Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Ассоциация биомолекулярных ресурсов
ABRF logo.png
Формирование1989 г.
Штаб-квартираЛексингтон, Кентукки
Место расположения
Членство 1200 (январь 2021 г.)
Официальный язык английский
ПрезидентКевин Кнудтсон
Веб-сайтhttp://www.abrf.org/

Ассоциация Биомолекулярной ресурсов зал (ABRF) посвящен продвижению основных и научных исследований в области биотехнологии лаборатории путем проведения научных исследований, связи и образования. [1] В состав ABRF входят более 1200 ученых, представляющих 340 различных основных лабораторий в 41 стране, в том числе в промышленных, государственных, академических и исследовательских учреждениях.

История [ править ]

В 1986 г. было проведено сателлитное совещание по исследовательским ресурсам в связи с Шестой Международной конференцией по методам анализа белковых последовательностей. [ необходима цитата ] В следующем году секвенирование белков и образцы аминокислот были отправлены на обследование 103 основных объектов. К 1989 году ABRF был официально организован и инкорпорирован. Каждый год ежегодное собрание проводилось как вспомогательное собрание Белкового общества до 1996 года, когда начались отдельные собрания. [2]

Исследовательские группы ABRF [ править ]

Исследовательские группы созданы для достижения двух целей Ассоциации биомолекулярных ресурсов. Во-первых, предоставить механизмы для самооценки и улучшения процедурной и оперативной точности, точности и эффективности ресурсов и исследовательских лабораторий. Во-вторых, внести свой вклад в обучение сотрудников ресурсных учреждений и исследовательских лабораторий, пользователей, администраторов и заинтересованных членов научного сообщества. [3] Результаты исследований ABRF Research Group опубликованы в научных статьях. [4] [5] [6] Результаты исследований ABRF Research Group были повторно использованы в других исследованиях. [7] [8] [9]

Ресурсные технологии [ править ]

Члены ABRF вовлечены в широкий спектр биомолекулярных технологий, которые реализуются на основных объектах:

  • Автоматизация: высокопроизводительный грохот, LIMS , робототехника .
  • Химия белков / пептидов : аминокислотный анализ, N- и C-концевое секвенирование, синтез пептидов, массивы пептидов / белков.
  • Биофизика : калориметрия , КД, флуоресценция , светорассеяние , ППР , ультрацентрифугирование .
  • Проточная цитометрия, активация флуоресценции, сортировка клеток
  • Экспрессия , идентификация и профилирование белков : дифференциальная флуоресценция, традиционный 2-мерный гель-электрофорез , открытие биомаркеров заболевания.
  • Экспрессия и профилирование генов: массивы генов, ПЦР в реальном времени .
  • Масс-спектрометрия : качественный, количественный и структурный анализ белков, углеводов , олигонуклеотидов и липидов .
  • Микроскопия, световая микроскопия и визуализация, конфокальная микроскопия.
  • Нуклеиновые Кислоты Химия : секвенирование ДНК , синтез ДНК , синтез РНК , генотипирования .
  • Разделение: 1- и 2-D PAGE, капиллярный электрофорез , хроматография .
  • Контроль качества : GLP, GMP, качество и соответствие.
  • Универсальный протеомный стандарт (UPS), смесь белков, используемых в качестве эталонного стандарта в протеомике, представленная вышеупомянутым sPRG. [10] Сюда входят два набора: исходный (UPS1, где все 48 белков находятся в 48 пмоль) и динамический диапазон концентраций (называемый UPS2) от 500 до 50 пмоль. [11]
  • Другое: биоинформатика , анализ углеводов , дифференциальное отображение, производство рекомбинантных белков .

Ежегодная конференция [ править ]

Ежегодно ежегодная конференция Ассоциации объектов биомолекулярных ресурсов проводится весной в разных городах Северной Америки. Эта международная конференция используется для ознакомления участников с новыми и развивающимися биотехнологиями посредством лекций, круглых столов, презентаций исследовательских групп, стендовых сессий, семинаров и технических выставок.

