биология коммуникации . 1 (1): 51. DOI : 10.1038 / s42003-018-0058-у . PMC 6123727 . PMID 30271934 .  
  225. ↑ Peng X, Alföldi J, Gori K, Eisfeld AJ, Tyler SR, Tisoncik-Go J и др. (Декабрь 2014 г.). «Проект последовательности генома хорька (Mustela putorius furo) облегчает изучение респираторных заболеваний человека» . Природа Биотехнологии . 32 (12): 1250–5. DOI : 10.1038 / nbt.3079 . PMC 4262547 . PMID 25402615 .  
  226. ^ Beichman AC, Koepfli KP, Li G, Murphy W, Dobrynin P, Kilver S, et al. (Июнь 2019). «Водная адаптация и истощенное разнообразие: глубокое погружение в геномы калана и гигантской выдры». Молекулярная биология и эволюция . 36 (12): 2631–2655. DOI : 10.1093 / molbev / msz101 . PMID 31212313 . 
  227. ^ Дастджерди А, Роберт C, Уотсон M (2014). «Секвенирование с низким охватом геномов двух азиатских слонов (Elephas maximus)» . GigaScience . 3 : 12. DOI : 10,1186 / 2047-217X-3-12 . PMC 4106201 . PMID 25053995 .  
  228. ^ Запись браузера UCSC
  229. ^ Wade CM, Giulotto E, Sigurdsson S, Zoli M, Gnerre S, Imsland F и др. (Ноябрь 2009 г.). «Последовательность генома, сравнительный анализ и популяционная генетика домашней лошади» . Наука . 326 (5954): 865–7. Bibcode : 2009Sci ... 326..865W . DOI : 10.1126 / science.1178158 . PMC 3785132 . PMID 19892987 .  
  230. ^ Kalbfleisch TS, Rice ES, DePriest MS, Walenz BP, Hestand MS, Vermeesch JR и др. (2018-11-16). «Улучшенный эталонный геном домашней лошади увеличивает смежность сборки и композицию» . Биология коммуникации . 1 (1): 197. DOI : 10.1038 / s42003-018-0199-г . PMC 6240028 . PMID 30456315 .  
  231. ^ a b c d e f g h i j k l m n o p q r s t u v w x y z aa ab ac ad ae af ag ah ai aj ak al Chen L, Qiu Q, Jiang Y, Wang K , Lin Z, Li Z и др. (Июнь 2019). «Крупномасштабное секвенирование генома жвачных животных дает представление об их эволюции и отличительных чертах». Наука . 364 (6446): eaav6202. Bibcode :2019Sci ... 364.6202C . DOI : 10.1126 / science.aav6202 . PMID  31221828 . S2CID  195191415 .
  232. ^ Кин М., Семейкс Дж., Уэбб А.Э., Ли Ю.И., Кесада В., Крейг Т. и др. (Январь 2015 г.). «Понимание эволюции долголетия из генома гренландского кита» . Сотовые отчеты . 10 (1): 112–22. DOI : 10.1016 / j.celrep.2014.12.008 . PMC 4536333 . PMID 25565328 .  
  233. ^ a b c d e Арнасон Ú, Ламмерс Ф., Кумар В., Нильссон М.А., Янке А. (апрель 2018 г.). «Секвенирование всего генома синего кита и других животных обнаруживает признаки интрогрессивного потока генов» . Успехи науки . 4 (4): eaap9873. Bibcode : 2018SciA .... 4.9873A . DOI : 10.1126 / sciadv.aap9873 . PMC 5884691 . PMID 29632892 .  
  234. ^ а б в Йим Х.С., Чо Й.С., Гуан Х, Кан С.Г., Чжон Дж.Й., Ча СС и др. (Январь 2014). «Геном малых полосатиков и водная адаптация китообразных» . Генетика природы . 46 (1): 88–92. DOI : 10.1038 / ng.2835 . PMC 4079537 . PMID 24270359 .  
  235. ^ Wang K, Wang L, Lenstra JA, Jian J, Yang Y, Hu Q и др. (Апрель 2017 г.). «Последовательность генома зубра (Bison bonasus)» . GigaScience . 6 (4): 1–5. DOI : 10,1093 / gigascience / gix016 . PMC 5530314 . PMID 28327911 .  
  236. ^ Dong J, Hu Z, Wu C, Guo H, Zhou B, Lv J, и др. (Июль 2012 г.). «Анализ ассоциаций выявляет множество новых локусов восприимчивости к раку легких и их взаимодействие с курением среди населения Китая» . Генетика природы . 44 (8): 895–9. DOI : 10.1038 / ng.2351 . PMC 6628171 . PMID 22797725 .  
  237. ^ Canavez FC, Luche ДД, Stothard Р, Лейте КР, Соуза-Canavez JM, Plastow G, и др. (2012). «Последовательность генома и сборка Bos indicus». Журнал наследственности . 103 (3): 342–8. DOI : 10.1093 / jhered / esr153 . PMID 22315242 . 
  238. ^ Эльсик К.Г., Теллам Р.Л., Уорли К.С., Гиббс Р.А., Музны Д.М., Вайншток Г.М. и др. (Апрель 2009 г.). «Последовательность генома тауринового крупного рогатого скота: окно в биологию и эволюцию жвачных» . Наука . 324 (5926): 522–8. Bibcode : 2009Sci ... 324..522A . DOI : 10.1126 / science.1169588 . PMC 2943200 . PMID 19390049 .  
  239. ^ Уильямс Дж. Л., Ямартино Д., Прюитт К. Д., Сонстегард Т., Смит Т. П., Лоу Вайоминг и др. (Октябрь 2017 г.). «Сборка генома и ресурс транскриптома речного буйвола, Bubalus bubalis (2n = 50)» . GigaScience . 6 (10): 1–6. DOI : 10,1093 / gigascience / gix088 . PMC 5737279 . PMID 29048578 .  
  240. ^ Koepfli KP, Tamazian G, Wildt D, Dobrynin P, Kim C, Frandsen PB, et al. (Июнь 2019). «Популяции in situ» . G3 . 9 (6): 1785–1793. DOI : 10,1534 / g3.119.400084 . PMC 6553546 . PMID 31000506 .  
  241. ^ Фарре М., Ли Q, Чжоу Y, Дамас Дж, Chemnick LG, Ким Дж, и др. (Февраль 2019). «Сборка генома гемсбока (Oryx gazella) почти в масштабе хромосомы: культовой антилопы пустыни Калахари» . GigaScience . 8 (2). DOI : 10,1093 / gigascience / giy162 . PMC 6351727 . PMID 30649288 .  
  242. ^ Ян Y, Ван Y, Zhao Y, Zhang X, Li R, Chen L и др. (Декабрь 2017 г.). «Проект генома барана Марко Поло (Ovis Ammon polii)» . GigaScience . 6 (12): 1–7. DOI : 10,1093 / gigascience / gix106 . PMC 5740985 . PMID 29112761 .  
  243. ↑ Zhang C, Chen L, Zhou Y, Wang K, Chemnick LG, Ryder OA и др. (Февраль 2018). «Проект генома милу (Elaphurus davidianus)» . GigaScience . 7 (2). DOI : 10,1093 / gigascience / gix130 . PMC 5824821 . PMID 29267854 .  
  244. ^ Li Z, Lin Z, Ba H, Chen L, Yang Y, Wang K и др. (Декабрь 2017 г.). «Проект генома северного оленя (Rangifer tarandus)» . GigaScience . 6 (12): 1–5. DOI : 10,1093 / gigascience / gix102 . PMC 5726476 . PMID 29099922 .  
  245. ↑ Ming Y, Jian J, Yu X, Wang J, Liu W (май 2019). «Ресурсы генома для сохранения индо-тихоокеанского горбатого дельфина Sousa chinensis» . Научные данные . 6 (1): 68. Bibcode : 2019NatSD ... 6 ... 68M . DOI : 10.1038 / s41597-019-0078-6 . PMC 6531461 . PMID 31118413 .  
  246. ^ Фарре М., Ли Q, Даролти И., Чжоу Ю., Дамас Дж, Проскурякова А.А. и др. (Август 2019 г.). «Интегрированная сборка генома в масштабе хромосом жирафа масаи (Giraffa camelopardalis tippelskirchi)» . GigaScience . 8 (8). DOI : 10,1093 / gigascience / giz090 . PMC 6669057 . PMID 31367745 .  
  247. ↑ IP S (12 декабря 2017 г.). «Геном белухи впервые секвенирован в Ванкувере» . Ванкувер Сан .
  248. ↑ Fan Z, Li W, Jin J, Cui K, Yan C, Peng C и др. (Апрель 2018). «Проект последовательности генома лесной кабарги (Moschus berezovskii)» . GigaScience . 7 (4). DOI : 10,1093 / gigascience / giy038 . PMC 5906906 . PMID 29635287 .  
  249. ↑ Fan G, Zhang Y, Liu X, Wang J, Sun Z, Sun S и др. (Июль 2019). «Первый геном на уровне хромосом для морского млекопитающего как ресурс для изучения экологии и эволюции». Ресурсы молекулярной экологии . 19 (4): 944–956. DOI : 10.1111 / 1755-0998.13003 . PMID 30735609 . S2CID 73451140 .  
