Из Википедии, бесплатной энциклопедии
  (Перенаправлено из Morphometric )
Перейти к навигации Перейти к поиску
Размер родов вымершего семейства птиц Confuciusornithidae по сравнению с человеком (рост 1,75 метра). А. Чангченгорнис . По голотипу . [1] Б. Конфуциусорнис . На основе нескольких экземпляров примерно одинакового размера. [2] C. Eoconfuciusornis . На основе голотипа ИВПП В11977. [3] [4]

Морфометрия (от греческого μορϕή morphe , «форма, форма» и -μετρία metria , «измерение») или морфометрия [5] относится к количественному анализу формы , концепции, которая включает в себя размер и форму. Морфометрические анализы обычно выполняются на организмах и полезны для анализа их летописи окаменелостей, влияния мутаций на форму, изменений формы в процессе развития, ковариаций между экологическими факторами и формой, а также для оценки количественно-генетических параметров формы. Морфометрию можно использовать для количественной оценки признака, имеющего эволюционное значение, и, обнаруживая изменения в форме, можно сделать вывод об их онтогенезе., функция или эволюционные отношения. Основная цель морфометрии - статистическая проверка гипотез о факторах, влияющих на форму.

«Морфометрия», в более широком смысле, также используется для точного определения местоположения определенных областей органов, таких как мозг, [6] [7] и для описания форм других предметов.

Формы [ править ]

Стандартные размеры птиц

Обычно различают три общих подхода к форме: традиционная морфометрия, морфометрия на основе ориентиров и морфометрия на основе контуров.

«Традиционная» морфометрия [ править ]

Традиционная морфометрия анализирует длину, ширину, массу, углы, соотношения и площади. [8]В общем, традиционные морфометрические данные - это измерения размера. Недостатком использования многих измерений размера является то, что большинство из них сильно коррелированы; в результате, несмотря на множество измерений, остается мало независимых переменных. Например, длина большеберцовой кости будет зависеть от длины бедренной кости, а также от длины плечевой и локтевой костей и даже от размеров головы. Тем не менее, традиционные морфометрические данные полезны, когда особый интерес представляют абсолютные или относительные размеры, например, при изучении роста. Эти данные также полезны, когда измерения размеров имеют теоретическое значение, такие как масса тела, площадь поперечного сечения и длина конечности, при исследованиях функциональной морфологии. Однако у этих измерений есть одно важное ограничение: они содержат мало информации о пространственном распределении изменений формы по всему организму.Они также полезны при определении степени воздействия определенных загрязнителей на человека. Эти индексы включают гепатосоматический индекс, гонадосоматический индекс, а также факторы состояния (shakumbila, 2014).

Геометрическая морфометрия на основе ориентиров [ править ]

Дополнительная информация: анализ геометрических данных и статистический анализ формы

В геометрической морфометрии, основанной на ориентирах, пространственная информация, отсутствующая в традиционной морфометрии, содержится в данных, потому что данные представляют собой координаты ориентиров : дискретные анатомические локусы, которые, возможно, гомологичны у всех людей в анализе (т. Е. Их можно рассматривать как " одна и та же точка в каждом образце в исследовании). Например, место пересечения двух определенных швов является ориентиром, равно как и пересечения жилок на крыле или листе насекомого или отверстиях., небольшие отверстия, через которые проходят вены и сосуды. В исследованиях, основанных на исторических данных, традиционно анализируются 2D-данные, но с увеличением доступности методов 3D-визуализации 3D-анализ становится все более осуществимым даже для небольших структур, таких как зубы. [9] При работе с окаменелостями или легко повреждаемыми образцами бывает сложно найти достаточно ориентиров, чтобы дать исчерпывающее описание формы. Это потому, что все ориентиры должны присутствовать на всех образцах, хотя координаты отсутствующих ориентиров можно оценить. Данные для каждого человека состоят из конфигурации ориентиров.

