Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Sphingomonadaceae
Культура "Sphingomonas phyllosphaerae"
Культура из Sphingomonas phyllosphaerae
Научная классификация е
Домен:Бактерии
Тип:Протеобактерии
Учебный класс:Alphaproteobacteria
Заказ:Сфингомонадалы
Семья:Sphingomonadaceae
Kosako et al. 2000 г.
Рода [1]

Sphingomonadaceae - это грамотрицательные бактерии семейства Alphaproteobacteria . Важной особенностью является наличие сфинголипидов (в основном 2'гидроксимиристол дигидросфингозин-1-глюкуроновая кислота, «SGL-1») во внешней мембране клеточной стенки. [2] [3] Клетки имеют яйцевидную или палочковидную форму. Другие также плеоморфны , т. Е. Клетки меняют форму со временем. Некоторые виды из семейства Sphingomonadaceae являются доминирующими компонентами биопленок. [4] [5] [6]

Подразделение [ править ]

Есть восемнадцать родов в Sphingomonadaceae: Aestuariisphingobium, Allosphingosinicella, Aquisediminimonas, Blastomonas , Chakrabartia, Hephaestia, Novosphingopyxis, Parablastomonas, Parasphingopyxis, Rhizorhabdus, Rhizorhapis, Sphingobium , Sphingomicrobium, Sphingomonas , Sphingopyxis , Sphingorhabdus, Sphingosinithalassobacter и Stakelama. [7]

Источник энергии [ править ]

Хотя большинство видов в семействе Sphingomonadaceae являются гетеротрофными [8], некоторые из них являются фототрофными .

Функция [ править ]

Известно, что некоторые виды Sphingomonadaceae разлагают некоторые ароматические соединения . Это делает бактерии интересными для восстановления окружающей среды . [9]

Разнообразны метаболическая емкость родов в пределах Sphingomonadaceae семейства, такие , как Sphingobium , Novosphingobium и Sphingopyxis включить этих роды , чтобы адаптироваться и быть обильными в присутствии бисфенол А . Микробное сообщество с многочисленными представителями Sphingomonadaceae может разлагать бисфенол А с постоянной скоростью. [10]

Род Sphingomonas Sphingomonadaceae способен производить сфинганы, разновидность экзополисахаридов с определенной вязкостью . Это свойство сфинганов делает его полезным во многих отраслях промышленности, включая пищевую и фармацевтическую. [11] [8]

Род Zymomonas в семействе Sphingomonadaceae является факультативно анаэробным, этанологическим и ферментативным. [12] Zymomonas Mobilis оказались более эффективными в переваривании глюкозы и производстве этанола по сравнению с Saccharomyces CEREVISIAE , [13] дрожжевыми виды , которые используются в бродильной и пищевой промышленности. [14] Хотя такие характеристики, как высокая скорость брожения этанола, высокая толерантность к этанолу и широкая толерантность к pH, делают Zymomonas ферментативным агентом в некоторых отраслях промышленности [15] [12], он также может вызывать порчу пива и сидра. [15] Производство сероводорода и ацетальдегида.Zymomonas увеличивают мутность и могут вызывать неприятный запах пива. [15] [16]

Распространение [ править ]

Бактерии семейства Sphingomonadaceae распространены в различных средах, таких как вода, [5] почва, [17] [18] отложения. [8] [19]

Взаимодействие с человеком и растениями [ править ]

Некоторые члены семейства Sphingomonadaceae обычно существуют в окружающей среде, подвергшейся воздействию человека, включая системы питьевой воды, [20] [5] больничную и бытовую водопроводную воду [21] и медицинские устройства. [22] [23] [24]

Известно, что большинство видов семейства Sphingomonadaceae не вредны для человека или растений. [8] Некоторые виды могут защищать растения от болезнетворных патогенов, таких как Thielaviopsis basicola и Rhizoctonia solani AG2-2IIIB. [8] [18] [17] [25]

В Sphingomonas и Sphingobium роды , как правило, имеют более высокую резистентность к антибиотикам , по сравнению с тремя другими родами в пределах семейства Sphingomonadaceae: Novosphingobium , Sphingopyxis и Blastomonas . [5] 

Ссылки [ править ]

