Празиновирус

Празиновирус

Негативное окрашенное изображение MpV-SP1
Классификация вирусов
(без рейтинга):	Вирус
Царство :	Вариднавирия
Царство:	Bamfordvirae
Тип:	Nucleocytoviricota
Класс:	Megaviricetes
Приказ:	Альгавиралес
Семья:	Phycodnaviridae
Род:	*Празиновирус*
Типовой вид
Вирус Micromonas pusilla SP1

Prasinovirus - это род крупных вирусов с двухцепочечной ДНКв семействе Phycodnaviridae, которые заражают фитопланктон у Prasinophyceae . В настоящее время существует только два вида этого рода, включая типовой вид вируса Micromonas pusilla SP1 ,^[1]^[2], который инфицирует космополитичную фотосинтетическую жгутиконосную жгутик Micromonas pusilla . ^[3] Однако существует большая группа генетически разнообразных, но родственных вирусов, которые демонстрируют значительные доказательства латерального переноса генов . ^[4]^[5]

Таксономия [ править ]

Диаграмма Венна общих кодирующих последовательностей (CDS) четырех MpV и M. pusilla UTEX LB991, основанная на кластерах по 0,5 аминокислотной идентичности. Пунктирные кружки представляют гены-хозяева, общие с вирусами ^[5] .

Группа: dsDNA

Заказ: Альгавиралес

Семья: Phycodnaviridae
- Род: Prasinovirus
  Вирус Micromonas pusilla SP1
  Вирус Ostreococcus tauri OtV5

^[2]

Структура [ править ]

Схематический рисунок типичного вириона Phycodnaviridae (поперечный разрез и вид сбоку)

Вирусы в Prasinovirus имеют оболочку с икосаэдрической и круглой геометрией и симметрией T = 169. Диаметр составляет порядка 104-118 нм. ^[1]

Род	Состав	Симметрия	Капсид	Геномное расположение	Геномная сегментация
Празиновирус	Икосаэдр	Т = 169	Окутанный	Линейный	Одночастный

Жизненный цикл [ править ]

Репликация вируса нуклео-цитоплазматическая. Репликация следует модели смещения цепи ДНК. Транскрипция с использованием шаблонов ДНК - это метод транскрипции. Вирус покидает клетку-хозяина путем лизиса с помощью литических фосфолипидов. Водоросли служат естественным хозяином. Пути передачи - пассивное распространение. ^[1]

Род	Детали хоста	Тканевый тропизм	Детали входа	Детали выпуска	Сайт репликации	Сайт сборки	Передача инфекции
Празиновирус	Водоросль	Никто	Эндоцитоз клеточных рецепторов	Лизис	Ядро	Цитоплазма	Пассивная диффузия

Ссылки [ править ]

^ ^a ^b ^c «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года .
^ а б ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.» . Проверено 15 июня 2015 года .
^ Коттрелл, Мэтью Т .; Саттл, Кертис А. (1991). «Широкое распространение и клональная изменчивость вирусов, вызывающих лизис космополитичного, эукариотического морского фитопланктера« Micromonas pusilla » » . Серия «Прогресс морской экологии» . 78 : 1–9. Bibcode : 1991MEPS ... 78 .... 1C . DOI : 10,3354 / meps078001 . ISSN 1616-1599 .
^ Bellec, Laure; Гримсли, Найджел; Дерелль, Эвелин; Моро, Эрве; Desdevises, Ив (2010). «Численность, пространственное распространение и генетическое разнообразие вирусов Ostreococcus tauri в двух различных средах». Отчеты по микробиологии окружающей среды . 2 (2): 313–321. DOI : 10.1111 / j.1758-2229.2010.00138.x . PMID 23766083 .
^ а б Финке, Ян Ф; Winget, Danielle M; Чан, Эми М; Саттл, Кертис А. (2017). «Вариация генетического репертуара вирусов, заражающих Micromonas pusilla, отражает горизонтальный перенос генов и связь с их распространением в окружающей среде» . Вирусы . 9 (5): 116. DOI : 10,3390 / v9050116 . PMC 5454428 . PMID 28534829 .

Внешние ссылки [ править ]

Вирусная зона : празиновирус
ICTV

[ViralZone-1] «Вирусная зона» . ExPASy . Проверено 15 июня 2015 года .

[ICTV-2] а б ICTV. «Таксономия вирусов: выпуск 2014 г.» . Проверено 15 июня 2015 года .

[3] Коттрелл, Мэтью Т .; Саттл, Кертис А. (1991). «Широкое распространение и клональная изменчивость вирусов, вызывающих лизис космополитичного, эукариотического морского фитопланктера« Micromonas pusilla » » . Серия «Прогресс морской экологии» . 78 : 1–9. Bibcode : 1991MEPS ... 78 .... 1C . DOI : 10,3354 / meps078001 . ISSN 1616-1599 .

[4] Bellec, Laure; Гримсли, Найджел; Дерелль, Эвелин; Моро, Эрве; Desdevises, Ив (2010). «Численность, пространственное распространение и генетическое разнообразие вирусов Ostreococcus tauri в двух различных средах». Отчеты по микробиологии окружающей среды . 2 (2): 313–321. DOI : 10.1111 / j.1758-2229.2010.00138.x . PMID 23766083 .

[Finke_2017-5] а б Финке, Ян Ф; Winget, Danielle M; Чан, Эми М; Саттл, Кертис А. (2017). «Вариация генетического репертуара вирусов, заражающих Micromonas pusilla, отражает горизонтальный перенос генов и связь с их распространением в окружающей среде» . Вирусы . 9 (5): 116. DOI : 10,3390 / v9050116 . PMC 5454428 . PMID 28534829 .

[1]