Есть три признанных категории достопримечательностей. [10] Ориентиры типа 1 определяются локально, то есть в виде структур, близких к этой точке; например, пересечение трех швов или пересечение жилок на крыле насекомого определяется локально и окружено тканью со всех сторон. Ориентиры типа 3 , напротив, определяются как точки, удаленные от ориентира, и часто определяются как точка, «наиболее удаленная» от другой точки. Ориентиры типа 2 являются промежуточными; в эту категорию входят такие точки, как структура острия или локальные минимумы и максимумы кривизны. Они определены с точки зрения местных особенностей, но не окружены со всех сторон. Помимо достопримечательностей есть и полуземелья., точки, положение которых на кривой произвольно, но которые предоставляют информацию о кривизне в двух [11] или трех измерениях. [12]

Геометрическая морфометрия на основе Прокруста [ править ]

Анализ формы начинается с удаления информации, не связанной с формой. По определению, форма не изменяется при перемещении, масштабировании или вращении. [13] Таким образом, для сравнения форм информация, не относящаяся к форме, удаляется из координат ориентиров. Эти три операции можно выполнить несколькими способами. Один из способов - зафиксировать координаты двух точек в точках (0,0) и (0,1), которые являются двумя концами базовой линии. На одном этапе формы переводятся в одно и то же положение (для этих значений фиксируются те же две координаты), формы масштабируются (до единичной длины базовой линии), а формы вращаются. [10] Альтернативным и предпочтительным методом является наложение Прокруста . Этот метод переводит центр тяжести фигур в (0,0); хКоордината центроида - это среднее значение координат x ориентиров, а координата y центроида - это среднее значение y-координаты. Фигуры масштабируются до единичного размера центроида, который является квадратным корнем из суммы квадратов расстояний от каждого ориентира до центроида. Конфигурация вращается, чтобы минимизировать отклонение между ней и эталоном, обычно средней формой. В случае полу-ориентиров также удаляется изменение положения вдоль кривой. Поскольку пространство формы искривлено, анализ выполняется путем проецирования форм на пространство, касательное к пространству формы. В касательном пространстве для проверки статистических гипотез о форме можно использовать обычные многомерные статистические методы, такие как многомерный дисперсионный анализ и многомерная регрессия.

Анализ на основе Прокруста имеет некоторые ограничения. Во-первых, наложение Прокруста использует критерий наименьших квадратов для поиска оптимального вращения; следовательно, вариация, локализованная в одном ориентире, будет размыта по многим. Это называется «эффектом Пиноккио». Другой заключается в том, что наложение само по себе может налагать на ориентиры модель ковариации. [14] [15] Кроме того, не может быть проанализирована любая информация, которая не может быть зафиксирована с помощью ориентиров и полуземель, включая классические измерения, такие как «наибольшая ширина черепа». Более того, есть критика методов на основе Прокруста, которые мотивируют альтернативный подход к анализу данных ориентиров.

Матричный анализ евклидовых расстояний [ править ]

Диффеоморфометрия [ править ]

Диффеоморфометрия [16] сосредоточена на сравнении форм и форм с метрической структурой, основанной на диффеоморфизмах, и занимает центральное место в области вычислительной анатомии . [17] регистрация диффеоморфен, [18] введен в 90 - е годы, в настоящее время является важным игроком с существующими кодами баз организованы вокруг ANTS, [19] DARTEL, [20] демонами, [21] LDDMM , [22] StationaryLDDMM [23] являются примеры активно используемых вычислительных кодов для построения соответствий между системами координат на основе разреженных объектов и плотных изображений. Морфометрия на основе вокселей(VBM) - важная технология, построенная на многих из этих принципов. Методы, основанные на диффеоморфных потоках, используются в Например, деформации могут быть диффеоморфизмами окружающего пространства, в результате чего создается структура LDDMM ( Large Deformation Diffeomorphic Metric Mapping ) для сравнения форм. [24] В отношении таких деформаций есть правая инвариантная метрика Computational Anatomy, которая обобщает метрику несжимаемых эйлеровых потоков, но включает норму Соболева, обеспечивающую гладкость потоков, [25] теперь определены метрики, связанные с гамильтоновыми управлениями диффеоморфных потоков. потоки. [26]

Контурный анализ [ править ]

Результаты анализа главных компонентов, выполненного на основе анализа контуров некоторых зубцов телодонта .

