Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Структура Z-ДНК. Протеопедия Z-ДНК

Z-ДНК - одна из многих возможных двойных спиральных структур ДНК . Это левосторонняя двойная спиральная структура, в которой спираль закручивается зигзагообразно влево, а не вправо, как в более распространенной форме В-ДНК . Z-ДНК считается одной из трех биологически активных двойных спиральных структур наряду с A-ДНК и B-ДНК.

История [ править ]

Левша ДНК была впервые обнаружена Робертом Уэллсом и его коллегами, в ходе своих исследований повторяющегося полимера из инозина - цитозин . [1] Они наблюдали спектр «обратного» кругового дихроизма для таких ДНК и интерпретировали это (правильно) как означающее, что нити намотаны друг на друга левосторонним образом. Связь между Z-ДНК и более знакомой B-ДНК была указана в работе Пола и Джовина [2], которые показали, что ультрафиолетовый круговой дихроизм поли (dG-dC) почти инвертирован в 4 М хлориде натрия.решение. Подозрение, что это было результатом превращения B-ДНК в Z-ДНК, было подтверждено исследованием спектров комбинационного рассеяния этих растворов и кристаллов Z-ДНК. [3] Впоследствии была опубликована кристаллическая структура «Z-ДНК», которая оказалась первой монокристаллической рентгеновской структурой фрагмента ДНК (самокомплементарный гексамер ДНК d (CG) 3 ). Он был решен как левая двойная спираль с двумя антипараллельными цепями, которые удерживались вместе парами оснований Уотсона-Крика (см. Рентгеновскую кристаллографию ). Эту проблему решили Эндрю Х. Дж. Ван , Александр Рич и его коллеги в 1979 году в Массачусетском технологическом институте.. [4] Кристаллизация соединения B-Z-ДНК в 2005 г. [5] дала лучшее понимание потенциальной роли Z-ДНК в клетках. Всякий раз, когда формируется сегмент Z-ДНК, на двух его концах должны быть соединения B – Z, связывающие его с B-формой ДНК, обнаруженной в остальной части генома .

В 2007 году РНК- версия Z-ДНК, Z-РНК , была описана как преобразованная версия двойной спирали А-РНК в левую спираль. [6] Переход от A-РНК к Z-РНК, однако, был описан еще в 1984 году. [7]

Структура [ править ]

Соединение B – Z связано с доменом связывания Z-ДНК. Обратите внимание на две выделенные выдавленные основы. От PDB : 2ACJ .

Z-ДНК сильно отличается от правосторонних форм. Фактически, Z-ДНК часто сравнивают с B-ДНК, чтобы проиллюстрировать основные различия. Спираль Z-ДНК является левой и имеет структуру, повторяющую все остальные пары оснований. Большая и малая бороздки, в отличие от A- и B-ДНК, мало отличаются по ширине. Формирование такой структуры в целом неблагоприятно, хотя определенные условия могут этому способствовать; такие , как переменный пурина - пиримидин последовательность (особенно поли (РСК) 2 ), отрицательная суперспирализация ДНК или высокое содержание соль и некоторые катионы (все при физиологической температуре, 37 ° С, и рНом7.3–7.4). Z-ДНК может образовывать соединение с B-ДНК (так называемая «соединительная коробка от B к Z») в структуре, которая включает экструзию пары оснований. [8] Конформация Z-ДНК была трудна для изучения, потому что она не существует как стабильный элемент двойной спирали. Напротив, это временная структура, которая иногда индуцируется биологической активностью, а затем быстро исчезает. [9]

Прогнозирование структуры Z-ДНК [ править ]

Можно предсказать вероятность того, что последовательность ДНК образует структуру Z-ДНК. Алгоритм для предсказания склонности ДНК к переходу из B-формы в Z-форму, ZHunt , был написан П. Шинг Хо в 1984 году в Массачусетском технологическом институте . [10] Этот алгоритм был позже разработан Трейси Кэмп , П. Кристофом Чампом , Сандором Морисом и Джеффри М. Варгасоном для картирования Z-ДНК по всему геному (с Хо в качестве главного исследователя). [11]

Путь образования Z-ДНК из B-ДНК [ править ]

