Список методов омики с одной ячейкой
Из Википедии, свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Опубликован список из более чем 100 различных методов секвенирования отдельных клеток (омикс). [1] Подавляющее большинство методов сочетаются с технологиями секвенирования с коротким чтением, хотя некоторые из них совместимы с секвенированием с длинным чтением.

Список

МетодСсылкаРежим секвенированияРанняя оценкаПоздняя оценка
Тан метод[2]Короткие чтения2008 г.2009 г.
CyTOF[3]Короткие чтения2011 г.2012 г.
STRT-seq / C1[4]Короткие чтения2011 г.2012 г.
SMART-seq[5]Короткие чтения2012 г.2013
CEL-seq[6]Короткие чтения2012 г.2013
Кварц-Seq[7]Короткие чтения2012 г.2013
PMA / SMA[8]Короткие чтения2012 г.2013
scBS-seq[9]Короткие чтения20132014 г.
AbPair[10]Короткие чтения2014 г.2014 г.
MARS-seq[11]Короткие чтения2014 г.2015 г.
DR-seq[12]Короткие чтения2014 г.2015 г.
G & T-Seq[13]Короткие чтения2014 г.2015 г.
SCTG[14]Короткие чтения2014 г.2015 г.
SIDR-seq[15]Короткие чтения2014 г.2015 г.
sci-ATAC-seq[16]Короткие чтения2014 г.2015 г.
Hi-SCL[17]Короткие чтения2015 г.2015 г.
SUPeR-seq[18]Короткие чтения2015 г.2015 г.
Drop-Chip[19]Короткие чтения2015 г.2015 г.
CytoSeq[20]Короткие чтения2015 г.2016 г.
inDrop[21]Короткие чтения2015 г.2016 г.
sc-GEM[22]Короткие чтения2015 г.2016 г.
scTrio-seq[23]Короткие чтения2015 г.2016 г.
scM и T-seq[24]Короткие чтения2015 г.2016 г.
ИГРАТЬ[25]Короткие чтения2015 г.2016 г.
Genshaft-et-al-2016[26]Короткие чтения2015 г.2016 г.
Darmanis-et-al-2016[27]Короткие чтения2015 г.2016 г.
CRISP-seq[28]Короткие чтения2015 г.2016 г.
scGESTALT[29]Короткие чтения2015 г.2016 г.
CEL-Seq2 / C1[30]Короткие чтения2015 г.2016 г.
STRT-seq-2i[31]Короткие чтения2016 г.2017 г.
RNAseq @ 10xgenomics[32]Короткие чтения2016 г.2017 г.
RNAseq / Экспрессия генов @ nanostringtech[33]Короткие чтения2016 г.2017 г.
sc Таргетированная экспрессия гена @ fluidigm[34]Короткие чтения2016 г.2017 г.
scTCR Wafergen[35]Короткие чтения2016 г.2017 г.
CROP-seq[36]Короткие чтения2016 г.2017 г.
SiC-seq[37]Короткие чтения2016 г.2017 г.
mcSCRB-seq[38]Короткие чтения2016 г.2017 г.
Патч-последовательность[39]Короткие чтения2016 г.2017 г.
Geo-seq[40]Короткие чтения2016 г.2017 г.
scNOMe-seq[41]Короткие чтения2016 г.2017 г.
scCOOL-seq[42]Короткие чтения2016 г.2017 г.
ВЫРЕЗАТЬ И Беги[43]Короткие чтения2016 г.2017 г.
MATQ-seq[44]Короткие чтения2016 г.2017 г.
Кварц-Seq2[45]Короткие чтения2017 г.2018 г.
Seq-Well[46]Короткие чтения2017 г.2018 г.
DroNC-Seq[47]Короткие чтения2017 г.2018 г.
sci-RNA-seq[48]Короткие чтения2017 г.2018 г.
scATAC @ 10xgenomics[49]Короткие чтения2017 г.2018 г.
scVDJ @ 10xgenomics[50]Короткие чтения2017 г.2018 г.
scNMT тройной омикс[51]Короткие чтения2017 г.2018 г.
SPLIT-seq Parse Biosciences[52]Короткие чтения2017 г.2018 г.
CITE-Seq[53]Короткие чтения2017 г.2018 г.
scMNase-seq[54]Короткие чтения2017 г.2018 г.
Chaligne-et-al-2018[55]Короткие чтения2017 г.2018 г.
Линней[56]Короткие чтения2017 г.2018 г.
TracerSeq[57]Короткие чтения2017 г.2018 г.
CellTag[58]Короткие чтения2017 г.2018 г.
ScarTrace[59]Короткие чтения2017 г.2018 г.
scRNA-Seq Dolomite Bio[60]Короткие чтения2017 г.2018 г.
Зацикливание[61]Короткие чтения2017 г.2018 г.
Perturb-ATAC[62]Короткие чтения2018 г.2019 г.
скМетилирование[63]Короткие чтения2018 г.2019 г.
наука[64]Короткие чтения2018 г.2019 г.
Мультиплексная капля scRNAseq[65]Короткие чтения2018 г.2019 г.
научно-автомобильный[66]Короткие чтения2018 г.2019 г.
C1 CAGE одноклеточный[67]Короткие чтения2018 г.2019 г.
sc парная микроРНК-мРНК[68]Короткие чтения2018 г.2019 г.
scCAT-seq[69]Короткие чтения2018 г.2019 г.
REAP-seq @fluidigm[70]Короткие чтения2018 г.2019 г.
scCC[71]Короткие чтения2018 г.2019 г.
yscRNA-SEQ[72]Короткие чтения2018 г.2019 г.
TARGET-seq[73]Короткие чтения2018 г.2019 г.
MULTI-seq[74]Короткие чтения2018 г.2019 г.
snRNA-seq[75]Короткие чтения2018 г.2019 г.
sci-RNA-seq3[76]Короткие чтения2018 г.2019 г.
BRIF-seq[77]Короткие чтения2018 г.2019 г.
Drop-seq Доломит Био[60]Короткие чтения2018 г.2019 г.
Слайд-последовательность[78]Короткие чтения2018 г.2019 г.
ВЫРЕЗАТЬ и пометить[79]Короткие чтения2018 г.2019 г.
CellTagging[80]Короткие чтения2018 г.2019 г.
DART-Seq[81]Короткие чтения2018 г.2019 г.
scDamID & T[82]Короткие чтения2018 г.2019 г.
ACT-seq[83]Короткие чтения2018 г.2019 г.
Научно-Hi-C[84]Короткие чтения2018 г.2019 г.
Слайд-последовательность[85]Короткие чтения2018 г.2019 г.
Упрощенный-Drop-seq[86]Короткие чтения2018 г.2019 г.
scChIC-seq[87]Короткие чтения2018 г.2019 г.