Контурный анализ - это еще один подход к анализу формы. Что отличает анализ контура, так это то, что коэффициенты математических функций подгоняются к точкам, отобранным вдоль контура. Существует несколько способов количественной оценки схемы. Старые методы , такие как «подгонки к полиномиальной кривой» [27] и основные компоненты количественного анализа [28] были заменены двумя основными современными подходами: eigenshape анализа , [29] и эллиптического анализа Фурье (ОДВ), [30]используя очертания, начертанные вручную или на компьютере. Первый включает в себя установку заранее заданного количества полуотмечений с равными интервалами вокруг контура формы, запись отклонения каждого шага от полуотметки к полуотметке от того, под каким углом этот шаг был бы, если бы объект был простой окружностью. [31] Последний определяет контур как сумму минимального количества эллипсов, необходимых для имитации формы. [32]

У обоих методов есть свои слабые стороны; наиболее опасным (и легко преодолимым) является их восприимчивость к шуму в очертаниях. [33] Аналогичным образом, ни один из них не сравнивает гомологические точки, и глобальным изменениям всегда придается больший вес, чем локальным изменениям (которые могут иметь большие биологические последствия). Анализ Eigenshape требует установки эквивалентной начальной точки для каждого образца, что может быть источником ошибок. EFA также страдает избыточностью, поскольку не все переменные являются независимыми. [33] С другой стороны, их можно применять к сложным кривым без необходимости определять центроид; это значительно упрощает устранение эффекта расположения, размера и поворота. [33]Воспринимаемые недостатки морфометрии контура заключаются в том, что он не сравнивает точки гомологичного происхождения и чрезмерно упрощает сложные формы, ограничиваясь рассмотрением контура, а не внутренних изменений. Кроме того, поскольку он работает, аппроксимируя контур серией эллипсов, он плохо справляется с заостренными формами. [34]

Одна из критических замечаний по поводу методов, основанных на контурах, заключается в том, что они игнорируют гомологию - известным примером такого пренебрежения является способность методов, основанных на контурах, сравнивать лопатку и картофельные чипсы. [35] Такое сравнение было бы невозможно, если бы данные были ограничены биологически гомологичными точками. Аргументом против этой критики является то, что если подходы к морфометрии могут быть использованы для проверки биологических гипотез при отсутствии данных о гомологии, то подходы, основанные на разломах, не подходят для проведения тех же типов исследований. [36]

Анализ данных [ править ]

Многомерные статистические методы могут использоваться для проверки статистических гипотез о факторах, влияющих на форму, и для визуализации их эффектов. Чтобы визуализировать закономерности изменения данных, данные необходимо привести к понятной (низкоразмерной) форме. Анализ главных компонентов (PCA) - часто используемый инструмент для обобщения вариаций. Проще говоря, эта техника проецирует как можно больше общего изменения в нескольких измерениях. См. Пример на рисунке справа. Каждая ось на графике PCA представляет собой собственный векторковариационной матрицы переменных формы. Первая ось соответствует максимальному изменению выборки, а другие оси представляют дальнейшие способы изменения выборки. Паттерн кластеризации образцов в этом морфопространстве представляет собой сходства и различия в формах, которые могут отражать филогенетические отношения . Помимо изучения закономерностей вариации, многомерные статистические методы могут использоваться для проверки статистических гипотез о факторах, влияющих на форму, и для визуализации их эффектов, хотя PCA не требуется для этой цели, если только метод не требует инвертирования матрицы вариации-ковариации.

Данные ориентира позволяют визуализировать разницу между средними значениями совокупности или отклонение индивида от среднего значения совокупности как минимум двумя способами. Один изображает векторы на ориентирах, которые показывают величину и направление, в котором этот ориентир смещен относительно других. Второй изображает разницу с помощью тонких пластин сплайнов , функция интерполяции , которая моделирует изменения между ориентирами с данных об изменениях в координатах из ориентиров. Эта функция создает то, что выглядит как деформированные сетки; там, где относительно удлиненные области, сетка будет выглядеть растянутой, а где эти области относительно укорочены, сетка будет выглядеть сжатой.

Экология и эволюционная биология [ править ]

Д'Арси Томпсон в 1917 году предположил, что формы у многих разных видов также могут быть связаны таким образом. В случае ракушек и рогов он дал довольно точный анализ ... Но он также нарисовал различные изображения рыб и черепов и утверждал, что они связаны деформациями координат. [37]

Анализ формы широко используется в экологии и эволюционной биологии для изучения пластичности [38] [39] [40] эволюционных изменений формы [41] [42] [43] [44] и в эволюционной биологии развития для изучения эволюции онтогенез формы, [45] [46] [47], а также истоки развития стабильности, канализации и модульности. [48] [49] [50] [51] [52] Многие другие приложения анализа формы в экологии и эволюционной биологии можно найти во вводном тексте: Zelditch, ML; Свидерски, DL; Листы, HD (2012).Геометрическая морфометрия для биологов: учебник . Лондон: Elsevier: Academic Press.

