Z-РНК представляет собой левостороннюю альтернативную конформацию двойной спирали РНК. Так же, как и для Z-ДНК , для Z-РНК предпочтительна последовательность, состоящая из пуриновых / пиримидиновых повторов и особенно CG-повторов.
Открытие
Способность дцРНК превращаться в левую спираль была продемонстрирована с помощью ЯМР и кругового дихроизма в 1984 году. [1] Было показано, что это преобразование требует высокой ионной силы и повышенных температур (35 градусов).
Структурные характеристики
Z-РНК должна напоминать, но не быть идентична Z-ДНК. [2] Структура комплекса Zalpha- домена с Z-РНК при концентрациях соли, близких к физиологическим, однако предполагает структуру, гораздо более близкую к конформации Z-ДНК, и указывает на две формы Z-РНК (конформации низкой и высокой соли) [3]
Роль в биологии
Образование Z-РНК в живых клетках было предложено в экспериментах с использованием антител против Z-РНК для окрашивания фиксированных клеток простейших [4]. Дальнейшие доказательства были получены с открытием, что Zalpha-домен фермента редактирования РНК ADAR1 связывается и распознается с высокой аффинностью Z -РНК. [5] Структурные особенности распознавания Z-РНК доменами Zalpha были выявлены кристаллографическим исследованием комплекса [3]
Рекомендации
- ^ Холл, К., П. Круз, И. Тиноко, младший, Т.М. Джовин, и Дж. Х. ван де Санде, «Z-РНК» - двойная спираль левой РНК. Nature, 1984. 311 (5986): с. 584-6.
- ^ Попенда, М., Дж. Милецки и Р. В. Адамиак, Структура высокого солевого раствора двойной двойной РНК с. 4044-54.
- ^ a b Пласидо, Д., Б. А. Браун, 2-й, К. Ловенхаупт, А. Рич и А. Атанасиадис, Левосторонняя двойная спираль РНК, связанная Z-альфа-доменом фермента, редактирующего РНК ADAR1. Структура, 2007. 15 (4): с. 395-404.
- ^ 1. Zarling, DA, CJ Calhoun, CC Hardin, and AH Zarling, Cytoplasmic Z-RNA. Proc Natl Acad Sci USA, 1987. 84 (17): p. 6117-21.
- ^ Brown, BA, 2nd, K. Lowenhaupt, CM Wilbert, EB Hanlon и A. Rich, Zalpha-домен редактирующего фермента dsRNA аденозиндезаминазы связывает левую Z-РНК, а также Z-ДНК. Proc Natl Acad Sci USA, 2000. 97 (25): p. 13532-6.