С момента открытия и кристаллизации Z-ДНК в 1979 году эта конфигурация оставила ученых в недоумении относительно пути и механизма от конфигурации B-ДНК к конфигурации Z-ДНК. [12] Конформационные изменения от B-ДНК к структуре Z-ДНК были неизвестны на атомном уровне, но в 2010 году компьютерное моделирование, проведенное Lee et al. смогли с помощью вычислений определить, что пошаговое распространение перехода от B к Z обеспечит более низкий энергетический барьер, чем предполагаемый ранее согласованный механизм. [13]Поскольку это было доказано с помощью вычислений, путь по-прежнему необходимо будет протестировать экспериментально в лаборатории для дальнейшего подтверждения и валидности, в которых Lee et al. В частности, в своей журнальной статье говорится: «Текущий [расчетный] результат может быть проверен экспериментами FRET с одной молекулой (smFRET) в будущем». [13] В 2018 году путь от B-ДНК к Z-ДНК был экспериментально доказан с помощью тестов smFRET. [14] Это было выполнено путем измерения значений интенсивности между донорными и акцепторными флуоресцентными красителями, также известными как флуорофоры , по отношению друг к другу, когда они обмениваются электронами, будучи помеченными на молекуле ДНК. [15] [16]Расстояния между флуорофорами можно использовать для количественного расчета изменений близости красителей и конформационных изменений в ДНК. Высокоаффинный связывающий белок Z-ДНК , hZαADAR1 [17], использовали в различных концентрациях для индукции трансформации из B-ДНК в Z-ДНК. [14] Анализы smFRET выявили переходное состояние B *, которое сформировалось в результате связывания hZαADAR1, накопленного на структуре B-ДНК и стабилизировавшего ее. [14]Этот шаг выполняется, чтобы избежать высокой энергии соединения, при которой структура B-ДНК может претерпевать конформационные изменения в структуре Z-ДНК без серьезных разрушительных изменений энергии. Этот результат совпадает с результатами расчетов Lee et al. доказывая, что механизм является ступенчатым, и его цель состоит в том, что он обеспечивает более низкий энергетический барьер для конформационного изменения конфигурации B-ДНК в Z-ДНК. [13] Вопреки предыдущему мнению, связывающие белки на самом деле не стабилизируют конформацию Z-ДНК после того, как она сформирована, но вместо этого они фактически способствуют образованию Z-ДНК непосредственно из конформации B *, которая формируется Структура B-ДНК связана с белками с высоким сродством. [14]

Биологическое значение [ править ]

Биологическая роль Z-ДНК в регуляции реакций интерферона I типа была подтверждена в исследованиях трех хорошо охарактеризованных редких менделевских заболеваний: симметричного наследственного дисхроматоза (OMIM: 127400), синдрома Айкарди-Гутьера (OMIM: 615010) и двустороннего полосатого тела. Некроз / Дистония. Семьи с гаплоидным транскриптомом ADAR позволили картировать варианты Zα непосредственно на заболевание, показывая, что генетическая информация кодируется в ДНК как по форме, так и по последовательности. [18] Роль в регуляции ответа интерферона I типа при раке также подтверждается данными о том, что 40% панели опухолей зависели от фермента ADAR для выживания. [19]

В предыдущих исследованиях Z-ДНК была связана как с болезнью Альцгеймера, так и с системной красной волчанкой . Чтобы продемонстрировать это, было проведено исследование ДНК, обнаруженной в гиппокампе мозга, который был нормальным, умеренно пораженным болезнью Альцгеймера и серьезно пострадал от болезни Альцгеймера. Благодаря использованию кругового дихроизма это исследование показало присутствие Z-ДНК в ДНК тех, кто серьезно пострадал. [20] В этом исследовании также было обнаружено, что основные части умеренно пораженной ДНК находились в промежуточной конформации BZ. Это важно, поскольку на основании этих результатов был сделан вывод, что переход от B-ДНК к Z-ДНК зависит от прогрессирования болезни Альцгеймера. [20]Кроме того, Z-ДНК связана с системной красной волчанкой (СКВ) благодаря присутствию встречающихся в природе антител. Значительные количества антител против Z-ДНК были обнаружены у пациентов с СКВ и не присутствовали при других ревматических заболеваниях. [21] Есть два типа этих антител. С помощью радиоиммуноанализа было обнаружено, что одно взаимодействует с основаниями, экспонированными на поверхности Z-ДНК и денатурированной ДНК, а другое взаимодействует исключительно с зигзагообразным остовом только Z-ДНК. Как и при болезни Альцгеймера, антитела различаются в зависимости от стадии заболевания, при этом максимальное количество антител наблюдается на наиболее активных стадиях СКВ.

