Из Википедии, бесплатной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску

Avogadro - это редактор молекул и визуализатор, предназначенный для кроссплатформенного использования в вычислительной химии , молекулярном моделировании , биоинформатике , материаловедении и смежных областях. [3] [4] [5] [6] Он расширяется с помощью архитектуры плагинов. [7]

Особенности [ править ]

Модель заполнения пространства лоратадина, созданная с помощью Avogadro.
  • Редактор-конструктор молекул для Windows , Linux , Unix и macOS .
  • Весь исходный код находится под лицензией GNU General Public License (GPL) версии 2.
  • Поддерживаемые языки: китайский , английский , французский , немецкий , итальянский , русский , испанский и польский .
  • Поддерживает многопоточный рендеринг и вычисления .
  • Архитектура плагина для разработчиков, включая рендеринг, интерактивные инструменты, команды и скрипты Python .
  • Импорт файлов OpenBabel , создание входных данных для нескольких пакетов вычислительной химии , рентгеновской кристаллографии и биомолекул .

См. Также [ править ]

  • Molden
  • Габедит
  • Молекель
  • PyMol
  • Jmol
  • РасМол
  • САМСОН
  • UCSF Химера
  • Программное обеспечение для молекулярного дизайна
  • Список программного обеспечения для квантовой химии и физики твердого тела
  • Сравнение программного обеспечения для моделирования молекулярной механики
  • Расширяемая среда вычислительной химии (ECCE)
  • Визуальная молекулярная динамика (VMD)
  • Химический

Ссылки [ править ]

  1. ^ "Авогадро 1.2 выпущен" . 15 июня 2016 . Проверено 16 мая 2017 года .
  2. ^ Hanwell, Марк Д. (2 декабря 2016). «Вышел Авогадро 1.90.0» . Проверено 16 мая 2017 года .
  3. ^ Hanwell, Маркус D; Кертис, Дональд Э; Лони, Дэвид С; Вандермерш, Тим; Журек, Ева; Хатчисон, Джеффри Р. (2012). «Авогадро: расширенный семантический химический редактор, платформа для визуализации и анализа» . J. Cheminform . 4 (1): 17. DOI : 10,1186 / 1758-2946-4-17 . PMC 3542060 . PMID 22889332 .  
  4. ^ Рал Мера-Адасме; Фернандо Мендизбаль; Клаудио Олеа-Азар; Себастин Миранда-Рохас; Патрисио Фуэнтеалба (2011). «Вычислительно эффективная и надежная мера порядка облигаций». J. Phys. Chem. . 115 (17): 4397–4405. Bibcode : 2011JPCA..115.4397M . DOI : 10.1021 / jp107498h . ЛВП : 10533/131936 . PMID 21469689 . 
  5. ^ Майкл Сальчиччоли; Вайтинг Ю; Марк А. Барто; Цзингуан Г. Чен; Дионисиос Г. Влахос (2011). «Дифференциация механизмов разрыва связей O – H и C – H этиленгликоля на Pt и Ni / Pt с использованием теории и экспериментов по изотопному мечению». Варенье. Chem. Soc . 133 (20): 7996–8004. DOI : 10.1021 / ja201801t . PMID 21526776 . 
  6. ^ Открытая документация Babel Автор: Джеффри Р. Хатчисон; Ноэль М. О'Бойл; Голубой обелиск (организация)
  7. ^ Сайт Авогадро

Внешние ссылки [ править ]

  • Официальный веб-сайт