  250. ^ Groenen М.А., Арчибальд А.Л., Uenishi Н, Таггл СК, Такеучи Y, Ротшильда М. Ф. и др. (Ноябрь 2012 г.). «Анализ генома свиней дает представление о демографии и эволюции свиней» . Природа . 491 (7424): 393–8. Bibcode : 2012Natur.491..393G . DOI : 10.1038 / nature11622 . PMC 3566564 . PMID 23151582 .  
  251. ^ Herrera-Альварес S, Karlsson Е, Райдера О.А., Линдблад-Тох К, Кроуфорд AJ (2018-09-23). «Как сделать грызуна-гиганта: геномная основа и компромиссы гигантизма капибары, самого большого грызуна в мире». bioRxiv 10.1101 / 424606 . DOI : 10.1101 / 424606 . S2CID 92321538 .   Cite journal requires |journal= (help)
  252. ↑ Long AD, Baldwin-Brown J, Tao Y, Cook VJ, Balderrama-Gutierrez G, Crobett-Detig R, Mortazavi R, Barbour AG (июль 2019 г.). «Геном Peromyscus leucopus , естественного хозяина болезни Лайма и других возникающих инфекций» . Успехи науки . 5 (7): eaaw6441. Bibcode : 2019SciA .... 5.6441L . DOI : 10.1126 / sciadv.aaw6441 . PMC 6656541 . PMID 31355335 .  
  253. ^ Хардин А, Nevonen К.А., Eckalbar WL, Карбоун л, Ахитув N (август 2019). «Сравнительная геномная характеристика мультимамматической мыши Mastomys coucha» . Молекулярная биология и эволюция . 36 (12): 2805–2812. DOI : 10.1093 / molbev / msz188 . PMC 6878952 . PMID 31424545 .  
  254. ^ Waterston RH, Lindblad-Toh K, Birney E, Rogers J, Abril JF, Agarwal P и др. (Декабрь 2002 г.). «Первоначальное секвенирование и сравнительный анализ генома мыши». Природа . 420 (6915): 520–62. Bibcode : 2002Natur.420..520W . DOI : 10,1038 / природа01262 . PMID 12466850 . 
  255. ^ Гиббс Р.А., Вайншток Г.М., Мецкер М.Л., Музны Д.М., Содергрен Э.Дж., Шерер С. и др. (Апрель 2004 г.). «Последовательность генома коричневой норвежской крысы дает представление об эволюции млекопитающих». Природа . 428 (6982): 493–521. Bibcode : 2004Natur.428..493G . DOI : 10,1038 / природа02426 . PMID 15057822 . S2CID 4415600 .  
  256. ^ Запись ансамбля
  257. ^ а б Харрисон М.С., Джонгпьер Э., Робертсон Х.М., Арнинг Н., Битард-Фейдель Т., Чао Х. и др. (Март 2018 г.). «Гемиметаболические геномы раскрывают молекулярные основы эусоциальности термитов» . Природа, экология и эволюция . 2 (3): 557–566. DOI : 10.1038 / s41559-017-0459-1 . PMC 6482461 . PMID 29403074 .  
  258. ^ Li S, Zhu S, Jia Q, Yuan D, Ren C, Li K и др. (Март 2018 г.). «Геномные и функциональные пейзажи пластичности развития американского таракана» . Nature Communications . 9 (1): 1008. Bibcode : 2018NatCo ... 9.1008L . DOI : 10.1038 / s41467-018-03281-1 . PMC 5861062 . PMID 29559629 .  
  259. ^ Террапон Н., Ли К., Робертсон Х.М., Джи Л., Мэн Х, Бут В. и др. (Май 2014 г.). «Молекулярные следы альтернативной социальной организации в геноме термитов». Nature Communications . 5 : 3636. Bibcode : 2014NatCo ... 5.3636T . DOI : 10.1038 / ncomms4636 . PMID 24845553 . 
  260. ^ Poulsen M, Hu H, Li C, Chen Z, Xu L, Otani S и др. (Октябрь 2014 г.). «Дополнительный вклад симбионтов в разложение растений у термитов, выращивающих грибы» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 111 (40): 14500–5. Bibcode : 2014PNAS..11114500P . DOI : 10.1073 / pnas.1319718111 . PMC 4209977 . PMID 25246537 .  
  261. ^ Килинг К.И., Юэн М.М., Ляо, Нью-Йорк, Докинг Т.Р., Чан С.К., Тейлор Г.А. и др. (Март 2013 г.). «Проект генома жука горной сосны, Dendroctonus ponderosae Hopkins, основного вредителя леса» . Геномная биология . 14 (3): R27. DOI : 10.1186 / GB-2013-14-3-R27 . PMC 4053930 . PMID 23537049 .  
  262. ^ a b Fallon TR, Lower SE, Chang CH, Bessho-Uehara M, Martin GJ, Bewick AJ, et al. (Октябрь 2018 г.). Уотерхаус Р., Таутц Д. (ред.). «Геномы светлячков проливают свет на параллельное происхождение биолюминесценции у жуков» . eLife . 7 : e36495. DOI : 10.7554 / eLife.36495 . PMC 6191289 . PMID 30324905 .  
  263. ^ Ван К., Ли П, Гао И, Лю Ц, Ван Ц, Инь Дж и др. (Апрель 2019 г.). «Сборка de novo генома белопятнистого цветочного жука (Protaetia brevitarsis)» . GigaScience . 8 (4). DOI : 10,1093 / gigascience / giz019 . PMC 6449472 . PMID 30949689 .  
  264. ^ Ричардс С., Гиббс Р.А., Вайншток Г.М., Браун С.Дж., Денелл Р., Биман Р.В. и др. (Апрель 2008 г.). «Геном модельного жука и вредителя Tribolium castaneum» (PDF) . Природа . 452 (7190): 949–55. Bibcode : 2008Natur.452..949R . DOI : 10,1038 / природа06784 . PMID 18362917 . S2CID 4402128 .   
  265. ^ Мэн Ф, Лю З., Хань Х, Финкельбергс Д., Цзян И, Чжу М. и др. (Март 2020 г.). «Сборка генома на уровне хромосом Aldrichina grahami, криминалистически важной мясной мухи» . GigaScience . 9 (3). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa020 . PMC 7081965 . PMID 32191812 .  
  266. ^ Drukewitz SH, Bokelmann л, Undheim Е.А., фон Reumont ВМ (июль 2019). «Токсины с нуля? Разнообразное мультимодальное происхождение генов у хищной мухи-грабителя Dasypogon diadema указывает на динамическую эволюцию яда двукрылых насекомых» . GigaScience . 8 (7). DOI : 10,1093 / gigascience / giz081 . PMC 6615979 . PMID 31289835 .  
  267. ↑ Kim S, Oh M, Jung W, Park J, Choi HG, Shin SC (март 2017). «Секвенирование генома крылатой мошки Parochlus steinenii с Антарктического полуострова» . GigaScience . 6 (3): 1–8. DOI : 10,1093 / gigascience / giw009 . PMC 5467013 . PMID 28327954 .  
  268. ^ Dikow РБ, Франдсен ПБ, Turcatel М, Dikow Т (2017-01-31). «Proctacanthus coquilletti (Insecta: Diptera: Asilidae) и 16 репрезентативных транскриптомов» . PeerJ . 5 : e2951. DOI : 10,7717 / peerj.2951 . PMC 5289110 . PMID 28168115 .  
  269. ^ Нене V, Wortman JR, Lawson D, Haas B, Kodira C, Tu ZJ, et al. (Июнь 2007 г.). «Последовательность генома Aedes aegypti, основного вектора арбовируса» . Наука . 316 (5832): 1718–23. Bibcode : 2007Sci ... 316.1718N . DOI : 10.1126 / science.1138878 . PMC 2868357 . PMID 17510324 .  
  270. ^ Chen XG, Jiang X, Gu J, Xu M, Wu Y, Deng Y и др. (Ноябрь 2015 г.). «Последовательность генома азиатского тигрового комара, Aedes albopictus, раскрывает понимание его биологии, генетики и эволюции» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (44): E5907-15. Bibcode : 2015PNAS..112E5907C . DOI : 10.1073 / pnas.1516410112 . PMC 4640774 . PMID 26483478 .  
  271. ^ Holt RA, Subramanian GM, Halpern A, Sutton GG, Charlab R, Nusskern DR, et al. (Октябрь 2002 г.). «Последовательность генома малярийного комара Anopheles gambiae». Наука . 298 (5591): 129–49. Bibcode : 2002Sci ... 298..129H . DOI : 10.1126 / science.1076181 . PMID 12364791 . S2CID 4512225 .  ЧАС
  272. ^ a b Lawniczak MK, Emrich SJ, Holloway AK, Regier AP, Olson M, White B и др. (Октябрь 2010 г.). «Широко распространенное расхождение между зарождающимися видами Anopheles gambiae, выявленное последовательностями всего генома» . Наука . 330 (6003): 512–4. Bibcode : 2010Sci ... 330..512L . DOI : 10.1126 / science.1195755 . PMC 3674514 . PMID 20966253 .  