Z-ДНК в транскрипции [ править ]

Обычно считается, что Z-ДНК обеспечивает снятие напряжения при скручивании во время транскрипции , и это связано с отрицательной сверхспирализацией . [5] [22] Однако, в то время как суперспирализация связана как с транскрипцией, так и с репликацией ДНК, образование Z-ДНК в первую очередь связано со скоростью транскрипции . [23]

Изучение хромосомы человека 22 показало корреляцию между Z-ДНК , образующие регионами и промоторными областями для ядерного фактора I . Это предполагает, что транскрипция в некоторых генах человека может регулироваться образованием Z-ДНК и активацией ядерного фактора I. [11]

Было показано, что последовательности Z-ДНК ниже промоторных областей стимулируют транскрипцию. Наибольшее повышение активности наблюдается, когда последовательность Z-ДНК размещается на три спиральных витка после промоторной последовательности . Кроме того, Z-ДНК вряд ли образует нуклеосомы , которые часто расположены после последовательности, образующей Z-ДНК. Предполагается, что из-за этого свойства Z-ДНК кодирует позиционирование нуклеосом. Поскольку размещение нуклеосом влияет на связывание факторов транскрипции , считается, что Z-ДНК регулирует скорость транскрипции. [24]

Было показано, что Z-ДНК, образованная путем активной транскрипции, за путь РНК-полимеразы через отрицательную суперспирализацию увеличивает генетическую нестабильность, создавая склонность к мутагенезу вблизи промоторов. [25] Исследование Escherichia coli показало, что делеции генов спонтанно возникают в областях плазмиды, содержащих Z-ДНК-образующие последовательности. [26] В клетках млекопитающих присутствие таких последовательностей вызывает делеции больших геномных фрагментов из-за хромосомных двухцепочечных разрывов . Обе эти генетические модификации были связаны с транслокациями генов, обнаруживаемыми при раковых заболеваниях, таких каклейкоз и лимфома , поскольку области разрыва в опухолевых клетках нанесены на график вокруг Z-ДНК-образующих последовательностей. [25] Однако более мелкие делеции в бактериальных плазмидах были связаны с проскальзыванием репликации , в то время как более крупные делеции, связанные с клетками млекопитающих, вызваны негомологичной репарацией концевых соединений , которая, как известно, подвержена ошибкам. [25] [26]

Токсическое действие бромистого этидия (EtBr) на трипаносомы вызвано сдвигом их кинетопластидной ДНК в Z-форму. Сдвиг вызван интеркалированием EtBr и последующим ослаблением структуры ДНК, что приводит к раскручиванию ДНК, переходу в Z-форму и ингибированию репликации ДНК. [27]

Открытие домена Zα [ править ]

Первый домен, связывающий Z-ДНК с высоким сродством, был обнаружен в ADAR1 с использованием подхода, разработанного Аланом Гербертом. [28] [29] Кристаллографические и ЯМР- исследования подтвердили биохимические данные о том, что этот домен связывает Z-ДНК неспецифическим образом. [30] [31] [32] Родственные домены были идентифицированы в ряде других белков благодаря гомологии последовательностей . [29]Идентификация домена Zα предоставила инструмент для других кристаллографических исследований, которые привели к характеристике Z-РНК и соединения B – Z. Биологические исследования показали, что Z-ДНК-связывающий домен ADAR1 может локализовать этот фермент, который модифицирует последовательность вновь образованной РНК на участки активной транскрипции. [33] [34] Роль Zα, Z-ДНК и Z-РНК в защите генома от инвазии ретро-элементов Alu у людей превратилась в механизм регуляции врожденных иммунных ответов на дцРНК. Мутации в Zα являются причиной человеческих интерферонопатий, таких как Менделирующий синдром Айкарди-Гутьера. [35] [18]

Последствия связывания Z-ДНК с белком E3L коровьей оспы [ править ]