  • ABRF 2022, 27–30 марта 2022 г., Палм-Спрингс, Калифорния
  • ABRF 2021, 7–11 марта 2021 г., виртуальная встреча в связи с COVID-19
  • ABRF 2020, 29 февраля - 3 марта 2020 г., Палм-Спрингс, Калифорния
  • ABRF 2019, 23–26 марта, Сан-Антонио , Техас; 30 лет преодоления ограничений науки и технологий, открывая двери в будущее
  • ABRF 2018, 22–25 апреля, Миртл-Бич, Южная Каролина ; Премьер-конференция по основным услугам
  • ABRF 2017, 25–28 марта, Сан-Диего , Калифорния; Форум по продвижению современных основных технологий для внедрения инноваций завтрашнего дня
  • ABRF 2016, 20–23 февраля, фут. Лодердейл , Флорида; Инновационные технологии, ускоряющие открытия
  • ABRF 2015, 28–31 марта, Сент-Луис , Миссури; Интеграционные технологии для развития научных ядер
  • ABRF 2014, 23–25 марта, Альбукерке , Нью-Мексико; Командная наука и большие данные: ядра на передовой
  • ABRF 2013, 2–5 марта, Палм-Спрингс, Калифорния; Инструменты для развития науки о конвергенции
  • ABRF 2012, 17–20 марта, Орландо, Флорида; Учимся на биомолекулах
  • ABRF 2011, 19–22 февраля, Сан-Антонио, Техас; Технологии для создания персонализированной медицины
  • ABRF 2010, 20–23 марта, Сакраменто, Калифорния; Преобразование фундаментальных исследований в достижения биомолекулярных технологий
  • ABRF 2009, 7–10 февраля, Мемфис, Теннесси; Применение и оптимизация существующих и новых биотехнологий
  • ABRF 2008, 9–12 февраля, Солт-Лейк-Сити, Юта; Разрешающие технологии в науках о жизни
  • ABRF 2007, 31 марта - 3 апреля, Тампа, Флорида; Создание биологической дорожной карты
  • ABRF 2006, 11–14 февраля, Лонг-Бич, Калифорния; Интеграция науки, инструментов и технологий с системной биологией
  • ABRF 2005, 5–8 февраля, Саванна, Джорджия; Биомолекулярные технологии: от открытия к гипотезе
  • ABRF 2004, 28 февраля - 2 марта, Портленд, Орегон; Интеграция технологий в протеомику и геномику
  • ABRF 2003, 10–13 февраля, Денвер, Колорадо; Перевод биологии с помощью протеомики и функциональной геномики
  • ABRF 2002, 9–12 марта, Остин, Техас; Биомолекулярные технологии: инструменты для открытий в протеомике и геномике
  • ABRF 2001, 24–27 февраля, Сан-Диего, Калифорния; Новая биология: технология разрешения макромолекулярных коммуникаций
  • ABRF 2000, 19–22 февраля, Белвью, Вашингтон; От единичного к глобальному анализу биологических систем
  • ABRF 1999, 19–22 марта, Дарем, Северная Каролина; Биоинформатика и биомолекулярные технологии: связывание геномов, протеомов и биохимии
  • ABRF 1998, 21–24 марта, Сан-Диего, Калифорния; От геномов к функциям - технические проблемы постгеномной эпохи
  • ABRF 1997, 9–12 февраля, Балтимор, Мэриленд; Методы взаимодействия геном-протеом
  • ABRF 1996, 30 марта - 2 апреля, Сан-Франциско, Калифорния; Биомолекулярные методы

Премия ABRF [ править ]

Премия ABRF вручается на ежегодном собрании ABRF за выдающийся вклад в биомолекулярные технологии. Лауреаты прошлых премий: [12]

