Памела А. Сильвер - американский биолог, системный биолог и биоинженер. Она имеет звание профессора биохимии и системной биологии Эллиота Т. и Они Х. Адамс в Гарвардской медицинской школе на факультете системной биологии. Сильвер - один из основных преподавателей Института биологической инженерии Висса при Гарвардском университете .
Памела Сильвер | |
---|---|
Родившийся | Памела Энн Сильвер |
Национальность | Американец |
Альма-матер |
|
Научная карьера | |
Учреждения | |
Тезис | Механизмы сборки мембраны: исследования ассоциации интегрального белка с биологическими мембранами (1982) |
Докторант | Уильям Т. Викнер |
Докторанты | Кристина Агапакис , Валери Вайс |
Другие известные студенты | Кармелла Хейнс Кэролайн Аджо-Франклин |
Веб-сайт | серебро |
Она внесла вклад в другие дисциплины, включая клеточную и ядерную биологию, [1] [2] [3] системную биологию, [4] [5] биологию РНК, [6] [7] [8] терапию рака, [9] международную политические исследования и последипломное образование. Сильвер был первым директором программы магистратуры Гарвардского университета по системной биологии . Она является членом Национального научного консультативного совета по биобезопасности. [10]
Образование и ранняя жизнь
Сильвер выросла в Атертоне, Калифорния, где она училась в начальной школе Лорел и Энсинал. За это время она стала победителем конкурса IBM Math Competition, выиграла логарифмическую линейку [11] и получила особое признание за свои ранние способности к науке. Она училась в Средней школе Менло Атертон и окончила школу Кастильеха в Пало-Альто. Она получила степень бакалавра химии в Калифорнийском университете в Санта-Круз и докторскую степень по биологической химии в Калифорнийском университете в Лос-Анджелесе в лаборатории Уильяма Т. Викнера , работая в основном над сборкой оболочки колифага M13. [12] [ необходима ссылка ]
Карьера и исследования
Сильвер провела свои постдокторские исследования с Марком Пташне в Гарвардском университете, где она обнаружила одну из первых последовательностей ядерной локализации. [13] [14] Она продолжала изучать механизм ядерной локализации в своей лаборатории в качестве доцента в Принстонском университете . За это время она охарактеризовала рецептор NLS и открыла один из первых эукариотических шаперонов DnaJ. [15]
Сильвер продолжил работу в области клеточной биологии после того, как перешел в Институт рака Даны Фарбер, чтобы провести расследование Клаудии Адамс Барр и стать доцентом биологической химии и молекулярной фармакологии в Гарвардской медицинской школе и Дана-Фарбер. За это время она была одной из первых, кто проследил за белками, меченными GFP, в живых клетках. [16] Кроме того, она инициировала ранние исследования в области системной биологии, чтобы изучить взаимодействия внутри ядра в масштабе всего генома. [17] Вместе с Биллом Селлерсом она открыла молекулы, которые блокируют ядерный экспорт [18], и легла в основу публичной компании Karyopharm Therapeutics. В 1997 году она была повышена до профессора биологической химии и молекулярной фармакологии в Гарвардской медицинской школе и Дана-Фарбер.
В 2004 году Сильвер перешел на недавно созданный факультет системной биологии Гарвардской медицинской школы в качестве профессора. Примерно в это же время она тесно сотрудничала с Рабочей группой по синтетической биологии Массачусетского технологического института и приняла решение перевести свою исследовательскую группу в синтетическую биологию . Она наблюдала движение органелл, фиксирующих углерод, у фотосинтезирующих бактерий. [19] Она много работала над созданием модифицированных бактерий, которые выступали бы в качестве сенсоров воздействия лекарственного вещества [20] или воспаления [21] в кишечнике млекопитающих. Она работала директором проекта ARPA-E (DOE) по электротопливу.
