Monodnaviria (лат.) — реалм[Ком. 1] ДНК-содержащих вирусов. Геном большинства членов реалма представлен кольцевой[англ.] одноцепочечной ДНК, которая реплицируется по типу катящегося кольца, причём инициация репликации обеспечивается эндонуклеазой из суперсемейства HUH, закодированной в геномах Monodnaviria. В состав реалма также включаются вирусы, произошедшие от «типичных» Monodnaviria и имеющих либо линейный геном, представленный одноцепочечной ДНК, либо геном в виде кольцевой двуцепочечной ДНК.
Реалм Monodnaviria был выделен в 2019 году и содержит четыре царства: Loebvirae[англ.], Sangervirae[англ.], Trapavirae[англ.] и Shotokuvirae. Представители трёх первых царств поражают прокариот, а представители царства Shotokuvirae, в состав которого входят и атипичные Monodnaviria, инфицируют эукариот. В ходе эволюции представители Monodnaviria, вероятно, возникали неоднократно и независимо от линейных плазмид бактерий и архей, которые кодируют эндонуклеазу HUH. Члены реалма, поражающие эукариот, по-видимому, также возникали несколько раз в ходе рекомбинации, которая приводила к слиянию вышеупомянутых плазмид с фрагментами ДНК, кодирующими белки капсида ряда РНК-содержащих вирусов. Большинство вирусов, имеющих одноцепочечную геномную ДНК, входят в состав реалма Monodnaviria.
Прототипные члены реалма часто обозначаются как CRESS-ДНК-вирусы. CRESS-ДНК-вирусы вызывают широкий спектр заболеваний, включая инфекции хозяйственно значимых культур растений, кроме того, они могут вызывать заболевания и у животных. К атипичным представителям реалма относятся, в числе прочих, папилломавирусы и полиомавирусы, которые могут вызывать разные виды рака. Многие представители Monodnaviria способны встраиваться в геномы своих хозяев, кроме того, среди Monodnaviria есть и вирусы, характеризующиеся высокой частотой мутаций и рекомбинаций.
Название таксона происходит от др.-греч. μόνος, что означает «одиночный» (отсылка к одноцепочной ДНК), и DNA (ДНК), а также стандартного для реалмов суффикса -viria[2].
Все прототипные члены Monodnaviria, за исключением нитчатых бактериофагов из семейства Inoviridae[англ.], кодируют эндонуклеазу суперсемейства HUH. Эндонуклеазы этого семейства содержат особый мотив HUH, который состоит из двух остатков гистидина и остатка крупной гидрофобной аминокислоты, а также мотив Y, который содержит один или два остатка тирозина. У вирусов, чей геном представлен одноцепочечной ДНК (оцДНК), эндонуклеазу HUH нередко называют белком инициации репликации или сокращённо Rep, поскольку именно с внесения этим ферментом разрыва в определённый сайт в геноме запускает репликацию вирусного генома по типу катящегося кольца[2][3].