Элемент посттранскрипционного ответа WHP


Посттранскрипционный регуляторный элемент вируса гепатита сурка (WHV) (WPRE) представляет собой последовательность ДНК , которая при транскрипции создает третичную структуру, усиливающую экспрессию . Эта последовательность обычно используется в молекулярной биологии для увеличения экспрессии генов, доставляемых вирусными векторами . [1] WPRE представляет собой трехсторонний регуляторный элемент с гамма-, альфа- и бета-компонентами. Альфа-компонент имеет длину 80 бит:

При использовании отдельно без гамма- и бета-компонентов WPRE альфа-компонент всего на 9% активнее, чем полный трехчастный WPRE. Последовательность полного трехстороннего WPRE:

AATCAACCTCTGGATTACAAAATTTGTGAAAGATTGACTGGTATTCTTAACTATGTTGCTCCTTTTACGCTATGTGGATACGCTGCTTTAATGCCTTTGTA
TCATGCTATTGCTTCCCGTATGGCTTTCATTTTCTCCTCCTTGTATAAATCCTGGTTGCTGTCTCTTTATGAGGAGTTGTGGCCCGTTGTCAGGCAACGTGGCGTG
GTGTGCACTGTGTTTGCTGACGCAACCCCCACTGGTTGGGGCATTGCCACCACCTGTCAGCTCCTTTCCGGGACTTTCGCTTTCCCCCTCCCTATTGCCACGGCGG
AACTCATCGCCGCCTGCCTTGCCCGCTGCTGGACAGGGGCTCGGCTGTTGGGCACTGACAATTCCGTGGTGTTGTCGGGGAAGCTGACGTCCTTTCCATGGCTGCT
CGCCTGTGTTGCCACCTGGATTCTGCGCGGGACGTCCTTCTGCTACGTCCCTTCGGCCCTCAATCCAGCGGACCTTCCTTCCCGCGGCCTGCTGCCGGCTCTGCGG
CCTCTTCCGCGTCTTCGCCTTCGCCCTCAGACGAGTCGGATCTCCCTTTGGGCCGCCTCCCCGCCTG

Эта последовательность имеет 100% гомологию с парами оснований от 1093 до 1684 генома вируса гепатита B сурка (WHV8). При использовании в 3'-нетранслируемой области (UTR) кассеты экспрессии млекопитающих он может значительно повысить стабильность мРНК и выход белка. [2]