SeSaM-Biotech GmbH (сокращенно SeSaM-Biotech) - это сервисная компания в области биотехнологий, основанная в 2008 году в Бремене и локализованная сегодня в Аахене .
Тип | Частный |
---|---|
Промышленность | Биотехнологии , контрактная исследовательская организация |
Основан | 2008 г. |
Основатель | Ульрих Шванеберг, Университет Якобса, Бремен |
Штаб-квартира | , Германия |
Услуги | Проекты белковой инженерии, библиотеки генов, разработка анализов, консультации, вычислительный анализ |
Количество работников | 9 (2017) |
Веб-сайт | www |
Основное внимание компания уделяет проектам протеиновой инженерии, основанным на стратегии QuESt (качественные ферментные решения), и созданию библиотеки генов с использованием запатентованной платформы технологии Sequence Saturation Mutagenesis .
Компания
SeSaM-Biotech GmbH была основана в 2008 году как дочернее предприятие Университета Якобса в Бремене профессором Ульрихом Шванебергом, который в предыдущие годы разработал и улучшил запатентованную ключевую технологию Sequence Saturation Mutagenesis (SeSaM) [1] [2] [ 3] В 2012 году SeSaM-Biotech переехала в новое помещение в Институте интерактивных материалов им. Лейбница (DWI) в Аахене. [4] Сегодня это небольшая компания в растущем секторе биотехнологий, предоставляющая в основном услуги различным клиентам из отрасли биотехнологий. Начиная с создания библиотеки SeSaM, SeSaM-Biotech теперь применяет множество случайных и целенаправленных методов мутагенеза в сочетании с разработкой и применением высокопроизводительных скрининговых анализов для реализации обширных проектов белковой инженерии в соответствии со стратегией KnowVolution. [5] Кроме того, проводятся внутренние исследования для дальнейшего развития собственных технологий и расширения ассортимента продукции за пределы предоставления услуг по протеиновой инженерии.
Последовательность Насыщения Метод мутагенеза
SeSaM был разработан профессором Шванебергом и его группой с целью преодоления нескольких основных ограничений, возникающих при работе со стандартными методами мутагенеза, основанными на простых методах ПЦР, подверженных ошибкам (epPCR). Посредством неспецифического введения универсальных или вырожденных оснований в каждое положение в последовательности гена SeSaM преодолевает предвзятость полимеразы, благоприятствуя временным заменам в определенных положениях, но открывает полную последовательность гена для разнообразного набора аминокислотных замен. [6] [7] Благодаря непрерывным исследованиям, проводимым SeSaM-Biotech и группой Schwaneberg, было введено несколько модификаций метода SeSaM, которые особенно позволили ввести последовательные мутации и дальнейшее изменение мутационной предвзятости в сторону трансверсионных замен, [8] [9] [10] [11] создания универсального инструмента для белковой инженерии и эволюции.
Услуги и продукты
SeSaM-Biotech владеет патентом на метод мутагенеза с насыщением последовательности для случайного мутагенеза, но применяет также дополнительные методы для случайного и целенаправленного мутагенеза, такие как лицензированный метод OmniChange . [12] Эти методы мутагенеза применяются для создания библиотек генов для клиентов или используются в комплексных проектах по инженерии белков, включая генерацию случайного и основанного на знаниях разнообразия, разработку анализов и скрининг вариантов. Кроме того, SeSaM-Biotech предлагает услуги по отдельным ферментам для разработки анализов, компьютерного анализа и в консультационном секторе. Направление деятельности по производству и продаже реагентов премиум-класса для биотехнологического применения находится в стадии разработки. [13]
Рекомендации
- ^ Вонг, Т.С.; Тройник, КЛ; Hauer, B .; Шванеберг, У. (2004). «Мутагенез с насыщением последовательности (SeSaM): новый метод направленной эволюции белка» . Nucleic Acids Res . 32 (3): e26. DOI : 10.1093 / NAR / gnh028 . PMC 373423 . PMID 14872057 .