Dip-C[88]Короткие чтения2018 г.2019 г.
CoBATCH[89]Короткие чтения2018 г.2019 г.
Convert-seq[90]Короткие чтения2018 г.2019 г.
ScATAC-seq на основе капель[91]Короткие чтения2018 г.2019 г.
ECCITE-seq[92]Короткие чтения2018 г.2019 г.
dsciATAC-seq[91]Короткие чтения2018 г.2019 г.
CLEVER-seq[93]Короткие чтения2018 г.2019 г.
scISOr-Seq[94]Короткие чтения2018 г.2019 г.
MARS-seq2.0[95]Короткие чтения2018 г.2019 г.
нано-НОМе[96]Длинные чтения2018 г.2019 г.
MeSMLR-seq[97]Длинные чтения2018 г.2019 г.
SMAC-seq[98]Длинные чтения2018 г.2019 г.
MoonTag / SunTag[99]Короткие чтения2018 г.2019 г.
SCoPE2[100]Короткие чтения2018 г.2019 г.
научная судьба[101]Короткие чтения2018 г.2019 г.
µDamID[102]Короткие чтения2018 г.2019 г.
Метил-HiC[103]Короткие чтения2018 г.2019 г.
RAGE-seq[104]Длинные чтения2018 г.2019 г.
Парный-Seq[105]Короткие чтения2018 г.2019 г.
Tn5Prime[106]Короткие чтения2018 г.2019 г.
NanoPARE[107]Короткие чтения2018 г.2019 г.
BART-Seq[108]Короткие чтения2018 г.2019 г.
scDam и T-seq[109]Короткие чтения2018 г.2019 г.
itChIP-seq[110]Короткие чтения2018 г.2019 г.
SNARE-seq[111]Короткие чтения2018 г.2019 г.
ASTAR-seq[112]Короткие чтения2018 г.2019 г.
sci-Plex[113]Короткие чтения2018 г.2019 г.
MIX-Seq[114]Короткие чтения2018 г.2019 г.
microSPLiT[115]Короткие чтения2018 г.2019 г.
PAIso-seq[116]Короткие чтения2018 г.2019 г.
FIN-Seq[117]Короткие чтения2018 г.2019 г.
LIBRA-seq[118]Короткие чтения2018 г.2019 г.
scifi-RNA-seq[119]Короткие чтения2018 г.2019 г.

использованная литература

  1. ^ "Single-Cell-Omics.v2.3.13 @albertvilella" . Документы Google . Проверено 1 января 2020 .
  2. ^ Тан Ф, Барбачору С, Ван И, Нордман Э, Ли С, Сюй Н и др. (Май 2009 г.). «Анализ целого транскриптома мРНК-Seq отдельной клетки». Методы природы . 6 (5): 377–82. DOI : 10,1038 / Nmeth.1315 . PMID 19349980 . S2CID 16570747 .  
  3. ^ "Fluidigm | Single-Cell Advances" . www.fluidigm.com .
  4. Перейти ↑ Hashimshony T, Wagner F, Sher N, Yanai I (сентябрь 2012 г.). «CEL-Seq: одноклеточная РНК-Seq путем мультиплексной линейной амплификации» . Отчеты по ячейкам . 2 (3): 666–73. DOI : 10.1016 / j.celrep.2012.08.003 . PMID 22939981 . 
  5. ^ Ислам S, Zeisel A, Joost S, La Manno G, Zajac P, Kasper M и др. (Февраль 2014 года). «Количественный анализ одноклеточной РНК-последовательности с уникальными молекулярными идентификаторами». Методы природы . 11 (2): 163–6. DOI : 10,1038 / Nmeth.2772 . PMID 24363023 . S2CID 6765530 .  
  6. ↑ Jaitin DA, Kenigsberg E, Keren-Shaul H, Elefant N, Paul F, Zaretsky I, et al. (Февраль 2014 года). «Массивно-параллельная одноклеточная последовательность РНК для безмаркерного разложения тканей на типы клеток» . Наука . 343 (6172): 776–9. Bibcode : 2014Sci ... 343..776J . DOI : 10.1126 / science.1247651 . PMC 4412462 . PMID 24531970 .  
  7. ↑ Sasagawa Y, Nikaido I, Hayashi T, Danno H, Uno KD, Imai T, Ueda HR (апрель 2013 г.). «Quartz-Seq: высоко воспроизводимый и чувствительный метод секвенирования одноклеточной РНК, выявляющий негенетическую гетерогенность экспрессии генов» . Геномная биология . 14 (4): R31. DOI : 10.1186 / ГБ- 2013-14-4 -r31 . PMC 4054835 . PMID 23594475 .  
  8. ↑ Pan X, Durrett RE, Zhu H, Tanaka Y, Li Y, Zi X и др. (Январь 2013). «Два метода секвенирования полноразмерной РНК для небольшого количества клеток и отдельных клеток» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 110 (2): 594–9. Bibcode : 2013PNAS..110..594P . DOI : 10.1073 / pnas.1217322109 . PMC 3545756 . PMID 23267071 .  
  9. ^ Смоллвуд С.А., Ли Х.Дж., Ангермюллер С, Крюгер Ф., Сааде Х., Пит Дж. И др. (Август 2014 г.). «Одноклеточное бисульфитное секвенирование всего генома для оценки эпигенетической гетерогенности» . Методы природы . 11 (8): 817–820. DOI : 10,1038 / Nmeth.3035 . PMC 4117646 . PMID 25042786 .  
  10. ^ Briggs AW, Goldfless SJ, Timberlake S, Belmont BJ, Clouser CR, Koppstein D, et al. (5 мая 2017 г.). «Проникающие в опухоль иммунные репертуары, захваченные одноклеточным штрих-кодированием в эмульсии» . bioRxiv : 134841. DOI : 10.1101 / 134841 .
  11. Перейти ↑ Picelli S, Björklund ÅK, Faridani OR, Sagasser S, Winberg G, Sandberg R (ноябрь 2013 г.). «Smart-seq2 для чувствительного профилирования полноразмерных транскриптомов в отдельных клетках». Методы природы . 10 (11): 1096–8. DOI : 10,1038 / Nmeth.2639 . PMID 24056875 . S2CID 6356570 .  
  12. Перейти ↑ Dey SS, Kester L, Spanjaard B, Bienko M, van Oudenaarden A (март 2015 г.). «Интегрированное секвенирование генома и транскриптома одной и той же клетки» . Природа Биотехнологии . 33 (3): 285–289. DOI : 10,1038 / НБТ.3129 . PMC 4374170 . PMID 25599178 .  