  • 2021 г. -
  • 2020 Джорджу Черчу за его новаторские исследования в области геномного секвенирования и его лидерство в области генной терапии и технологий синтетической биологии.
  • 2019 Ричард М. Каприоли за открытие временной и пространственной обработки в биологических системах с помощью масс-спектрометрии.
  • 2018 Амоса Байроха за развитие ресурсов сообщества, таких как UniProtKB / Swiss-Prot knowledgebase , PROSITE , ENZYME и neXtProt .
  • 2017 Сэр Шанкар Баласубраманян и Дэвид Кленерман за изобретение метода секвенирования ДНК следующего поколения, который сегодня широко известен как «секвенирование путем синтеза».
  • 2016 Эммануэль Шарпантье и Дженнифер Дудна за разработку технологий редактирования генома CRISPR / Cas9.
  • 2015 Джон Уайт и Уильям Брэдшоу Амос за разработку лазерного сканирующего конфокального микроскопа высокого разрешения
  • 2014 Патрик Х. О'Фаррелл , за разработку 2-мерного гель-электрофореза.
  • 2013 Леонард Герценберг и Леонора Герценберг за разработку метода сортировки клеток, активируемого потоком (FACS).
  • 2012 г. Алану Г. Маршаллу за разработку масс-спектрометрии с ионным циклотронным резонансом с преобразованием Фурье (FT-ICR).
  • 2011 Сэр Алек Джон Джеффрис : Разработаны методы ДНК - дактилоскопии и ДНК профилирования
  • 2010 Пэт Браун : Новаторская работа в области разработки микроматриц и различных применений этой технологии в генетических исследованиях.
  • 2009 Матиас Улен
  • 2008 Руэди Эберсольд
  • 2007 Дональд Ф. Хант
  • 2006 Роджер Цзянь
  • 2005 Стивен Фодор
  • 2004 Эдвин Южный
  • 2003 Франц Хилленкамп и Майкл Карас
  • 2002 Джон Фенн
  • 2001 Чаба Хорват
  • 2000 Лерой Худ
  • 1999 Марвин Х. Карутерс за новаторский вклад в химический синтез ДНК и РНК.
  • 1998 Брюс Меррифилд
  • 1997 Ллойд М. Смит
  • 1996 Дэвид Липман
  • 1995 Клаус Биманн
  • 1994 Фредерик Сэнджер

Журнал биомолекулярных методов [ править ]

ABRF является издателем журнала биомолекулярных методов. Журнал рецензируется и выходит ежеквартально. [13] Основное внимание в журнале уделяется публикации научных обзоров и статей, связанных с биомолекулярными ресурсами. Опубликованные исследовательской группой отчеты включают ежегодные опросы. Также включены новости и события, а также обзор статей, посвященных методам, используемым в типичных средах основного объекта. Текущий главный редактор - Рон Орландо, Университет Джорджии .

Исполнительный совет ABRF [ править ]

  • Кевин Кнудтсон, президент ABRF, Отдел геномики, Университет Айовы
  • Кристиан Литл, казначей, Дартмутский колледж
  • Мари Адамс, Институт Ван Андела
  • Роксанна Эшворт, Университет Джона Хопкинса
  • Шридар Читтур, СУНИ Олбани
  • Жюстин Кигеньи, Медицинский центр KU
  • Клавдий Мундома, Университет штата Флорида
  • Магнус Палмблад, Медицинский центр Лейденского университета
  • Кен Шоппманн, исполнительный директор ABRF

Ссылки [ править ]