Нейровизуализация [ править ]

В нейровизуализации , наиболее распространенные варианты воксела основе морфометрии , деформации на основе морфометрии и поверхность на основе морфометрии из мозга . [ требуется разъяснение ]

Костная гистоморфометрия [ править ]

Гистоморфометрия кости включает получение образца биопсии кости и обработку образцов кости в лаборатории, получение оценок пропорциональных объемов и поверхностей, занимаемых различными компонентами кости. Сначала кость разрушается в ваннах с высококонцентрированным этанолом и ацетоном . Затем кость заделывают и окрашивают, чтобы ее можно было визуализировать / проанализировать под микроскопом . [53] Биопсия кости проводится с использованием трепана для биопсии кости. [54]

Другие приложения [ править ]

Применение морфометрии не ограничивается биологическим использованием. Это также может быть применено к местности в виде геоморфометрии . [55] Он также имеет множество других приложений. [ требуется проверка ]

См. Также [ править ]

  • Аллометрия
  • Аллометрическая инженерия
  • Морфометрия мозга
  • Д'Арси Вентворт Томпсон
  • Геометрическая морфометрия в антропологии
  • Меристика
  • Филогенетические сравнительные методы

Примечания [ править ]

^ 1 с греческого: «морф», что означает форма или форма, и «метрон», размер.

Ссылки [ править ]

