Пещера расположена на 300 метров к западу от Дряновского монастыря, на высоте 335 метров над уровнем моря. Для сохранения пещеры она объявлена памятником природы.
Лучше всего изучен археологами первый грот пещеры. Здесь открыты орудия труда и следы активной деятельности древнего человека, датируемые средним (70 000 — 50 000 гг. до н. э.) и верхним (45 000 до 20 000 гг. до н. э.) палеолитом. Опубликованные в 2020 году находки представляют наиболее раннее свидетельство присутствия Homo sapiens в Европе, когда в ней всё ещё жили неандертальцы[1]. Принадлежность человеческих костных останков человеку разумному доказали анализом белковых последовательностей (протеом) методом масс-спектрометрии и изучением митохондриальной ДНК.
Температура внутри пещеры постоянная — 13 °C, влажность — 95 %. Пещера образована водами реки Андыки. Открыты следы человеческой культуры, кости диких и домашних животных. Также найден скелет медведя размером 3 метра.
Карстовые образования в пещере отдалённо напоминают рыб, змей, людей, Богородицу с младенцем, медведя и много других. Одна из популярных среди туристов частей пещеры — «Чистилище» — низкий и труднопроходимый коридор размерами 60 на 40 см, через который, как говорят, могут пройти только праведники.
У образцов ВВ7-240 и CC7-335 возрастом более 45 тыс. л. н. генетики определили митохондриальную гаплогруппу N[2] и Y-хромосомную гаплогруппу C1 (C-F3393)[3]. У образца CC7-2289 (ок. 44 тыс. л. н.) определили митохондриальную гаплогруппу R[2]. У образцов AA7-738 (ок. 43,5 тыс. л. н.) и F6-620 (44 180—42 450 лет до н. э.) определили митохондриальную гаплогруппу M[2]. У образца F6-620 определили Y-хромосомную гаплогруппу F (F-M89)[3]. У образца BK-1653 возрастом ок. 34,5 тыс. л. н. определили митохондриальную гаплогруппу U8[4][2][5]. Геномы ранних образцов из Бачо Киро возрастом 42580—45930 л. н. (IUP Bacho Kiro) отдалённо связаны с 40 тысячелетним человеком из пещеры Тяньюань в Китае, в меньшей степени с GoyetQ116-1 из Бельгии и усть-ишимским человеком, а также с другими древними и современными геномами восточноазиатов и коренных американцев. F6-620, BB7-240 и CC7-335 имеют в своей ДНК 3,8 %, 3,0 % и 3,4 % примеси от неандертальцев, появившейся в результате скрещивания шестью или семью поколениями ранее. Это говорит о том, что IUP Bacho Kiro произошли от древней популяции, которая когда-то распространилась по всей Евразии, но в Европе её потомки вымерли. Более поздние особи из пещеры Бачо Киро (BK1653) были ближе к современным европейским популяциям, чем к современным азиатским[2][6][7].
В пещере Бачо Киро от начала декабря до конца марта в среднем регистрируются до 100 больших и малых подковоносов[8].