  273. ^ Zhou D, Zhang D, Ding G, Shi L, Hou Q, Ye Y и др. (Январь 2014). «Последовательность генома Anopheles sinensis дает представление о генетических основах компетентности комаров в отношении малярийных паразитов» . BMC Genomics . 15 (1): 42. DOI : 10.1186 / 1471-2164-15-42 . PMC 3901762 . PMID 24438588 .  
  274. ^ a b c d e f g h i j k l m n o Neafsey DE, Waterhouse RM, Abai MR, Aganezov SS, Alexseyev MA, Allen JE, et al. (Январь 2015 г.). «Геномика комаров. Высокоэволюционирующие переносчики малярии: геномы 16 комаров Anopheles» . Наука . 347 (6217): 1258522. DOI : 10.1126 / science.1258522 . PMC 4380271 . PMID 25554792 .  
  275. ^ Ghurye Дж, Корен S, Малый ST, Редмонд S, Хауэлл P, Phillippy А.М., Besansky Нью - Джерси (июнь 2019). «Сборка в масштабе хромосом основного африканского переносчика малярии Anopheles funestus» . GigaScience . 8 (6). DOI : 10,1093 / gigascience / giz063 . PMC 6545970 . PMID 31157884 .  
  276. ^ Arensburger Р, Megy К, Уотерхауза Р. М., Абрудан Дж, Амедео Р, Antelo В, и др. (Октябрь 2010 г.). «Секвенирование Culex quinquefasciatus создает платформу для сравнительной геномики комаров» . Наука . 330 (6000): 86–8. Bibcode : 2010Sci ... 330 ... 86A . DOI : 10.1126 / science.1191864 . PMC 3740384 . PMID 20929810 .  
  277. ^ Чжоу Q, Чжу HM, Хуан QF, Zhao L, Zhang GJ, Рой SW, и др. (Март 2012 г.). «Расшифровка эволюции неополовой и В-хромосомы по проекту генома Drosophila albomicans» . BMC Genomics . 13 : 109. DOI : 10.1186 / 1471-2164-13-109 . PMC 3353239 . PMID 22439699 .  
  278. ^ a b c d e f g h i j Clark AG, Eisen MB, Smith DR, Bergman CM, Oliver B, Markow TA и др. (Ноябрь 2007 г.). «Эволюция генов и геномов на филогении дрозофилы». Природа . 450 (7167): 203–18. Bibcode : 2007Natur.450..203C . DOI : 10,1038 / природа06341 . PMID 17994087 . S2CID 2416812 .  
  279. ^ a b c d e f g h "Проект Drosophila modENCODE BCM-HGSC" . Медицинский колледж Бейлора, Центр секвенирования генома человека .
  280. ^ Адамс, доктор медицины, Селникер С.Е., Холт Р.А., Эванс КА, Гокейн Д.Д., Аманатидес П.Г. и др. (Март 2000 г.). «Последовательность генома Drosophila melanogaster». Наука . 287 (5461): 2185–95. Bibcode : 2000Sci ... 287.2185. . DOI : 10.1126 / science.287.5461.2185 . PMID 10731132 . 
  281. ^ Hamilton PT, Леонг JS, Кооп BF, Перлман SJ (март 2014). «Транскрипционные ответы в защитном симбиозе дрозофилы» . Молекулярная экология . 23 (6): 1558–70. DOI : 10.1111 / mec.12603 . PMID 24274471 . S2CID 2964885 .  
  282. ^ Ричардс S, Лю Y, Bettencourt BR, Hradecky P, Letovsky S, Nielsen R и др. (Январь 2005 г.). «Сравнительное секвенирование генома Drosophila pseudoobscura: хромосомная, генная и цис-элементная эволюция» . Геномные исследования . 15 (1): 1–18. DOI : 10.1101 / gr.3059305 . PMC 540289 . PMID 15632085 .  
  283. ^ "Геном Drosophila santomea - версия 1.0" . Andolfatto Lab . Университет Принстона.
  284. ^ а б Хименес-Гури Э., Уэрта-Сепас Дж., Коззуто Л., Уоттон К. Р., Кан Х., Химмельбауэр Х. и др. (Февраль 2013). «Сравнительная транскриптомика раннего развития двукрылых» . BMC Genomics . 14 : 123. DOI : 10.1186 / 1471-2164-14-123 . PMC 3616871 . PMID 23432914 .  
  285. ^ Мартинсон Е.О., Пейтон Дж., Келкар Ю.Д., Дженнингс ЕС, Бенуа Дж. Б., Веррен Дж. Х., Денлингер Д.Л. (май 2019 г.). "Sarcophaga bullata" . G3 . 9 (5): 1313–1320. DOI : 10,1534 / g3.119.400148 . PMC 6505164 . PMID 30926723 .  
  286. ^ Лемке S, Antonopoulos Д., Мейер F, Domanus MH, Шмидт-Отт U (май 2011). «Компоненты передачи сигналов BMP в эмбриональных транскриптомах парящей мухи Episyrphus balteatus (Syrphidae)» . BMC Genomics . 12 : 278. DOI : 10.1186 / 1471-2164-12-278 . PMC 3224130 . PMID 21627820 .  
  287. ^ Международный консорциум по геномике тли (февраль 2010 г.). «Последовательность генома гороховой тли Acyrthosiphon pisum» . PLOS Биология . 8 (2): e1000313. DOI : 10.1371 / journal.pbio.1000313 . PMC 2826372 . PMID 20186266 .  
  288. ^ Ян П, Ю С, Хао Дж, Лю В, Чжао З, Чжу З, и др. (Сентябрь 2019 г.). «Последовательность генома китайского белого воскового щитовка Ericerus pela: первый проект генома семейства Coccidae щитовок» . GigaScience . 8 (9). DOI : 10,1093 / gigascience / giz113 . PMC 6743827 . PMID 31518402 .  
  289. ^ Zhu J, Jiang F, Wang X, Yang P, Bao Y, Zhao W и др. (Декабрь 2017 г.). «Последовательность генома маленькой коричневой цикадки, Laodelphax striatellus» . GigaScience . 6 (12): 1–12. DOI : 10,1093 / gigascience / gix109 . PMC 5740986 . PMID 29136191 .  
  290. ^ Kingan SB, Urban J, Lambert CC, Baybayan P, Childers AK, Coates B и др. (Октябрь 2019 г.). «Сборка высококачественного генома из одной собранного в полевых условиях пятнистой мухи (Lycorma delicatula) с использованием системы PacBio Sequel II» . GigaScience . 8 (10). DOI : 10,1093 / gigascience / giz122 . PMC 6791401 . PMID 31609423 .  
  291. ^ Мескита Р.Д., Вионетт-Амарал Р.Дж., Ловенбергер С., Ривера-Помар Р., Монтейро Ф.А., Минкс П. и др. (Декабрь 2015 г.). «Геном Rhodnius prolixus, насекомого-переносчика болезни Шагаса, обнаруживает уникальные приспособления к гематофагии и паразитарной инфекции» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (48): 14936–41. Bibcode : 2015PNAS..11214936M . DOI : 10.1073 / pnas.1506226112 . PMC 4672799 . PMID 26627243 .  
  292. ↑ Chen W, Shakir S, Bigham M, Richter A, Fei Z, Jander G (апрель 2019). «Последовательность генома кукурузной листовой тли (Rhopalosiphum maidis Fitch)» . GigaScience . 8 (4). DOI : 10,1093 / gigascience / giz033 . PMC 6451198 . PMID 30953568 .  
  293. ^ Chen J, Fan J, Zhang Y, Li Q, Zhang S, Yin H и др. (2019-08-01). «Проект генома на уровне хромосом зерновой тли Sitobion miscanthi» . GigaScience . 8 (8). DOI : 10,1093 / gigascience / giz101 . PMC 6701489 . PMID 31430367 .  
  294. ^ Лю Цюй, Го И, Чжан И, Ху В, Ли И, Чжу Д. и др. (Август 2019 г.). «Сборка генома на уровне хромосом для насекомых-переносчиков болезни Шагаса, Triatoma rubrofasciata» . GigaScience . 8 (8). DOI : 10,1093 / gigascience / giz089 . PMC 6699579 . PMID 31425588 .  
  295. ^ Nygaard S, Zhang G, Schiøtt M, Li C, Wurm Y, Hu H и др. (Август 2011 г.). «Геном муравья-листореза Acromyrmex echinatior предполагает ключевые приспособления к развитой социальной жизни и выращиванию грибов» . Геномные исследования . 21 (8): 1339–48. DOI : 10.1101 / gr.121392.111 . PMC 3149500 . PMID 21719571 .  
  296. ^ Консорциум по секвенированию генома медоносной пчелы (октябрь 2006 г.). «Понимание социальных насекомых из генома пчелы Apis mellifera» . Природа . 443 (7114): 931–49. Bibcode : 2006Natur.443..931T . DOI : 10,1038 / природа05260 . PMC 2048586 . PMID 17073008 .  
  297. ^ Suen G, Teiling C, Li L, Holt C, Abouheif E, Bornberg-Bauer E, et al. (Февраль 2011 г.). Копенгейвер G (ред.). «Последовательность генома муравья-листореза Atta cephalotes позволяет лучше понять его облигатный симбиотический образ жизни» . PLOS Genetics . 7 (2): e1002007. DOI : 10.1371 / journal.pgen.1002007 . PMC 3037820 . PMID 21347285 .  
