Тамир Гонен

Тамир Гонен

Родился	1975 (45–46 лет)
Альма-матер	Оклендский университет ( бакалавр , доктор философии )
Награды	Премия Американской диабетической ассоциации за карьерный рост Ранний научный сотрудник Медицинского института Говарда Хьюза
Научная карьера
Поля	Мембранный белок Структурная биология cryoEM MicroED
Учреждения	Медицинский институт Говарда Хьюза, Калифорнийский университет, Лос-Анджелес, Исследовательский кампус Джанелии, Вашингтонский университет, Гарвардская медицинская школа
Тезис	Новые белок-белковые взаимодействия в хрусталике: решение загадки Mp20
Докторант	Эдвард Н. Бейкер Йорг Кистлер
Другие научные консультанты	Томас Вальц

Веб-сайт	https://cryoem.ucla.edu/

Тамир Гонен (1975 г.р.) американский структурный биохимик и мембранная биофизика самым известным за его вклад в структурной биологии из мембранных белков , мембран биохимии и электронной крио-микроскопии ( cryoEM ) , особенно в электронной кристаллографии 2D кристаллов , а также для развития 3D электрона дифракция от микроскопических кристаллов, известных как MicroED. Гонен - исследователь Медицинского института Говарда Хьюза , профессор Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе , директор-основатель Центра визуализации MicroED в Калифорнийском университете в Лос-Анджелесе и член Королевского общества Новой Зеландии .

Образование

Гонен учился в Оклендском университете в Новой Зеландии и получил диплом бакалавра наук по неорганической химии и биологическим наукам, а затем получил диплом с отличием первого класса по биологическим наукам в 1998 году. Затем в 2002 году он получил степень доктора философии в области биологических наук Оклендский университет для исследования с Эдвардом Н. Бейкером и Джоргом Кистлером. Постдокторское образование проводилось в Гарвардской медицинской школе в лаборатории Томаса Вальца.

Исследовать

Текущее исследование Гонена сосредоточено на структурах и функциях важных с медицинской точки зрения мембранных белков, которые участвуют в гомеостазе и разработке методов криоЭМ, а именно дифракции электронов на микрокристаллах ( microED ). Он опубликовал первую структуру атомного разрешения, определенную криоЭМ, подробно описав структуру аквапорина-0 с разрешением 1,9 Å. ^[1]

Развитие дифракции электронов на микрокристаллах

Лаборатория Гонена возглавила использование дифракции электронов для определения структуры белка из трехмерных нанокристаллов в замороженном гидратированном состоянии. ^[2]^[3]^[4] Метод, получивший название microED, был основан в 2013 году с подтверждением принципа работы, опубликованным в eLife. ^[5] В 2014 году была создана и продемонстрирована технология непрерывного вращения MicroED. ^[6] В 2015 году с помощью MicroED была определена первая новая структура белка альфа-синуклеина с разрешением 1,4Å ^[7] в сотрудничестве с Дэвидом Эйзенбергом, а в 2016 году microED предоставила данные с разрешением 1Å для белковых нанокристаллов, где фаза могла быть решена ab initio. . ^[8]MicroED использовался для открытия лекарств, ^[9] определения мембранных белков, таких как ионные каналы ^[10] материалов ^[11] и малых органических молекул, изученных в замороженном гидратированном состоянии ^[12]^[13] и расширенных до субатомного разрешения лучше, чем 0,8Å. ^[14]

Карьера

Научный сотрудник Гарвардской медицинской школы (2002 - 2005 гг.)
Доцент Вашингтонского университета , Сиэтл (2005 - 2010)
Ученый в начале своей карьеры, Медицинский институт Говарда Хьюза (2009-2011)
Доцент Вашингтонского университета, Сиэтл (2011 г.)
Руководитель группы, Медицинский институт Говарда Хьюза, Исследовательский кампус Джанелии (2011-2017)
Профессор биологической химии и физиологии Калифорнийского университета в Лос-Анджелесе, медицинская школа Дэвида Геффена (2017-настоящее время)
Исследователь, Медицинский институт Говарда Хьюза (2017 – настоящее время)

Почести

С отличием первой степени по биологическим наукам (Оклендский университет, 1998 г.)
Премия за развитие карьеры Американской диабетической ассоциации (2009 г.)
Член Королевского общества Новой Зеландии (2014)
Председатель подгруппы КриоЭМ Биофизического общества (2018 г.)