  1. ^ Chiappe, LM; и другие. (1999). «Новая позднемезозойская птица-конфуциусорнитид из Китая» (PDF) . Журнал палеонтологии позвоночных . 19 (1): 1–7. DOI : 10.1080 / 02724634.1999.10011117 . [ постоянная мертвая ссылка ]
  2. ^ Норелл, Массачусетс; и другие. (1999). «Анатомия и систематика Confuciusornithidae (Theropoda: Aves) из позднего мезозоя Северо-Восточного Китая» (PDF) . Бюллетень Американского музея естественной истории . 242 : 10. Архивировано из оригинального (PDF) 19 ноября 2011 года . Проверено 2 марта 2013 .
  3. ^ Бентон, MJ; и другие. (2008). «Примитивная птица-конфуциусорнитид из Китая и ее значение для раннего полета птиц» . Наука в Китае. Серия D: Науки о Земле . 51 (5): 625–639. Bibcode : 2008ScChD..51..625Z . DOI : 10.1007 / s11430-008-0050-3 . S2CID 84157320 . 
  4. ^ Chiappe, LM; и другие. (2008). «История жизни базальной птицы: морфометрия раннемелового Confuciusornis » . Письма биологии . 4 (6): 719–723. DOI : 10.1098 / RSBL.2008.0409 . PMC 2614169 . PMID 18832054 .  
  5. ^ "Главная: Оксфордский словарь английского языка" . oed.com . Проверено 21 апреля 2018 года .
  6. ↑ Гонсалес Баллестер, Мигель Анхель (1999). «Морфометрический анализ структур мозга в МРТ» (PDF) . Institut National de Recherche en Informatique et en Automatique .
  7. ^ Шолле, Мадлен Б .; Олдридж, Кристина; Пэнгборн, Николь; Weinberg, Seth M .; ДеЛеон, Валери Б.; Барон, Жан-Клод (28 января 2014 г.). «Ориентир мозга для геометрического морфометрического анализа: исследование ошибок» . PLOS ONE . 9 (1): e86005. Bibcode : 2014PLoSO ... 986005C . DOI : 10.1371 / journal.pone.0086005 . PMC 3904856 . PMID 24489689 .  
  8. ^ Маркус, LF (1990). Глава 4. Традиционная морфометрия. В трудах Мичиганского морфометрического семинара. Специальная публикация № 2. FJ Rohlf и FL Bookstein. Анн-Арбор, М. И., Музей зоологии Мичиганского университета: 77–122.
  9. ^ Синглтон, М .; Розенбергер, А.Л .; Робинсон, С .; О'Нил, Р. (2011). «Изменение Аллометрический и метамерный форму в Pan моляров нижней челюсти: Цифровой морфометрического анализа». Анатомическая запись . 294 (2): 322–334. DOI : 10.1002 / ar.21315 . PMID 21235007 . S2CID 17561423 .  
  10. ^ а б Букштейн, Флорида (1991). Морфометрические инструменты для ориентировочных данных: геометрия и биология . Кембридж: Издательство Кембриджского университета.
  11. ^ Зельдич, М .; Дерево, АР; Капот, RM; Свидерски, Д.Л. (2008). «Модульность нижней челюсти грызунов: объединение мышц, костей и зубов» (PDF) . Эволюция и развитие . 10 (6): 756–768. DOI : 10.1111 / j.1525-142X.2008.00290.x . ЛВП : 2027,42 / 73767 . PMID 19021747 . S2CID 112076 .   
  12. ^ Mitteroecker, P; Букштейн, Флорида (2008). «Эволюционная роль модульности и интеграции в черепе гоминоидов» . Эволюция . 62 (4): 943–958. DOI : 10.1111 / j.1558-5646.2008.00321.x . PMID 18194472 . S2CID 23716467 .  
  13. Перейти ↑ Kendall, DG (1977). «Распространение формы». Достижения в прикладной теории вероятностей . 9 (3): 428–430. DOI : 10.2307 / 1426091 . JSTOR 1426091 . 
  14. ^ Rohlf, FJ; Слайс, Д. (1990). «Расширения метода Прокруста для оптимального наложения ориентиров». Систематическая зоология . 39 (1): 40–59. CiteSeerX 10.1.1.547.626 . DOI : 10.2307 / 2992207 . JSTOR 2992207 .  
  15. ^ Уокер, Дж. (2000). «Способность геометрических морфометрических методов оценивать известную ковариационную матрицу» . Систематическая биология . 49 (4): 686–696. DOI : 10.1080 / 106351500750049770 . PMID 12116434 . 
  16. ^ Миллер, Майкл I .; Юнес, Лоран; Труве, Ален (18 ноября 2013 г.). «Диффеоморфометрия и системы геодезического позиционирования для анатомии человека» . Технологии . 2 (1): 36–43. DOI : 10.1142 / S2339547814500010 . ISSN 2339-5478 . PMC 4041578 . PMID 24904924 .   
  17. ^ Гренандер, Ульф; Миллер, Майкл И. (1998-12-01). «Вычислительная анатомия: новая дисциплина» . В. Прил. Математика . LVI (4): 617–694. DOI : 10.1090 / QAM / 1668732 . ISSN 0033-569X . 
  18. ^ Christensen, GE; Rabbitt, RD; Миллер, Мичиган (1 января 1996 г.). «Деформируемые шаблоны с использованием кинематики больших деформаций». IEEE Transactions по обработке изображений . 5 (10): 1435–1447. Bibcode : 1996ITIP .... 5.1435C . DOI : 10.1109 / 83.536892 . ISSN 1057-7149 . PMID 18290061 .  
  19. ^ "Стнава / АНЦ" . GitHub . Проверено 11 декабря 2015 .
  20. ^ Ashburner, Джон (2007-10-15). «Быстрый алгоритм регистрации диффеоморфных изображений». NeuroImage . 38 (1): 95–113. DOI : 10.1016 / j.neuroimage.2007.07.007 . ISSN 1053-8119 . PMID 17761438 . S2CID 545830 .   