Синтетическая биология
Некоторые из работ Сильвера в этой области включают разработку: клеток млекопитающих для запоминания и отчетности о прошлом воздействии лекарств и радиации, [22] [23] [24] надежных вычислительных схем в эмбриональных стволовых клетках и бактериях [25] и синтетических переключателей. для уменьшения сайленсинга генов за счет интеграции новых терапевтических белков. [26] [27] Работа Сильвера закладывает основу для разработки новых методов лечения как для людей, так и для животных.
Фиксация углерода и устойчивость
Серебро характеризует карбоксисому - главную структуру, связывающую углерод у цианобактерий - для повышения эффективности фотосинтеза [28] и фиксации углерода. [29] Она также сконструировала цианобактерии для более эффективного превращения углерода в дорогостоящие товары и показала, что эти бактерии могут образовывать устойчивые консорциумы. [30] В сотрудничестве с Джессикой Полька Сильвер выполнил микроскопию β-карбоксисомы сверхвысокого разрешения . [31]
Сильвер сотрудничал с Дэниелом Ночера из Гарвардского университета, чтобы разработать устройство, названное « Бионический лист », которое преобразует солнечную энергию в топливо с помощью гибридной каталитической системы расщепления воды, которая использует метаболически модифицированные бактерии. [32]
Генная регуляция
Сильвер обнаружила корреляцию между ядерным транспортом и регуляцией генов - она идентифицировала первую аргининметилтрансферазу, которая играет роль в функции хроматина и важна для перемещения связывающих РНК белков между ядром и цитоплазмой клеток. Она также обнаружила ранее неизвестные вариации среди рибосом, что привело ее к предложению уникальной специфичности для соответствия между рибосомами и последующей трансляции мРНК. Открытие Сильвера имеет несколько значений для нашего понимания того, как регуляция генов влияет на развитие болезней, таких как рак. [33]
Награды
Сильвер был лауреатом президентской премии NSF для молодых исследователей, стипендиата Марша десятицентовиков Бэзила О'Коннора, признанного исследователя Американской кардиологической ассоциации, лекции директоров NIH и награды NIH MERIT, награды за инновации в BIO, научный сотрудник Института перспективных исследований Рэдклиффа, профессора Эллиота Т. и Они Х. Адамс в Гарвардской медицинской школе и назван 20-тью глобальными влиятельными лицами в области синтетической биологии. Она входит в состав многочисленных консультативных советов и представляла интересы членов Конгресса США.
Серебро было удостоено награды BBS Mentoring Award за высшее образование в Гарвардской медицинской школе. Она также является одним из основателей Международного конкурса генно-инженерных машин (iGEM) и в настоящее время входит в совет директоров iGEM.org. Сильвер основал и был первым директором программы магистратуры Гарвардского университета по системной биологии. Сильвер был избран в Американскую академию искусств и наук в 2017 году [34].
Внешние ссылки
- Серебряная лаборатория
- Серебряная страница профиля, Институт Висса
- Департамент системной биологии Гарварда
- Программа PhD по системной биологии
- iGEM
Рекомендации
- ^ Джейсон Кахана; Брюс Дж. Шнапп; Памела Сильвер (10 октября 1995 г.). «Кинетика разделения тел полюса веретена у почкующихся дрожжей» . Труды Национальной академии наук . 92 (21): 9707–9711. Bibcode : 1995PNAS ... 92.9707K . DOI : 10.1073 / pnas.92.21.9707 . PMC 40871 . PMID 7568202 .
- ^ PA Silver; Л. П. Киган; М. Пташине (1 октября 1984 г.). «Амино-конец продукта дрожжевого гена GAL4 достаточен для ядерной локализации» . Труды Национальной академии наук . 81 (19): 5951–5. Bibcode : 1984PNAS ... 81.5951S . DOI : 10.1073 / pnas.81.19.5951 . PMC 391836 . PMID 6091123 .
- ^ Casolari, JM; Браун, CR; Комили, С .; West, J .; Иероним, Х. и Сильвер, Пенсильвания (14 мая 2004 г.). «Полногеномная локализация ядерного транспортного механизма показывает связь транскрипционного статуса и ядерной организации». Cell . 117 (4): 427–439. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (04) 00448-9 . PMID 15137937 . S2CID 8932425 .
