Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Протеопедия
Proteopedia logo.gif
Тип бизнесаНекоммерческая
Тип сайта
Интернет-энциклопедия
Доступно ванглийский
СделаноДжоэл Л. Сассман, Эран Ходис и Хайме Прилуски
URLproteopedia.org
КоммерческийНет
Запущен2007 г.
Текущее состояниеПостоянное незавершенное производство

Proteopedia - это вики , трехмерная энциклопедия белков и других молекул . [1] [2] [3] [4] Сайт содержит страницу для каждой записи в банке данных о белках (> 130 000 страниц), а также страницы, которые более подробно описывают структуры белков в целом, такие как ацетилхолинэстераза , [5 ] гемоглобин , [6] и фотосистемы II , [7] с Jmol зрением , который подчеркивает функциональные сайты и лигандов. В нем используется инструмент для создания сцен, поэтому пользователям не нужно изучать язык сценариев JSmol для создания настраиваемых молекулярных сцен. Пользовательские сцены легко прикрепляются к «зеленым ссылкам» в описательном тексте, который отображает эти сцены в JSmol. Веб-браузер - это все, что нужно для доступа к сайту и трехмерной информации; установка программ просмотра не требуется.

Proteopedia был лауреатом премии 2010 года за лучший веб-сайт журнала The Scientist . [8]

Правовые аспекты [ править ]

Условия лицензирования [ править ]

Все материалы, добавленные пользователями, бесплатны и защищены лицензией GNU Free Documentation License . Proteopedia находится в Израильском центре структурной протеомики [9] при Научном институте Вейцмана .

См. Также [ править ]

Ссылки [ править ]

  1. ^ Hodis Е, Prilusky Дж, Мартц Е, Silman I, J Линька, Сассмен ДЛ (2008). «Протеопедия - научная« вики », преодолевающая разрыв между трехмерной структурой и функцией биомакромолекул» . Genome Biol . 9 (8): R121. DOI : 10.1186 / GB-2008-9-8-R121 . PMC  2575511 . PMID  18673581 .
  2. ^ Martz E (2009). "Proteopedia.Org: научная" Wiki ", преодолевающая разрыв между трехмерной структурой и функцией биомакромолекул" . Биополимеры . 92 (1): 76–7. DOI : 10.1002 / bip.21126 . PMID 19117028 . 
  3. ^ Hodis Е, Prilusky Дж, Сассмен ДЛ (2010). «Proteopedia: совместный виртуальный трехмерный веб-ресурс, посвященный структуре и функциям белков и биомолекул» . Биохимия и молекулярная биология образования . 38 (5): 341–2. DOI : 10.1002 / bmb.20431 . PMID 21567857 . 
  4. ^ Прилуски, J; Hodis, E .; Canner, D .; Decatur, WA; Oberholser, K .; Martz, E .; Берчанский, А .; Harel, M .; Суссман, JL (август 2011 г.). «Proteopedia: отчет о состоянии совместной трехмерной сетевой энциклопедии белков и других биомолекул». Журнал структурной биологии . 175 (2): 244–252. DOI : 10.1016 / j.jsb.2011.04.011 . PMID 21536137 . 
  5. ^ «Ацетилхолинэстераза» . Протеопедия.
  6. ^ «Гемоглобин» . Протеопедия.
  7. ^ "Фотосистема II" . Протеопедия.
  8. ^ Луиджи C (сентябрь 2010). "Web Gems Представляем победителей первых ежегодных конкурсов Labbies, наши призы лабораторий за лучшее веб-мультимедиа: Победитель веб-сайта: Proteopedia" . Ученый . 24 (9): 47. Очень увлекательно. Я долго смотрел и играл (и учился) с ним. Очень информативный и хороший ресурс.
  9. ^ "Израильский центр структурной протеомики" .

Внешние ссылки [ править ]

  • Сайт Proteopedia