Членство

2014 Королевское общество Новой Зеландии

использованная литература

^ Гонен, Тамир; Чэн, Ифань; Слиз, Петр; Хироаки, Йоко; Фудзиёси, Ёсинори; Харрисон, Стивен С.; Вальц, Томас (2005-12-01). «Липидно-белковые взаимодействия в двухслойных двумерных кристаллах AQP0» . Природа . 438 (7068): 633–638. Bibcode : 2005Natur.438..633G . DOI : 10,1038 / природа04321 . ISSN 1476-4687 . PMC 1350984 . PMID 16319884 .
^ Doerr, Allison (2014). «Электронная кристаллография становится трехмерной с MicroED». Природные методы . 11 (1): 6–7. DOI : 10.1038 / nmeth.2797 . ISSN 1548-7091 . PMID 24524127 . S2CID 38786632 .
^ Карри, Стивен (2013-11-19). «Протокол Златовласки: электроны, посланные, чтобы заставить микрокристаллы работать для структурной биологии | Стивен Карри» . Хранитель . Проверено 31 июля 2018 .
^ Doerr, Allison (2015). «Конструкции из крошечных кристаллов». Природные методы . 12 (1): 37. DOI : 10.1038 / nmeth.3238 . ISSN 1548-7091 . S2CID 29710840 .
^ Ши, Дан; Nannenga, Brent L .; Iadanza, Matthew G .; Гонен, Тамир (2013-11-19). «Трехмерная электронная кристаллография микрокристаллов белков» . eLife . 2 : e01345. DOI : 10.7554 / eLife.01345 . ISSN 2050-084X . PMC 3831942 . PMID 24252878 .
^ Nannenga, Brent L .; Ши, Дан; Лесли, Эндрю GW; Гонен, Тамир (2014). «Определение структуры с высоким разрешением путем сбора данных непрерывного вращения в MicroED» . Природные методы . 11 (9): 927–930. DOI : 10,1038 / Nmeth.3043 . ISSN 1548-7105 . PMC 4149488 . PMID 25086503 .
^ Родригес, Хосе А .; Иванова, Магдалена И .; Савая, Майкл Р .; Cascio, Duilio; Рейес, Фрэнсис Э .; Ши, Дан; Сангван, Смрити; Guenther, Elizabeth L .; Джонсон, Лиза М. (24 сентября 2015 г.). «Структура токсичного ядра α-синуклеина из невидимых кристаллов» . Природа . 525 (7570): 486–490. Bibcode : 2015Natur.525..486R . DOI : 10.1038 / nature15368 . ISSN 1476-4687 . PMC 4791177 . PMID 26352473 .
^ Савая, Майкл Р .; Родригес, Хосе; Cascio, Duilio; Collazo, Майкл Дж .; Ши, Дан; Рейес, Фрэнсис Э .; Хаттне, Йохан; Гонен, Тамир; Айзенберг, Дэвид С. (2016). «Ab initio определение структуры из прионных нанокристаллов с атомным разрешением с помощью MicroED» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (40): 11232–11236. DOI : 10.1073 / pnas.1606287113 . ISSN 1091-6490 . PMC 5056061 . PMID 27647903 .
^ Purdy, Майкл Д .; Ши, Дан; Хрустович, Якуб; Хаттне, Йохан; Гонен, Тамир; Йегер, Марк (30 декабря 2017 г.). «Структуры MicroED ВИЧ-1 Gag CTD-SP1 обнаруживают связывающие взаимодействия с ингибитором созревания Bevirimat». bioRxiv 10.1101 / 241182 .
^ Лю, Шиан; Гонен, Тамир (2018-05-03). «Структура MicroED ионного канала NaK показывает процесс распределения Na + в фильтре селективности» . Биология коммуникации . 1 (1): 38. DOI : 10.1038 / s42003-018-0040-8 . ISSN 2399-3642 . PMC 6112790 . PMID 30167468 .
^ Вергара, Сандра; Lukes, Dylan A .; Martynowycz, Michael W .; Сантьяго, Улисес; Plascencia-Villa, Germán; Weiss, Simon C .; де ла Крус, М. Джейсон; Блэк, Дэвид М .; Альварес, Маркос М. (2017-11-16). «Структура MicroED Au146 (p-MBA) 57 при субатомном разрешении выявляет двойной кластер FCC» . Журнал писем по физической химии . 8 (22): 5523–5530. arXiv : 1706.07902 . DOI : 10.1021 / acs.jpclett.7b02621 . ISSN 1948-7185 . PMC 5769702 . PMID 29072840 .
^ Галлахер-Джонс, Маркус; Глинн, Калина; Бойер, Дэвид Р .; Martynowycz, Michael W .; Эрнандес, Эвелин; Мяо, Дженнифер; Зи, Чи-Те; Новикова, Ирина В .; Гольдшмидт, Лукаш (2018-01-15). «Крио-ЭМ структура суб-Ангстрема прионной протофибриллы обнаруживает полярный кламмер» . Структурная и молекулярная биология природы . 25 (2): 131–134. DOI : 10.1038 / s41594-017-0018-0 . ISSN 1545-9993 . PMC 6170007 . PMID 29335561 .
^ Джонс, GC; Мартынович, МВт; Хаттне, Дж; Фултон, Т.Дж.; Штольц, БМ; Rodriguez, JA; Нельсон, H; Гонен, Т. (2018). «Метод CryoEM MicroED как мощный инструмент для определения структуры малых молекул» (PDF) . АСУ Центральная Наука . 4 (11): 1587–1592. DOI : 10,26434 / chemrxiv.7215332 . PMC 6276044 . PMID 30555912 .
^ Хьюз, Майкл П .; Савая, Майкл Р .; Бойер, Дэвид Р .; Гольдшмидт, Лукаш; Родригес, Хосе А .; Cascio, Duilio; Чонг, Лиза; Гонен, Тамир; Айзенберг, Дэвид С. (2018). «Атомные структуры белковых сегментов низкой сложности обнаруживают изогнутые β-листы, которые собирают сети» . Наука . 359 (6376): 698–701. Bibcode : 2018Sci ... 359..698H . DOI : 10.1126 / science.aan6398 . ISSN 1095-9203 . PMC 6192703 . PMID 29439243 .

