Ген rpoN ( РНК -полимераза, азот-лимитирующий N ) кодирует сигма-фактор сигма-54 ( σ54 , сигма-N или RpoN ), белок Escherichia coli и других видов бактерий. RpoN противодействует сигма-факторам RpoS. [1]
Первоначально идентифицированный как регулятор генов, участвующих в метаболизме и ассимиляции азота в условиях ограничения азота, [2] σ54 E. coli , как было показано, играет важную регулирующую роль во множестве других клеточных процессов. Сходным образом гомологи σ54 у других видов регулируют широкий спектр процессов, включая синтез жгутиков и вирулентность. [3]
Элементы промотора σ54 состоят из консервативных нуклеотидов, расположенных в положениях -12 и -24 по отношению к сайту начала транскрипции. [4] Это контрастирует с членами семейства σ70, которые распознают консервативные промоторные элементы, расположенные примерно в -10 и -35 относительно сайта начала транскрипции. [5] В отличие от членов семейства σ70, белки σ54, как было показано, связывают промоторную ДНК независимо от коровой РНКП in vitro . [6] Другой отличительной характеристикой белков σ54 является их абсолютная потребность в белках-активаторах, известных как белки, связывающие бактериальные энхансеры (bEBP), для инициации транскрипции. [4] [7] Таким образом, как активные, так и неактивные формы РНКП:σ54 связаны на промоторах.[8]