  298. ^ а б Бонасио Р., Чжан Г, Йе Ц, Мутти Н.С., Фанг Х, Цинь Н. и др. (Август 2010 г.). «Геномное сравнение муравьев Camponotus floridanus и Harpegnathos saltator» . Наука . 329 (5995): 1068–71. Bibcode : 2010Sci ... 329.1068B . DOI : 10.1126 / science.1192428 . PMC 3772619 . PMID 20798317 .  
  299. ^ Oxley PR, Ji L, Fetter-Pruneda I, McKenzie SK, Li C, Hu H, Zhang G, Kronauer DJ (февраль 2014 г.). «Геном клонального муравья-рейдера Cerapachys biroi» . Текущая биология . 24 (4): 451–8. DOI : 10.1016 / j.cub.2014.01.018 . PMC 3961065 . PMID 24508170 .  
  300. ^ Коноров Е.А., Никитин М.А., Михайлов К.В., Лысенков С.Н., Беленький М., Чанг П.Л., Нуждин С.В., Скобеева В.А. (февраль 2017). «Геномная эксаптация позволяет Lasius niger адаптироваться к городской среде» . BMC Evolutionary Biology . 17 (Suppl 1): 39. DOI : 10,1186 / s12862-016-0867-х . PMC 5333191 . PMID 28251870 .  
  301. ^ Смит CD, Зимин A, Холт C, Abouheif E, Benton R, Cash E, et al. (Апрель 2011 г.). «Проект генома всемирно распространенного и инвазионного аргентинского муравья (Linepithema humile)» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (14): 5673–8. Bibcode : 2011PNAS..108.5673S . DOI : 10.1073 / pnas.1008617108 . PMC 3078359 . PMID 21282631 .  
  302. ^ a b c Веррен Дж. Х., Ричардс С., Дежарден Калифорния, Нихуис О, Гадау Дж., Колборн Дж. К. и др. (Январь 2010 г.). «Функциональные и эволюционные выводы из геномов трех паразитоидных видов Nasonia» . Наука . 327 (5963): 343–8. Bibcode : 2010Sci ... 327..343. . DOI : 10.1126 / science.1178028 . PMC 2849982 . PMID 20075255 .  
  303. ^ Kapheim KM, Pan H, Li C, Blatti C, Harpur BA, Ioannidis P, et al. (Март 2019 г.). "Nomia melanderi)" . G3 . 9 (3): 625–634. DOI : 10,1534 / g3.118.200865 . PMC 6404593 . PMID 30642875 .  
  304. ^ Смит CR, Смит CD, Робертсон HM, Helmkampf M, Зимин A, Yandell M, и др. (Апрель 2011 г.). «Проект генома красного муравья-комбайна Pogonomyrmex barbatus» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (14): 5667–72. Bibcode : 2011PNAS..108.5667S . DOI : 10.1073 / pnas.1007901108 . PMC 3078412 . PMID 21282651 .  
  305. ^ Вюрм У, Ван - J, Риба-Grognuz О, Корона М, Найгаард S, Хант Б. и др. (Апрель 2011 г.). «Геном огненного муравья Solenopsis invicta» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 108 (14): 5679–84. Bibcode : 2011PNAS..108.5679W . DOI : 10.1073 / pnas.1009690108 . PMC 3078418 . PMID 21282665 .  
  306. ^ Kim SR, Kwak W, Kim H, Caetano-Anolles K, Kim KY, Kim SB и др. (Январь 2018). «Последовательность генома шелковой моли японского дуба, Antheraea yamamai: первый проект генома в семействе Saturniidae» . GigaScience . 7 (1): 1–11. DOI : 10,1093 / gigascience / gix113 . PMC 5774507 . PMID 29186418 .  
  307. ^ Йен ЕС, Маккарти С.А., Галарза Дж. А., Генералович Т. Н., Пелан С., Нгуен П. и др. (Август 2020 г.). «Сборка гаплотипа de novo генома лесной тигровой моли (Arctia plantaginis) посредством трио биннинга» . GigaScience . 9 (8). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa088 . PMC 7433188 . PMID 32808665 .  
  308. ^ Nowell RW, Elsworth B, Oostra V, Zwaan BJ, Wheat CW, Saastamoinen M и др. (Июль 2017 г.). «Проект генома микалезиновой бабочки Bicyclus anynana с высоким охватом» . GigaScience . 6 (7): 1–7. DOI : 10,1093 / gigascience / gix035 . PMC 5493746 . PMID 28486658 .  
  309. ^ Мита К., Касахара М, Сасаки С., Нагаясу Й, Ямада Т, Канамори Х, Намики Н., Китагава М, Ямасита Х, Ясукочи Й, Кадоно-Окуда К., Ямамото К., Аджимура М, Равикумар Г, Шимомура М, Нагамура , Шин-И Т, Абэ Х, Шимада Т, Моришита С., Сасаки Т (февраль 2004 г.). «Последовательность генома тутового шелкопряда Bombyx mori». Исследования ДНК . 11 (1): 27–35. DOI : 10.1093 / dnares / 11.1.27 . PMID 15141943 . 
  310. ^ Ван Ф, Инь Ц, Тан Р, Чен М, Ву Цюй, Хуанг Ц и др. (Сентябрь 2019 г.). «Сборка генома Cydia pomonella на уровне хромосом дает представление о химической экологии и устойчивости к инсектицидам» . Nature Communications . 10 (1): 4237. Bibcode : 2019NatCo..10.4237W . DOI : 10.1038 / s41467-019-12175-9 . PMC 6748993 . PMID 31530873 .  
  311. Перейти ↑ Zhan S, Merlin C, Boore JL, Reppert SM (ноябрь 2011 г.). «Геном бабочки монарх дает представление о миграции на большие расстояния» . Cell . 147 (5): 1171–85. DOI : 10.1016 / j.cell.2011.09.052 . PMC 3225893 . PMID 22118469 .  
  312. ^ Dasmahapatra KK (июль 2012). «Геном бабочки показывает беспорядочный обмен мимикрическими адаптациями между видами» . Природа . 487 (7405): 94–8. Bibcode : 2012Natur.487 ... 94T . DOI : 10.1038 / nature11041 . PMC 3398145 . PMID 22722851 .  
  313. ^ Ахола В., Лехтонен Р., Сомервуо П., Салмела Л., Коскинен П., Растас П. и др. (Сентябрь 2014 г.). «Геном рябчиков Гланвилля сохраняет древний кариотип и выявляет селективные хромосомные слияния у чешуекрылых» . Nature Communications . 5 (1): 4737. Bibcode : 2014NatCo ... 5.4737A . DOI : 10.1038 / ncomms5737 . PMC 4164777 . PMID 25189940 .  
  314. ^ Цун Q, Ли W, Borek D, Otwinowski Z, Гришин NV (февраль 2019). «Геном медведя-великана-шкипера предполагает генетическую адаптацию к жизни в корнях юкки» . Молекулярная генетика и геномика . 294 (1): 211–226. DOI : 10.1007 / s00438-018-1494-6 . PMC 6436644 . PMID 30293092 .  
  315. ^ Лу С, Ян Дж, Дай Х, Се Ф, Хе Дж, Донг Зи и др. (Ноябрь 2019 г.). «Эталонный геном на хромосомном уровне китайской бабочки павлина (Papilio bianor) на основе секвенирования ДНК третьего поколения и анализа Hi-C» . GigaScience . 8 (11). DOI : 10,1093 / gigascience / giz128 . PMC 6827417 . PMID 31682256 .  
  316. ^ Шен Дж, Конг Q, Кинч Л.Н., Борек Д., Отвиновский З., Гришин Н.В. (03.11.2016). «Pieris rapae, стойкий инопланетянин, вредитель капусты и источник противораковых белков» . F1000 Исследования . 5 : 2631. DOI : 10,12688 / f1000research.9765.1 . PMC 5247789 . PMID 28163896 .  
  317. ^ You M, Yue Z, He W, Yang X, Yang G, Xie M и др. (Февраль 2013). «Гетерозиготный геном моли дает представление о травоядности и детоксикации». Генетика природы . 45 (2): 220–5. DOI : 10.1038 / ng.2524 . PMID 23313953 . S2CID 645600 .  
  318. ^ Гуэн А, Bretaudeau А, Нам К, Гименес S, AURY Ю.М., Duvic В, и др. (Сентябрь 2017 г.). «Два генома высокополифагных чешуекрылых вредителей (Spodoptera frugiperda, Noctuidae) с различными диапазонами растений-хозяев» . Научные отчеты . 7 (1): 11816. Bibcode : 2017NatSR ... 711816G . DOI : 10.1038 / s41598-017-10461-4 . PMC 5613006 . PMID 28947760 .  
  319. ^ Kakumani PK, Малхотра P, Мукерджи SK, Бхатнагар РК (август 2014). «Проект сборки генома армейского червя Spodoptera frugiperda». Геномика . 104 (2): 134–43. DOI : 10.1016 / j.ygeno.2014.06.005 . PMID 24984256 . 