внешние ссылки

Веб-сайт лаборатории Гонена
Следователь HHMI Тамир Гонен

[Gonen_2005-1] Гонен, Тамир; Чэн, Ифань; Слиз, Петр; Хироаки, Йоко; Фудзиёси, Ёсинори; Харрисон, Стивен С.; Вальц, Томас (2005-12-01). «Липидно-белковые взаимодействия в двухслойных двумерных кристаллах AQP0» . Природа . 438 (7068): 633–638. Bibcode : 2005Natur.438..633G . DOI : 10,1038 / природа04321 . ISSN 1476-4687 . PMC 1350984 . PMID 16319884 .

[2] Doerr, Allison (2014). «Электронная кристаллография становится трехмерной с MicroED». Природные методы . 11 (1): 6–7. DOI : 10.1038 / nmeth.2797 . ISSN 1548-7091 . PMID 24524127 . S2CID 38786632 .

[3] Карри, Стивен (2013-11-19). «Протокол Златовласки: электроны, посланные, чтобы заставить микрокристаллы работать для структурной биологии | Стивен Карри» . Хранитель . Проверено 31 июля 2018 .

[4] Doerr, Allison (2015). «Конструкции из крошечных кристаллов». Природные методы . 12 (1): 37. DOI : 10.1038 / nmeth.3238 . ISSN 1548-7091 . S2CID 29710840 .

[Shi_2013-5] Ши, Дан; Nannenga, Brent L .; Iadanza, Matthew G .; Гонен, Тамир (2013-11-19). «Трехмерная электронная кристаллография микрокристаллов белков» . eLife . 2 : e01345. DOI : 10.7554 / eLife.01345 . ISSN 2050-084X . PMC 3831942 . PMID 24252878 .

[Nannenga_2014-6] Nannenga, Brent L .; Ши, Дан; Лесли, Эндрю GW; Гонен, Тамир (2014). «Определение структуры с высоким разрешением путем сбора данных непрерывного вращения в MicroED» . Природные методы . 11 (9): 927–930. DOI : 10,1038 / Nmeth.3043 . ISSN 1548-7105 . PMC 4149488 . PMID 25086503 .

