Thermotoga | |
---|---|
Схема раздела Thermotoga maritima с изображением «тоги» | |
Научная классификация | |
Домен: | Бактерии |
Тип: | Термотоги |
Заказ: | Thermotogales |
Семья: | Thermotogaceae |
Род: | Thermotoga |
Разновидность | |
Thermotoga caldifontis [1] |
Thermotoga - это род филума Thermotogae . Члены Thermotoga - гипертермофильные бактерии, чья клетка обернута уникальной оболочкой, напоминающей внешнюю мембрану, которая называется «тога».
Члены типа окрашивают грамотрицательные, поскольку они обладают тонким пептидогликаном между двумя липидными бислоями, хотя оба они своеобразны. [2] Пептидогликан необычен, поскольку поперечная сшивка представляет собой не только мезо-диаминопимелат, как это происходит у Proteobacteria , но и D-лизин. [NB 1] [3]
Это анаэробы с разной степенью переносимости кислорода. Они способны восстанавливать элементарную серу (S 0 ) до сероводорода, который, в свою очередь, можно использовать. [2]
Является ли термофилия нововведением линии или наследственной чертой, неясно и не может быть определено.
Геном Thermotoga maritima был секвенирован в 1999 году, и было выявлено несколько генов архейного происхождения, что, возможно, позволило его термофильной адаптации. [4] Содержание CG (цитозин-гуанин) T. maritima составляет 46,2%; [2] большинство термофилов действительно имеют высокое содержание ХГ; это привело к предположению, что содержание ХГ может быть несущественным последствием для термофилии, а не движущей силой к термофилии. [5] [6]
Члены и родственники [ править ]
Типовым видом этого рода является T. maritima , впервые описанный в 1986 г. [2] В то время это был первый описанный вид этого типа. Род Thermotoga теперь содержит девять официальных видов, [7] в то время как филюм содержит одну семью ( Thermotogaceae ) с официальным десять родов ( Fervidobacterium , Geotoga , Kosmotoga , Marinitoga , Mesotoga , Petrotoga , Thermococcoides , Thermosipho , Thermotoga и Oceanotoga ).
Штамм T. subterranea SL1 был обнаружен в континентальном нефтяном резервуаре с температурой 70 ° C в Восточно-Парижском бассейне, Франция . [8]
Точное отношение Thermotogae к другим типам обсуждается ( v. Бактериальный тип ): несколько исследований показали, что они имеют глубокое ветвление (в руководстве Берджи это фактически появилось в «Томе I: Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии»). "), [9] в то время как другие обнаружили, что Firmicutes глубоко разветвляются, а Thermotogae группируются вдали от основания.
Имя [ редактировать ]
Статья и глава в руководстве Берджи были написаны несколькими авторами, включая микробиологов Карла Стеттера и Карла Вёзе . [2]
Новое латинское название женского рода «Thermotoga» означает «горячая верхняя одежда», являясь комбинацией греческого существительного θέρμη ( Therme , тепло) [10] или более правильно прилагательного θερμός, rj, όν ( термос, е, о , горячих ) [11] и латинское существительное женского рода toga (римская верхняя одежда). [2]
Сноски [ править ]
- ^ Все протеиногенные аминокислоты имеют L-конфигурацию; в пептидогликане присутствуют некоторые аминокислоты с D-конфигурацией.
Лизин синтезируется из мезо-диаминопимелата диаминопимелатдекарбоксилазой .
Ссылки [ править ]
- ^ а б LPSN lpsn.dsmz.de
- ^ a b c d e f Huber, R .; Т. А. Лэнгуорти; Х. Кониг; М. Томм; CR Woese; УБ Слейтр; К. О. Стеттер (1986). «Thermotoga maritima sp. Nov. Представляет новый род уникальных чрезвычайно теплолюбивых эубактерий, растущих до 90 ° C» (PDF) . Arch. Microbiol . 144 (4): 324–333. DOI : 10.1007 / BF00409880 .
- ^ Бонифаций, А .; Паркет, Ц .; Артур, М .; Mengin-Lecreulx, D .; Блано, Д. (2009). "Выяснение структуры пептидогликана Thermotoga maritima выявило два новых типа поперечных связей" . Журнал биологической химии . 284 (33): 21856–21862. DOI : 10.1074 / jbc.M109.034363 . PMC 2755910 . PMID 19542229 .
- ^ Фрейзер, CM; Clayton, KE; Гилл, РА; Гвинн, SR; Додсон, М.Л .; Haft, RJ; Хики, DH; Петерсон, ЭК; Нельсон, JD; Ketchum, WC; Макдональд, KA; Utterback, L .; Малек, TR; Linher, JA; Garrett, KD; Стюарт, ММ; Хлопок, AM; Пратт, доктор медицины; Филлипс, MS; Ричардсон, Калифорния; Heidelberg, D .; Sutton, J .; Fleischmann, GG; Эйзен, РД; Уайт, JA; Зальцберг, O .; Смит, С.Л .; Вентер, Х.о .; Фрейзер, Дж. К. (1999). «Доказательства латерального переноса генов между археями и бактериями из последовательности генома Thermotoga maritima». Природа . 399 (6734): 323–329. Bibcode : 1999Natur.399..323N . DOI : 10.1038 / 20601 . PMID 10360571 .
- ^ Pasamontes, A .; Гарсия-Валлве, С. (2006). «Использование многофакторного метода для анализа аминокислотного состава консервативной группы ортологичных белков у прокариот» . BMC Bioinformatics . 7 : 257. DOI : 10,1186 / 1471-2105-7-257 . PMC 1489954 . PMID 16709240 .
- ^ Puigbò, P .; Pasamontes, A .; Гарсия-Валлве, С. (2008). «Обретение и потеря теплолюбивой адаптации у прокариот». Тенденции в генетике . 24 (1): 10–14. DOI : 10.1016 / j.tig.2007.10.005 . PMID 18054113 .
- ^ запись термотога в ЛПСН ; Euzéby, JP (1997). «Список названий бактерий со статусом в номенклатуре: папка, доступная в Интернете» . Международный журнал систематической и эволюционной микробиологии . 47 (2): 590–2. DOI : 10.1099 / 00207713-47-2-590 . PMID 9103655 .
- Перейти ↑ Li H, Yang SZ, Mu BZ, Rong ZF, Zhang J (2007). «Молекулярное филогенетическое разнообразие микробного сообщества, связанного с высокотемпературным нефтяным резервуаром на морском нефтяном месторождении» . FEMS Microbiol Ecol . 60 (1): 74–84. DOI : 10.1111 / j.1574-6941.2006.00266.x . PMID 17286581 .
- ^ Бун, Дэвид Р .; Кастенхольц, Ричард В. (18 мая 2001 г.) [1984 (Уильямс и Уилкинс)]. Джордж М. Гаррити (ред.). Археи и глубоко ветвящиеся и фототрофные бактерии . Руководство Берджи по систематической бактериологии. 1 (2-е изд.). Нью-Йорк: Спрингер. С. 721 . ISBN 978-0-387-98771-2. Британская библиотека № GBA561951.
- ^ θέρμη . Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте " Персей"
- ^ θερμός . Лидделл, Генри Джордж ; Скотт, Роберт ; Греко-английский лексикон в проекте " Персей"