  1. ^ «Заявление о миссии» . Ассоциация биомолекулярных ресурсов. Архивировано 1 апреля 2019 года . Дата обращения 4 марта 2020 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  2. ^ Крабб, JW: "ABRF; Краткая история" ABRF News, июнь 1995 г.
  3. ^ "Рекомендации исследовательской группы" (PDF) . Ассоциация биомолекулярных ресурсов. Архивировано из оригинального (PDF) 31 января 2012 года . Проверено 15 апреля 2009 года . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  4. ^ Чой, Мина; Эрен-Догу, Зейнеп Ф .; Коланджело, Кристофер; Коттрелл, Джон; Hoopmann, Michael R .; Капп, Юджин А .; Ким, Сангтае; Лам, Генри; Neubert, Thomas A .; Пальмблад, Магнус; Phinney, Brett S .; Weintraub, Susan T .; Маклин, Брендан; Витек, Ольга (2017). "Исследование ABRF Proteome Informatics Research Group (iPRG) 2015: Обнаружение дифференциально обильных белков в безметочных количественных экспериментах ЖХ-МС / МС". Журнал протеомных исследований . 16 (2): 945–957. DOI : 10.1021 / acs.jproteome.6b00881 . PMID 27990823 . 
  5. ^ Chalkley, Роберт Дж .; Бандейра, Нуно; Чемберс, Мэтью С .; Clauser, Karl R .; Коттрелл, Джон С .; Deutsch, Eric W .; Капп, Юджин А .; Лам, Генри HN; Макдональд, У. Хейс; Neubert, Thomas A .; Сунь, Жуй-Сян (2014). «Исследовательская группа по протеомной информатике (iPRG) _2012: исследование по обнаружению модифицированных пептидов в сложной смеси» . Молекулярная и клеточная протеомика . 13 (1): 360–371. DOI : 10.1074 / mcp.M113.032813 . PMC 3879627 . PMID 24187338 . Проверено 5 ноября 2018 .   CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  6. ^ Беннетт, Кейрин L .; Ван, Ся; Bystrom, Cory E .; Чемберс, Мэтью С .; Andacht, Tracy M .; Данготт, Ларри Дж .; Эльорца, Феликс; Лешик, Джон; Молина, Хенрик; Мориц, Роберт Л .; Phinney, Brett S .; Томпсон, Дж. Уилл; Бангер, Морин К .; Табб, Дэвид Л. (2015). «Исследование группы ABRF Proteomic 2012/2013: Оценка продольной внутрилабораторной изменчивости в рутинных анализах тандемной масс-спектрометрии с жидкостной хроматографией на пептидах» . Молекулярная и клеточная протеомика . 14 (12): 3299–3309. DOI : 10.1074 / mcp.O115.051888 . PMC 4762617 . PMID 26435129 . Проверено 5 ноября 2018 .   CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  7. ^ Нгуен, Чунг Хай; Рустенбург, Ариен С .; Krimmer, Stefan G .; Чжан, Хэси; Кларк, Джон Д .; Novick, Paul A .; Брэнсон, Ким; Pande, Vijay S .; Ходера, Джон Д .; Мин, Дэвид DL (2018). «Байесовский анализ калориметрии изотермического титрования для термодинамики связывания» . PLOS One . 13 (9): e0203224. DOI : 10.1371 / journal.pone.0203224 . PMC 6136728 . PMID 30212471 .  
  8. ^ The, Мэтью; Эдфорс, Фредрик; Перес-Риверол, Яссет; Пейн, Сэмюэл Х .; Hoopmann, Michael R .; Пальмблад, Магнус; Форсстрём, Бьёрн; Келл, Лукас (2018). «Стандарт белка, который имитирует гомологию для характеристики алгоритмов вывода белков» . Журнал протеомных исследований . 17 (5): 1879–1886. DOI : 10.1021 / acs.jproteome.7b00899 . PMC 6474350 . PMID 29631402 .  
  9. ^ Ву, Гуаньин; Ван, Сян; Сюй, Баохуа (2018). «Новая оценка уровня ложных открытий на уровне белков» . BMC Genomics . 19 (Suppl 6): 567. DOI : 10,1186 / s12864-018-4923-3 . PMC 6101079 . PMID 30367581 .  
  10. ^ «Универсальные стандарты протеомики - подтверждение будущего протеомики» . Проверено 22 августа +2016 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  11. ^ «Протеомные стандарты UPS1 и UP2» . Проверено 22 августа +2016 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  12. ^ "Премия ABRF" . Ассоциация биомолекулярных ресурсов. Архивировано из оригинала на 30 января 2012 года . Проверено 22 августа +2016 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )
  13. ^ "JBT: Журнал биомолекулярных методов" . Ассоциация биомолекулярных ресурсов. Архивировано 3 августа 2019 года . Дата обращения 4 марта 2020 . CS1 maint: обескураженный параметр ( ссылка )

Внешние ссылки [ править ]

  • Ассоциация объектов биомолекулярных ресурсов ABRF
  • Федерация американских обществ экспериментальной биологии FASEB
  • Дискуссионный форум ABRF
  • Журнал биомолекулярных методов
  • ABRF в LinkedIn
  • Лидерство