- ^ Джейсон С. Кэрролл; X Ширли Лю; Александр С Бродский; Вэй Ли; Клиффорд Мейер; Анна Ж. Сари; Джером Экхаут; Вэньлинь Шао; Эли В. Хестерманн; Тимоти Р. Гейстлингер; Эдвард Фокс; Памела Сильвер; Майлз Браун (15 июля 2005 г.). «Хромосомное картирование связывания рецептора эстрогена выявляет дальнодействующую регуляцию, требующую белка лба FoxA1» . Cell . 122 (1): 33–43. DOI : 10.1016 / j.cell.2005.05.008 . PMID 16009131 . S2CID 16841542 . Проверено 6 мая 2015 года .
- ^ Хейли Иероним; Памела А Сильвер (1 февраля 2003 г.). «Полногеномный анализ взаимодействий РНК-белок иллюстрирует специфичность механизма экспорта мРНК». Генетика природы . 33 (2): 155–161. DOI : 10.1038 / ng1080 . PMID 12524544 . S2CID 25722385 .
- ^ Майкл Дж. Мур; Цинцин Ван; Калеб Дж. Кеннеди; Памела Сильвер (20 августа 2010 г.). «Альтернативная сеть сплайсинга связывает контроль клеточного цикла с апоптозом» . Cell . 142 (4): 625–636. DOI : 10.1016 / j.cell.2010.07.019 . PMC 2924962 . PMID 20705336 .
- ^ Элиза Си Шен; Майкл Ф. Генри; Валери Х. Вайс; Сандро Валентини; Памела Сильвер; Маргарет С. Ли (1 марта 1998 г.). «Метилирование аргинина облегчает ядерный экспорт белков hnRNP» . Гены и развитие . 12 (5): 679–691. DOI : 10,1101 / gad.12.5.679 . PMC 316575 . PMID 9499403 .
- ^ Маргарет С. Ли; Майкл Генри; Памела Сильвер (15 мая 1996 г.). «Белок, который перемещается между ядром и цитоплазмой, является важным медиатором экспорта РНК» . Гены и развитие . 10 (10): 1233–1246. DOI : 10,1101 / gad.10.10.1233 . PMID 8675010 .
- ^ Твины Р. Кау; Фрэнк Шредер; Шиваприя Рамасвами; Шерил Л. Войцеховски; Жан Дж. Чжао; Томас М. Робертс; Джон Кларди ; Уильям Р. Селлерс; Памела А Сильвер (31 декабря 2003 г.). «Химический генетический скрининг выявляет ингибиторы регулируемого ядерного экспорта фактора транскрипции Forkhead в опухолевых клетках с дефицитом PTEN». Раковая клетка . 4 (6): 463–476. DOI : 10.1016 / S1535-6108 (03) 00303-9 . PMID 14706338 .
- ^ «Национальный научный консультативный совет по биобезопасности (NSABB)» . Управление научной политики . Проверено 16 января 2021 года .
- ^ «Памела Сильвер из Гарварда вспоминает путь из Кремниевой долины к синтетической биологии» . Harvard Gazette . 16 мая 2017 года . Проверено 19 января 2019 года .
- ^ Серебро, П .; Watts, C .; Викнер, В. (август 1981 г.). «Мембранная сборка из очищенных компонентов. I. Изолированная оболочка M13 не требует рибосом или растворимых белков для обработки мембранами». Cell . 25 (2): 341–345. DOI : 10.1016 / 0092-8674 (81) 90052-0 . ISSN 0092-8674 . PMID 7026042 . S2CID 24764847 .
- ^ Серебро, П .; Киган, Л. и Пташне, М. (1984). «Аминоконец продукта гена GAL4 дрожжей достаточен для ядерной локализации» . Proc. Natl. Акад. Sci. США . 81 (19): 5951–5. Bibcode : 1984PNAS ... 81.5951S . DOI : 10.1073 / pnas.81.19.5951 . PMC 391836 . PMID 6091123 .