  21. ^ "Программное обеспечение - Том Веркаутерен" . sites.google.com . Проверено 11 декабря 2015 .
  22. ^ «NITRC: LDDMM: Информация об инструменте / ресурсе» . www.nitrc.org . Проверено 11 декабря 2015 .
  23. ^ "Публикация: Сравнение алгоритмов диффеоморфной регистрации: стационарный LDDMM и диффеоморфные демоны" . www.openaire.eu . Архивировано из оригинала на 2016-02-16 . Проверено 11 декабря 2015 .
  24. ^ Ф. Бег; М. Миллер; А. Труве; Л. Юнес (февраль 2005 г.). «Вычисление метрических отображений большой деформации с помощью геодезических потоков диффеоморфизмов». Международный журнал компьютерного зрения . 61 (2): 139–157. DOI : 10.1023 / B: visi.0000043755.93987.aa . S2CID 17772076 . 
  25. ^ Миллер, Мичиган; Юнес, Л. (01.01.2001). «Групповые действия, гомеоморфизмы и сопоставление: общие рамки». Международный журнал компьютерного зрения . 41 : 61–84. CiteSeerX 10.1.1.37.4816 . DOI : 10,1023 / A: 1011161132514 . S2CID 15423783 .  
  26. ^ Миллер, Майкл I .; Труве, Ален; Юнес, Лоран (01.01.2015). "Гамильтоновы системы и оптимальное управление в вычислительной анатомии: 100 лет после Д'Арси Томпсона". Ежегодный обзор биомедицинской инженерии . 17 : 447–509. DOI : 10,1146 / annurev-Bioeng-071114-040601 . ISSN 1545-4274 . PMID 26643025 .  
  27. ^ Роджерс, Маргарет (1982). «Описание образующей двустворчатых моллюсков с прямым шарниром». Палеонтология . 25 : 109–117.
  28. ^ Glassburn, TA (1995). «Новый палеонтологический метод описания временных изменений формы двустворчатых моллюсков миоцена». Палеонтология . 38 : 133–151.
  29. Перейти ↑ Lohmann, GP (1983). «Анализ собственной формы микрофоссилий: общая морфометрическая процедура для описания изменений формы». Математическая геология . 15 (6): 659–672. DOI : 10.1007 / BF01033230 . S2CID 120295975 . 
  30. ^ Ферсон, S .; Rohlf, FJ; Коэн, РК (1985). «Измерение вариации формы двумерных контуров». Систематическая зоология . 34 (1): 59–68. DOI : 10.2307 / 2413345 . JSTOR 2413345 . 
  31. ^ Для примера «в использовании» см. MacLeod, N .; Роуз, К.Д. (1 января 1993 г.). «Вывод локомоторного поведения у палеогеновых млекопитающих с помощью анализа собственной формы». Американский журнал науки . 293 (А): 300–355. Bibcode : 1993AmJS..293..300M . DOI : 10.2475 / ajs.293.A.300 .
  32. ^ например, Schmittbuhl, M .; Rieger, J .; Ле Минор, JM; Schaaf, A .; Гай, Ф. (2007). «Вариации формы нижней челюсти у современных гоминоидов: общая, специфическая и подвидовая количественная оценка с использованием эллиптического анализа Фурье в боковой проекции». Американский журнал физической антропологии . 132 (1): 119–31. DOI : 10.1002 / ajpa.20476 . PMID 17063462 . 
  33. ^ a b c Haines, AJ; Крэмптон, Дж. С. (2000). «Усовершенствования метода анализа формы Фурье, применяемого в морфометрических исследованиях». Палеонтология . 43 (4): 765–783. DOI : 10.1111 / 1475-4983.00148 .
  34. ^ Зельдич, ML; Свидерски, DL; Листы, HD; Финк, WL (2004). Геометрическая морфометрия для биологов: учебник . Сан-Диего: Elsevier Academic Press.
  35. ^ Зельдич, М .; Финк, W. L; Свидерски, Д. Л. (1995). «Морфометрия, гомология и филогенетика - количественные признаки как синапоморфии». Систематическая биология . 44 (2): 179–189. DOI : 10.1093 / sysbio / 44.2.179 .
  36. Перейти ↑ MacLeod, Norman (1999). «Обобщение и расширение метода собственных форм визуализации и анализа пространства форм». Палеобиология . 25 (1): 107–38. ISSN 1938-5331 . JSTOR 2665995 .  
  37. ^ Вольфрам, Стивен (2002). Новый вид науки . Wolfram Media, Inc. стр. 1010 . ISBN 978-1-57955-008-0.
  38. ^ Парсонс, KJ; Листы, HD; Skulason, S .; Фергюсон, ММ (2011). «Фенотипическая пластичность, гетерохрония и онтогенетическое воспроизводство паттерна при ювенильном развитии дивергентного арктического гольца ( Salvelinus alpinus )». Журнал эволюционной биологии . 24 (8): 1640–1652. DOI : 10.1111 / j.1420-9101.2011.02301.x . PMID 21599773 . S2CID 9741179 .  
  39. ^ Hollander, J .; Коллиер, М.Л .; Адамс, округ Колумбия; Йоханнессон, К. (2006). «Фенотипическая пластичность двух морских улиток: ограничения, вытесняющие историю жизни» . Журнал эволюционной биологии . 19 (6): 1861–1872. DOI : 10.1111 / j.1420-9101.2006.01171.x . PMID 17040383 . S2CID 17342939 .  
