Иоганн Филипп фон Шёнборн (нем. Johann Philipp von Schönborn; 6 августа 1605, замок Лаубузешбах, Таунус — 12 февраля 1673, Вюрцбург) — курфюрст-архиепископ Майнцский (с 1647 года), епископ Вюрцбургский (с 1642 года), епископ Вормский (с 1663 года). Один из идеологов Вестфальского мира.
Иоганн-Филипп принадлежал к аристократическому роду Шёнборн, известному в регионе реки Лан с XIII столетия. Отцом его был амтман на службе у майнцкого курфюрста Георг фон Шёнборн, мать — Барбара фон дер Лайен. Некоторые члены семейства фон Шёнборн в XVI столетии приняли протестантизм, и по некоторым сведениям сам Иоганн Филипп в младенчестве был крещён по протестантскому обряду, однако затем воспитывался матерью в католической вере.
Образование получил в иезуитском коллеже Майнца, затем учился юриспруденции в Орлеане и в Сиене. с ранних лет готовился к духовной карьере. В 1621 году становится каноником в Вюрцбурге, в 1625 году — в Майнце. В 1626 году принял миропомазание в Майнце, в 1629 году становится членом соборного капитула в Майнце.
В 1631 году, во время Тридцатилетней войны, бежит перед наступающей на Майнц шведской армией в Кёльн, где к этому времени собралась практически вся духовно-католическая верхушка Священной Римской империи. Здесь Иоганн-Фридрих знакомится с оказавшим впоследствии на него значительное влияние иезуитом Фридрихом Шпее фон Лангенфельдом, активным противником развернувшихся в Германии и Австрии XVII столетий так называемых «процессов против ведьм».
8 сентября 1642 года Иоганн-Филипп становится епископом Вюрцбурга, заняв этот пост, активно занимается улаживанием противоречий между воюющими в Тридцатилетней войне сторонами, приведшим в результате к Вестфальскому миру 1648 года. Убедившись в том, что выиграть войну против франко-шведской коалиции Священная Римская империя не в состоянии, епископ начинает зондировать почву для широких переговоров. Однако так как его собственная позиция в данном вопросе была слаба, Иоганн-Филипп ищет союзников, и находит такого во французском первом министре Жюле Мазарини. Заботясь о сословных правах германской земельной аристократии, епископ добивается рассмотрения её привилегий на Вестфальском конгрессе и посылает туда делегацию. На активную деятельность Иоганна-Филиппа обращает серьёзное внимание как императорский двор в Вене, так и французское правительство. Имперское правительство увидело угрозу в расколе между своей жёсткой централизаторской политикой и местными владетелями в Германии, и пошло на целый ряд уступок на Вестфальских переговорах. Так как на переговорах, по настоянию Швеции, рассматривались также и религиозные вопросы внутри Германии, Иоганн-Филипп был и здесь готов к компромиссам — чем, однако, вызвал недовольство папы и его представителя, нунция Фабио Чиги .