[Rodriguez_2015-7] Родригес, Хосе А .; Иванова, Магдалена И .; Савая, Майкл Р .; Cascio, Duilio; Рейес, Фрэнсис Э .; Ши, Дан; Сангван, Смрити; Guenther, Elizabeth L .; Джонсон, Лиза М. (24 сентября 2015 г.). «Структура токсичного ядра α-синуклеина из невидимых кристаллов» . Природа . 525 (7570): 486–490. Bibcode : 2015Natur.525..486R . DOI : 10.1038 / nature15368 . ISSN 1476-4687 . PMC 4791177 . PMID 26352473 .

[Sawaya_2016-8] Савая, Майкл Р .; Родригес, Хосе; Cascio, Duilio; Collazo, Майкл Дж .; Ши, Дан; Рейес, Фрэнсис Э .; Хаттне, Йохан; Гонен, Тамир; Айзенберг, Дэвид С. (2016). «Ab initio определение структуры из прионных нанокристаллов с атомным разрешением с помощью MicroED» . Труды Национальной академии наук Соединенных Штатов Америки . 113 (40): 11232–11236. DOI : 10.1073 / pnas.1606287113 . ISSN 1091-6490 . PMC 5056061 . PMID 27647903 .

[9] Purdy, Майкл Д .; Ши, Дан; Хрустович, Якуб; Хаттне, Йохан; Гонен, Тамир; Йегер, Марк (30 декабря 2017 г.). «Структуры MicroED ВИЧ-1 Gag CTD-SP1 обнаруживают связывающие взаимодействия с ингибитором созревания Bevirimat». bioRxiv 10.1101 / 241182 .

[Liu_2018-10] Лю, Шиан; Гонен, Тамир (2018-05-03). «Структура MicroED ионного канала NaK показывает процесс распределения Na + в фильтре селективности» . Биология коммуникации . 1 (1): 38. DOI : 10.1038 / s42003-018-0040-8 . ISSN 2399-3642 . PMC 6112790 . PMID 30167468 .

[Vergara_2017-11] Вергара, Сандра; Lukes, Dylan A .; Martynowycz, Michael W .; Сантьяго, Улисес; Plascencia-Villa, Germán; Weiss, Simon C .; де ла Крус, М. Джейсон; Блэк, Дэвид М .; Альварес, Маркос М. (2017-11-16). «Структура MicroED Au146 (p-MBA) 57 при субатомном разрешении выявляет двойной кластер FCC» . Журнал писем по физической химии . 8 (22): 5523–5530. arXiv : 1706.07902 . DOI : 10.1021 / acs.jpclett.7b02621 . ISSN 1948-7185 . PMC 5769702 . PMID 29072840 .

[12] Галлахер-Джонс, Маркус; Глинн, Калина; Бойер, Дэвид Р .; Martynowycz, Michael W .; Эрнандес, Эвелин; Мяо, Дженнифер; Зи, Чи-Те; Новикова, Ирина В .; Гольдшмидт, Лукаш (2018-01-15). «Крио-ЭМ структура суб-Ангстрема прионной протофибриллы обнаруживает полярный кламмер» . Структурная и молекулярная биология природы . 25 (2): 131–134. DOI : 10.1038 / s41594-017-0018-0 . ISSN 1545-9993 . PMC 6170007 . PMID 29335561 .

[13] Джонс, GC; Мартынович, МВт; Хаттне, Дж; Фултон, Т.Дж.; Штольц, БМ; Rodriguez, JA; Нельсон, H; Гонен, Т. (2018). «Метод CryoEM MicroED как мощный инструмент для определения структуры малых молекул» (PDF) . АСУ Центральная Наука . 4 (11): 1587–1592. DOI : 10,26434 / chemrxiv.7215332 . PMC 6276044 . PMID 30555912 .

[14] Хьюз, Майкл П .; Савая, Майкл Р .; Бойер, Дэвид Р .; Гольдшмидт, Лукаш; Родригес, Хосе А .; Cascio, Duilio; Чонг, Лиза; Гонен, Тамир; Айзенберг, Дэвид С. (2018). «Атомные структуры белковых сегментов низкой сложности обнаруживают изогнутые β-листы, которые собирают сети» . Наука . 359 (6376): 698–701. Bibcode : 2018Sci ... 359..698H . DOI : 10.1126 / science.aan6398 . ISSN 1095-9203 . PMC 6192703 . PMID 29439243 .

[1]