  40. ^ Гонсалес, ПН; Hallgrimsson, B .; Ойхенарт, EE (2011). «Пластичность развития ковариантной структуры черепа: эффекты пренатального стресса» . Журнал анатомии . 218 (2): 243–257. DOI : 10.1111 / j.1469-7580.2010.01326.x . PMC 3042757 . PMID 21138433 .  
  41. ^ Монтейро, LR; Ногейра, MR (2009). «Адаптивные излучения, экологическая специализация и эволюционная интеграция сложных морфологических структур» . Эволюция . 64 (3): 724–743. DOI : 10.1111 / j.1558-5646.2009.00857.x . PMID 19804403 . S2CID 5256038 .  
  42. ^ Дрейк, AG; Клингенберг, КП (2008). «Темпы морфологических изменений: историческая трансформация формы черепа у сенбернаров» . Труды Королевского общества B: биологические науки . 275 (1630): 71–76. DOI : 10.1098 / rspb.2007.1169 . PMC 2562403 . PMID 17956847 .  
  43. ^ Бернер, Д .; Адамс, округ Колумбия; Грандшамп, AC; Хендри, AP (2008). «Естественный отбор определяет модели дивергенции озерных ручьев в морфологии кормодобывания колюшки» . Журнал эволюционной биологии . 21 (6): 1653–1665. DOI : 10.1111 / j.1420-9101.2008.01583.x . PMID 18691241 . S2CID 11184677 .  
  44. ^ Swiderski, DL; Зельдич, ML (2010). «Морфологическое разнообразие, несмотря на изометрическое масштабирование плеч рычагов». Эволюционная биология . 37 : 1–18. DOI : 10.1007 / s11692-010-9081-8 . S2CID 39484740 . 
  45. ^ Mitteroecker, P .; Gunz, P .; Букштейн, Флорида (2005). «Гетерохрония и геометрическая морфометрия: сравнение роста черепа у Pan paniscus и Pan troglodyte s». Эволюция и развитие . 7 (3): 244–258. CiteSeerX 10.1.1.460.8419 . DOI : 10.1111 / j.1525-142x.2005.05027.x . PMID 15876197 . S2CID 14370905 .   
  46. ^ Фредерих, B .; Adriaens, D .; Вандевалле, П. (2008). «Онтогенетические изменения формы Pomacentridae (Teleostei, Perciformes) и их отношения со стратегиями питания: геометрический морфометрический подход» . Биологический журнал Линнеевского общества . 95 : 92–105. DOI : 10.1111 / j.1095-8312.2008.01003.x .
  47. ^ Зельдич, ML; Листы, HD; Финк, WL (2003). «Онтогенетическая динамика неравенства форм». Палеобиология . 29 : 139–156. DOI : 10.1666 / 0094-8373 (2003) 029 <0139: todosd> 2.0.co; 2 .
  48. ^ Hallgrímsson, B .; Браун, JJY; Форд-Хатчинсон, AF; Листы, HD; Зельдич, М.Л .; Джирик, FR (2006). «Брахиморфная мышь и онтогенетическая основа канализации и морфологической интеграции» (PDF) . Эволюция и развитие . 8 (1): 61–73. DOI : 10.1111 / j.1525-142x.2006.05075.x . ЛВП : 2027,42 / 71779 . PMID 16409383 . S2CID 42887577 .   
  49. ^ Hallgrímsson, B .; Либерман, ДЕ; Liu, W .; Форд-Хатчинсон, AF; Джирик, FR (2007). «Эпигенетические взаимодействия и структура фенотипической изменчивости черепа» . Эволюция и развитие (Представленная рукопись). 9 (1): 76–91. DOI : 10.1111 / j.1525-142x.2006.00139.x . PMID 17227368 . S2CID 14230925 .  
  50. ^ Клингенберг, CP; Мебус, К .; Оффрей, JC (2003). «Интеграция развития в сложной морфологической структуре: насколько отличны модули в нижней челюсти мыши?». Эволюция и развитие . 5 (5): 522–531. DOI : 10.1046 / j.1525-142x.2003.03057.x . PMID 12950630 . S2CID 17447408 .  
  51. ^ Клингенберг, CP; Заклан, С.Д. (2000). «Морфологическая интеграция между отделами развития в крыле дрозофилы ». Эволюция . 54 (4): 1273–1285. DOI : 10.1111 / j.0014-3820.2000.tb00560.x . PMID 11005294 . S2CID 221539997 .  
  52. ^ Маршалл, Эшли Ф .; Бардуа, Карла; Гауэр, Дэвид Дж .; Уилкинсон, Марк; Шеррат, Эмма; Госвами, Анджали (2019). «Трехмерные морфометрические анализы высокой плотности подтверждают сохранение статической (внутривидовой) модульности слепого черепа (Amphibia: Gymnophiona)» . Биологический журнал Линнеевского общества . 126 (4): 721–742. DOI : 10.1093 / biolinnean / blz001 .
  53. Перейти ↑ Revell PA (декабрь 1983 г.). «Гистоморфометрия кости» . J. Clin. Патол . 36 (12): 1323–31. DOI : 10.1136 / jcp.36.12.1323 . PMC 498562 . PMID 6361070 .  
  54. ^ Ходжсон SF; Джонсон, KA; Muhs, JM; Lufkin, EG; Маккарти, Дж. Т. (январь 1986 г.). «Амбулаторная чрескожная биопсия гребня подвздошной кости: методы, заболеваемость и приемлемость для пациентов». Mayo Clin Proc . 61 (1): 28–33. DOI : 10.1016 / s0025-6196 (12) 61395-0 . PMID 3941566 . 
  55. ^ Мора, Л., Бонифас, Р., Лопес-Мартинес, Р. (2016). "Unidades geomorfológicas de la cuenca del Río Grande de Comitán, Лагос-де-Монтебелло, Чьяпас-Мексика" . Boletín de la Sociedad Geológica Mexicana (на испанском языке). 68 (3): 377–394. DOI : 10,18268 / BSGM2016v68n3a1 .CS1 maint: несколько имен: список авторов ( ссылка )

