Сортировка nexins является большой группой белков , которые локализованы в цитоплазме и имеют потенциал для мембранной ассоциации либо через их липид-связывающий домен PX (а фосфолипид -связывающего мотив ) или через белка-белковые взаимодействия с мембранно-ассоциированного белковыми комплексами [2 ] [3] Было показано, что некоторые члены этого семейства способствуют сортировке белков .
|
Структура домена PX от p40 (phox), связанного с фосфатидилинозитол-3-фосфатом. [1] |
|
PX |
PF00787 |
IPR001683 |
PX |
PDOC50195 |
1ч6ч / СФЕРА / СУПФАМ |
57 год |
4на 3 |
|
У человека сортировочные нексины транскрибируются из следующих генов:
Гены | Состав домена |
---|
N-конец | Середина 1 | Середина-2 | Середина-3 | C-конец |
---|
SNX1 , SNX2 | Sorting_nexin_N | - | PX | - | БАР [4] (Vps5) |
SNX4 , SNX7 , SNX8 , SNX30 | - | - | PX | - | BAR [4] (Vsp5) |
SNX5 , SNX6 , SNX32 | - | - | PX | - | БАР [4] |
SNX9 , SNX18 , SNX33 | SH3 | - | PX | - | BAR [4] (BAR_3_WASP_bdg) [5] |
SNX13 , SNX14 , SNX19 , SNX25 | PXA [6] | РГО | PX | - | Nexin_C |
SNX15 | - | - | PX | - | Массачусетский технологический институт [7] |
SNX17 , SNX31 | - | - | PX | RA [8] | FERM_M [9] |
SNX23 | kinesin_motor | SMAD_FHA [10] | PX | - | - |
SNX26 | - | - | PX | SH3 | RhoGAP |
SNX27 | ПДЗ | - | PX | - | РА |
SNX28 | - | - | PX | SH3 | SH3 |
SNX3 , SNX10 , SNX11 , SNX12 , SNX16 , SNX20 , SNX21 , SNX22 , SNX24 , SNX29 | - | - | PX | - | - |
Сортировочные нексины либо состоят исключительно из домена PX (например, SNX3), либо имеют модульную структуру, состоящую из домена PX и дополнительных доменов .
Подгруппа сортирующих нексинов (включающая у людей SNX1, SNX2, SNX4, SNX5, SNX6, SNX7, SNX8, SNX9, SNX18, SNX30, SNX32 и SNX33) имеет BAR- домен на своем C-конце. (Домен BAR для SNX 1, 2, 4, 7, 8 и 30 классифицируется pfam как «терминал типа Vps5 C».)
Пример доменной структуры сортировки нексинов можно увидеть здесь для SNX1:
- NTD - N-концевой домен
- PX домен
- CTD - C-концевой BAR домен
Схематическая диаграмма 1D структур репрезентативного сортировочного нексина, сортировочного нексина 1 (SNX1). NTD = N-концевой домен SNX, PX = домен PX, CTD = C-концевой домен BAR.