- ^ Серебро, П .; Чанг А. и Сэдлер И. (1988). «Мутации, влияющие на локализацию и производство ядерного белка дрожжей» . Гены и развитие . 2 (6): 707–17. DOI : 10,1101 / gad.2.6.707 . PMID 3138162 .
- ^ Блумберг, Х. и Сильвер, П. (1991). «SCJ1, гомолог DNAJ, который изменяет сортировку белков в дрожжах». Природа . 349 (6310): 627–30. DOI : 10.1038 / 349627a0 . PMID 2000136 . S2CID 4358892 .
- ^ Kahana, J .; Шнапп Б. и Сильвер П. (1995). «Кинетика разделения тел полюса веретена у почкующихся дрожжей» . Proc. Natl. Акад. Sci . 92 (21): 9707–9711. Bibcode : 1995PNAS ... 92.9707K . DOI : 10.1073 / pnas.92.21.9707 . PMC 40871 . PMID 7568202 .
- ^ Casolari, J .; Браун, CR; Комили, С .; West, J .; Иероним, Х. и Сильвер, Пенсильвания. (2004). «Полногеномная локализация ядерного транспортного механизма показывает связь транскрипционного статуса и ядерной организации». Cell . 117 (4): 427–439. DOI : 10.1016 / s0092-8674 (04) 00448-9 . PMID 15137937 . S2CID 8932425 .
- ^ Кау, TR; Schroeder, F; Wojciechowski, C .; Чжоу, JJ; Робертс, Т .; Кларди, Дж; Продавцы, W & Silver, PA. (2003). «Химический генетический скрининг ингибиторов регулируемого экспорта фактора транскрипции Forkhead в опухолевые клетки». Раковая клетка . 4 (6): 463–476. DOI : 10.1016 / s1535-6108 (03) 00303-9 . PMID 14706338 .
- ^ Сэвидж Д., Афонсу Б., Сильвер ПА (2010). «Пространственно упорядоченная динамика машины бактериальной фиксации углерода». Наука . 327 (5970): 1258–61. Bibcode : 2010Sci ... 327.1258S . DOI : 10.1126 / science.1186090 . PMID 20203050 . S2CID 36685539 .
- ^ Котула Дж. У., Кернс С. Дж., Шакет Л. А., Сирадж Л., Коллинз Дж. Дж., Уэй Дж. К., Сильвер, Пенсильвания (1 апреля 2014 г.). «Программируемые бактерии обнаруживают и записывают сигнал окружающей среды в кишечнике млекопитающих» . Труды Национальной академии наук . 111 (13): 4838–4843. Bibcode : 2014PNAS..111.4838K . DOI : 10.1073 / pnas.1321321111 . PMC 3977281 . PMID 24639514 .
- ^ Риглар, Дэвид Т .; Giessen, Tobias W .; Байм, Михаил; Кернс, С. Джордан; Niederhuber, Matthew J .; Бронсон, Родерик Т .; Котула, Джонатан В .; Гербер, Георг К .; Уэй, Джеффри К. (июль 2017 г.). «Сконструированные бактерии могут долгое время функционировать в кишечнике млекопитающих как живые средства диагностики воспаления» . Природа Биотехнологии . 35 (7): 653–658. DOI : 10.1038 / nbt.3879 . ISSN 1546-1696 . PMC 5658125 . PMID 28553941 .
- ^ Аджо-Франклин, CM; Друбин Д.А. Eskin, J .; Ну и дела, E .; Landgraf, D .; Филипс, И. и Сильвер, Пенсильвания. (15 сентября 2007 г.). «Рациональный дизайн памяти в эукариотических клетках» . Гены и развитие . 21 (18): 2271–2276. DOI : 10,1101 / gad.1586107 . PMC 1973140 . PMID 17875664 .
- ^ Беррилл Д., Сильвер ПА (2011). «Синтетическая схема идентифицирует субпопуляции с устойчивой памятью о повреждении ДНК» . Гены и развитие . 25 (5): 434–439. DOI : 10,1101 / gad.1994911 . PMC 3049284 . PMID 21363961 .