  320. ^ Sivasankaran K, Mathew P, S Anand, Ceasar SA, Mariapackiam S, Ignacimuthu S (декабрь 2017). «Полная последовательность митохондриального генома плодоядной моли Eudocima phalonia (Linnaeus, 1763) (Lepidoptera: Noctuoidea)» . Геномические данные . 14 : 66–81. DOI : 10.1016 / j.gdata.2017.09.004 . PMC 5633087 . PMID 29021958 .  
  321. ^ Ван X, Фанг X, Ян П, Цзян X, Цзян Ф, Чжао Д. и др. (14 января 2014 г.). «Геном саранчи дает представление об образовании роя и дальних полетах» . Nature Communications . 5 (1): 2957. Bibcode : 2014NatCo ... 5.2957W . DOI : 10.1038 / ncomms3957 . PMC 3896762 . PMID 24423660 .  
  322. ^ Верлинден Х, Стерк Л., Ли Дж, Ли З, Иссел А, Гансеманс И и др. (27 июля 2020 г.). «Первый проект сборки генома пустынной саранчи Schistocerca gregaria» . F1000 Исследования . 9 : 775. DOI : 10,12688 / f1000research.25148.1 . PMC 7607483 . PMID 33163158 .  
  323. ^ Киркнесс EF, Хаас BJ, Sun W, Braig HR, Perotti MA, Clark JM и др. (Июль 2010 г.). «Последовательности генома тельца человека и его первичного эндосимбионта дают представление о постоянном паразитическом образе жизни» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 107 (27): 12168–73. Bibcode : 2010PNAS..10712168K . DOI : 10.1073 / pnas.1003379107 . PMC 2901460 . PMID 20566863 .  
  324. ↑ Луо С, Тан М, Франдсен ПБ, Стюарт Р.Дж., Чжоу X (декабрь 2018 г.). «Геном подводного архитектора ручейника Stenopsyche tienmushanensis Hwang (Insecta: Trichoptera)» . GigaScience . 7 (12). DOI : 10,1093 / gigascience / giy143 . PMC 6302954 . PMID 30476205 .  
  325. ↑ Jørgensen TS, Petersen B, Petersen HC, Browne PD, Prost S, Stillman JH и др. (Май 2019). «Геном и транскриптом мРНК Cosmopolitan Calanoid Copepod Acartiatonsa Dana улучшают понимание эволюции размера генома Copepod» . Геномная биология и эволюция . 11 (5): 1440–1450. DOI : 10.1093 / GbE / evz067 . PMC 6526698 . PMID 30918947 .  
  326. ^ "Консорциум геномики дафний" . Архивировано из оригинала на 2010-01-09 . Проверено 23 мая 2012 .
  327. ^ " Дафния пулекс v1.0" . Объединенный институт генома DOE . Проверено 29 ноября 2009 .
  328. ^ Colbourne JK, Pfrender ME, Gilbert D, Thomas WK, Tucker A, Oakley TH и др. (Февраль 2011 г.). «Экоответственный геном Daphnia pulex» . Наука . 331 (6017): 555–61. Bibcode : 2011Sci ... 331..555C . DOI : 10.1126 / science.1197761 . PMC 3529199 . PMID 21292972 .  
  329. Перейти ↑ Baldwin-Brown JG, Weeks SC, Long AD (январь 2018). «Новый стандарт для геномов ракообразных: очень смежная, аннотированная сборка генома моллюска Eulimnadia texana выявляет порядок генов HOX и идентифицирует половую хромосому» . Геномная биология и эволюция . 10 (1): 143–156. DOI : 10.1093 / GbE / evx280 . PMC 5765565 . PMID 29294012 .  
  330. ^ Jin S, Bian C, Jiang S, Han K, Xiong Y, Zhang W и др. (Январь 2021 г.). «Сборка генома на уровне хромосом восточной речной креветки, Macrobrachium nipponense» . GigaScience . 10 (1). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa160 . PMC 7812440 . PMID 33459341 .  
  331. ^ Кенни NJ, Sin YW, Шен X, Zhe Q, Wang W, Chan TF и ​​др. (Март 2014 г.). «Геномная последовательность и экспериментальная управляемость новой модели десятиногих креветок, Neocaridina denticulata» . Морские препараты . 12 (3): 1419–37. DOI : 10.3390 / md12031419 . PMC 3967219 . PMID 24619275 .  
  332. ↑ Kao D, Lai AG, Stamataki E, Rosic S, Konstantinides N, Jarvis E, et al. (Ноябрь 2016 г.). «Parhyale hawaiensis, модель развития животных, регенерации, иммунитета и переваривания лигноцеллюлозы» . eLife . 5 : e20062. DOI : 10.7554 / eLife.20062 . PMC 5111886 . PMID 27849518 .  
  333. ^ Тан Б., Чжан Д., Ли Х, Цзян С., Чжан Х, Сюань Ф и др. (Январь 2020 г.). «Сборка генома на уровне хромосом показывает уникальную эволюцию генома краба-плавунца (Portunus trituberculatus)» . GigaScience . 9 (1). DOI : 10,1093 / gigascience / giz161 . PMC 6944217 . PMID 31904811 .  
  334. ^ Gutekunst Дж, Andriantsoa R, Falckenhayn С, Ханна К, Штейн Вт, Rasamy Дж, Łyko Р (март 2018). «Клональная эволюция генома и быстрое инвазивное распространение мраморных раков». Природа, экология и эволюция . 2 (3): 567–573. DOI : 10.1038 / s41559-018-0467-9 . PMID 29403072 . S2CID 3354026 .  
  335. ^ Кан С, Ан Д.Х., Ли Дж. Х., Ли С. Г., Шин С. К., Ли Дж и др. (Январь 2017 г.). «Геном антарктических рачков, Tigriopus kingsejongensis» . GigaScience . 6 (1): 1–9. DOI : 10,1093 / gigascience / giw010 . PMC 5467011 . PMID 28369352 .  
  336. ^ Носса CW, Havlak Р, Юэ JX, J Ур, Винсент К.Ю., Брокманна HJ, и др. (2014). «Совместная сборка и генетическое картирование генома атлантического подковообразного краба выявляет древнюю дупликацию всего генома» . GigaScience . 3 : 9. дои : 10,1186 / 2047-217X-3-9 . PMC 4066314 . PMID 24987520 .  
  337. ^ Shingate Р, Рави В, Прасада А, Тэй ВН, Garg КМ, Chattopadhyay В, и др. (Май 2020 г.). «Сборка на уровне хромосом генома подковообразного краба дает представление об эволюции его генома» . Nature Communications . 11 (1): 2322. Bibcode : 2020NatCo..11.2322S . DOI : 10.1038 / s41467-020-16180-1 . PMC 7210998 . PMID 32385269 .  
  338. ^ a b Sanggaard KW, Bechsgaard JS, Fang X, Duan J, Dyrlund TF, Gupta V, et al. (Май 2014 г.). «Геномы пауков дают представление о составе и эволюции яда и шелка» . Nature Communications . 5 : 3765. Bibcode : 2014NatCo ... 5.3765S . DOI : 10.1038 / ncomms4765 . PMC 4273655 . PMID 24801114 .  
  339. ^ Шеффер М.М., Хоппе А., Крехенвинкель Х., Уль Г., Кусс А.В., Дженсен Л. и др. (Январь 2021 г.). «Эталонный геном на уровне хромосом европейского паука-осы Argiope bruennichi: ресурс для исследований по расширению ареала и эволюционной адаптации» . GigaScience . 10 (1). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa148 . PMC 7788392 . PMID 33410470 .  
  340. ^ Санчес-Эрреро JF, Фриас-Лопес C, Эскуэр П., Инохоса-Альварес S, Арнедо М.А., Санчес-Грасиа A, Розас J (август 2019). «Проект последовательности генома паука Dysdera silvatica (Araneae, Dysderidae): ценный ресурс для функциональных и эволюционных геномных исследований хелицератов» . GigaScience . 8 (8). DOI : 10,1093 / gigascience / giz099 . PMC 6701490 . PMID 31430368 .  
  341. ^ Gulia-Nuss M, Nuss AB, Meyer JM, Sonenshine DE, Roe RM, Waterhouse RM и др. (Февраль 2016). "Геномное понимание клещевого вектора болезни Лайма Ixodes scapularis" . Nature Communications . 7 : 10507. Bibcode : 2016NatCo ... 710507G . DOI : 10.1038 / ncomms10507 . PMC 4748124 . PMID 26856261 .  
  342. ^ Цао З, Юй, Ву И, Хао П, Ди З, Хе И и др. (2013). «Геном Mesobuthus martensii раскрывает уникальную модель адаптации членистоногих» . Nature Communications . 4 : 2602. Bibcode : 2013NatCo ... 4.2602C . DOI : 10.1038 / ncomms3602 . PMC 3826648 . PMID 24129506 .  
  343. ^ Бабб П.Л., Лахенс Н.Ф., Корреа-Гарвал С.М., Николсон Д.Н., Ким Э.Дж., Хогенеш Дж. Б. и др. (Май 2017). «Геном Nephila clavipes подчеркивает разнообразие генов паучьего шелка и их сложную экспрессию». Генетика природы . 49 (6): 895–903. DOI : 10.1038 / ng.3852 . PMID 28459453 . S2CID 1221097 .  