Поскольку Z-ДНК была исследована более тщательно, было обнаружено, что структура Z-ДНК может связываться со связывающими белками Z-ДНК посредством лондонской дисперсии и водородных связей . [36] Одним из примеров связывающего Z-ДНК белка является белок E3L коровьей оспы , который является продуктом гена E3L и имитирует белок млекопитающих, который связывает Z-ДНК. [37] [38] Не только белок E3L имеет сродство к Z-ДНК, он также, как было установлено, играет роль в уровне тяжести вирулентности у мышей, вызываемой вирусом осповакцины, типом поксвируса . Двумя важными компонентами белка E3L, которые определяют вирулентность, являются N-конец и C-конец.. N-конец состоит из последовательности, аналогичной последовательности Zα-домена, также называемой z-альфа-доменом аденозиндезаминазы , тогда как C-конец состоит из двухцепочечного связывающего РНК-мотива. [37] Благодаря исследованиям, проведенным Kim, Y. et al. в Массачусетском технологическом институте было показано, что замена N-конца белка E3L на последовательность домена Zα, содержащую 14 связывающих остатков Z-ДНК, подобных E3L, практически не влияет на патогенность вируса у мышей. [37] Напротив, Kim, Y. et al. также обнаружили, что удаление всех 83 остатков N-конца E3L приводило к снижению вирулентности. Это подтверждает их утверждение о том, что N-конец, содержащий связывающие остатки Z-ДНК, необходим для вирулентности. [37]В целом, эти результаты показывают, что аналогичные связывающие остатки Z-ДНК на N-конце белка E3L и в домене Zα являются наиболее важными структурными факторами, определяющими вирулентность, вызываемую вирусом осповакцины, в то время как аминокислотные остатки, не участвующие в Z-ДНК. привязка практически не влияет. Будущее значение этих результатов включает уменьшение связывания Z-ДНК с E3L в вакцинах, содержащих вирус осповакцины, так что негативные реакции на вирус могут быть минимизированы у людей. [37]

Кроме того, Александр Рич и Джин-А Квон обнаружили, что E3L действует как трансактиватор для генов человеческого IL-6, NF-AT и p53. Их результаты показывают, что клетки HeLa, содержащие E3L, имели повышенную экспрессию генов IL-6, NF-AT и p53 человека, а точечные мутации или делеции некоторых связывающих Z-ДНК аминокислотных остатков снижали эту экспрессию. [36] В частности, мутации в Tyr 48 и Pro 63, как было обнаружено, уменьшают трансактивацию ранее упомянутых генов в результате потери водородных связей и лондонских дисперсионных сил между E3L и Z-ДНК. [36] В целом, эти результаты показывают, что уменьшение связей и взаимодействий между Z-ДНК и связывающими белками Z-ДНК снижает как вирулентность, так и экспрессию генов, тем самым показывая важность наличия связей между Z-ДНК и связывающим белком E3L.

Сравнение геометрии некоторых форм ДНК [ править ]

Вид сбоку на A-, B- и Z-ДНК.
Ось спирали A-, B- и Z-ДНК.
Геометрические атрибуты A-, B и Z-ДНК [39] [40] [41]
ФормаB-формаZ-форма
Чувство спиралиправшаправшалевша
Повторяющийся блок1 п.н.1 п.н.2 п.н.
Вращение / уд.32,7 °34,3 °30 °
бп / оборот111012
Наклон н.п. к оси+ 19 °−1,2 °−9 °
Подъем / уд. По оси2,3 Å (0,23 нм)3,32 Å (0,332 нм)3,8 Å (0,38 нм)
Шаг / поворот спирали28,2 Å (2,82 нм)33,2 Å (3,32 нм)45,6 Å (4,56 нм)
Средняя крутка пропеллера+ 18 °+ 16 °0 °
Гликозильный уголантиантиC: анти ,
G: син
Сахарная морщинкаC3'- эндоC2'- эндоC: C2′- эндо ,
G: C3′- эндо
Диаметр23 Å (2,3 нм)20 Å (2,0 нм)18 Å (1,8 нм)

См. Также [ править ]

  • ADAR1
  • ДНК суперспираль
  • E3L
  • Механические свойства ДНК
  • Протеопедия Z-ДНК
  • Спутниковая ДНК
  • Z-ДНК-связывающий белок 1 (ZBP1)
  • Зуотин

