Тристромавирусы


Tristromaviridae семейство вирусов. [1] Археи родов Thermoproteus и Pyrobaculum служат естественными хозяевами. [2] Tristromaviridae — единственное семейство в отряде Primavirales . В роду два рода и три вида. [3]

Вирусы рода Tristromaviridae имеют оболочку палочковидной формы. Диаметр около 38 нм, длина 410 нм. Геномы линейны, имеют длину около 15,9 т.п.н. Вирион TTV1 содержит четыре белка, кодируемых вирусом, TP1-4. [2] [4] Белки не имеют сходства последовательностей со структурными белками вирусов других семейств, включая липотриксвирусы. Нуклеокапсидный белок TP1, по-видимому, произошел от эндонуклеазы Cas4, консервативного компонента адаптивного иммунитета CRISPR-Cas, что представляет собой первый описанный случай экзаптации фермента для функции капсидного белка вируса. [5]

Структура вириона с высоким разрешением была определена крио-ЭМ для нитчатого вируса Pyrobaculum 2 (PFV2), вируса, тесно связанного с PFV1, который представляет типовой вид. [6] Структура показала, что нуклеокапсид формируется из двух основных белков капсида (MCP1 и MCP2). MCP1 и MCP2 образуют гетеродимер, который обертывает линейный геном двухцепочечной ДНК, превращая его в А-форму. Взаимодействие между геномом и МЧК приводит к конденсации генома в суперспираль вириона. [6] Спиралевидный нуклеокапсид окружен липидной оболочкой и содержит другие вирусные белки, из которых наиболее распространен VP3. [7]

Складка MCP, а также организация вирионов тристромавирусов аналогичны таковым у членов семейств Rudiviridae [8] и Lipotrixviridae , [9] [10] , которые вместе составляют отряд Ligamenvirales . Из-за этого структурного сходства порядок Ligamenvirales и семейство Tristromaviridae было предложено объединить в рамках класса «Tokiviricetes» (toki означает «нить» на грузинском языке, а viricetes является официальным суффиксом для класса вирусов). [6]

Репликация вируса цитоплазматическая. Попадание в клетку-хозяин достигается за счет адсорбции на клетке-хозяине. Транскрипция на основе ДНК - это метод транскрипции. Естественными хозяевами служат археи родов Thermoproteus и Pyrobaculum . Вирионы высвобождаются путем лизиса. Пути передачи - пассивная диффузия. [2]