  344. ^ Schwager EE, Sharma PP, Clarke T, Leite DJ, Wierschin T, Pechmann M, et al. (Июль 2017 г.). «Геном домашнего паука показывает древнюю дупликацию всего генома во время эволюции паукообразных» . BMC Biology . 15 (1): 62. DOI : 10,1186 / s12915-017-0399-х . PMC 5535294 . PMID 28756775 .  
  345. ^ Grbić M, Van Leeuwen T, Clark RM, Rombauts S, Rouzé P, Grbić V и др. (Ноябрь 2011 г.). «Геном Tetranychus urticae обнаруживает приспособления травоядных вредителей» . Природа . 479 (7374): 487–92. Bibcode : 2011Natur.479..487G . DOI : 10,1038 / природа10640 . PMC 4856440 . PMID 22113690 .  
  346. ↑ Dong X, Armstrong SD, Xia D, Makepeace BL, Darby AC, Kadowaki T (1 марта 2017 г.). «Проект генома эктопаразитического клеща медоносной пчелы, Tropilaelaps mercedesae , сформирован историей жизни паразита» . Gigascience . 6 (3): 1–17. DOI : 10,1093 / gigascience / gix008 . PMC 5467014 . PMID 28327890 .  
  347. ^ Чипман AD, Ferrier DE, Brena C, Qu J, Hughes DS, Schröder R и др. (Ноябрь 2014 г.). «Первая последовательность генома многоножки показывает консервативное содержание генов членистоногих и организацию генома у многоножки Strigamia maritima» . PLOS Биология . 12 (11): e1002005. DOI : 10.1371 / journal.pbio.1002005 . PMC 4244043 . PMID 25423365 .  
  348. ^ Бутби ТС, Tenlen JR, Смит FW, Ван JR, Patanella К.А., Нисимура Е. О., и др. (Декабрь 2015 г.). «Доказательства обширного горизонтального переноса генов из чернового генома тихоходки» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 112 (52): 15976–81. Bibcode : 2015PNAS..11215976B . DOI : 10.1073 / pnas.1510461112 . PMC 4702960 . PMID 26598659 .  
  349. ^ Koutsovoulos G, S Кумар, Laetsch ДР, Стивенс л, Дауб Дж, Конлона С, бордовый Н, Томас Р, Aboobaker А, Blaxter М (2015). «Геном тихоходки Hypsibius dujardini». bioRxiv 10.1101 / 033464 . 
  350. ↑ Varney RM, Speiser DI, McDougall C, Degnan BM, Kocot KM (декабрь 2020 г.). «Чувствительный к железу геном хитона Acanthopleura Granulata». Геномная биология и эволюция . evaa263. DOI : 10.1093 / GbE / evaa263 . PMID 33320175 . 
  351. ^ Го И, Чжан И, Лю Цюй, Хуанг И, Мао Г, Юэ З и др. (Октябрь 2019 г.). «Сборка генома на хромосомном уровне для гигантской африканской улитки Achatina fulica» . GigaScience . 8 (10). DOI : 10,1093 / gigascience / giz124 . PMC 6802634 . PMID 31634388 .  
  352. ^ Брежова Б., Альбертин CB, Сильва Ф, Гарднер П., Барил Т., Хейворд А. и др. (01.01.2020). «Проект последовательности генома неуловимого гигантского кальмара Architeuthis dux» . GigaScience . 9 (1). DOI : 10,1093 / gigascience / giz152 . PMC 6962438 . PMID 31942620 .  
  353. ^ Ли С, Лю X, Лю Б, Ма Б, Лю Ф, Лю G и др. (Апрель 2018). «Проект генома перуанского гребешка Argopecten purpuratus» . GigaScience . 7 (4). DOI : 10,1093 / gigascience / giy031 . PMC 5905365 . PMID 29617765 .  
  354. ^ а б Сун Дж, Чжан И, Сюй Т, Чжан И, Му Х, Чжан И и др. (Апрель 2017 г.). «Адаптация к глубоководной хемосинтетической среде, выявленная геномами мидий». Природа, экология и эволюция . 1 (5): 121. DOI : 10.1038 / s41559-017-0121 . PMID 28812709 . S2CID 26405671 .  
  355. ^ Adema CM, Hillier LW, Jones CS, Loker ES, Knight M, Minx P и др. (Май 2017). «Полногеномный анализ пресноводных улиток, передающих шистосомоз» . Nature Communications . 8 : 15451. Bibcode : 2017NatCo ... 815451A . DOI : 10.1038 / ncomms15451 . PMC 5440852 . PMID 28508897 .  
  356. ^ Li Y, Sun X, Hu X, Xun X, Zhang J, Guo X и др. (Ноябрь 2017 г.). «Геном морского гребешка показывает молекулярную адаптацию к полусидячему образу жизни и нейротоксинам» . Nature Communications . 8 (1): 1721. Bibcode : 2017NatCo ... 8.1721L . DOI : 10.1038 / s41467-017-01927-0 . PMC 5700196 . PMID 29167427 .  
  357. ^ Zhang G, Fang X, Guo X, Li L, Luo R, Xu F и др. (Октябрь 2012 г.). «Геном устрицы раскрывает стрессовую адаптацию и сложность формирования раковины». Природа . 490 (7418): 49–54. Bibcode : 2012Natur.490 ... 49Z . DOI : 10.1038 / nature11413 . ЛВП : 10722/251007 . PMID 22992520 . S2CID 52853995 .  
  358. ^ Calcino AD, Луис де Оливейра A, Симаков O, Schwaha T, Zieger E, Wollesen T и др. (Октябрь 2019 г.). «Геном квагги и эволюция толерантности к пресной воде» . Исследования ДНК . 26 (5): 411–422. DOI : 10,1093 / dnares / dsz019 . PMC 6796509 . PMID 31504356 .  
  359. ^ Belcaid М, Casaburi G, McAnulty SJ, Schmidbaur Н, Суриа А.М., Moriano-Гутьеррес С, и др. (Февраль 2019). «Симбиотические органы, сформированные различными способами эволюции генома у головоногих моллюсков» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 116 (8): 3030–3035. DOI : 10.1073 / pnas.1817322116 . PMC 6386654 . PMID 30635418 .  
  360. ^ Cai H, Li Q, Fang X, Li J, Curtis NE, Altenburger A и др. (Февраль 2019). "Проект сборки генома морского слизня Elysia chlorotica, работающего на солнечной энергии" . Научные данные . 6 : 190022. Bibcode : 2019NatSD ... 690022C . DOI : 10.1038 / sdata.2019.22 . PMC 6380222 . PMID 30778257 .  
  361. ^ Нам Б. Х., Квак В., Ким Й., Ким Д. Г., Конг Х. Дж., Ким В. Дж. И др. (Май 2017). «Последовательность генома тихоокеанского морского ушка (Haliotis Discus hannai): первый проект генома в семье Haliotidae» . GigaScience . 6 (5): 1–8. DOI : 10,1093 / gigascience / gix014 . PMC 5439488 . PMID 28327967 .  
  362. ^ Whitelaw BL, Cooke IR, Finn J, da Fonseca RR, Ritschard EA, Gilbert MT и др. (Ноябрь 2020 г.). «Эволюция адаптивного яда и его токсичность у осьминогов обусловлены обширным образованием, расширением и потерей новых генов» . GigaScience . 9 (11). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa120 . PMC 7656900 . PMID 33175168 .  
  363. ^ a b c Симаков О., Марлетаз Ф., Чо С.Дж., Эдсингер-Гонсалес Э., Хавлак П., Хеллстен У. и др. (Январь 2013). «Понимание эволюции билатерий из трех спиральных геномов» . Природа . 493 (7433): 526–31. Bibcode : 2013Natur.493..526S . DOI : 10.1038 / nature11696 . PMC 4085046 . PMID 23254933 .  
  364. ^ Uliano-Сильва М, Дондеро Ж, Дэн Отто Т, Коста - я, Лима NC, Америко JA, и др. (Февраль 2018). «Гибридно-иерархическая стратегия сборки генома для секвенирования инвазивной золотой мидии Limnoperna fortunei» . GigaScience . 7 (2). DOI : 10,1093 / gigascience / gix128 . PMC 5836269 . PMID 29267857 .  
  365. ^ Murgarella МЫ, Puiu Д, Novoa В, Фигуэрасе А, D Посада, Canchaya С (2016-03-15). «Первое понимание генома мидии-фильтратора Mytilus galloprovincialis» . PLOS ONE . 11 (3): e0151561. Bibcode : 2016PLoSO..1151561M . DOI : 10.1371 / journal.pone.0151561 . PMC 4792442 . PMID 26977809 .  
  366. ^ Альбертин CB, Симаков О., Митрос Т., Ван З.Й., Пунгор Дж. Р., Эдсингер-Гонсалес Э и др. (Август 2015 г.). «Геном осьминога и эволюция нейронных и морфологических новинок головоногих моллюсков» . Природа . 524 (7564): 220–4. Bibcode : 2015Natur.524..220A . DOI : 10,1038 / природа14668 . PMC 4795812 . PMID 26268193 .  