Ссылки [ править ]

  1. ^ Mitsui, Y .; Langridge, R .; Shortle, BE; Cantor, CR; Грант, RC; Kodama, M .; Уэллс, RD (1970). «Физические и ферментативные исследования поли d (I – C) · poly d (I – C), необычной двойной спирали ДНК». Природа . 228 (5277): 1166–1169. DOI : 10.1038 / 2281166a0 . PMID  4321098 .
  2. ^ Поль, FM; Джовин TM (1972). «Соль-индуцированное кооперативное конформационное изменение синтетической ДНК: равновесие и кинетические исследования с поли (dG-dC)». Журнал молекулярной биологии . 67 (3): 375–396. DOI : 10.1016 / 0022-2836 (72) 90457-3 . PMID 5045303 . 
  3. ^ Thamann, TJ; Лорд, RC; Wang, AH; Рич А. (1981). «Высоко солевая форма поли (dG – dC) · поли (dG – dC) - левосторонняя Z-ДНК: рамановские спектры кристаллов и растворов» . Исследования нуклеиновых кислот . 9 (20): 5443–5457. DOI : 10.1093 / NAR / 9.20.5443 . PMC 327531 . PMID 7301594 .  
  4. ^ Ван, AH; Quigley, GJ; Колпак, FJ; Кроуфорд, JL; ван Бум, JH; van der Marel, G .; Рич А. (1979). «Молекулярная структура левовращающего фрагмента двойной спирали ДНК при атомном разрешении». Природа . 282 (5740): 680–686. Bibcode : 1979Natur.282..680W . DOI : 10.1038 / 282680a0 . PMID 514347 . 
  5. ^ a b Ha, SC; Lowenhaupt, K .; Rich, A .; Kim, YG; Ким, К.К. (2005). «Кристаллическая структура соединения между B-ДНК и Z-ДНК выявляет два выдавленных основания». Природа . 437 (7062): 1183–1186. Bibcode : 2005Natur.437.1183H . DOI : 10,1038 / природа04088 . PMID 16237447 . 
  6. ^ Placido, D .; Браун, BA, II; Lowenhaupt, K .; Rich, A .; Афанасиадис, А. (2007). «Левая двойная спираль РНК, связанная Zalpha-доменом фермента, редактирующего РНК ADAR1» . Структура . 15 (4): 395–404. DOI : 10.1016 / j.str.2007.03.001 . PMC 2082211 . PMID 17437712 .  
  7. ^ Холл, К .; Cruz, P .; Тиноко, И., младший; Джовин, ТМ; ван де Санде, Дж. Х. (октябрь 1984 г.). « ' Z-RNA'-левша РНК двойной спирали». Природа . 311 (5986): 584–586. Bibcode : 1984Natur.311..584H . DOI : 10.1038 / 311584a0 . PMID 6482970 . 
  8. ^ де Роса, М .; de Sanctis, D .; Росарио, Алабама; Арчер, М .; Rich, A .; Афанасиадис, А .; Каррондо, Массачусетс (май 2010 г.). «Кристаллическая структура стыка двух спиралей Z-ДНК» . Труды Национальной академии наук . 107 (20): 9088–9092. Bibcode : 2010PNAS..107.9088D . DOI : 10.1073 / pnas.1003182107 . PMC 2889044 . PMID 20439751 .  
  9. ^ Чжан, H .; Yu, H .; Ren, J .; Цюй, X. (2006). «Обратимый переход B / Z-ДНК в условиях низкого содержания соли и селективности не-B-формы поли (dA) поли (dT) кубаноподобным комплексом европий- L- аспарагиновая кислота» . Биофизический журнал . 90 (9): 3203–3207. Bibcode : 2006BpJ .... 90.3203Z . DOI : 10.1529 / biophysj.105.078402 . PMC 1432110 . PMID 16473901 .  
  10. ^ Хо, PS; Эллисон, MJ; Quigley, GJ; Рич А. (1986). «Компьютерный термодинамический подход для предсказания образования Z-ДНК в естественных последовательностях» . EMBO Journal . 5 (10): 2737–2744. DOI : 10.1002 / j.1460-2075.1986.tb04558.x . PMC 1167176 . PMID 3780676 .  