- ^ Вонг, Т.С.; Тройник, КЛ; Hauer, B .; Шванеберг, У. (2005). «Мутагенез с насыщением последовательностей с настраиваемыми частотами мутаций». Анальный. Биохим . 341 (1): 187–189. DOI : 10.1016 / j.ab.2005.03.023 . PMID 15866543 .
- ^ Вонг, Т.С.; Roccatano, D .; Loakes, D .; Тройник, КЛ; Schenk, A .; Hauer, B .; Шванеберг, У. (2008). «Мутагенез с насыщением последовательности, обогащенной трансверсией (SeSaM-Tv +): метод случайного мутагенеза с последовательными заменами нуклеотидов, который дополняет предвзятость подверженной ошибкам ПЦР». Biotechnol. Дж . 3 (1): 74–82. DOI : 10.1002 / biot.200700193 . PMID 18022859 .
- ^ [1] . Moneyhouse. Проверено 24 апреля 2017 года.
- ^ Cheng, F .; Zhu, L .; Шванеберг, У. (2015). «Направленная эволюция 2.0: улучшение и расшифровка свойств ферментов» (PDF) . Chem. Commun . 51 (48): 9760–9772. DOI : 10.1039 / c5cc01594d . PMID 25874672 .
- ^ Вонг, Т.С.; Тройник, КЛ; Hauer, B .; Шванеберг, У. (2004). «Мутагенез с насыщением последовательности (SeSaM): новый метод направленной эволюции белка» . Nucleic Acids Res . 32 (3): e26. DOI : 10.1093 / NAR / gnh028 . PMC 373423 . PMID 14872057 .
- ^ Вонг, Т.С.; Roccatano, D .; Loakes, D .; Тройник, КЛ; Schenk, A .; Hauer, B .; Шванеберг, У. (2008). «Мутагенез с насыщением последовательности, обогащенной трансверсией (SeSaM-Tv +): метод случайного мутагенеза с последовательными заменами нуклеотидов, который дополняет предвзятость подверженной ошибкам ПЦР». Biotechnol. Дж . 3 (1): 74–82. DOI : 10.1002 / biot.200700193 . PMID 18022859 .
- ^ Вонг, Т.С.; Тройник, КЛ; Hauer, B .; Шванеберг, У. (2005). «Мутагенез с насыщением последовательностей с настраиваемыми частотами мутаций». Анальный. Биохим . 341 (1): 187–189. DOI : 10.1016 / j.ab.2005.03.023 . PMID 15866543 .
- ^ Mundhada, H .; Marienhagen, J .; Scacioc, A .; Schenk, A .; Roccatano, D .; Шванеберг, У. (2011). «SeSaM-Tv-II генерирует пространство последовательностей белка, которое невозможно получить с помощью epPCR». ChemBioChem . 12 (10): 1595–1601. DOI : 10.1002 / cbic.201100010 . PMID 21671328 .
- ^ Ruff, AJ; Marienhagen, J .; Verma, R .; Roccatano, D .; Genieser, H.-G .; Niemann, R .; Шиванге, А.В.; Шванеберг, У. (2012). «dRTP и dPTP - пара комплементарных нуклеотидов для метода мутагенеза с насыщением последовательностей (SeSaM)». J Mol Catal B-Enzym . 84 : 40–47. DOI : 10.1016 / j.molcatb.2012.04.018 .
- ^ Zhao, J .; Кардашлиев, Т .; Ruff, AJ; Bocola, M .; Шванеберг, М. (2014). «Уроки разнообразия экспериментов направленной эволюции на основе анализа 3000 мутаций». Biotechnol Bioeng . 111 (2): 2380–2389. DOI : 10.1002 / bit.25302 . PMID 24904008 .
- ^ Dennig, A .; Шиванге, А.В.; Marienhagen, J .; Шванеберг, У. (2011). «OmniChange: независимый от последовательности метод для одновременного сайт-насыщения пяти кодонов» . PLOS ONE . 6 (10): e26222. DOI : 10.1371 / journal.pone.0026222 . PMC 3198389 . PMID 22039444 .
- ^ [2] . Официальная домашняя страница SeSaM-Biotech GmbH. Проверено 25 апреля 2017 года.
Внешние ссылки
- Официальный веб-сайт