  367. ^ Ким Б.М., Кан С., Ан Д.Х., Юнг Ш., Ри Х., Ю Дж.С. и др. (Ноябрь 2018 г.). «Геном обыкновенного длиннорукого осьминога Octopus minor» . GigaScience . 7 (11). DOI : 10,1093 / gigascience / giy119 . PMC 6279123 . PMID 30256935 .  
  368. ^ Zarrella I, Herten K, Maes GE, Tai S, Yang M, Seuntjens E и др. (Апрель 2019 г.). «Сборка генома Octopus vulgaris с помощью обследования и справки» . Научные данные . 6 (1): 13. Bibcode : 2019NatSD ... 6 ... 13Z . DOI : 10.1038 / s41597-019-0017-6 . PMC 6472339 . PMID 30931949 .  
  369. ^ Ван С, Чжан Дж, Цзяо В, Ли Дж, Сюнь Х, Сунь Y и др. (Апрель 2017 г.). «Геном морского гребешка дает представление об эволюции кариотипа и развития двуногих животных». Природа, экология и эволюция . 1 (5): 120. DOI : 10.1038 / s41559-017-0120 . PMID 28812685 . S2CID 10331741 .  
  370. ^ Кенни NJ, Маккарти SA, Дудченко O, Джеймс K, Betteridge E, Corton C, и др. (Май 2020 г.). «Богатый геном геном гребешка Pecten maximus» . GigaScience . 9 (5). DOI : 10,1093 / gigascience / giaa037 . PMC 7191990 . PMID 32352532 .  
  371. ^ Такеучи Т., Кавасима Т., Коянаги Р., Гёджа Ф., Танака М., Икута Т. и др. (Апрель 2012 г.). «Проект генома жемчужной устрицы Pinctada fucata: платформа для понимания биологии двустворчатых моллюсков» . Исследования ДНК . 19 (2): 117–30. DOI : 10,1093 / dnares / dss005 . PMC 3325083 . PMID 22315334 .  
  372. ^ Лю Ц., Чжан И, Рен И, Ван Х, Ли С, Цзян Ф и др. (Сентябрь 2018 г.). «Геном золотой яблочной улитки Pomacea canaliculata дает представление о стрессоустойчивости и инвазивной адаптации» . GigaScience . 7 (9). DOI : 10,1093 / gigascience / giy101 . PMC 6129957 . PMID 30107526 .  
  373. ^ Мун С., Ким Й.Дж., Марккандан К., Шин В, О С, Ву Дж и др. (Июнь 2017 г.). «Полный геном и транскриптом манильского моллюска (Ruditapes philippinarum)» . Геномная биология и эволюция . 9 (6): 1487–1498. DOI : 10.1093 / GbE / evx096 . PMC 5499747 . PMID 28505302 .  
  374. ^ Пауэлл Д., Субраманиан С., Суванса-Ард С., Чжао М., О'Коннор В., Рафтос Д., Элизур А. (декабрь 2018 г.). «Геном устрицы Saccostrea дает представление об экологической устойчивости двустворчатых моллюсков» . Исследования ДНК . 25 (6): 655–665. DOI : 10,1093 / dnares / dsy032 . PMC 6289776 . PMID 30295708 .  
  375. ^ Бай CM, Xin LS, Rosani U, Wu B, Wang QC, Duan XK и др. (Июль 2019). «Сборка на хромосомном уровне кровяного моллюска Scapharca (Anadara) broughtonii с использованием длинных последовательностей чтения и Hi-C» . GigaScience . 8 (7). DOI : 10,1093 / gigascience / giz067 . PMC 6615981 . PMID 31289832 .  
  376. ^ Renaut S, D Guerra, Hoeh WR, Стюарт ДТ, Богэн А.Е., Ghiselli Ф, и др. (Июль 2018). «Обследование генома пресноводной мидии Venustaconcha ellipsiformis (Bivalvia: Unionida) с использованием метода гибридной сборки De Novo» . Геномная биология и эволюция . 10 (7): 1637–1646. DOI : 10.1093 / GbE / evy117 . PMC 6054159 . PMID 29878181 .  
  377. ^ Ван X, Чен W, Хуан Y, Sun J, Men J, Liu H и др. (Октябрь 2011 г.). «Проект генома канцерогенного печеночного двуустки человека Clonorchis sinensis» . Геномная биология . 12 (10): R107. DOI : 10.1186 / ГБ-2011-12-10-r107 . PMC 3333777 . PMID 22023798 .  
  378. ^ а б в г Цай И.Дж., Заровецки М., Холройд Н., Гарсиаррубио А., Санчес-Флорес А., Брукс К.Л. и др. (Апрель 2013). «В геномах четырех видов ленточных червей обнаружена адаптация к паразитизму» . Природа . 496 (7443): 57–63. Bibcode : 2013Natur.496 ... 57. . DOI : 10,1038 / природа12031 . PMC 3964345 . PMID 23485966 .  
  379. ^ Zheng H, Zhang W, Zhang L, Zhang Z, Li J, Lu G и др. (Октябрь 2013). «Геном гидатидного цепня Echinococcus granulosus». Генетика природы . 45 (10): 1168–75. DOI : 10.1038 / ng.2757 . PMID 24013640 . S2CID 205347630 .  
  380. ^ Young ND, Jex AR, Li B, Liu S, Yang L, Xiong Z и др. (Январь 2012 г.). «Полногеномная последовательность Schistosoma haematobium» . Генетика природы . 44 (2): 221–5. DOI : 10.1038 / ng.1065 . ЛВП : 10072/45821 . PMID 22246508 . S2CID 13309839 .  
  381. ^ a b Stroehlein AJ, Korhonen PK, Chong TM, Lim YL, Chan KG, Webster B и др. (Сентябрь 2019 г.). «Высококачественный геном Schistosoma haematobium, достигнутый с помощью одномолекулярного секвенирования с большим интервалом» . GigaScience . 8 (9). DOI : 10,1093 / gigascience / giz108 . PMC 6736295 . PMID 31494670 .  
  382. ^ В Schistosoma japonicum секвенированию генома и Консорциум Функциональный анализ (июль 2009). «Геном Schistosoma japonicum обнаруживает особенности взаимодействия паразита и хозяина» . Природа . 460 (7253): 345–51. Bibcode : 2009Natur.460..345Z . DOI : 10,1038 / природа08140 . PMC 3747554 . PMID 19606140 .  
  383. ^ Берриман М., Хаас Б.Дж., Ловерде П.Т., Уилсон Р.А., Диллон Г.П., Серкейра Г.К. и др. (Июль 2009 г.). «Геном кровяной двуустки Schistosoma mansoni» . Природа . 460 (7253): 352–8. Bibcode : 2009Natur.460..352B . DOI : 10,1038 / природа08160 . PMC 2756445 . PMID 19606141 .  
  384. ^ Протасио А.В., Цай И.Дж., Бэббидж А., Никол С., Хант М., Аслетт М.А. и др. (Январь 2012 г.). «Систематически улучшенный высококачественный геном и транскриптом кровяной двуустки человека Schistosoma mansoni» . PLOS «Забытые тропические болезни» . 6 (1): e1455. DOI : 10.1371 / journal.pntd.0001455 . PMC 3254664 . PMID 22253936 .  
  385. ^ "Проект" . Архивировано из оригинала на 2012-03-08 . Проверено 23 мая 2012 .
  386. ^ "SmedGD" .
  387. ^ Schwarz Е.М., Ху Y, Antoshechkin I, Миллер М., Штернберг PW, Aroian RV (апрель 2015). «Геном и транскриптом зоонозной анкилостомы Ancylostoma ceylanicum идентифицируют семейства генов, специфичных для инфекции» . Генетика природы . 47 (4): 416–22. DOI : 10.1038 / ng.3237 . PMC 4617383 . PMID 25730766 .  
  388. ^ Jex AR, Liu S, Li B, Young ND, зал RS, Li Y и др. (Октябрь 2011 г.). «Проект генома Ascaris suum». Природа . 479 (7374): 529–33. Bibcode : 2011Natur.479..529J . DOI : 10,1038 / природа10553 . PMID 22031327 . S2CID 205226683 .  
  389. ^ Ghedin E, Wang S, Spiro D, Caler E, Zhao Q, Crabtree J, et al. (Сентябрь 2007 г.). "Проект генома филяриального паразита нематоды Brugia malayi" . Наука . 317 (5845): 1756–60. Bibcode : 2007Sci ... 317.1756G . DOI : 10.1126 / science.1145406 . PMC 2613796 . PMID 17885136 .  
  390. ↑ Kikuchi T, Cotton JA, Dalzell JJ, Hasegawa K, Kanzaki N, McVeigh P и др. (Сентябрь 2011 г.). «Геномное понимание происхождения паразитизма у появляющегося патогена растений Bursaphelenchus xylophilus» . PLOS Патогены . 7 (9): e1002219. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1002219 . PMC 3164644 . PMID 21909270 .  