  11. ^ a b Чемпион, ПК; Maurice, S .; Варгасон, JM; Лагерь, Т .; Хо, PS (2004). «Распределение Z-ДНК и ядерного фактора I в хромосоме 22 человека: модель сопряженной регуляции транскрипции» . Исследования нуклеиновых кислот . 32 (22): 6501–6510. DOI : 10.1093 / NAR / gkh988 . PMC 545456 . PMID 15598822 .  
  12. ^ Ван, Эндрю Х.-Дж .; Куигли, Гэри Дж .; Колпак, Фрэнсис Дж .; Кроуфорд, Джеймс Л .; ван Бум, Жак Х .; van der Marel, Gijs; Рич, Александр (декабрь 1979). «Молекулярная структура левовращающего фрагмента двойной спирали ДНК при атомном разрешении». Природа . 282 (5740): 680–686. Bibcode : 1979Natur.282..680W . DOI : 10.1038 / 282680a0 . ISSN 0028-0836 . PMID 514347 .  
  13. ^ a b c Ли, Джуйонг; Ким, Ян-Гюн; Ким, Кён Гю; Сок, Чаок (05.08.2010). «Переход между B-ДНК и Z-ДНК: ландшафт свободной энергии для распространения соединения B-Z». Журнал физической химии B . 114 (30): 9872–9881. CiteSeerX 10.1.1.610.1717 . DOI : 10.1021 / jp103419t . ISSN 1520-6106 .  
  14. ^ a b c d Ким, Сук Хо; Лим, Со-Хи; Ли, Эй-Ри; Квон, До Хун; Сон, Хён Гю; Ли, Джун-Хва; Чо, Минхенг; Джонер, Альберт; Ли, Нам-Кён (23.03.2018). «Раскрытие пути к Z-ДНК в индуцированном белком переходе B – Z» . Исследования нуклеиновых кислот . 46 (8): 4129–4137. DOI : 10.1093 / NAR / gky200 . ISSN 0305-1048 . PMC 5934635 . PMID 29584891 .   
  15. ^ Купер, Дэвид; Хм, Хойи; Таузин, Лоуренс Дж .; Поддар, Нитеш; Ландес, Кристи Ф. (2013-06-03). "Время жизни фотообесцвечивания цианиновых флуорофоров, используемых для одномолекулярного резонансного переноса энергии Ферстера в присутствии различных систем фотозащиты" . ChemBioChem . 14 (9): 1075–1080. DOI : 10.1002 / cbic.201300030 . ISSN 1439-4227 . PMC 3871170 . PMID 23733413 .   
  16. ↑ Диденко, Владимир В. (ноябрь 2001 г.). «ДНК-зонды с использованием флуоресцентного резонансного переноса энергии (FRET): конструкции и приложения» . Биотехнологии . 31 (5): 1106–1121. DOI : 10.2144 / 01315rv02 . ISSN 0736-6205 . PMC 1941713 . PMID 11730017 .   
  17. ^ Герберт, А .; Alfken, J .; Kim, Y.-G .; Миан, IS; Nishikura, K .; Рич, А. (1997-08-05). «Связывающий домен Z-ДНК, присутствующий в человеческом редактирующем ферменте, двухцепочечной РНК-аденозиндезаминазе» . Труды Национальной академии наук . 94 (16): 8421–8426. Bibcode : 1997PNAS ... 94.8421H . DOI : 10.1073 / pnas.94.16.8421 . ISSN 0027-8424 . PMC 22942 . PMID 9237992 .   
  18. ^ а б Герберт, А. (2019). «Менделирующая болезнь, вызванная вариантами, влияющими на распознавание Z-ДНК и Z-РНК доменом Zα фермента редактирования двухцепочечной РНК ADAR» . Европейский журнал генетики человека . 8 : 114–117. DOI : 10.1038 / s41431-019-0458-6 . PMC 6906422 . PMID 31320745 .  
  19. ^ Герберт, А. (2019). «ADAR и иммунное молчание при раке». Тенденции рака . 5 (5): 272–282. DOI : 10.1016 / j.trecan.2019.03.004 . PMID 31174840 . 
  20. ^ а б Сурам, Анита; Рао, Джаганнатха К.С.; S., Latha K .; А., Вишвамитра М. (2002). «Первые доказательства топологического изменения ДНК с конформации B-ДНК на Z-ДНК в гиппокампе мозга при болезни Альцгеймера». Нейромолекулярная медицина . 2 (3): 289–298. DOI : 10,1385 / нм: 2: 3: 289 . ISSN 1535-1084 . 