  1. ^ " Sphingomonadaceae " . Таксономия NCBI . Bethesda, MD: Национальный центр биотехнологической информации . Дата обращения 13 мая 2019 .
  2. ^ Гаррити GM, Бреннер DJ, Krieg NR, Staley JR, ред. (2005). Руководство Берджи по систематической бактериологии . Два протеобактерии, часть C: альфа-, бета-, дельта- и эпсилонпротеобактерии. Нью-Йорк, Нью-Йорк: Springer. ISBN 978-0-387-24145-6.
  3. ^ Ikushiro H, Islam MM, Тохо H, Hayashi H (август 2007). «Молекулярная характеристика мембран-ассоциированных растворимых серин-пальмитоилтрансфераз из Sphingobacterium multivorum и Bdellovibrio stolpii» . Журнал бактериологии . 189 (15): 5749–61. DOI : 10.1128 / JB.00194-07 . PMC 1951810 . PMID 17557831 .  
  4. ^ de Vries HJ, Beyer F, Jarzembowska M, Lipińska J, van den Brink P, Zwijnenburg A, et al. (2019-01-25). «Sphingomonadaceae из загрязненных мембран» . NPJ Биопленки и микробиомы . 5 (1): 6. DOI : 10.1038 / s41522-018-0074-1 . PMC 6347639 . PMID 30701078 .  
  5. ^ a b c d Ваз-Морейра I, Нунес О.К., Манайя К.М. (август 2011 г.). «Разнообразие и образцы устойчивости к антибиотикам изолятов Sphingomonadaceae из питьевой воды» . Прикладная и экологическая микробиология . 77 (16): 5697–706. DOI : 10,1128 / AEM.00579-11 . PMC 3165245 . PMID 21705522 .  
  6. ↑ Li L, Jeon Y, Lee SH, Ryu H, Santo Domingo JW, Seo Y (июль 2019). «Динамика физико-химической и общинной структуры биопленок под влиянием органического вещества водорослей и гуминовых веществ» . Исследования воды . 158 : 136–145. DOI : 10.1016 / j.watres.2019.04.014 . PMC 6563348 . PMID 31026675 .  
  7. ^ "LPSN - Список прокариотических имен со статусом в номенклатуре" .
  8. ^ а б в г д Glaeser SP, Kämpfer P (2014). «Семейство Sphingomonadaceae». В Rosenberg E, DeLong EF, Lory S, Stackebrandt E (ред.). Прокариоты . Прокариоты: Alphaproteobacteria и Betaproteobacteria . Берлин, Гейдельберг: Springer. С. 641–707. DOI : 10.1007 / 978-3-642-30197-1_302 . ISBN 978-3-642-30197-1.
  9. ^ Balkwill DL, Фредриксон JK, Ромайн MR (12 октября 2006). «Сфингомонады и родственные им роды». Прокариоты, Справочник по биологии бактерий . Том 7: Протеобактерии: подклассы Delta и Epsilon. Глубоко укоренившиеся бактерии. ISBN 978-0-387-33493-6.
  10. ↑ Oh S, Choi D (апрель 2019). «Сообщество микробов усиливает биоразложение бисфенола А путем отбора Sphingomonadaceae». Микробная экология . 77 (3): 631–639. DOI : 10.1007 / s00248-018-1263-4 . PMID 30251120 . S2CID 52811122 .  
  11. ↑ Li H, Jiao X, Sun Y, Sun S, Feng Z, Zhou W, Zhu H (ноябрь 2016 г.). «Подготовка и характеристика нового сфингана WL из морских Sphingomonas sp. WG» . Научные отчеты . 6 (1): 37899. Bibcode : 2016NatSR ... 637899L . DOI : 10.1038 / srep37899 . PMC 5121650 . PMID 27883073 .  
  12. ^ а б Янг С., Фэй Кью, Чжан И, Контрерас Л.М., Уттуркар С.М., Браун С.Д. и др. (Ноябрь 2016 г.). «Zymomonas mobilis как модельная система для производства биотоплива и биохимических продуктов» . Микробная биотехнология . 9 (6): 699–717. DOI : 10.1111 / 1751-7915.12408 . PMC 5072187 . PMID 27629544 .  
  13. ↑ Conway T (сентябрь 1992 г.). «Путь Энтнера-Дудорова: история, физиология и молекулярная биология» . FEMS Microbiology Reviews . 9 (1): 1-27. DOI : 10.1111 / j.1574-6968.1992.tb05822.x . PMID 1389313 . 
  14. ^ Переса-Torrado R, Querol А (2016). «Оппортунистические штаммы Saccharomyces cerevisiae: потенциальный риск, продаваемый в пищевых продуктах» . Границы микробиологии . 6 : 1522. DOI : 10,3389 / fmicb.2015.01522 . PMC 4705302 . PMID 26779173 .  
