Красная книга Республики Башкортостан — перечень редких и находящихся под угрозой исчезновения видов животных и растений на территории Башкирии.
В 1984 году вышло первое неофициальное издание Красной книги Башкирской АССР, а в 1987 году она была переиздана с небольшими изменениями (исключено 3 и добавлено 17 видов), в состав последней вошли 184 вида высших сосудистых растений и 154 вида животных[1].
В настоящее время на охраняемых природных территориях республики под защитой такие животные, как лось, марал, косуля, медведь, рысь, бобр, барсук, сурок-байбак, кабан, норка, выхухоль и некоторые другие.
За четыре века с территории Башкирии исчезли 10 видов животных, это тарпан, северный олень, сайгак, росомаха, соболь, чёрный гриф, белоголовый сип, дрофа, кудрявый пеликан, белорыбица.
Красная книга РБ охватывает не только тех животных, которые уже оказались редкими, то есть на грани исчезновения, но и тех, которые могут пополнить этот список в ближайшее время.
В Красной книге РБ описаны Правила добывания объектов животного и растительного мира, относящихся к видам, занесенным в Красную книгу Республики Башкортостан, и ответственность за нарушение этих правил.