  21. ^ Лафер, EM; Валле, РП; Möller, A; Нордхейм, А; Schur, PH; Рич, А; Столлар, Б.Д. (1 февраля 1983 г.). «Z-ДНК-специфические антитела при системной красной волчанке человека» . Журнал клинических исследований . 71 (2): 314–321. DOI : 10,1172 / jci110771 . ISSN 0021-9738 . PMC 436869 . PMID 6822666 .   
  22. ^ Rich, A; Чжан, С (2003). «Хронология: Z-ДНК: долгий путь к биологической функции». Природа Обзоры Генетики . 4 (7): 566–572. DOI : 10.1038 / nrg1115 . PMID 12838348 . 
  23. ^ Виттиг, B .; Dorbic, T .; Рич А. (1991). «Транскрипция связана с образованием Z-ДНК в метаболически активных пермеабилизированных ядрах клеток млекопитающих» . Труды Национальной академии наук . 88 (6): 2259–2263. Bibcode : 1991PNAS ... 88.2259W . DOI : 10.1073 / pnas.88.6.2259 . PMC 51210 . PMID 2006 166 .  
  24. ^ Вонг, B .; Chen, S .; Kwon, J.-A .; Рич А. (2007). «Характеристика Z-ДНК как элемента границы нуклеосомы в дрожжах Saccharomyces cerevisiae » . Труды Национальной академии наук . 104 (7): 2229–2234. Bibcode : 2007PNAS..104.2229W . DOI : 10.1073 / pnas.0611447104 . PMC 1892989 . PMID 17284586 .  
  25. ^ a b c Wang, G .; Кристенсен, Луизиана; Васкес, К.М. (2006). «Последовательности, образующие Z-ДНК, вызывают крупномасштабные делеции в клетках млекопитающих» . Труды Национальной академии наук . 108 (8): 2677–2682. Bibcode : 2006PNAS..103.2677W . DOI : 10.1073 / pnas.0511084103 . PMC 1413824 . PMID 16473937 .  
  26. ^ a b Freund, AM; Bichara, M .; Фукс, Р.П. (1989). «Последовательности, образующие Z-ДНК, представляют собой горячие точки спонтанных делеций» . Труды Национальной академии наук . 86 (19): 7465–7469. Bibcode : 1989PNAS ... 86.7465F . DOI : 10.1073 / pnas.86.19.7465 . PMC 298085 . PMID 2552445 .  
  27. ^ Рой Чоудхури, А .; Бакши, Р .; Wang, J .; Йылдырыр, Г .; Лю, Б .; Папас-Браун, В .; Толун, Г .; Гриффит, Дж. Д.; Шапиро Т.А.; Дженсен, RE; Englund, PT (декабрь 2010 г.). «Убийство африканских трипаносом бромистым этидием» . PLoS Патогены . 6 (12): e1001226. DOI : 10.1371 / journal.ppat.1001226 . PMC 3002999 . PMID 21187912 .  
  28. ^ Герберт, А .; Рич А. (1993). «Способ идентификации и характеристики связывающих Z-ДНК белков с использованием линейного олигодезоксинуклеотида» . Исследования нуклеиновых кислот . 21 (11): 2669–2672. DOI : 10.1093 / NAR / 21.11.2669 . PMC 309597 . PMID 8332463 .  
  29. ^ а б Герберт, А .; Alfken, J .; Kim, YG; Миан, IS; Nishikura, K .; Рич А. (1997). «Связывающий домен Z-ДНК, присутствующий в человеческом редактирующем ферменте, двухцепочечной РНК-аденозиндезаминазе» . Труды Национальной академии наук . 94 (16): 8421–8426. Bibcode : 1997PNAS ... 94.8421H . DOI : 10.1073 / pnas.94.16.8421 . PMC 22942 . PMID 9237992 .  
  30. ^ Герберт, А .; Schade, M .; Lowenhaupt, K .; Альфкен, Дж; Schwartz, T .; Шляхтенко, Л.С.; Любченко Ю.Л .; Рич А. (1998). «Домен Zα из человеческого ADAR1 связывается с конформером Z-ДНК многих различных последовательностей» . Исследования нуклеиновых кислот . 26 (15): 2669–2672. DOI : 10.1093 / NAR / 26.15.3486 . PMC 147729 . PMID 9671809 .  