  13. ↑ Macaulay IC, Haerty W, Kumar P, Li YI, Hu TX, Teng MJ и др. (Июнь 2015 г.). «G & T-seq: параллельное секвенирование одноклеточных геномов и транскриптомов» . Методы природы . 12 (6): 519–22. DOI : 10,1038 / Nmeth.3370 . PMID 25915121 . S2CID 969246 .  
  14. Перейти ↑ Li W, Calder RB, Mar JC, Vijg J (февраль 2015 г.). «Одноклеточная транскриптогеномика выявляет транскрипционное исключение ENU-мутированных аллелей» . Мутационные исследования . 772 : 55–62. DOI : 10.1016 / j.mrfmmm.2015.01.002 . PMC 4342853 . PMID 25733965 .  
  15. ^ Хан KY, Ким KT, Joung JG, Son DS, Ким YJ, Jo A и др. (Январь 2018). «SIDR: одновременное выделение и параллельное секвенирование геномной ДНК и общей РНК из отдельных клеток» . Геномные исследования . 28 (1): 75–87. DOI : 10.1101 / gr.223263.117 . PMC 5749184 . PMID 29208629 .  
  16. ↑ Cusanovich DA, Daza R, Adey A, Pliner HA, Christiansen L, Gunderson KL и др. (Май 2015 г.). «Мультиплексное профилирование отдельных клеток доступности хроматина с помощью комбинаторной клеточной индексации» . Наука . 348 (6237): 910–4. Bibcode : 2015Sci ... 348..910C . DOI : 10.1126 / science.aab1601 . PMC 4836442 . PMID 25953818 .  
  17. ^ Ротем А, Рам О, Шореш Н., Сперлинг Р.А., Шналл-Левин М., Чжан Х. и др. (1 января 2015 г.). «Высокопроизводительное мечение одиночных клеток (Hi-SCL) для RNA-Seq с использованием капельной микрофлюидики» . PLOS ONE . 10 (5): e0116328. Bibcode : 2015PLoSO..1016328R . DOI : 10.1371 / journal.pone.0116328 . PMC 4441486 . PMID 26000628 .  
  18. ↑ Fan X, Zhang X, Wu X, Guo H, Hu Y, Tang F, Huang Y (июль 2015 г.). "Одноклеточный анализ транскриптома РНК-seq линейных и кольцевых РНК в мышиных доимплантационных эмбрионах" . Геномная биология . 16 (1): 148. DOI : 10.1186 / s13059-015-0706-1 . PMC 4511241 . PMID 26201400 .  
  19. ^ "Drop-Chip" . pubs.broadinstitute.org .
  20. ↑ Fan HC, Fu GK, Fodor SP (февраль 2015 г.). «Профилирование экспрессии. Комбинаторное маркирование отдельных клеток для цитометрии экспрессии генов». Наука . 347 (6222): 1258367. DOI : 10.1126 / science.1258367 . PMID 25657253 . S2CID 5493175 .  
  21. ^ Кляйн AM, Mazutis L, Akartuna I, Tallapragada N, Veres A, Li V и др. (Май 2015 г.). «Штрих-кодирование капель для транскриптомики одиночных клеток, применяемое к эмбриональным стволовым клеткам» . Cell . 161 (5): 1187–1201. DOI : 10.1016 / j.cell.2015.04.044 . PMC 4441768 . PMID 26000487 .  
  22. ↑ Cheow LF, Courtois ET, Tan Y, Viswanathan R, Xing Q, Tan RZ и др. (Октябрь 2016 г.). «Одноклеточное мультимодальное профилирование выявляет клеточную эпигенетическую гетерогенность». Методы природы . 13 (10): 833–6. DOI : 10,1038 / Nmeth.3961 . PMID 27525975 . S2CID 3531201 .  
  23. ^ Hou Y, Guo H, Cao C, Li X, Hu B, Zhu P и др. (Март 2016 г.). «Трехкомпонентное секвенирование одной клетки выявляет генетическую, эпигенетическую и транскриптомную гетерогенность гепатоцеллюлярных карцином» . Клеточные исследования . 26 (3): 304–19. DOI : 10.1038 / cr.2016.23 . PMC 4783472 . PMID 26902283 .  
  24. ↑ Angermueller C, Clark SJ, Lee HJ, Macaulay IC, Teng MJ, Hu TX и др. (Март 2016 г.). «Параллельное одноклеточное секвенирование связывает транскрипционную и эпигенетическую гетерогенность» . Методы природы . 13 (3): 229–232. DOI : 10,1038 / Nmeth.3728 . PMC 4770512 . PMID 26752769 .  
  25. ↑ Frei AP, Bava FA, Zunder ER, Hsieh EW, Chen SY, Nolan GP, ​​Gherardini PF (март 2016). «Высоко мультиплексное одновременное обнаружение РНК и белков в отдельных клетках» . Методы природы . 13 (3): 269–75. DOI : 10,1038 / Nmeth.3742 . PMC 4767631 . PMID 26808670 .  
  26. ^ Genshaft AS, Li S, Gallant CJ, Darmanis S, Prakadan SM, Ziegler CG и др. (Сентябрь 2016 г.). «Мультиплексное целевое профилирование одноклеточных протеомов и транскриптомов в одной реакции» . Геномная биология . 17 (1): 188. DOI : 10.1186 / s13059-016-1045-6 . PMC 5027636 . PMID 27640647 .  
  27. ^ Дарманис С., Слоан С.А., Кроот Д., Миньярди М., Черникова С., Самгабаби П. и др. (Октябрь 2017 г.). «Анализ одноклеточной РНК-Seq инфильтрации неопластических клеток на мигрирующем фронте глиобластомы человека» . Отчеты по ячейкам . 21 (5): 1399–1410. DOI : 10.1016 / j.celrep.2017.10.030 . PMC 5810554 . PMID 29091775 .  
  28. ^ Jaitin DA, Weiner A, Yofe I, Lara-Astiaso D, Keren-Shaul H, David E, et al. (Декабрь 2016 г.). «Рассечение иммунных цепей путем связывания CRISPR-Pooled Screens с одноклеточной RNA-Seq» . Cell . 167 (7): 1883–1896.e15. DOI : 10.1016 / j.cell.2016.11.039 . PMID 27984734 . 
  29. ↑ Raj B, Wagner DE, McKenna A, Pandey S, Klein AM, Shendure J и др. (Июнь 2018). «Одновременное одноклеточное профилирование клонов и типов клеток в головном мозге позвоночных» . Природа Биотехнологии . 36 (5): 442–450. DOI : 10,1038 / НБТ.4103 . PMC 5938111 . PMID 29608178 .  
