Гаплогруппа J1 происходит от мутации гаплогруппы J, произошедшей у мужчины, жившего ок. 31 600 лет назад. Последний общий предок современных носителей гаплогруппы J1 жил 27 800 лет назад (даты определены по снипам компанией YFull[3]).
Распространение J1 за пределами Ближнего Востока может быть связано с неолитическими передвижениями народов (J1*) и позже миграциями семито-говорящего населения Ближнего Востока в Испанию, Пакистан и другие регионы.
По результатам раннего коммерческого тестирования сложилось впечатление, что большинство современных носителей данной гаплогруппы относятся именно к подгруппе J1c3-P58, что уже ныне подтвердилось более широким тестированием и является очевидным фактом.[источник не указан 954 дня]
J1-Z18471 сформировалась около 8100 лет назад и разделилась на субклады J1-Z1842 и J1-L1189/BY94 около 7000 лет назад[4].
Самая многочисленная подгруппа J1c3 (P58) распространена в значительной степени среди евреев и населения Аравийского полуострова. Также гаплогруппа в целом широко распространена в Леванте и среди семитоязычного населения Северной Африки — например, ассирийцев, палестинцев-христиан, друзов. Для евреев характерны субклады J1c3* и J1c3d* (коэны). Например корневой субклад J1* (M267), будучи характерным для ассирийцев, народов Дагестана, Чечни, европейцев, у евреев и арабов практически не наблюдается.
Наибольшая концентрация данной гаплогруппы, субклад J1c3d*, наблюдается в Йемене[5][6] и Саудовской Аравии[7], среди палестинцев[8], в Сирии и Ливане[9].