Родился 4 мая 1796 года в семье действительного статского советника, обер-прокурора Сената Тимофея Ивановича Можайского (1760—1805).
Был зачислен 23 января 1807 года в Морской кадетский корпус; 7 июня 1812 года произведён в чин гардемарина; 21 июля 1815 года выпущен из корпуса с производством в мичманы. В следующем году совершил плавание на корабле «Трех Иерархов» до Ревеля. В 1817—1818 годах совершил переход на корабле «Любек» до Кадиса и вернулся обратно на испанском транспорте.
27 февраля 1820 года был произведен в чин лейтенанта; 15 ноября 1823 года назначен помощником лоц-капитан в Роченсальме, где до 1832 года обучал лоцманов плаванию в финских шхерах.
1 января 1831 года был произведён в чин капитан-лейтенанта и в 1832—1848 годах исполнял должность капитана Архангельского порта, одновременно, в 1833 и 1835 годах командуя 8-пушечной шхуной «№ 2»[1], занимавшей брандвахтенный пост в Лапоминской гавани.
В 1836 году награжден орденом Св. Станислава 3-й степени; 6 декабря 1838 года произведён в капитаны 2-го ранга; в 1839 году награждён орденом Св. Анны 3-й степени; 30 марта 1841 года произведён в капитаны 1-го ранга; в 1844 году награждён орденом Св. Станислава 2-й степени.
21 января 1848 года был назначен старшим адъютантом при дежурном генерале Главного Морского штаба графе Л. Л. Гейдене, а 3 ноября того же года назначен и. д. капитана Гребного порта и 6 декабря 1850 года был произведён в чин генерал-майора с утверждением в должности. В 1851 году награжден орденом Св. Владимира 4-й степени, в 1853 году — орденом Св. Анны 2-й степени, 17 апреля 1855 года — орденом Св. Владимира 3-й степени.