  30. ↑ Hashimshony T, Senderovich N, Avital G, Klochendler A, de Leeuw Y, Anavy L и др. (Апрель 2016 г.). «CEL-Seq2: высокочувствительная одноклеточная РНК-Seq с высокой степенью мультиплексирования» . Геномная биология . 17 (1): 77. DOI : 10.1186 / s13059-016-0938-8 . PMC 4848782 . PMID 27121950 .  
  31. ^ Hochgerner H, Lönnerberg P, Hodge R, Mikes J, Heskol A, Hubschle H и др. (Ноябрь 2017 г.). «STRT-seq-2i: двойной индекс 5 'одиночной клеточной и ядерной РНК-seq на адресном массиве микролунок» . Научные отчеты . 7 (1): 16327. Bibcode : 2017NatSR ... 716327H . DOI : 10.1038 / s41598-017-16546-4 . PMC 5703850 . PMID 29180631 .  
  32. ^ "Single Cell RNA-Seq" . 10x Genomic.
  33. ^ «Технология nCounter®» . Технологии NanoString.
  34. ^ "Fluidigm | Расходные материалы | Экспрессия гена, нацеленного на одну клетку" . www.fluidigm.com .
  35. ^ Inc, WaferGen Bio-systems. «WaferGen представляет результаты секвенирования одноклеточного Т-клеточного рецептора с использованием одноклеточной системы ICELL8 ™ на совещании по одноклеточной геномике в 2016 г.» . www.prnewswire.com .
  36. ^ Датлингер П., Рендейро А.Ф., Шмидл С., Краусгрубер Т., Тракслер П., Клугаммер Дж. И др. (Март 2017 г.). «Объединенный CRISPR-скрининг со считыванием одноклеточного транскриптома» . Методы природы . 14 (3): 297–301. DOI : 10,1038 / Nmeth.4177 . PMC 5334791 . PMID 28099430 .  
  37. ↑ Lan F, Demaree B, Ahmed N, Abate AR (июль 2017 г.). «Секвенирование одноклеточного генома на сверхвысокой производительности с микрофлюидным штрих-кодированием капель» . Природа Биотехнологии . 35 (7): 640–646. DOI : 10,1038 / НБТ.3880 . PMC 5531050 . PMID 28553940 .  
  38. ↑ Bagnoli JW, Ziegenhain C, Janjic A, Wange LE, Viet B, Parekh S и др. (18 октября 2017 г.). «mcSCRB-seq: чувствительное и мощное секвенирование одноклеточной РНК» . bioRxiv : 188367. DOI : 10.1101 / 188367 .
  39. ↑ Cadwell CR, Sandberg R, Jiang X, Tolias AS (июль 2017 г.). «Вопросы и ответы: использование Patch-seq для профилирования отдельных ячеек» . BMC Biology . 15 (1): 58. DOI : 10.1186 / s12915-017-0396-0 . PMC 5499043 . PMID 28679385 .  
  40. ↑ Chen J, Suo S, Tam PP, Han JJ, Peng G, Jing N (март 2017). «Пространственный транскриптомный анализ криосрезов образцов ткани с помощью Geo-seq». Протоколы природы . 12 (3): 566–580. DOI : 10.1038 / nprot.2017.003 . PMID 28207000 . 
  41. ↑ Pott S (июнь 2017 г.). Рен Б. (ред.). «Одновременное измерение доступности хроматина, метилирования ДНК и фазирования нуклеосом в отдельных клетках» . eLife . 6 : e23203. DOI : 10.7554 / eLife.23203 . PMC 5487215 . PMID 28653622 .  
  42. ↑ Guo F, Li L, Li J, Wu X, Hu B, Zhu P и др. (Август 2017 г.). «Одноклеточное мультиомное секвенирование ранних эмбрионов мыши и эмбриональных стволовых клеток» . Клеточные исследования . 27 (8): 967–988. DOI : 10.1038 / cr.2017.82 . PMC 5539349 . PMID 28621329 .  
  43. Перейти ↑ Skene PJ, Henikoff S (январь 2017 г.). Рейнберг Д. (ред.). «Эффективная направленная нуклеазная стратегия для картирования сайтов связывания ДНК с высоким разрешением» . eLife . 6 : e21856. DOI : 10.7554 / eLife.21856 . PMC 5310842 . PMID 28079019 .  
  44. ↑ Sheng K, Cao W, Niu Y, Deng Q, Zong C (март 2017). «Эффективное обнаружение вариаций в одноклеточных транскриптомах с использованием MATQ-seq». Методы природы . 14 (3): 267–270. DOI : 10,1038 / Nmeth.4145 . PMID 28092691 . S2CID 582788 .  
  45. ^ Сасагава Y, Данно Х, Такада Х, Эбисава М, Танака К., Хаяси Т. и др. (Март 2018 г.). «Quartz-Seq2: высокопроизводительный метод секвенирования РНК одной клетки, который эффективно использует считывание ограниченной последовательности» . Геномная биология . 19 (1): 29. DOI : 10.1186 / s13059-018-1407-3 . PMC 5845169 . PMID 29523163 .  
  46. ^ Gierahn TM, Wadsworth MH, Hughes TK, Bryson BD, Butler A, Satija R и др. (Апрель 2017 г.). «Seq-Well: портативное дешевое секвенирование РНК отдельных клеток с высокой пропускной способностью» . Методы природы . 14 (4): 395–398. DOI : 10,1038 / Nmeth.4179 . HDL : 1721,1 / 113430 . PMC 5376227 . PMID 28192419 .  
  47. ↑ Хабиб Н., Авраам-Давиди I, Басу А., Беркс Т., Шекхар К., Хофри М. и др. (Октябрь 2017 г.). «Массивно-параллельная одноядерная последовательность РНК с DroNc-seq» . Методы природы . 14 (10): 955–958. DOI : 10,1038 / Nmeth.4407 . PMC 5623139 . PMID 28846088 .  
  48. ^ Цао Дж., Пакер Дж. С., Рамани В., Кусанович Д. А., Хюинь С., Даза Р. и др. (Август 2017 г.). «Комплексное одноклеточное транскрипционное профилирование многоклеточного организма» . Наука . 357 (6352): 661–667. Bibcode : 2017Sci ... 357..661C . DOI : 10.1126 / science.aam8940 . PMC 5894354 . PMID 28818938 .  
  49. ^ https://www.10xgenomics.com/solutions/single-cell-atac/ [ пустой URL ]
  50. ^ https://www.10xgenomics.com/solutions/vdj/ [ пустой URL ]
  51. ^ Argelaguet R, Мохаммед H, Кларк SJ, Stapel LC, Krueger C, Kapourani C и др. (13 января 2019 г.). «Многокомпонентное профилирование отдельных клеток выявляет иерархический эпигенетический ландшафт во время спецификации зародышевого листка млекопитающих» . bioRxiv : 519207. DOI : 10.1101 / 519207 .
