Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
Зив Бар-Джозеф
Зив Бар-Джозеф выступает на ISMB в 2012 году
Зив Бар-Джозеф выступает на ISMB в 2012 году
Родившийся1971 год (49–50 лет) [1]
Альма-матер
НаградыПриз Овертона (2012)
Научная карьера
Поля
Учреждения
ТезисВывод взаимодействий, программ экспрессии и регулирующих сетей на основе биологических данных с высокой пропускной способностью  (2003)
Докторант
Веб-сайтwww .cs .cmu .edu / ~ zivbj /

Зив Бар-Джозеф - израильский вычислительный биолог и профессор кафедры вычислительной биологии и машинного обучения Школы компьютерных наук Карнеги-Меллона . [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10]

Образование [ править ]

Бар-Джозеф изучал информатику на уровне бакалавра наук (1997 г.) и магистра наук (1999 г.) в Еврейском университете Иерусалима . Он получил докторскую степень в Массачусетском технологическом институте информатики в 2003 году под руководством Дэвида К. Гиффорда и Томми С. Яаккола. [1] После этого он работал научным сотрудником в Лаборатории компьютерных наук и искусственного интеллекта Массачусетского технологического института (CSAIL) и в Институте Уайтхеда . [11]

Исследование [ править ]

Исследования Бар-Джозефа в Карнеги-Меллон в первую очередь сосредоточены на разработке вычислительных методов, позволяющих лучше понять взаимодействия и динамику сложных биологических систем, особенно систем, которые меняются со временем, таких как клеточный цикл . [3] [12]

В Массачусетском технологическом институте группа Бар-Джозефа разработала новый алгоритм для обнаружения регуляторных сетей генных модулей у дрожжей. Эти модули представляют собой группы генов, которые работают вместе для выполнения таких задач, как дыхание, синтез белка и реакция на внешний стресс. [12] [13]

Он также интересуется, как идеи из информатики и биологии могут быть использованы для воздействия на другую область, в частности, как природные алгоритмы могут быть использованы для улучшения алгоритмов распределенных вычислений . [3] [14]

Награды и награды [ править ]

Бар-Джозеф был награжден премией DIMACS-Celera Genomics для аспирантов в области вычислительной молекулярной биологии и наградой NSF CAREER. [15] В 2012 году он был награжден Премией Овертона ISCB в знак признания его значительного и длительного вклада в вычислительную биологию. [16]

Он был сопредседателем конференции Research in Computational Molecular Biology (RECOMB) в 2009 и 2010 годах, а в 2013 году вошел в совет директоров журнала Bioinformatics в качестве младшего редактора [17].

Личная жизнь [ править ]

Бар-Джозеф увлечен бегом и пробежал несколько марафонов продолжительностью менее 3 часов. [3] [12] [16] Он живет в Питтсбурге и Шохаме со своей женой и тремя детьми. [12]

См. Также [ править ]

  • Михал Линиал

Ссылки [ править ]

  1. ^ a b c Бар-Джозеф, Зив (2003). Вывод взаимодействий, программ экспрессии и регуляторных сетей на основе биологических данных с высокой пропускной способностью (кандидатская диссертация). Массачусетский Институт Технологий. ЛВП : 1721,1 / 28289 .
  2. ^ "Израильские ученые открыли фонтан молодости?" . www.israel21c.org . Проверено 13 февраля 2014 .
  3. ^ a b c d "Зив Бар-Джозеф" . www.cs.cmu.edu . Проверено 13 февраля 2014 .
  4. Перейти ↑ Lee, TI (2002). «Транскрипционные регуляторные сети в Saccharomyces cerevisiae». Наука . 298 (5594): 799–804. Bibcode : 2002Sci ... 298..799L . DOI : 10.1126 / science.1075090 . PMID 12399584 . S2CID 4841222 .  
  5. Перейти ↑ Bar-Joseph, Z. (2004). «Анализ данных экспрессии генов временных рядов» . Биоинформатика . 20 (16): 2493–2503. DOI : 10.1093 / биоинформатики / bth283 . PMID 15130923 . 
  6. ^ Бар-Джозеф, публикации Зива, проиндексированныебиблиографической базой данных Scopus . (требуется подписка)
  7. ^ Зив Бар-Джозеф насервере библиографии DBLP
  8. ^ Список публикаций из Microsoft Academic
  9. ^ Зив Бар-Джозеф странице профиля автора в ACM Digital Library
  10. ^ Бар-Джозеф, З .; Эль-Янив, Р .; Лищинский, Д .; Верман, М. (2001). «Смешивание текстур и синтез текстурных фильмов с использованием статистического обучения». IEEE Transactions по визуализации и компьютерной графике . 7 (2): 120. DOI : 10,1109 / +2945,928165 .
  11. ^ "Зив Бар-Джозеф CV" (PDF) . Проверено 16 февраля 2014 года .
  12. ^ a b c d "Бегущий человек - Школа компьютерных наук Карнеги-Меллона" . www.cs.cmu.edu . 2011-08-23 . Проверено 13 февраля 2014 .
  13. ^ Бар-Джозеф, З .; Гербер, Г.К .; Ли, Т.И.; Ринальди, штат Нью-Джерси; Ю, JY; Роберт, ФО; Гордон, ДБ; Fraenkel, E .; Яаккола, TS; Янг, РА; Гиффорд, Д.К. (2003). «Вычислительное открытие генных модулей и регуляторных сетей». Природа Биотехнологии . 21 (11): 1337–42. DOI : 10.1038 / nbt890 . PMID 14555958 . S2CID 6210576 .  
  14. ^ «Алгоритмы в природе» . Проверено 21 февраля 2014 года .
  15. ^ "Тезисы и биографии основных докладчиков" . www.iscb.org . ISCB . Проверено 16 февраля 2014 года .
  16. ^ a b Mullins, J .; Моррисон Маккей, Би Джей (2012). «Международное общество вычислительной биологии награждает Гуннара фон Хейне и Зива Бар-Джозефа лучшими наградами в области биоинформатики / вычислительной биологии за 2012 год» . PLOS Вычислительная биология . 8 (5): e1002535. Bibcode : 2012PLSCB ... 8E2535M . DOI : 10.1371 / journal.pcbi.1002535 . PMC 3364933 . 
  17. ^ «Годовой отчет ISCB за 2013 год» . www.iscb.org . ISCB . Проверено 15 февраля 2014 года .