Библиография [ править ]

  • Адамс, Дин К .; Майкл Л. Коллайер (2009). «Общая основа для анализа фенотипических траекторий в эволюционных исследованиях». Эволюция . 63 (5): 1143–1154. DOI : 10.1111 / j.1558-5646.2009.00649.x . PMID  19210539 . S2CID  1873905 .
  • Букштейн, Фред (1991). Морфометрические инструменты для ориентировочных данных: геометрия и биология . Кембридж: Издательство Кембриджского университета. ISBN 978-0-521-58598-9.
  • Кадрин, Стивен X. (2000). «Успехи в морфометрической идентификации рыбных запасов». Обзоры по биологии рыб и рыболовству . 10 : 91–112. DOI : 10,1023 / A: 1008939104413 . S2CID  25658507 .
  • Елева, AMT, редактор (2004). Морфометрия: приложения в биологии и палеонтологии . Берлин: Springer. ISBN 978-3-540-21429-8.
  • Klingenberg, CP; Н.А. Гидашевский (2010). «Тестирование и количественная оценка филогенетических сигналов и гомоплазии в морфометрических данных» . Систематическая биология . 59 (3): 245–261. DOI : 10.1093 / sysbio / syp106 . PMID  20525633 .
  • Маклеллан, Трейси; Эндлер, Джон А. (1998). «Относительный успех некоторых методов измерения и описания формы сложных объектов» . Систематическая биология . 47 (2): 264–81. DOI : 10.1080 / 106351598260914 . ISSN  1076-836X . JSTOR  2585371 .
  • Rohlf, FJ; Д. Слайс (1990). «Расширения метода Прокруста для оптимального наложения ориентиров». Систематическая зоология . 10 (39): 40–59. CiteSeerX  10.1.1.547.626 . DOI : 10.2307 / 2992207 . JSTOR  2992207 .

Внешние ссылки [ править ]

  • Дикинсон, Т.А. (2001). «Морфометрические методы» . Проверено 9 октября 2016 .
  • ПРОШЛЫЙ
  • SHAPE - Эллиптические дескрипторы Фурье
  • Программное обеспечение для морфометрии - Архив различных типов программного обеспечения для использования в морфометрии, особенно геометрической морфометрии.