  52. ↑ Розенберг А.Б., Роко С.М., Маскат Р.А., Кучина А., Образец P, Яо З. и др. (Апрель 2018 г.). «Одноклеточное профилирование развивающегося головного и спинного мозга мышей со штрих-кодированием разделенного пула» . Наука . 360 (6385): 176–182. Bibcode : 2018Sci ... 360..176R . DOI : 10.1126 / science.aam8999 . PMC 7643870 . PMID 29545511 .  
  53. ↑ Stoeckius M, Hafemeister C, Stephenson W, Houck-Loomis B, Chattopadhyay PK, Swerdlow H и др. (Сентябрь 2017 г.). «Одновременное измерение эпитопа и транскриптома в отдельных клетках» . Методы природы . 14 (9): 865–868. DOI : 10,1038 / Nmeth.4380 . PMC 5669064 . PMID 28759029 .  
  54. ^ Лай Б., Гао В., Цуй К., Се В., Тан Кью, Джин В. и др. (Октябрь 2018 г.). «Принципы организации нуклеосом, выявленные с помощью секвенирования одноклеточной микрококковой нуклеазы» . Природа . 562 (7726): 281–285. Bibcode : 2018Natur.562..281L . DOI : 10.1038 / s41586-018-0567-3 . PMC 8353605 . PMID 30258225 . S2CID 52841785 .   
  55. ^ Нам А.С., Ким К., Шалин Р., Иззо Ф., Анг С., Абу-Зейна Г. и др. (16 октября 2018 г.). «Высокопроизводительное капельное генотипирование транскриптомов (GoT) выявляет зависимость идентичности клеток от воздействия соматических мутаций» . bioRxiv : 444687. DOI : 10.1101 / 444687 .
  56. ↑ Spanjaard B, Hu B, Mitic N, Olivares-Chauvet P, Janjuha S, Ninov N, Junker JP (июнь 2018). «Одновременное отслеживание происхождения и идентификация клеточного типа с использованием генетических рубцов, индуцированных CRISPR-Cas9» . Природа Биотехнологии . 36 (5): 469–473. DOI : 10,1038 / НБТ 4124 . PMC 5942543 . PMID 29644996 .  
  57. ↑ Wagner DE, Weinreb C, Collins ZM, Briggs JA, Megason SG, Klein AM (июнь 2018 г.). «Одноклеточное картирование ландшафтов экспрессии генов и клонов в эмбрионе рыбок данио» . Наука . 360 (6392): 981–987. Bibcode : 2018Sci ... 360..981W . DOI : 10.1126 / science.aar4362 . PMC 6083445 . PMID 29700229 .  
  58. ↑ Guo C, Kong W, Kamimoto K, Rivera-Gonzalez GC, Yang X, Kirita Y, Morris SA (май 2019). «Индексирование CellTag: мультиплексирование образцов на основе генетических штрих-кодов для геномики единичных клеток» . Геномная биология . 20 (1): 90. DOI : 10.1186 / s13059-019-1699- у . PMC 6509836 . PMID 31072405 .  
  59. ↑ Alemany A, Florescu M, Baron CS, Peterson-Maduro J, van Oudenaarden A (апрель 2018 г.). «Отслеживание клонов всего организма с использованием секвенирования одной клетки». Природа . 556 (7699): 108–112. Bibcode : 2018Natur.556..108A . DOI : 10,1038 / природа25969 . PMID 29590089 . S2CID 4633026 .  
  60. ^ a b "Надя Инструмент" . Dolomite Bio .
  61. ^ Лай Б, Тан Q, Джин В, Ху Г, Ванса Д., Цуй К. и др. (Сентябрь 2018 г.). «Trac-looping измеряет структуру генома и доступность хроматина» . Методы природы . 15 (9): 741–747. DOI : 10.1038 / s41592-018-0107- у . PMC 7212307 . PMID 30150754 .  
  62. ^ Рубин AJ, Паркер KR, Satpathy AT, Qi Y, Wu B, Ong AJ и др. (Январь 2019). «Комбинированный CRISPR-скрининг одиночных клеток и эпигеномное профилирование выявляют регуляторные сети причинных генов» . Cell . 176 (1–2): 361–376.e17. DOI : 10.1016 / j.cell.2018.11.022 . PMC 6329648 . PMID 30580963 .  
  63. ^ Karemaker ID, Vermeulen M (сентябрь 2018 г.). «Профилирование метилирования одноклеточной ДНК: технологии и биологические применения». Тенденции в биотехнологии . 36 (9): 952–965. DOI : 10.1016 / j.tibtech.2018.04.002 . PMID 29724495 . 
  64. ↑ de Wit E (май 2017 г.). «Захват гетерогенности: одноклеточные структуры трехмерного генома». Структурная и молекулярная биология природы . 24 (5): 437–438. DOI : 10.1038 / nsmb.3404 . PMID 28471429 . S2CID 5132000 .  
  65. ^ Канг Х.М., Субраманиам М, Тарг С, Нгуен М, Малискова Л, Маккарти Э и др. (Январь 2018). «Мультиплексное капельное секвенирование РНК одной клетки с использованием естественных генетических вариаций» . Природа Биотехнологии . 36 (1): 89–94. DOI : 10,1038 / НБТ.4042 . PMC 5784859 . PMID 29227470 .  
  66. ^ Цао Дж, Кусанович Д.А., Рамани В., Агамирзайе Д., Плинер Х.А., Хилл А.Дж. и др. (Сентябрь 2018 г.). «Совместное профилирование доступности хроматина и экспрессии генов в тысячах отдельных клеток» . Наука . 361 (6409): 1380–1385. Bibcode : 2018Sci ... 361.1380C . DOI : 10.1126 / science.aau0730 . PMC 6571013 . PMID 30166440 .  
  67. ↑ Куно Т., Муди Дж., Квон А.Т., Шибаяма Ю., Като С., Хуанг И. и др. (Январь 2019). «C1 CAGE определяет сайты начала транскрипции и активность энхансера при разрешении одной клетки» . Nature Communications . 10 (1): 360. Bibcode : 2019NatCo..10..360K . DOI : 10,1038 / s41467-018-08126-5 . PMC 6341120 . PMID 30664627 .  
  68. ^ Wang N, Zheng J, Chen Z, Liu Y, Dura B, Kwak M и др. (Январь 2019). «Совместное секвенирование микроРНК-мРНК одной клетки выявляет негенетическую гетерогенность и механизмы регуляции микроРНК» . Nature Communications . 10 (1): 95. Bibcode : 2019NatCo..10 ... 95W . DOI : 10.1038 / s41467-018-07981-6 . PMC 6327095 . PMID 30626865 .  
