В годы Российской империи село Марзили (Марзилу 1-е) находилось в составе Шушинского уезда Елизаветпольской губернии. По данным «Кавказского календаря» на 1912 год в селе проживало 1625 человек, в основном азербайджанцы, указанные в календаре как «татары»[1].
В ходе Карабахской войны село было оккупировано армянами. Согласно административно-территориальному делению непризнанной Нагорно-Карабахской Республики, фактически контролировавшей село с 1993 по 2020 год, было расположено в Мартунинском районе НКР.
В результате Второй Карабахской войны было достигнуто соглашение о прекращении огня, согласно которому, 20 ноября 2020 года, территория Агдамского района, в том числе село Марзили, была возвращена Азербайджану.[2][3].