- ^ Burrill DR, Inniss MC, Boyle PM, Silver PA (1 июля 2012 г.). «Синтетические схемы памяти для отслеживания судьбы клеток человека» . Гены и развитие . 26 (13): 1486–1497. DOI : 10,1101 / gad.189035.112 . PMC 3403016 . PMID 22751502 .
- ^ Робинсон-Мошер А., Чен Дж. Х., Уэй Дж., Сильвер ПА (18 ноября 2014 г.). «Разработка терапевтических белков, нацеленных на клетки, выявляет взаимодействие между связностью доменов и связыванием клеток» . Биофизический журнал . 107 (10): 2456–2466. Bibcode : 2014BpJ ... 107.2456R . DOI : 10.1016 / j.bpj.2014.10.007 . PMC 4241446 . PMID 25418314 .
- ^ Хейнс К.А., Сильвер ПА (5 августа 2011 г.). «Синтетическое изменение эпигенетического молчания» . Журнал биологической химии . 286 (31): 27176–27182. DOI : 10.1074 / jbc.C111.229567 . PMC 3149311 . PMID 21669865 .
- ^ Александр А. Грин; Памела А. Сильвер; Джеймс Дж. Коллинз и Пэн Инь (6 ноября 2014 г.). «Переключатели Toehold: разработанные De-Novo регуляторы экспрессии генов» (PDF) . Cell . 159 (4): 925–39. DOI : 10.1016 / j.cell.2014.10.002 . PMC 4265554 . PMID 25417166 . Проверено 7 мая 2015 года .
- ^ Ducat DC, Avelar-Rivas JA, Way JC, Silver PA (апрель 2012 г.). «Изменение направления потока углерода для повышения продуктивности фотосинтеза» . Прикладная и экологическая микробиология . 78 (8): 2660–2668. DOI : 10,1128 / AEM.07901-11 . PMC 3318813 . PMID 22307292 .
- ^ Дукат, округ Колумбия, Сильвер, Пенсильвания (август 2012 г.). «Улучшение углеродных путей» . Текущее мнение в химической биологии . 16 (3–4): 337–344. DOI : 10.1016 / j.cbpa.2012.05.002 . PMC 3424341 . PMID 22647231 .
- ^ Полька Дж., Сильвер ПА (1 декабря 2013 г.). «Построение синтетической клеточной организации» . Молекулярная биология клетки . 24 (23): 3585–3587. DOI : 10,1091 / mbc.E13-03-0155 . PMC 3842987 . PMID 24288075 .
- ^ Niederhuber, Matthew J .; Ламберт, Талли Дж .; Япп, Кларенс; Серебро, Памела А .; Полька, Джессика К. (1 октября 2017 г.). «Микроскопия сверхвысокого разрешения β-карбоксисомы выявляет гомогенный матрикс» . Молекулярная биология клетки . 28 (20): 2734–2745. DOI : 10,1091 / mbc.E17-01-0069 . ISSN 1939-4586 . PMC 5620380 . PMID 28963440 .
- ^ Торелла Дж. П., Гальярди С. Дж., Чен Дж. С., Бедиако Д. К., Колон Б., Вэй Дж. К., Сильвер П. А., Ночера Д. Г. (24 февраля 2015 г.). «Эффективное производство топлива из солнечной энергии с помощью гибридной каталитической системы с микробиологическим расщеплением воды» . Труды Национальной академии наук . 112 (8): 2337–2342. Bibcode : 2015PNAS..112.2337T . DOI : 10.1073 / pnas.1424872112 . PMC 4345567 . PMID 25675518 .
- ^ Ю. М.К., Ламминг Д. В., Эскин Дж. А., Синклер Д. А., Сильвер ПА (1 декабря 2006 г.). «Роль метилирования аргинина в образовании молчащего хроматина» . Гены и развитие . 20 (23): 3249–3254. DOI : 10,1101 / gad.1495206 . PMC 1686602 . PMID 17158743 .
- ^ «Новоизбранные стипендиаты» . www.amacad.org . Проверено 1 мая 2017 года .