  69. ^ Лю Л., Лю Ц., Квинтеро А., Ву Л., Юань И, Ван М. и др. (Январь 2019). «Деконволюция одноклеточных мультикомных слоев выявляет регуляторную неоднородность» . Nature Communications . 10 (1): 470. Bibcode : 2019NatCo..10..470L . DOI : 10.1038 / s41467-018-08205-7 . PMC 6349937 . PMID 30692544 .  
  70. ↑ Corporation, Fluidigm (31 января 2019 г.). «Fluidigm представляет REAP-Seq для многоклеточного анализа одиночных клеток на C1» . Комната новостей GlobeNewswire .
  71. ↑ Moudgil A, Wilkinson MN, Chen X, He J, Cammack AJ, Vasek MJ и др. (1 февраля 2019 г.). «Транспозоны с самооценкой позволяют одновременно считывать экспрессию генов и связывание факторов транскрипции в отдельных клетках» . bioRxiv . 182 (4): 992–1008.e21. DOI : 10,1101 / 538553 . PMC 7510185 . PMID 32710817 .  
  72. ^ Надаль-Рибеллес М., Ислам С., Вей В., Латорре П., Нгуен М., де Надаль Е. и др. (Апрель 2019 г.). «Чувствительная высокопроизводительная одноклеточная последовательность РНК выявляет внутриклональные корреляции транскриптов в популяциях дрожжей» . Природная микробиология . 4 (4): 683–692. DOI : 10.1038 / s41564-018-0346-9 . PMC 6433287 . PMID 30718850 .  
  73. ^ Родригес-Мейра А., Бак Дж., Кларк С.А., Повинелли Б.Дж., Алколея В., Лука Е. и др. (Март 2019 г.). «Распознавание внутриопухолевой гетерогенности с помощью высокочувствительного мутационного анализа отдельных клеток и параллельного секвенирования РНК» . Молекулярная клетка . 73 (6): 1292–1305.e8. DOI : 10.1016 / j.molcel.2019.01.009 . PMC 6436961 . PMID 30765193 .  
  74. ↑ McGinnis CS, Patterson DM, Winkler J, Conrad DN, Hein MY, Srivastava V, et al. (Июль 2019). «MULTI-seq: мультиплексирование образцов для секвенирования одноклеточной РНК с использованием индексов, помеченных липидами» . Методы природы . 16 (7): 619–626. DOI : 10.1038 / s41592-019-0433-8 . PMC 6837808 . PMID 31209384 .  
  75. ↑ Gaublomme JT, Li B, McCabe C, Knecht A, Yang Y, Drokhlyansky E, et al. (Июль 2019). «Мультиплексирование ядер с антителами со штрих-кодом для одноядерной геномики» . Nature Communications . 10 (1): 2907. Bibcode : 2019NatCo..10.2907G . DOI : 10.1038 / s41467-019-10756-2 . PMC 6606589 . PMID 31266958 .  
  76. ^ "Атлас РНК мыши" . oncoscape.v3.sttrcancer.org .
  77. ↑ Li X, Chen L, Zhang Q, Sun Y, Li Q, Yan J (март 2019). "BRIF-Seq: Бисульфит-преобразованные случайно интегрированные фрагменты секвенирования на уровне одной клетки" . Молекулярный завод . 12 (3): 438–446. DOI : 10.1016 / j.molp.2019.01.004 . PMID 30639749 . 
  78. ^ Родрикес С.Г., Стиклс Р.Р., Гоева А., Мартин К.А., Мюррей Е., Вандербург С.Р. и др. (Март 2019 г.). «Slide-seq: масштабируемая технология для измерения экспрессии всего генома с высоким пространственным разрешением» . Наука . 363 (6434): 1463–1467. Bibcode : 2019Sci ... 363.1463R . DOI : 10.1126 / science.aaw1219 . PMC 6927209 . PMID 30923225 .  
  79. ^ Kaya-Okur HS, Wu SJ, Codomo CA, Pledger ES, Bryson TD, Henikoff JG и др. (Апрель 2019 г.). «CUT & Tag для эффективного эпигеномного профилирования малых образцов и отдельных клеток» . Nature Communications . 10 (1): 1930. Bibcode : 2019NatCo..10.1930K . DOI : 10.1038 / s41467-019-09982-5 . PMC 6488672 . PMID 31036827 .  
  80. ↑ Бидди, Брент А. (7 марта 2019 г.). «Одноклеточное картирование клонов и идентичности с помощью CellTagging» . Протоколы.io . DOI : 10.17504 / протоколы.io.yxifxke .
  81. ^ Сайкия М., Бернхэм П., Кешавджи С.Х., Ван М.Ф., Хеян М., Морал-Лопес П. и др. (Январь 2019). «Одновременное мультиплексное секвенирование ампликона и профилирование транскриптома в отдельных клетках» . Методы природы . 16 (1): 59–62. DOI : 10.1038 / s41592-018-0259-9 . PMC 6378878 . PMID 30559431 .  
  82. ^ Rooijers K, Markodimitraki CM, Rang FJ, de Vries SS, Chialastri A, de Luca KL и др. (Июль 2019). «Одновременная количественная оценка контактов белок-ДНК и транскриптомов в отдельных клетках» . Природа Биотехнологии . 37 (7): 766–772. DOI : 10.1038 / s41587-019-0150- у . PMC 6609448 . PMID 31209373 .  
  83. Перейти ↑ Carter B, Ku WL, Kang JY, Hu G, Perrie J, Tang Q, Zhao K (август 2019). «Картирование модификаций гистонов в клетках с низким числом и одиночных клетках с использованием антител-ориентированной маркировки хроматина (ACT-seq)» . Nature Communications . 10 (1): 3747. Bibcode : 2019NatCo..10.3747C . DOI : 10.1038 / s41467-019-11559-1 . PMC 6702168 . PMID 31431618 .  
  84. ^ Рамани V, Дэн X, Qiu R, Lee C, Disteche CM, Noble WS и др. (Сентябрь 2019 г.). «Sci-Hi-C: одноклеточный метод Hi-C для картирования трехмерной организации генома в большом количестве отдельных клеток» . Методы . 170 : 61–68. DOI : 10.1016 / j.ymeth.2019.09.012 . PMC 6949367 . PMID 31536770 .  
  85. ^ Родрикес С.Г., Стиклс Р.Р., Гоева А., Мартин К.А., Мюррей Е., Вандербург С.Р. и др. (Март 2019 г.). «Slide-seq: масштабируемая технология для измерения экспрессии всего генома с высоким пространственным разрешением» . Наука . 363 (6434): 1463–1467. Bibcode : 2019Sci ... 363.1463R . DOI : 10.1126 / science.aaw1219 . PMC 6927209 . PMID 30923225 .  
