История Пермского театра кукол началась в 1937 г., когда областной комитет по делам искусств организовал труппу на основе небольшой кукольной группы при Пермской филармонии. Первой постановкой нового театра стала сказка «По щучьему велению», которая тогда ставилась в Москве. Вначале у труппы не было своего помещения, и она вела кочевую жизнь, перемещаясь на гастролях на грузовиках, пароходах, лошадях. В 1943 г. труппа впервые в СССР поставила кукольную оперу «Муха-цокотуха» М. Красева, посвящённую эвакуированным из Москвы детям.
Своё помещение у театра появилось только в конце 1950-х гг., когда в 1957—1959 гг. для него началось переоборудование здания бывшей пересыльной тюрьмы, построенной ещё Р. И. Карвовским. Перестройка здания проводилась при содействии С. В. Образцова ленинградскими архитекторами и обошлась в 2 млн рублей. А первым значительным кукольным спектаклем в новом здании стала комедия для взрослых «Чертова мельница».
Пермский театр кукол под руководством В. Д. Офрихтера значительно поднял уровень своей творческой работы. Коллектив театра получил дипломы за участие в смотрах польской, чешской, венгерской драматургии и на советской сцене: в этот период ставятся такие спектакли, как «Сэмбо», «Клоп», «Кукольный город», «Капризка», а также кукольные оперы «Муха-цокотуха» и «Мойдодыр», пантомима «Красная птица», опера-буфф «Прекрасная Елена».
В 1980-х гг. под руководством И. В. Игнатьева театр посетил с гастролями фестивали Урала, Нечерноземья, Москву, Узбекистан, Украину, а также за рубежом: Японию (гастроли и XV Всемирный конгресс УНИМА в 1988 г.) и Луисвилл в США (1995 г.). Тогда же был поставлен спектакль «Машенька и медведь», созданный И. и А. Игнатьевыми и до сих пор с успехом идущий на сцене театра.
С 1995 года руководителем театра стал И. Н. Тернавский, Театр ставит такие произведения, как «Необыкновенные приключения на дорогах», «Волшебник Изумрудного города», «Маугли», «Обыкновенный кукольный концерт», «Колобок», «Король Лир».
В 1999 г. со спектаклем «Ты кто?» по мотивам рассказов А. Платонова театр стал лауреатом фестиваля «Волшебная кулиса», а в 2000 г. получил специальный приз Департамента культуры и искусства администрации Пермской области «За мастерство» на VIII Всероссийском фестивале моноспектаклей. Драма «Маугли» завоевала областную Премию «За лучшее достижение в сфере культуры и искусства».