Содержание | |
---|---|
Описание | Экспериментально подтвержденные взаимодействия микроРНК- мишень (MTI). |
Типы данных захвачены | miRNA-мишень взаимодействия |
Контакт | |
Исследовательский центр | Национальный университет Цзяо Дун |
Лаборатория | Институт биоинформатики и системной биологии |
Авторы | Шэн-Да Сюй |
Первичное цитирование | Сюй и др. (2011) [1] |
Дата выпуска | 2013 |
Доступ | |
Веб-сайт | http://mirtarbase.cuhk.edu.cn |
Скачать URL | http://mirtarbase.cuhk.edu.cn/php/download.php |
Разнообразный | |
Версия | 4.5 |
miRTarBase [1] - это тщательно подобранная база данных взаимодействий микроРНК с мишенью . В качестве базы данных miRTarBase накопила более пятидесяти тысяч взаимодействий miRNA-мишень (MTI), которые собираются путем ручного обзора соответствующей литературы после систематического анализа данных текста для фильтрации научных статей, связанных с функциональными исследованиями miRNA. Как правило, собранные MTI подтверждаются экспериментально с помощью репортерного анализа, вестерн-блоттинга, микрочипов и экспериментов по секвенированию следующего поколения. Несмотря на то, что miRTarBase содержит наибольшее количество проверенных MTI, она обеспечивает самую обновленную коллекцию по сравнению с другими подобными, ранее разработанными базами данных.
См. Также [ править ]
Ссылки [ править ]
- ^ а б Сюй С.Д., Линь FM, Ву В.Й., Лян Ц., Хуанг В.С., Чан В.Л., Цай В.Т., Чен Г.З., Ли СиДжей, Чиу С.М., Цзянь СН, Ву МС, Хуан С.Й., Цзоу А.П., Хуан HD (2011) . «miRTarBase: база данных курирует экспериментально подтвержденные взаимодействия микроРНК-мишень» . Исследования нуклеиновых кислот . 39 (Проблема с базой данных): D163-9. DOI : 10.1093 / NAR / gkq1107 . PMC 3013699 . PMID 21071411 .