  391. ^ Мортазави А., Шварц Э.М., Уильямс Б., Шеффер Л., Антошечкин И., Уолд Б.Дж. и др. (Декабрь 2010 г.). «Создание каркаса генома нематоды Caenorhabditis с помощью RNA-seq» . Геномные исследования . 20 (12): 1740–7. DOI : 10.1101 / gr.111021.110 . PMC 2990000 . PMID 20980554 .  
  392. ^ "GSC: Caenorhabditis n. Sp. PB2801" . Архивировано из оригинального 18 августа 2007 года . Проверено 28 апреля 2007 года .
  393. ^ "Червячная база" . Проверено 4 сентября 2015 года .
  394. ^ Stein LD, Bao Z, Blasiar D, Blumenthal T, Brent MR, Chen N, et al. (Ноябрь 2003 г.). «Последовательность генома Caenorhabditis briggsae: платформа для сравнительной геномики» . PLOS Биология . 1 (2): E45. DOI : 10.1371 / journal.pbio.0000045 . PMC 261899 . PMID 14624247 .  
  395. ^ C. elegans Консорциум секвенирования. (Декабрь 1998 г.). «Последовательность генома нематоды C. elegans: платформа для изучения биологии». Наука . 282 (5396): 2012–8. Bibcode : 1998Sci ... 282.2012. . DOI : 10.1126 / science.282.5396.2012 . PMID 9851916 . 
  396. ^ "GSC: Caenorhabditis remanei" . Архивировано из оригинального 13 марта 2007 года . Проверено 28 апреля 2007 года .
  397. Перейти ↑ Haag ES, Chamberlin H, Coghlan A, Fitch DH, Peters AD, Schulenburg H (март 2007 г.). «Эволюция Caenorhabditis: если все они похожи, значит, вы недостаточно внимательно» (PDF) . Тенденции в генетике . 23 (3): 101–4. DOI : 10.1016 / j.tig.2007.01.002 . PMID 17275130 .  
  398. ^ Godel C, Kumar S, Koutsovoulos G, Ludin P, Nilsson D, Comandatore F и др. (Ноябрь 2012 г.). «Геном сердечного червя, Dirofilaria immitis, выявляет мишени для лекарств и вакцин» . Журнал FASEB . 26 (11): 4650–61. DOI : 10.1096 / fj.12-205096 . PMC 3475251 . PMID 22889830 .  
  399. ^ Коттон Дж. А., Лилли С. Дж., Джонс Л. М., Кикучи Т., Рид А. Дж., Торп П. и др. (Март 2014 г.). «Геном и специфические транскриптомы жизненного цикла Globodera pallida проливают свет на ключевые аспекты паразитизма растений цистовой нематодой» . Геномная биология . 15 (3): R43. DOI : 10.1186 / GB-2014-15-3-R43 . PMC 4054857 . PMID 24580726 .  
  400. ^ Laing R, Kikuchi T, Martinelli A, Tsai IJ, Beech RN, Redman E, et al. (Август 2013). «Геном и транскриптом Haemonchus contortus, ключевой модели паразита для открытия лекарств и вакцин» . Геномная биология . 14 (8): R88. DOI : 10.1186 / GB-2013-14-8-R88 . PMC 4054779 . PMID 23985316 .  
  401. ^ Masonbrink R, TR Майер, Muppirala U, Seetharam А.С., Лорд Е, Juvale П.С. и др. (9 февраля 2019 г.). «Геном нематоды соевых бобов ( Heterodera glycines ) обнаруживает сложные модели дупликаций, участвующих в эволюции генов паразитизма» . BMC Genomics . 20 (1): 119. DOI : 10,1186 / s12864-019-5485-8 . PMC 6367775 . PMID 30732586 .  
  402. ^ Бай X, Адамс Б.Дж., Циче Т.А., Клифтон С., Гоглер Р., Ким К.С. и др. (18 июля 2013 г.). «Любовник и боец: последовательность генома энтомопатогенной нематоды Heterorhabditis bacteriophora» . PLOS ONE . 8 (7): e69618. Bibcode : 2013PLoSO ... 869618B . DOI : 10.1371 / journal.pone.0069618 . PMC 3715494 . PMID 23874975 .  
  403. ^ Desjardins CA, Cerqueira GC, Goldberg JM, Dunning Hotopp JC, Haas BJ, Zucker J, et al. (Май 2013). «Геномика лоа-лоа, филяриального паразита человека без Wolbachia» . Генетика природы . 45 (5): 495–500. DOI : 10.1038 / ng.2585 . PMC 4238225 . PMID 23525074 .  
  404. ^ Opperman CH, Bird DM, Williamson VM, Rokhsar DS, Burke M, Cohn J и др. (Сентябрь 2008 г.). «Последовательность и генетическая карта Meloidogyne hapla: компактный геном нематод для паразитизма растений» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 105 (39): 14802–7. Bibcode : 2008PNAS..10514802O . DOI : 10.1073 / pnas.0805946105 . PMC 2547418 . PMID 18809916 .  
  405. ^ Абад Р, Gouzy Дж, AURY Ю.М., Castagnone-Серен Р, Даншен Е.Г., Deleury Е, и др. (Август 2008 г.). «Последовательность генома многоклеточного растения-паразита нематоды Meloidogyne incognita». Природа Биотехнологии . 26 (8): 909–15. DOI : 10.1038 / nbt.1482 . PMID 18660804 . S2CID 8836601 .  
  406. ^ Тан Ю.Т., Гао X, Роза Б.А., Абубакер С., Холлсворт-Пепин К., Мартин Дж. И др. (Март 2014 г.). «Геном анкилостомы человека Necator americanus» . Генетика природы . 46 (3): 261–269. DOI : 10.1038 / ng.2875 . PMC 3978129 . PMID 24441737 .  
  407. ^ a b «База данных филяриальных червей» . 2015-06-04 . Дата обращения 5 июня 2015 .
  408. ^ Дитерих C, Клифтон SW, Шустер Л.Н., Чинвалла А, Делеханти К., Динкелакер I и др. (Октябрь 2008 г.). «Геном Pristionchus pacificus дает уникальную возможность взглянуть на образ жизни и паразитизм нематод» . Генетика природы . 40 (10): 1193–8. DOI : 10.1038 / ng.227 . PMC 3816844 . PMID 18806794 .  
  409. ^ Schiffer PH, Kroiher M, Kraus C, Koutsovoulos GD, Kumar S, Camps JI, et al. (Декабрь 2013). «Геном Romanomermis culicivorax: выявление фундаментальных изменений в основных генетических инструментах развития нематод» . BMC Genomics . 14 (1): 923. DOI : 10.1186 / 1471-2164-14-923 . PMC 3890508 . PMID 24373391 .  
  410. ^ Jex AR, Nejsum P, Schwarz EM, Hu L, Young ND, Hall RS и др. (Июль 2014 г.). «Геном и транскриптом свиного власоглава Trichuris suis» . Генетика природы . 46 (7): 701–6. DOI : 10.1038 / ng.3012 . PMC 4105696 . PMID 24929829 .  
  411. ^ а б Фот Б.Дж., Цай И.Дж., Рид А.Дж., Бэнкрофт А.Дж., Никол С, Трейси А. и др. (Июль 2014 г.). «Анализ генома власоглавов и транскриптома двух видов дает молекулярное понимание тесного взаимодействия паразита и хозяина» . Генетика природы . 46 (7): 693–700. DOI : 10.1038 / ng.3010 . PMC 5012510 . PMID 24929830 .  
  412. ^ "JGI: Capitella teleta" .
  413. ^ "JGI: Helobdella robusta" .
  414. ^ "WhitneyLab: Eisenia fetida" .
  415. ^ Zwarycz AS, Нос CW, Putnam NH, Райан JF (декабрь 2015). «Сроки и объем геномного расширения в пределах Annelida: данные из гомеобоксов в геноме дождевого червя Eisenia fetida» . Геномная биология и эволюция . 8 (1): 271–81. DOI : 10.1093 / GbE / evv243 . PMC 4758240 . PMID 26659921 .  
  416. ^ Райко М., Комиссаров А., Лим-Фонг Г., Родос А.С., Кван Дж. К., Кливер С., Чеснокова П., О'Брайен С. Дж., Лопес СП (сентябрь 2020 г.). «Проект генома мшанки Bugula neritina - колониального животного, обладающего мощными симбионтами и потенциальными лекарствами» . Научные данные . 7 (1): 356. DOI : 10.1038 / s41597-020-00684-у . PMC 7576161 . PMID 33082320 .  
  417. ^ Луо Й.Дж., Такеучи Т., Коянаги Р., Ямада Л., Канда М., Халтурина М. и др. (Сентябрь 2015 г.). «Геном Lingula дает представление об эволюции брахиопод и происхождении фосфатной биоминерализации» . Nature Communications . 6 : 8301. Bibcode : 2015NatCo ... 6.8301L . DOI : 10.1038 / ncomms9301 . PMC 4595640 . PMID 26383154 .  
  418. ^ Flot JF, Hespeels B, Li X, Noel B, Архипова I, Даншен Е.Г. и др. (Август 2013). «Геномные доказательства амейотической эволюции бделлоидной коловратки Adineta vaga». Природа . 500 (7463): 453–7. Bibcode : 2013Natur.500..453F . DOI : 10,1038 / природа12326 . PMID 23873043 . S2CID 1706158 .