  86. ↑ Biočanin M, Bues J, Dainese R, Amstad E, Deplancke B (апрель 2019 г.). «Упрощенный рабочий процесс Drop-seq с минимальной потерей шариков с использованием микрожидкостного чипа для захвата и обработки шариков» . Лаборатория на чипе . 19 (9): 1610–1620. DOI : 10.1039 / C9LC00014C . PMID 30920557 . 
  87. ^ Ку В.Л., Накамура К., Гао В., Цуй К., Ху Г., Тан К. и др. (Апрель 2019 г.). «Последовательность иммунного расщепления одноклеточного хроматина (scChIC-seq) для профилирования модификации гистонов» . Методы природы . 16 (4): 323–325. DOI : 10.1038 / s41592-019-0361-7 . PMC 7187538 . PMID 30923384 .  
  88. ↑ Tan L, Xing D, Daley N, Xie XS (апрель 2019 г.). «Трехмерные структуры генома отдельных сенсорных нейронов в зрительной и обонятельной системах мышей». Структурная и молекулярная биология природы . 26 (4): 297–307. DOI : 10.1038 / s41594-019-0205-2 . PMID 30936528 . S2CID 89616808 .  
  89. ↑ Wang Q, Xiong H, Ai S, Yu X, Liu Y, Zhang J, He A (октябрь 2019 г.). «CoBATCH для высокопроизводительного эпигеномного профилирования одной клетки» . Молекулярная клетка . 76 (1): 206–216.e7. DOI : 10.1016 / j.molcel.2019.07.015 . PMID 31471188 . 
  90. ↑ Luginbühl J, Kouno T, Nakano R, Chater TE, Sivaraman DM, Kishima M и др. (5 апреля 2019 г.). «Расшифровка нейронального разнообразия с помощью одноклеточного Convert-seq» . bioRxiv : 600239. DOI : 10.1101 / 600239 .
  91. ^ a b Lareau CA, Duarte FM, Chew JG, Kartha VK, Burkett ZD, Kohlway AS, et al. (Август 2019). «Комбинаторное индексирование на основе капель для массового доступа к одноклеточному хроматину». Природа Биотехнологии . 37 (8): 916–924. DOI : 10.1038 / s41587-019-0147-6 . PMID 31235917 . S2CID 195329871 .  
  92. ^ Mimitou EP, Cheng A, Montalbano A, Hao S, Stoeckius M, Legut M и др. (Май 2019). «Мультиплексное обнаружение белков, транскриптомов, клонотипов и нарушений CRISPR в отдельных клетках» . Методы природы . 16 (5): 409–412. DOI : 10.1038 / s41592-019-0392-0 . PMC 6557128 . PMID 31011186 .  
  93. ↑ Zhu C, Gao Y, Peng J, Tang F, Yi C (1 января 2019 г.). «Одноклеточное секвенирование 5fC». Одноклеточные методы . Методы молекулярной биологии. 1979 г. Клифтон, Нью-Джерси, стр. 251–267. DOI : 10.1007 / 978-1-4939-9240-9_16 . ISBN 978-1-4939-9239-3. PMID  31028643 .
  94. Перейти ↑ Russell AB, Elshina E, Kowalsky JR, Te Velthuis AJ, Bloom JD (июль 2019). «Секвенирование одноклеточного вируса инфекций гриппа, запускающих врожденный иммунитет» . Журнал вирусологии . 93 (14). DOI : 10.1128 / JVI.00500-19 . PMC 6600203 . PMID 31068418 .  
  95. ^ Керен-Шауль Х, Кенигсберг Э, Джайтин Д.А., Дэвид Э, Пол Ф, Танай А, Амит I (июнь 2019). «MARS-seq2.0: экспериментальный и аналитический конвейер для индексированной сортировки в сочетании с секвенированием одноклеточной РНК». Протоколы природы . 14 (6): 1841–1862. DOI : 10.1038 / s41596-019-0164-4 . PMID 31101904 . S2CID 156055842 .  
  96. ^ Ли I, Разаги Р., Гилпатрик Т., Мольнар М., Садовски Н., Симпсон Дж. Т. и др. (2 февраля 2019 г.). «Одновременное профилирование доступности хроматина и метилирования на линиях клеток человека с секвенированием нанопор» . bioRxiv : 504993. DOI : 10.1101 / 504993 .
  97. ^ Ван И, Ван А, Лю З., Турман А.Л., Пауэрс Л.С., Цзоу М. и др. (Август 2019). «Долгое чтение одной молекулы раскрывает хроматиновую основу экспрессии генов» . Геномные исследования . 29 (8): 1329–1342. DOI : 10.1101 / gr.251116.119 . PMC 6673713 . PMID 31201211 .  
  98. ^ Шипони Z, Маринов GK, Swaffer MP, Sinott-Armstrong NA, Skotheim JM, Kundaje A, et al. (22 декабря 2018 г.). «Дальнее одномолекулярное картирование доступности хроматина у эукариот» . bioRxiv . 17 (3): 319–327. DOI : 10.1101 / 504662 . PMC 7968351 . PMID 32042188 .  
  99. ↑ Boersma S, Khuperkar D, Verhagen BM, Sonneveld S, Grimm JB, Lavis LD, Tanenbaum ME (июль 2019 г.). «Многоцветная визуализация одной молекулы выявляет обширную неоднородность в декодировании мРНК» . Cell . 178 (2): 458–472.e19. DOI : 10.1016 / j.cell.2019.05.001 . PMC 6630898 . PMID 31178119 .  
  100. ↑ Specht H, Emmott E, Koller T, Slavov N ​​(9 июня 2019 г.). «Высокопроизводительная одноклеточная протеомика количественно определяет возникновение неоднородности макрофагов» . bioRxiv : 665307. DOI : 10.1101 / 665307 .
  101. Перейти ↑ Cao J, Zhou W, Steemers F, Trapnell C, Shendure J (11 июня 2019 г.). «Характеристика временной динамики экспрессии генов в единичных клетках с научной судьбой» . bioRxiv : 666081. DOI : 10.1101 / 666081 .
  102. ↑ Altemose N, Maslan A, Lai A, White JA, Streets AM (18 июля 2019 г.). «μDamID: микрофлюидный подход для визуализации и секвенирования белок-ДНК взаимодействий в отдельных клетках» . bioRxiv : 706903. DOI : 10.1101 / 706903 .
  103. ^ Ли Г, Лю И, Чжан И, Кубо Н, Ю М, Фанг Р. и др. (Октябрь 2019 г.). «Совместное профилирование метилирования ДНК и архитектуры хроматина в отдельных клетках» . Методы природы . 16 (10): 991–993. DOI : 10.1038 / s41592-019-0502- z . PMC 6765429 . PMID 31384045 .  