  15. ^ a b c Янасэ Х (01.01.2014). «Зимомонас». В Batt CA, Tortorello ML (ред.). Энциклопедия пищевой микробиологии . Энциклопедия пищевой микробиологии (второе издание) . Оксфорд: Academic Press. С. 856–863. DOI : 10.1016 / b978-0-12-384730-0.00365-7 . ISBN 978-0-12-384733-1.
  16. ^ Харрисон MA (2009-01-01). «Пиво / Пивоварение». В Schaechter M (ред.). Энциклопедия микробиологии (Третье изд.). Оксфорд: Academic Press. С. 23–33. DOI : 10.1016 / b978-012373944-5.00117-6 . ISBN 978-0-12-373944-5. Отсутствует или пусто |title=( справка )
  17. ^ a b Киселкова М., Альмарио Дж., Копецки Дж., Сагова-Маречкова М., Хаурат Дж., Мюллер Д. и др. (Август 2014 г.). «Оценка ризобактериальных показателей подавления черной корневой гнили табака на фермерских полях». Отчеты по микробиологии окружающей среды . 6 (4): 346–53. DOI : 10.1111 / 1758-2229.12131 . PMID 24992533 . 
  18. ^ а б Гомес Экспосито Р., де Брюйн И., Постма Дж., Рааймейкерс Дж. М. (18 декабря 2017 г.). «Современные взгляды на роль ризосферных бактерий в почвах, подавляющих болезни» . Границы микробиологии . 8 : 2529. DOI : 10,3389 / fmicb.2017.02529 . PMC 5741648 . PMID 29326674 .  
  19. ↑ Jin L, Ko SR, Jin CZ, Jin FJ, Li T, Ahn CY, Oh HM, Lee HG (01.08.2019). «Описание новых членов семейства Sphingomonadaceae: Aquisediminimonas profunda gen. Nov., Sp. Nov. И Aquisediminimonas sediminicola sp. Nov., Выделенных из пресноводных отложений» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 69 (8): 2179–2186. DOI : 10.1099 / ijsem.0.003347 . PMID 31204973 . 
  20. ↑ Li D, Li Z, Yu J, Cao N, Liu R, Yang M (ноябрь 2010 г.). «Характеристика структуры бактериального сообщества в системе распределения питьевой воды во время появления красной воды» . Прикладная и экологическая микробиология . 76 (21): 7171–80. DOI : 10,1128 / AEM.00832-10 . PMC 2976220 . PMID 20851995 .  
  21. ↑ Narciso-da-Rocha C, Vaz-Moreira I, Manaia CM (январь 2014 г.). «Генотипическое разнообразие и устойчивость к антибиотикам у Sphingomonadaceae, выделенных из больничной водопроводной воды». Наука об окружающей среде в целом . 466–467: 127–35. Bibcode : 2014ScTEn.466..127N . DOI : 10.1016 / j.scitotenv.2013.06.109 . PMID 23892027 . 
  22. ↑ Soto-Giron MJ, Rodriguez-R LM, Luo C, Elk M, Ryu H, Hoelle J и др. (Май 2016). Бессер Т.Э. (ред.). «Биопленки на больничных душевых шлангах: характеристика и значение для нозокомиальных инфекций» . Прикладная и экологическая микробиология . 82 (9): 2872–2883. DOI : 10,1128 / AEM.03529-15 . PMC 4836434 . PMID 26969701 .  
  23. ^ Поза М, Gayoso С, Гомес МДж, Rumbo-Feal S, Томас М, Аранда Дж, и др. (2012-08-29). «Изучение бактериального разнообразия в больницах с помощью пиросеквенирования титана GS-FLX» . PLOS ONE . 7 (8): e44105. Bibcode : 2012PLoSO ... 744105P . DOI : 10.1371 / journal.pone.0044105 . PMC 3430676 . PMID 22952889 .  
  24. ^ Meric M, Willke A, Kolayli F, Явуз S, Vahaboglu H (март 2009). «Водная эпидемия Sphingomonas paucimobilis в отделении интенсивной терапии». Журнал инфекции . 58 (3): 253–5. DOI : 10.1016 / j.jinf.2009.01.007 . PMID 19232740 . 
  25. ^ Шапель E Мендес R, Баккер PA, Raaijmakers JM (январь 2016). «Грибковая инвазия в микробиом ризосферы» . Журнал ISME . 10 (1): 265–8. DOI : 10.1038 / ismej.2015.82 . PMC 4681858 . PMID 26023875 .