  31. ^ Шварц, Т .; Рулд, Массачусетс; Lowenhaupt, K .; Герберт, А .; Рич А. (1999). «Кристаллическая структура домена Zα редактирующего фермента человека ADAR1, связанного с левой Z-ДНК». Наука . 284 (5421): 1841–1845. DOI : 10.1126 / science.284.5421.1841 . PMID 10364558 . 
  32. ^ Schade, M .; Тернер, CJ; Kühne, R .; Schmieder, P .; Lowenhaupt, K .; Герберт, А .; Rich, A .; Ошкинат, H (1999). «Структура раствора Zα-домена фермента редактирования РНК человека ADAR1 обнаруживает предрасположенную поверхность связывания для Z-ДНК» . Труды Национальной академии наук . 96 (22): 2465–2470. Bibcode : 1999PNAS ... 9612465S . DOI : 10.1073 / pnas.96.22.12465 . PMC 22950 . PMID 10535945 .  
  33. ^ Герберт, А .; Рич А. (2001). «Роль связывающих доменов для дцРНК и Z-ДНК в редактировании in vivo минимальных субстратов с помощью ADAR1» . Труды Национальной академии наук . 98 (21): 12132–12137. Bibcode : 2001PNAS ... 9812132H . DOI : 10.1073 / pnas.211419898 . PMC 59780 . PMID 11593027 .  
  34. ^ Halber, D. (1999-09-11). «Ученые наблюдают биологическую активность« левой »ДНК» . MIT News Office . Проверено 29 сентября 2008 .
  35. ^ Герберт, А. (2019). «Z-ДНК и Z-РНК при заболеваниях человека» . Биология коммуникации . 2 : 7. DOI : 10.1038 / s42003-018-0237-х . PMC 6323056 . PMID 30729177 .  
  36. ^ a b c Kwon, J.-A .; Рич, А. (26 августа 2005 г.). «Биологическая функция Z-ДНК-связывающего белка вируса осповакцины E3L: трансактивация генов и антиапоптотическая активность в клетках HeLa» . Труды Национальной академии наук . 102 (36): 12759–12764. DOI : 10.1073 / pnas.0506011102 . ISSN 0027-8424 . 
  37. ^ a b c d e Kim, Y.-G .; Muralinath, M .; Брандт, Т .; Pearcy, M .; Hauns, K .; Lowenhaupt, K .; Джейкобс, Б.Л .; Рич, А. (30 мая 2003 г.). «Роль связывания Z-ДНК в патогенезе вируса осповакцины» . Труды Национальной академии наук . 100 (12): 6974–6979. DOI : 10.1073 / pnas.0431131100 . ISSN 0027-8424 . PMC 165815 . PMID 12777633 .   
  38. ^ Kim, Y.-G .; Lowenhaupt, K .; О, Д.-Б .; Kim, KK; Рич, А. (02.02.2004). «Доказательства того, что фактор вирулентности осповакцины E3L связывается с Z-ДНК in vivo: значение для разработки терапии поксвирусной инфекции» . Труды Национальной академии наук . 101 (6): 1514–1518. DOI : 10.1073 / pnas.0308260100 . ISSN 0027-8424 . PMC 341766 . PMID 14757814 .   
  39. ^ Sinden, Ричард Р. (1994). Структура и функция ДНК (1-е изд.). Академическая пресса. п. 398. ISBN 978-0-126-45750-6.
  40. ^ Rich, A .; Norheim, A .; Ван, AH (1984). «Химия и биология левосторонней Z-ДНК». Ежегодный обзор биохимии . 53 (1): 791–846. DOI : 10.1146 / annurev.bi.53.070184.004043 . PMID 6383204 . 
  41. ^ Хо, PS (1994-09-27). «Не-B-ДНК структура d (CA / TG) n не отличается от Z-ДНК» . Труды Национальной академии наук . 91 (20): 9549–9553. Bibcode : 1994PNAS ... 91.9549H . DOI : 10.1073 / pnas.91.20.9549 . PMC 44850 . PMID 7937803 .