  104. ^ Сингх М., Аль-Эриани Г., Карсуэлл С., Фергюсон Дж. М., Блэкберн Дж., Бартон К. и др. (Июль 2019). «Высокопроизводительное целевое долгосрочное секвенирование отдельных клеток выявляет клональный и транскрипционный ландшафт лимфоцитов» . Nature Communications . 10 (1): 3120. Bibcode : 2019NatCo..10.3120S . DOI : 10.1038 / s41467-019-11049-4 . PMC 6635368 . PMID 31311926 .  
  105. ^ Zhu C, Yu M, Huang H, Juric I, Abnousi A, Hu R и др. (Ноябрь 2019 г.). «Сверхвысокопроизводительный метод совместного анализа открытого хроматина и транскриптома на одной клетке» . Структурная и молекулярная биология природы . 26 (11): 1063–1070. DOI : 10.1038 / s41594-019-0323- х . PMC 7231560 . PMID 31695190 .  
  106. Перейти ↑ Cole C, Byrne A, Beaudin AE, Forsberg EC, Vollmers C (июнь 2018) . «Tn5Prime, метод 5 'захвата на основе Tn5 для одиночной клеточной РНК-seq» . Исследования нуклеиновых кислот . 46 (10): e62. DOI : 10.1093 / nar / gky182 . PMC 6007450 . PMID 29548006 .  
  107. Перейти ↑ Schon MA, Kellner MJ, Plotnikova A, Hofmann F, Nodine MD (декабрь 2018 г.). «NanoPARE: параллельный анализ 5 'концов РНК от РНК с низким входом» . Геномные исследования . 28 (12): 1931–1942. DOI : 10.1101 / gr.239202.118 . PMC 6280765 . PMID 30355603 .  
  108. ^ Узбас Ф, Опперер Ф, Сёнмезер С, Шапошников Д., Сасс С, Крендл С и др. (Август 2019). «BART-Seq: экономичное целевое секвенирование с массовым распараллеливанием для геномики, транскриптомики и анализа отдельных клеток» . Геномная биология . 20 (1): 155. DOI : 10.1186 / s13059-019-1748-6 . PMC 6683345 . PMID 31387612 .  
  109. ^ Rooijers K, Markodimitraki CM, Rang FJ, de Vries SS, Chialastri A, de Luca KL и др. (Июль 2019). «Одновременная количественная оценка контактов белок-ДНК и транскриптомов в отдельных клетках» . Природа Биотехнологии . 37 (7): 766–772. DOI : 10.1038 / s41587-019-0150- у . PMC 6609448 . PMID 31209373 .  
  110. ^ Ai S, Xiong H, Li CC, Luo Y, Shi Q, Liu Y и др. (Сентябрь 2019 г.). «Профилирование состояний хроматина с использованием одноклеточной itChIP-seq». Природа клеточной биологии . 21 (9): 1164–1172. DOI : 10.1038 / s41556-019-0383-5 . PMID 31481796 . S2CID 201815293 .  
  111. ↑ Chen S, Lake BB, Zhang K (декабрь 2019 г.). «Высокопроизводительное секвенирование транскриптома и доступности хроматина в одной и той же клетке» . Природа Биотехнологии . 37 (12): 1452–1457. DOI : 10.1038 / s41587-019-0290-0 . PMC 6893138 . PMID 31611697 .  
  112. ^ Xing QR, Farran CE, Yi Y, Warrier T, Gautam P, Collins JJ и др. (4 ноября 2019 г.). «Параллельное бимодальное секвенирование одной клетки транскриптома и доступности хроматина» . bioRxiv . 30 (7): 1027–1039. DOI : 10,1101 / 829960 . PMC 7397874 . PMID 32699019 .  
  113. ^ Srivatsan SR, McFaline-Figueroa JL, Ramani V, Saunders L, Cao J, Packer J и др. (Декабрь 2019 г.). «Массивно мультиплексная химическая транскриптомика при разрешении одной клетки» . Наука . 367 (6473): 45–51. DOI : 10.1126 / science.aax6234 . PMC 7289078 . PMID 31806696 .  
  114. ^ МакФарланд Дж. М., Паолелла Б. Р., Уоррен А., Гейгер-Шуллер К., Шибу Т., Ротберг М. и др. (8 декабря 2019 г.). «Мультиплексное одноклеточное профилирование транскрипционных ответов после пертурбации для определения уязвимости рака и терапевтического механизма действия» . bioRxiv : 868752. DOI : 10.1101 / 868752 .
  115. ^ Кучина А., Бреттнер Л. М., Палеолог Л., Роко С. М., Розенберг А. Б., Кариньяно А. и др. (11 декабря 2019 г.). «Секвенирование микробной одноклеточной РНК с помощью штрих-кодирования разделенного пула» . bioRxiv : 869248. DOI : 10.1101 / 869248 .
  116. Перейти ↑ Liu Y, Nie H, Liu H, Lu F (ноябрь 2019 г.). «Секвенирование поли (A) изоформ РНК (PAIso-seq) выявляет широко распространенные неаденозиновые остатки в поли (A) хвостах РНК» . Nature Communications . 10 (1): 5292. Bibcode : 2019NatCo..10.5292L . DOI : 10.1038 / s41467-019-13228-9 . PMC 6876564 . PMID 31757970 .  
  117. Перейти ↑ Amamoto R, Zuccaro E, Curry NC, Khurana S, Chen HH, Cepko CL, Arlotta P (ноябрь 2019 г.). «FIN-Seq: профили транскрипции определенных типов клеток из замороженных архивных тканей центральной нервной системы человека» . Исследования нуклеиновых кислот . 48 (1): e4. DOI : 10.1093 / nar / gkz968 . PMC 7145626 . PMID 31728515 .  
  118. ↑ Setliff I, Shiakolas AR, Pilewski KA, Murji AA, Mapengo RE, Janowska K и др. (Декабрь 2019 г.). «Высокопроизводительное сопоставление последовательностей рецепторов В-клеток с антигенной специфичностью» . Cell . 179 (7): 1636–1646.e15. DOI : 10.1016 / j.cell.2019.11.003 . PMC 7158953 . PMID 31787378 .  
  119. Перейти ↑ Datlinger P, Rendeiro AF, Boenke T, Krausgruber T, Barreca D, Bock C (18 декабря 2019 г.). «Сверхвысокопроизводительное секвенирование одноклеточной РНК с помощью комбинаторной жидкостной индексации» . bioRxiv : 2019.12.17.879304. DOI : 10.1101 / 2019.12.17.879304 .
Получено с https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=List_of_single_cell_omics_methods&oldid=1050053669 .
Contribute a better translation